合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-07-15	Integrated platform for structural and functional analysis of terpene synthases of Cannabis sativa 2025, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.19723 PMID:40656959	research paper	开发了一个集成平台，用于系统表达、纯化、酶学表征和大麻萜烯合成酶（TPS）的结晶	结合动力学、热稳定性和结构分析，以及数据挖掘指导的结晶筛选，生产出衍射质量晶体	TPS酶的催化效率低，限制了其在大规模商业生产中的应用	优化萜烯生产，用于制药、害虫管理和合成生物学应用	大麻萜烯合成酶（TPS）	生物化学	NA	结晶、动力学分析、热稳定性分析、数据挖掘	NA	酶结构信息	10种大麻TPS酶
22	2025-07-14	Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing 2025-Jul-10, Trends in genetics : TIG IF:13.6Q1 DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003 PMID:40645879	review	本文综述了CRISPR技术在基因组编辑以外的广泛应用，包括分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用图谱和单细胞分析等领域	探讨了CRISPR技术在基因组编辑之外的新应用，如利用Cas酶的附带切割活性进行快速核酸检测，以及通过合成生物学组件扩展其检测离子、代谢物和蛋白质的能力	未来研究需要克服当前技术的局限性，如与人工智能、空间组学和微流体的整合	扩展CRISPR技术的应用范围，超越传统的基因组编辑	CRISPR技术及其在多个领域的应用	分子生物学	NA	CRISPR, Cas酶, 合成生物学	NA	NA	NA
23	2025-07-14	Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds 2025-Jul-09, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641 PMID:40645511	综述	本文综述了酵母作为C1细胞工厂，将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望	探讨了合成甲基营养在非甲基营养底盘中的发展，以及通过非理性基因组工程和菌株进化结合理性设计揭示的C1途径和底物耐受机制	C1生物工艺的规模化仍存在未解决的技术限制，距离实际工业应用还有很长的路要走	可持续地减少制造业的碳排放，通过微生物转化温室气体为高价值生化产品	工业酵母对甲醇和甲酸盐的耐受和同化能力	合成生物学	NA	合成甲基营养、非理性基因组工程、菌株进化、理性设计	NA	NA	NA
24	2025-07-12	Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection 2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2025.2530156 PMID:40619672	研究论文	本研究设计了一种最小逻辑门，用于编程益生菌Escherichia coli Nissle 1917以检测和治疗由两种细菌引起的肠道感染	设计了正交基因电路和'AND'门，实现了在两种病原体同时存在时的显著趋化和杀伤效果	研究仅在体外和小鼠模型中验证，尚未进行人体试验	开发一种预防和治疗双重细菌感染的方法	益生菌Escherichia coli Nissle 1917和两种病原体	合成生物学	肠道感染	基因电路设计	NA	NA	小鼠模型
25	2025-07-12	Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites 2025-Jul-11, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00356 PMID:40643567	研究论文	本研究开发了基于CRISPRi的植物细胞正交抑制系统，利用具有两个相同sgRNA结合位点的FMV 34S启动子合成变体	首次在植物细胞中利用FMV 34S启动子变体开发CRISPRi正交抑制系统，并验证了相同sgRNA结合位点比异源位点具有更高的抑制效率	研究仅基于瞬时转基因表达系统，未在稳定转化植物中进行验证	开发植物合成生物学工具箱中的基因表达精确调控系统	植物细胞中的基因表达调控系统	合成生物学	NA	CRISPRi、dCas9-SRDX融合蛋白、Cre/loxP RNA支架正交系统	NA	基因表达数据	33种34S启动子变体
26	2025-07-12	Advancing fungal phylogenetics: integrating modern sequencing, dark taxa discovery, and machine learning 2025-Jul-11, Archives of microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00203-025-04392-2 PMID:40643763	综述	本文综述了现代分子技术在真菌遗传学研究中的最新进展，包括DNA指纹识别、NGS和TGS等技术在物种鉴定、系统发育重建和疾病管理中的应用	整合了现代测序技术、暗分类群发现和机器学习算法，提出了解决真菌分类学和疾病管理中现存挑战的新方法	存在解决基因组内变异、调和基因树不一致性以及标准化大规模真菌种群研究流程的挑战	推进真菌诊断学，增强分类学清晰度，并在快速环境变化的时代减轻真菌疾病的社会经济影响	真菌遗传学、真菌多样性和致病性	生物信息学	真菌相关疾病	NGS, TGS, DNA指纹识别, 多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)	机器学习算法	基因组数据	NA
