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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-15 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用中的表观遗传调控机制及其在疾病发病和治疗中的应用潜力 | 强调了物种特异性表观遗传变化在致病中的作用,并探讨了寄生虫如何通过表观遗传途径操纵宿主免疫信号,包括共感染和共病模型 | NA | 探讨表观遗传机制在利什曼病中的调控作用及基于表观遗传学和合成生物学的治疗策略潜力 | 利什曼原虫及其与宿主的相互作用 | NA | 利什曼病 | NA | NA | NA | NA | 合成基因电路 | 利什曼原虫,宿主细胞 | NA | 医学 |
| 22 | 2026-01-15 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 本研究开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包,用于动态调控代谢通量,并在枯草芽孢杆菌中成功应用于D-泛酸和核黄素的生物合成 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合,创建了可响应细胞密度的动态基因调控工具包,并通过优化关键组件显著提升了调控效率 | 未明确说明该工具包在其他宿主微生物中的普适性,且大规模发酵应用可能面临工程菌株稳定性挑战 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应系统、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的基因调控回路,包含PhrQ/RapQ信号系统与CRISPRi的整合设计 | 工业生物技术 |
| 23 | 2026-01-15 |
Engineered bacteria as living therapeutics: Next-generation precision tools for health, industry, environment, and agriculture
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025042
PMID:41522435
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌作为活体疗法方面的最新进展,探讨了其在医疗、工业、环境和农业领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成基因电路和模块化质粒架构,结合计算建模与机器学习,实现了对微生物行为的精细调控 | 存在遗传稳定性、生物安全性、临床与工业环境可重复性等挑战,伦理与监管框架仍需完善 | 探讨工程化细菌作为下一代精准工具在健康、工业、环境和农业领域的应用潜力 | 工程化细菌(活体疗法) | NA | NA | CRISPR-Cas系统、合成基因电路、模块化质粒架构 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 合成基因电路(如生物传感器、逻辑门等) | 医学, 工业, 环境, 农业 |
| 24 | 2026-01-15 |
A Gene-Switch Platform Interfacing with Reactive Oxygen Species Enables Transcription Fine-Tuning by Soluble and Volatile Pharmacologics and Food Additives
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306333
PMID:38526196
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研究论文 | 本研究开发了一种哺乳动物基因开关平台,通过多种产生低水平活性氧(ROS)的分子来精确控制治疗基因表达,应用于1型糖尿病小鼠的胰岛素生产 | 利用KEAP1-NRF2-ARE通路作为ROS传感器,使基因开关能被多种可溶性和挥发性小分子(如食品添加剂和药物)激活,扩展了诱导剂的多样性 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;ROS水平的长期安全性需进一步评估 | 开发一种可被多种小分子诱导的基因开关平台,用于细胞基因疗法中的治疗蛋白精确控制 | 哺乳动物细胞(工程化细胞)和1型糖尿病小鼠模型 | 合成生物学 | 1型糖尿病 | 基因工程、微囊化技术、ROS传感 | NA | 实验数据(如基因表达、血糖水平) | 实验型1型糖尿病小鼠 | CRISPR-Cas9, 基因电路设计 | 哺乳动物细胞 | 基于KEAP1-NRF2-ARE通路的基因开关,包含八串联ARE重复序列的启动子,用于ROS响应性基因激活 | 医学 |
| 25 | 2026-01-14 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Jan-13, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
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研究论文 | 本研究设计并建模了用于系统性递送细菌癌症疗法的生物传感器驱动的封装系统 | 开发了基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动封装系统,用于自主控制细菌荚膜多糖表达以改善药代动力学特性,并首次建立了双状态药代动力学模型来模拟活体治疗剂的动态行为 | 模型仍需在更复杂的体内环境中进一步验证,临床转化前需要更多的实验数据支持 | 改进细菌癌症疗法的系统性递送安全性和有效性 | 工程化的大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、药代动力学建模 | 双状态药代动力学模型 | 实验数据与模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学电路设计 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 生物传感器驱动的基因电路,包含群体感应和酸感应模块,用于自主控制荚膜多糖表达 | 医学 |
