合成生物学相关文章
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当前共找到 5175 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-15 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-May-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 综述二萜合酶作为生物活性二萜类化合物合成的守门酶，为发现和工程化改造以实现高效合成提供资源 | 建立了包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库，并通过整合生物信息学分析阐明不同功能类别的催化机制、产物多样性和系统发育分布 | 未提及具体局限性 | 总结二萜类化合物的生物活性和应用，构建二萜合酶功能数据库，并探讨其在合成生物学中的发展方向 | 二萜合酶（diTPSs）以及代表性二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | 序列数据库 | 562个功能表征的二萜合酶 | NA | 微生物（如微生物细胞工厂） | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药，农业，化妆品，食品 |
| 62 | 2026-06-15 |
Valorizing renewable biomass into potential prebiotic oligosaccharides: Enzymatic, microbial, and synthetic biology strategies
2026-May-26, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134974
PMID:42203116
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综述 | 本文综述了利用酶工程、微生物工程和合成生物学策略将可再生生物质转化为潜在益生元低聚糖的最新进展 | 系统整合了从海洋和陆地生物质资源生产多种新型低聚糖（如新琼寡糖、纤维寡糖等）的酶法和微生物技术，并强调了GRAS级微生物宿主合成人乳低聚糖的生物制造途径 | 未详细讨论大规模生产的经济可行性和下游纯化挑战 | 总结可再生生物质转化为益生元低聚糖的生物技术方法及其在个性化营养和微生物组靶向治疗中的应用潜力 | 海洋大型藻类、木质纤维素残渣、富含果胶作物等可再生生物质 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、微生物共培养 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | GRAS级微生物宿主 | 微生物生物合成途径（如人乳寡糖合成） | 食品、医学 |
| 63 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展，为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 64 | 2026-06-15 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 系统综述沙棘作为未来食品的生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合合成生物学（CRISPR/Cas9代谢工程与精密发酵）、纳米递送技术和个性化营养策略，构建沙棘从传统药用到未来智能食品的转化框架 | 未涉及具体实验验证数据，缺乏不同递送系统效率的定量比较，未讨论沙棘全产业链的技术经济可行性 | 探索沙棘生物活性成分的应用潜力，提出合成生物与食品工程相结合的产业化路径 | 沙棘中的黄酮类、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖等生物活性成分 | 合成生物学, 食品工程 | NA | CRISPR/Cas9介导代谢工程, 精密发酵, 纳米封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（用于精密发酵的工程菌株） | 代谢工程通路优化、营养递送系统（封装、黏膜黏附平台） | 食品, 医药 |
| 65 | 2026-06-15 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 综述了超声响应工程菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制与应用 | 系统整合了超声调控与工程菌微生物治疗相结合的创新策略，并详细阐述其作用机制及最新研究进展 | 未明确讨论该组合策略在临床转化中面临的挑战或潜在风险 | 总结工程菌在肿瘤治疗中的直接修饰方法、作用机制及应用策略，并重点阐述超声与工程菌联合应用的相互作用机制和研究进展 | 超声响应工程菌及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学、纳米科学、微生物治疗 | 肿瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 超声响应智能递药系统、生物活性分子调控回路 | 医学 |
| 66 | 2026-06-15 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调节c-di-GMP信号增强氧化亚铁硫杆菌的生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过调控全局调控分子c-di-GMP同时增强生物浸出效率和重金属耐受性，克服了传统单性状改造的局限性 | NA | 探索通过工程化c-di-GMP信号通路来优化生物浸出微生物的多个关键性状 | 氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans） | 合成生物学 | NA | c-di-GMP调控技术 | NA | 转录组数据 | 三种工程菌株S-222、S-306和S-651 | NA | 氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans） | 通过过表达鸟苷酸环化酶基因调控c-di-GMP信号通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 67 | 2026-06-15 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 该论文系统综述了通过仿生构建策略生产三磷酸腺苷的人工细胞的三种方法及其在生物医学和能源领域的应用 | 创新性地系统整合了三种构建能量自给人工细胞的策略，包括基于质子泵和ATP酶的组装、直接封装细胞器以及非经典系统，并探讨了其催化效率和生物分子封装能力 | 未明确提及当前构建策略在稳定性、可扩展性和成本效益方面的具体挑战 | 探索人工细胞中三磷酸腺苷合成的三种构建策略的最新进展，并推动从基础研究向实际应用的转化 | 人工细胞中的三磷酸腺苷合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成途径模拟 | 医学, 环境, 材料 |