27	2025-07-12	Harnessing Synthetic Biology to Empower a Circular Plastics Economy 2025-Jul-10, Canadian journal of microbiology IF:1.8Q4 DOI:10.1139/cjm-2025-0053 PMID:40638940	review	本文综述了利用合成生物学和微生物群落工程技术降解和升级塑料废物的当前策略	探讨了合成生物学如何增强生物过程以可持续处理塑料废物并支持循环塑料经济	未提及具体实验数据或案例研究来验证这些策略的实际效果	推动生物技术解决方案在循环塑料经济中的应用	塑料废物	合成生物学	NA	微生物群落工程	NA	NA	NA
28	2025-07-12	Engineered Coenzyme A Biosynthesis and Butyrate Transporter Drives High-Efficient Butyrate Synthesis in Escherichia coli 2025-Jul-10, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.70018 PMID:40641096	研究论文	本研究通过工程化改造大肠杆菌的辅酶A生物合成和丁酸转运系统，实现了高效的丁酸合成	通过增强辅酶A生物合成和优化丁酸转运系统，显著提高了丁酸的产量和产率	研究仅限于大肠杆菌系统，未在其他微生物中验证	提高丁酸在大肠杆菌中的合成效率	大肠杆菌	代谢工程与合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	NA
29	2025-07-12	Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores 2025-Jul-09, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984 PMID:40403226	综述	本文综述了受自然界隐生现象启发，化学家设计和合成的'细胞壳'结构及其在单细胞纳米封装（SCNE）中的应用	通过SCNE技术赋予细胞外源性表型特征，展示了人工孢子在合成生物学、生物医学工程等领域的潜在应用	未提及具体实验数据或案例研究，主要集中于理论和技术综述	探索和开发人工孢子技术，以增强细胞的保护性和功能性	人工'细胞壳'结构	合成生物学、生物医学工程	NA	单细胞纳米封装（SCNE）	NA	NA	NA
30	2025-07-12	CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers 2025-Jul-09, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.00382-25 PMID:40434115	研究论文	开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默（CRISPRcosi）方法，用于对抗Lsr2样异源沉默蛋白	首次利用nuclease-deficient dCas酶对抗Lsr2样异源沉默蛋白，实现无需启动子工程的反沉默效果	在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中，反沉默效果因靶位点和链的不同而存在差异	研究基因表达调控新方法，应用于生物技术和合成生物学	Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2及其靶启动子	合成生物学	NA	CRISPR/dCas系统	NA	基因组转录组数据	多种放线菌菌株
31	2025-07-12	The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies 2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01795-9 PMID:40634759	综述	本文综述了急性髓系白血病（AML）的免疫逃逸机制及免疫治疗策略	探讨了免疫检查点抑制剂、疫苗及联合治疗策略在AML中的创新应用	面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性及缺乏预测性生物标志物等挑战	评估AML免疫治疗的机制、挑战及未来发展方向	急性髓系白血病（AML）及其免疫微环境	肿瘤免疫学	急性髓系白血病	免疫检查点抑制剂（ICIs）、树突状细胞融合疫苗、单细胞基因组学、AI	NA	NA	NA
32	2025-07-12	PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes 2025-Jul-08, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202509127 PMID:40626944	研究论文	本文提出了一种无需PCR的位点定向诱变方法，利用DNAzyme在重复序列上进行操作	开发了一种名为DANDA的新系统，通过单链DNA辅助双链DNA切口技术，扩展了DNAzyme在双链超螺旋质粒上的应用范围	未提及该方法在更复杂或更大规模DNA序列上的适用性	克服传统PCR方法在重复序列上位点定向诱变的局限性	含有重复序列的质粒	合成生物学	NA	DNAzyme介导的DNA切割	NA	DNA序列数据	未明确提及具体样本数量
33	2025-07-12	An artificial intelligence-based approach for identifying the proteins regulating liquid-liquid phase separation 2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf313 PMID:40632496	研究论文	本文提出了一种基于人工智能的方法来识别调控液-液相分离（LLPS）的蛋白质	使用ESM2_t36预训练蛋白质语言模型提取蛋白质序列的语义信息，并结合多层感知机分类器，显著优于传统序列方法	数据集中正样本（913）与负样本（6584）数量不平衡，可能影响模型性能	开发一种能够准确识别LLPS调控蛋白的人工智能工具	调控液-液相分离的蛋白质	生物信息学	NA	ESM2_t36预训练蛋白质语言模型，多层感知机分类器，SHAP解释方法	多层感知机（MLP）	蛋白质序列	913个正样本和6584个负样本的蛋白质序列