| 26 | 2026-01-14 |
Molecular networks and signaling pathways governing abiotic stress tolerance in cotton: advances and perspectives
2026-Jan-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01795-8
PMID:41528403
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综述 | 本文综述了棉花响应非生物胁迫(如干旱、盐分、热、冷和重金属毒性)的分子网络与信号通路研究进展,并展望了未来研究方向 | 整合了最新的表观遗传调控机制(如m6A RNA甲基化和非编码RNA)以及合成生物学方法在棉花胁迫响应网络研究中的应用 | NA | 阐明棉花非生物胁迫耐受性的分子调控网络与信号通路,为培育抗逆棉花品种提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.) | NA | NA | 分子生物学、生物技术、遗传工程、基因组编辑、组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 27 | 2026-01-14 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-Jan-12, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 本研究对Cellvibrio japonicus中的甘露二糖差向异构酶和甘露糖苷磷酸化酶进行了生理和生化表征,揭示了它们在甘露聚糖代谢晚期阶段的关键作用 | 首次在C. japonicus中功能性地表征了甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA),并发现它们对线性甘露聚糖、甘露二糖和甘露三糖的利用至关重要,同时揭示了缺乏epiA基因的菌株中半乳糖取代的甘露寡糖的毒性效应 | 研究主要基于体外酶活性和突变分析,未深入探讨这些酶在复杂环境或体内条件下的具体调控机制 | 探究C. japonicus中甘露聚糖代谢晚期阶段的酶学机制及其在合成生物学应用中的潜力 | Cellvibrio japonicus细菌及其甘露二糖差向异构酶(EpiA)和甘露糖苷磷酸化酶(Mgp130A) | 合成生物学 | NA | 生理学表征、生化分析、功能突变分析、酶活性测定 | NA | 酶活性数据、突变表型数据 | NA | 质粒构建(pJKN5) | Cellvibrio japonicus(革兰氏阴性腐生菌) | NA | 生物技术、制药开发、可再生化学品生产 |
| 28 | 2026-01-14 |
Industrial Byproducts as Sustainable Feedstocks for Biopharmaceutical Manufacturing: Waste-to-Medicine Pathways for a Circular Economy
2026-Jan-12, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70124
PMID:41527212
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综述 | 本文系统性地探讨了工业副产品作为生物制药可持续原料的来源、分类及应用,评估了将其转化为高价值治疗产品的生物技术策略,并分析了相关的环境、经济、监管及技术挑战 | 首次系统性地将工业副产品定位为生物制药的可持续原料,并整合了从废物到药物的转化路径、生命周期分析及人工智能等未来优化策略,强调了其在推动循环经济和零废物生产中的变革潜力 | 存在技术限制、严格的质量与标准化要求、复杂的政策与伦理挑战等重大障碍,且工业副产品的来源和成分可能不稳定,影响生产的可重复性和规模化 | 探索工业副产品作为可持续原料在生物制药制造中的应用潜力,以降低生产成本并促进循环经济 | 工业副产品(如制药及相关行业的废弃物、农业工业废物、海洋来源残留物、发酵副产品)及其转化为生物制药产品的过程 | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、酶促生物转化、合成生物学驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 29 | 2026-01-14 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Jan-12, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
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综述 | 本文提出并定义了跨界肽(TKPs)的概念,综述了其在植物相关相互作用中的角色,包括共生、寄生、植物-微生物互作、食草性和宿主-病毒动态中的功能 | 首次系统性地提出跨界肽(TKPs)作为跨界生物通讯的中央介质,并总结了其在多种生物互作中的新兴作用,为植物生物学和跨物种通讯研究提供了新的概念框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且当前TKPs的识别和功能验证仍面临技术挑战,实际应用潜力尚待进一步探索 | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学意义,并促进跨学科研究以拓展植物生物学和跨物种通讯的前沿领域 | 植物和微生物来源的跨界肽,涉及豆科植物-根瘤菌结瘤、线虫寄生、微生物免疫抑制、病毒和昆虫衍生肽等 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 30 | 2026-01-14 |
Triply Responsive Control of Ion Transport with an Artificial Channel Creates a Switchable AND to OR Logic Gate