| 68 | 2026-06-15 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
|
研究论文 | 开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法，用于实现植物合成生物学常见实验操作的自动化 | 通过表格化输入无需编程经验即可操作，降低了自动化门槛，并提供了从简单到复杂操作的端到端分子克隆流程 | 依赖于Opentrons OT-2机器人平台，且验证方案可能仍需针对特定实验条件进行微调 | 提高植物合成生物学实验中自动化技术的可及性和易用性 | 植物分子生物学和合成生物学相关的实验流程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
|
研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM，用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束，使模型仅从同义选项中预测掩码密码子，从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义，捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型，推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 70 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
|
研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型，用于设计原核生物顺式调控元件（CREs），无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs，从17000个原核生物基因组预训练，零样本预测启动子强度相关性显著提升（平均Spearman相关从0.27提高到0.50），参数减少10^3倍，并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台，用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件（CREs） | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |
| 71 | 2026-06-15 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 系统综述精准发酵技术用于生产新型食品及其可持续应用的研究进展 | 首次在统一框架内整合微生物菌株设计、生物过程工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度，填补了以往产品导向或生物体导向综述的空白 | 存在高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度低及监管不确定性等挑战 | 系统分析精准发酵在可持续食品生产中的进展与挑战 | 精准发酵生产新型食品的相关研究和案例 | NA | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | 37项研究纳入综述 | 代谢途径工程 | 微生物 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 72 | 2026-06-15 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-01-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
|
综述 | 综述机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展 | 系统总结了基于机器学习的全局和局部模型在酶动力学参数预测中的应用，并提出了利用高通量数据生成和半监督学习来克服数据稀缺问题的新机遇 | 数据稀缺仍然是这些模型的主要限制 | 为利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围提供路线图 | 酶动力学参数（kcat、Km、kcat/Km等） | 机器学习 | NA | NA | 机器学习模型（全局模型和局部模型） | 酶序列和动力学参数数据 | NA | NA | NA | NA | 酶工程、代谢建模、合成生物学 |
| 73 | 2026-06-15 |
Cell-free systems for expression of transmembrane protein
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.001
PMID:41688133
|
综述 | 讨论无细胞蛋白合成系统在表达跨膜蛋白中的基本原理、进展和应用 | 全面比较原核和真核无细胞平台在跨膜蛋白生产中的优势，并深入探讨膜模拟物、折叠伴侣、非标准氨基酸等生化方法以及混合系统、微流控反应器和自动化等技术创新 | 未明确提及具体限制，但可推断无细胞系统在维持跨膜蛋白正确拓扑结构和功能性重构方面仍面临挑战 | 系统阐述无细胞蛋白合成在跨膜蛋白表达中的潜力和应用前景 | 跨膜蛋白及无细胞蛋白合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | 无细胞蛋白合成系统 | 原核生物、真核生物 | 无细胞表达系统用于跨膜蛋白生产 | 药物发现, 结构生物学, 生物传感器开发, 下一代生物制品 |
| 74 | 2026-06-15 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
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综述 | 全面评估无细胞系统面临的挑战与机遇 | 系统总结了无细胞系统在医学应用中的最新进展，并深入探讨了技术、伦理、环境和社会平衡问题 | 未提供具体实验数据或案例验证，更多为观点性总结 | 评估无细胞系统的技术挑战与未来机遇 | 无细胞系统技术及其在医学领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 疫苗生产, 基因表达研究, 即时诊断 |
| 75 | 2026-06-15 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-12, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