34	2025-07-12	Innovation in Swine Nutrition in China over the Past Decade 2025-Jun-24, The Journal of nutrition IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.tjnut.2025.06.009 PMID:40571101	综述	本文回顾了过去十年中国在猪营养学领域的创新进展，重点讨论了猪饲料行业现代化、营养需求分析、质量控制策略及可持续发展计划	系统总结了应对猪产业重大挑战的针对性策略，如精准饲喂、循环农业中的废弃物回收、霉菌毒素降解及抗生素替代品，并展望了合成生物学、人工智能等未来技术在猪营养学中的应用	未具体说明各项创新技术在实际生产中的推广应用效果及经济可行性	优化猪营养以提高饲料效率、动物福利和可持续实践，应对粮食安全和环境挑战	中国养猪业及饲料产业	动物营养学	NA	合成生物学、分子技术	NA	NA	NA
35	2025-07-12	Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment 2025-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202501918 PMID:40545445	研究论文	本文开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体，用于调节外源性植入物诱导的促炎因子	开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体，能够模拟天然细胞功能，调节生化微环境的稳态	未提及具体的临床应用效果或长期稳定性数据	设计并构建能够调节生化微环境稳态的治疗性脂质体，以促进组织再生	仿生脂质体及其在调节生化微环境中的应用	合成生物学与组织工程	NA	自组装技术、纳米酶活性调控	NA	NA	NA
36	2025-07-12	Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae 2025-Jan-30, FEMS yeast research IF:2.4Q3 DOI:10.1093/femsyr/foaf032 PMID:40577080	研究论文	本文描述了一种在酿酒酵母中通过CRISPR介导的交换或移除已整合表达盒的系统，将模块化原则扩展到菌株水平	开发了一种允许CRISPR介导的标准化交换或移除已整合表达盒的系统，提高了现有菌株的修改效率	未提及系统的广泛适用性或在不同菌株中的效率差异	提高酿酒酵母菌株构建的模块化和灵活性	酿酒酵母	合成生物学	NA	CRISPR (Cas9和Cas12a)	NA	NA	未明确提及具体样本数量，但测试了荧光蛋白表达盒的交换效率
37	2025-07-12	Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion 2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.01.23.634604 PMID:39896471	研究论文	本研究探索了利用GP1 PPSPX基序和内含肽介导的融合技术来工程化微藻细胞壁锚定蛋白及其受控释放	发现PPSPX基序对蛋白锚定至细胞壁的关键作用，并开发了pH敏感的内含肽介导的受控释放系统	研究主要针对微藻系统，在其他生物系统中的适用性尚待验证	开发蛋白定位和受控释放的创新工具，应用于合成生物学、工业生物技术和药物递送领域	微藻细胞壁锚定蛋白和塑料降解酶PHL7	合成生物学	NA	蛋白融合技术、内含肽介导的蛋白剪切	NA	蛋白定位数据、荧光动力学数据、Western blot数据	未明确说明具体样本数量，但包含多种构建体测试
38	2025-07-12	High-yield bioproduction of virus-free virus-like P4-EKORhE multi-lysin transducing particles as an antimicrobial gene therapeutic 2025, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2025.1561443 PMID:40636261	research paper	该研究描述了生物工程P4-EKORhE的构建及高产病毒样颗粒的方法，用于传递基因编码的抗菌剂	结合合成生物学和优化的上下游处理，实现了病毒样颗粒的高产（每毫升高达10个颗粒），并保持了抗菌剂的有效性	研究仅在纯细菌培养和噬菌体感染模型中测试了抗菌活性，未涉及更复杂的体内环境	开发高产病毒样颗粒的生物生产方法，用于传递基因编码的抗菌剂	生物工程P4-EKORhE病毒样颗粒及其抗菌活性	合成生物学	NA	合成生物学、优化的上下游处理	NA	NA	纯细菌培养和A549永生化人类上皮组织细胞共培养模型
39	2025-07-12	Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam 2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s42770-024-01454-3 PMID:38985434	研究论文	本研究从印度阿萨姆邦Pobitora野生动物保护区的森林根际土壤中分离出Streptomyces sp. PBR19，并评估其抗菌活性和生物合成潜力	发现一种可能为新分类单元的放线菌PBR19，具有显著的抗菌活性，并含有与抗生素合成相关的PKSII基因	研究仅针对部分ESKAPE病原体进行测试，未全面评估其抗菌谱	探索森林根际土壤中放线菌的抗菌潜力和生物合成能力	Streptomyces sp. PBR19及其代谢产物	微生物学	细菌感染	扫描电子显微镜(SEM)、基因测序、最小抑菌浓度(MIC)测定	NA	微生物学数据、基因序列数据	1株放线菌分离株(PBR19)及其代谢产物
40	2025-07-12	Engineering Synthetic Erythrocytes as Next-Generation Blood Substitutes 2024-Jul-10, Advanced functional materials IF:18.5Q1 DOI:10.1002/adfm.202315879 PMID:39386164	综述	本文综述了人工红细胞作为下一代血液替代品的研究进展	从材料工程角度探讨合成红细胞的设计与功能重建，提出合成工程化红细胞是最有前景的方法	未提及具体临床试验数据或规模化生产的具体障碍	解决全球血液短缺问题，开发安全可扩展的血液替代品	工程化人工红细胞（合成红细胞）	生物医学工程	NA	合成生物学、纳米技术、颗粒制备技术	NA	NA	NA