2026-Jan-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202517444
PMID:41251147
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研究论文 | 本文介绍了一种基于柱[5]芳烃功能化的光开关邻四氟偶氮苯基团的人工离子通道,其活性可通过光、pH和客体/配体三种正交刺激控制 | 开发了一种三响应合成离子通道,实现了光、pH和客体添加的多模态控制,并设计出可切换的AND到OR逻辑门系统 | 未提及具体选择性或与生物离子通道的直接比较数据 | 创建具有多重可控性的合成离子通道以模拟生物离子通道功能 | 基于柱[5]芳烃的光开关人工离子通道 | 合成生物学 | NA | 单分子平面双层电导研究 | NA | 电导数据 | NA | NA | NA | 可切换的AND到OR逻辑门系统 | 医学 |
| 31 | 2026-01-14 |
2-Hydroxy-4-Methoxybenzaldehyde (2H4MB): Integrating Cell Culture, Metabolic Engineering, and Intelligent Genome Editing
2026-Jan-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010503
PMID:41516375
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综述 | 本文综述了利用细胞培养、代谢工程和智能基因组编辑技术提高2-羟基-4-甲氧基苯甲醛(2H4MB)产量的最新进展 | 整合了代谢工程、合成生物学、体外培养方法和人工智能辅助路径预测,并探讨了基于CRISPR的基因组编辑在调控关键生物合成基因中的应用 | 遗传资源不足、生物合成途径了解不充分、缺乏可靠的转化系统 | 提高2H4MB的产量,以应对其在天然植物中生产受限的问题 | 2-羟基-4-甲氧基苯甲醛(2H4MB) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、机器学习 | 预测性机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 生物合成途径调控 | 医药、香料、香精 |
| 32 | 2026-01-14 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2026-Jan, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,在大肠杆菌中异源表达并纯化了源自粪肠球菌的抗菌肽enterocin A,并评估了其对抗多药耐药病原体的活性 | 设计并从头合成了完整的enterocin A遗传盒,包括功能性调控元件和N端His标签,建立了一种从包涵体中高效回收并纯化活性抗菌肽的稳健且经济的方法 | 表达产物主要以包涵体形式存在,需要额外的溶解和重折叠步骤,这可能会影响产量和工艺复杂性 | 开发替代性抗菌策略,以应对抗生素耐药性全球健康挑战 | 源自粪肠球菌的抗菌肽enterocin A | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因合成、PCR、DNA测序、Ni-NTA亲和层析 | NA | NA | 针对5种多药耐药病原体进行了抗菌活性测试,包括金黄色葡萄球菌ATCC 25923、铜绿假单胞菌ATCC 27853等 | Gibson Assembly(基于从头合成构建载体),iGEM(涉及遗传回路设计理念) | 大肠杆菌BL21 (DE3) | 包含成熟enterocin A编码序列、功能性调控元件和N端His标签的合成遗传盒,用于异源表达和纯化 | 医药,食品 |
| 33 | 2026-01-14 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-Jan, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
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综述 | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变,重点比较了它们在功能机制上的差异,并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在推动个性化益生菌疗法中的应用与挑战 | 强调下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila和Faecalibacterium prausnitzii)具有更具体的靶向功能机制,并与代谢、炎症和神经系统疾病相关联,同时整合了合成生物学和人工智能技术以促进个性化治疗 | 广泛的临床应用仍处于早期阶段,存在安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统益生菌与下一代益生菌的功能机制,并探索如何利用新技术推动个性化益生菌疗法的发展 | 传统益生菌(如乳杆菌和双歧杆菌)和下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila和Faecalibacterium prausnitzii) | NA | NA | 合成生物学、人工智能、微生物组分析、组学技术 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | NA | NA | 医学 |
| 34 | 2026-01-14 |
Host Factors Promoting the LTR Retrotransposon Life Cycle in Plant Cells: Current Knowledge and Future Directions
2025-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010374
PMID:41516247