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综述 | 综合评价多组学整合的原则、方法及应用，强调其在系统生物学中的范式转变 | 利用人工智能与单细胞组学等前沿技术解决多组学数据的高维度、异质性和特定上下文扰动等挑战 | 数据异质性、可解释性不足等当前限制 | 系统生物学中多组学整合的原则、方法及应用 | 癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的多组学数据 | 机器学习 | 癌症 | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | 机器学习模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 76 | 2026-06-15 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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综述 | 提出理解和预测土壤微生物群落中基因转移的路线图 | 针对土壤复杂异质性环境下合成DNA工程菌的基因转移预测难题，提出构建土壤标准、利用新兴技术测量宿主范围等系统策略，并强调生物防控措施的责任性社区参与 | 未提供具体实验数据或验证结果，主要基于现有知识缺口提出理论框架 | 建立环境特异性模型以预测工程微生物在土壤中的基因转移风险，推动安全合成生物学应用 | 土壤微生物群落中的工程微生物及天然微生物 | 合成生物学 | NA | 合成DNA技术 | 群落尺度环境特异性模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 土壤微生物 | NA | 环境, 农业, 能源, 食品 |
| 77 | 2026-06-15 |
SUPREM: an engineered non-site-specific m6A RNA methyltransferase with highly improved efficiency
2024-11-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae887
PMID:39417589
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研究论文 | 通过祖先序列重建改造细菌DNA甲基转移酶EcoGII，开发出一种高效、非位点特异性的m6A RNA甲基转移酶SUPREM | 首次利用祖先序列重建方法改造非特异性RNA甲基转移酶，显著提升其表达水平、热稳定性和甲基化活性，并鉴定出关键残基 | 未提及SUPREM在体内RNA甲基化修饰的特异性及潜在脱靶效应 | 开发高效的非位点特异性RNA甲基转移酶工具，用于体内RNA甲基化修饰研究 | 细菌DNA甲基转移酶EcoGII及其改造变体SUPREM | 合成生物学 | NA | 纳米孔直接RNA测序, LC-MS/MS, 免疫荧光染色 | NA | RNA序列数据, 质谱数据, 免疫荧光图像 | NA | 祖先序列重建 | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 生物学 |
| 78 | 2026-06-15 |
Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules
2024-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae742
PMID:39193902
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法，利用机器学习定义的共调控基因群作为设计元件，以实现细胞功能的可预测重编程 | 提出基于iModulon的工程策略，将机器学习定义的共调控基因群作为设计元件，通过发现未知iModulon、增强特定iModulon活性、重新平衡iModulon活性水平和基于iModulon的基因注释，实现细胞功能的系统性和可预测重编程 | 该方法可能仍受限于上下文依赖性能和复杂电路-宿主相互作用，且未对不同宿主系统的通用性进行讨论 | 开发一种基于iModulon的工程方法，提高合成生物学中细胞功能重编程的可扩展性和可预测性 | 细菌细胞中的共调控基因群（iModulon） | 机器学习 | NA | 机器学习、iModulon分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 细菌 | iModulon调控模块（包括蛋白生产、耐热性、果糖利用、渗透胁迫耐受、氧化胁迫耐受、自然感受态激活） | 工业生物技术、医学 |
| 79 | 2026-06-15 |
Development of a tightly regulated copper-inducible transient gene expression system in Nicotiana benthamiana incorporating a suicide exon and Cre recombinase
2024-10, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20021
PMID:39081031
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研究论文 | 开发了一种在本氏烟中利用自杀外显子和Cre重组酶的严格调控铜诱导瞬时基因表达系统 | 通过结合自杀外显子和Cre/LoxP系统增强了铜诱导系统的调控严谨性，有效控制了超敏细胞死亡反应 | 原始铜诱导系统在调控某些测试的超敏细胞死亡反应时不够严谨 | 开发一个能严格调控本氏烟转基因表达的化学诱导系统 | 本氏烟（Nicotiana benthamiana） | 功能基因组学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA | MoClo合成生物学方法 | 本氏烟（Nicotiana benthamiana） | 铜诱导系统结合自杀外显子HyP5SM/OsL5和Cre/LoxP调控元件 | 农业 |
| 80 | 2026-06-15 |
Generation of hypoxia-sensing chimeric antigen receptor T cells
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100723
PMID:34401788
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研究论文 | 生成缺氧感应嵌合抗原受体T细胞的协议 | 利用实体瘤中的缺氧条件限制CAR表达于肿瘤微环境，减少脱靶毒性和紧张信号 | NA | 开发用于实体瘤治疗的缺氧感应CAR-T细胞 | 缺氧感应嵌合抗原受体T细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 缺氧感应嵌合抗原受体 | 医学 |