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综述 | 本文综述了植物细胞中促进LTR反转座子生命周期的主机因素,探讨了其与宿主过程的整合及未来研究方向 | 提出整合植物移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学和互作组学来阐明植物特异性机制 | 精确机制在植物中仍不明确,尤其是针对富含LTR反转座子的植物 | 探讨促进植物中LTR反转座子转座的主机蛋白质 | LTR反转座子及其与植物宿主细胞的相互作用 | 植物生物学 | NA | 移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学、互作组学 | NA | 文献分析 | NA | 基因组编辑 | 植物细胞 | NA | 农业 |
| 35 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略,用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计,成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织(心脏、肢体、中枢神经系统)的增强子功能,尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习,全基因组染色质可及性分析,迁移学习 | 卷积神经网络(CNN) | 基因组序列数据,染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习,并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学,合成生物学,基因治疗 |
| 36 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程,用于优化基于变构转录因子的生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程,结合方向性标签训练模型,快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器,用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器,用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于定向进化中,但未明确指定),机器学习框架 | 细胞游离系统(无特定宿主生物) | 基于变构转录因子的生物传感器,用于铅检测 | 环境监测 |
| 37 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力,并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战,其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 38 | 2026-01-14 |
[Building on 40 Years, Now Pioneering the Future: Preface to the 40th Anniversary Issue of the Chinese Journal of Biotechnology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250804
PMID:41457585
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评论 | 本文是《中国生物技术杂志》创刊40周年特刊的序言,回顾了期刊的贡献并展望了未来 | 作为40周年特刊的序言,系统总结了期刊在推动中国生物技术创新与转化方面的历史作用 | NA | 纪念期刊创刊40周年,展示生物技术领域的最新进展并展望未来发展方向 | 《中国生物技术杂志》及其40周年特刊收录的40篇文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物制造、健康、能源、农业 |
| 39 | 2026-01-14 |
Artificial intelligence in biology and medicine
2025-Oct-17, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02029-4
PMID:41107683
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综述 | 本文探讨了人工智能在生物学和医学领域的角色、应用、未来趋势、挑战及伦理问题 | 系统性地综述了AI在生物学多个子领域(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞与合成生物学)及医学领域(如诊断、疫苗开发、疾病治疗)的应用,并探讨了可解释AI、生物启发模型、以及AI与机器人学、纳米技术等先进技术的协同作用 | 分析了AI面临的局限与挑战,包括伦理与法律问题、数据质量问题以及标准化的需求 | 探讨人工智能在生物学和医学领域的应用潜力、未来发展方向及其带来的机遇与风险 | 人工智能技术及其在生物学(如基因组学、蛋白质组学、生物技术、细胞生物学、合成生物学)和医学(如疾病诊断、疫苗开发、治疗,包括COVID-19)中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 40 | 2026-01-14 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的策略,用于制造均匀可重复的蛋白质基纳米颗粒,以精确控制纳米颗粒的异质组分,并探索了纳米颗粒配体密度与肿瘤靶向/渗透之间的相互作用 | 开发了铁蛋白组装工具箱系统,实现了在大肠杆菌中细胞内组装铁蛋白亚基/变体,从而精确控制纳米颗粒的异质组分,并首次系统研究了纳米颗粒异质性对肿瘤摄取和渗透的影响 | NA | 探索纳米颗粒异质性在生物系统中的命运决定作用,特别是配体密度对肿瘤靶向和渗透的影响 | 铁蛋白杂合纳米笼(FHn),包含人铁蛋白重链和轻链 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学策略,铁蛋白组装工具箱系统 | NA | NA | NA | 铁蛋白组装工具箱系统 | 大肠杆菌 | 铁蛋白杂合纳米笼的组装,涉及人铁蛋白重链和轻链的异质组合 | 医学 |