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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-11 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining Dose, Exposure, and Control for Living Drug Carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
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综述 | 介绍药效微生物动力学作为量化活体药物递送系统的框架,重新定义剂量、暴露和控制的概念 | 首次提出药效微生物动力学框架,整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理,建立针对活体治疗剂的定量递送科学体系 | 框架仍处于理论阶段,实际应用中的边界条件和有效性需进一步验证 | 建立量化活体药物递送系统的框架以替代传统药代动力学/药效学模型 | 活体药物载体,包括益生菌、工程微生物疗法和活体生物治疗产品 | NA | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 同步裂解细菌肿瘤疗法 | 医学 |
| 122 | 2026-06-11 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的概念及其潜在应用 | 提出将RNA折纸作为可编程支架用于构建仿生细胞骨架网络,利用RNA的共转录折叠、三级相互作用及与细胞机器交互等独特优势 | 体内稳定性和有效递送仍是主要挑战 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础理解并启发未来发展 | RNA折纸纳米管及其在人工细胞骨架中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 纳米管结构,模仿微管和肌动蛋白丝 | 纳米技术, 合成生物学, 医学 |
| 123 | 2026-06-11 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 综述通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展的研究进展 | 系统总结了通过代谢工程在细胞内合成非标准氨基酸以克服传统依赖外源添加限制的创新策略 | 未具体提及局限性,但可推断当前方法可能面临代谢途径效率、宿主兼容性等挑战 | 探讨代谢工程与遗传密码扩展结合在合成生物学中的应用前景 | 遗传密码扩展技术及非标准氨基酸的生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基础研究、应用研究 |
| 124 | 2026-06-11 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 综述利用细菌分泌系统改造共生或益生大肠杆菌,设计活体治疗药物以定向递送治疗蛋白 | 系统比较了不同细菌分泌系统(包括源自病原体的系统)用于工程菌递送治疗性蛋白的优缺点,并以炎症性肠病为例展示了合成生物学在解决治疗递送挑战中的应用 | 未提及具体实验验证或临床转化中的数据,可能停留在概念综述层面 | 探讨通过工程化细菌分泌系统实现治疗蛋白定向递送,克服传统给药方式的系统性副作用 | 共生和益生大肠杆菌及其改造的分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 分泌系统(如源自病原体的分泌装置)与转录调控通路 | 医学 |
| 125 | 2026-06-11 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了利用光合细菌Rhodobacter sphaeroides高效生物合成辅酶Q10和卟啉类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了R. sphaeroides作为底盘菌株的代谢灵活性、内源调控网络及工程改造方法,突出其在辅酶Q10和卟啉生物合成中的多功能性和鲁棒性 | 未涉及多种高价值萜类与氢气的具体产量优化数据及实际工业化应用的经济可行性评估 | 评述R. sphaeroides的代谢特征、天然调控网络和工程化改造策略,评估其作为合成生物学平台菌株在工业生物生产中的应用潜力 | 紫色非硫光合细菌Rhodobacter sphaeroides | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢工程、发酵工程 | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径优化、前体供应增强、氧化还原与能量平衡调控、全局调控系统操纵 | 工业生物技术、医药 |
| 126 | 2026-06-11 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
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研究论文 | 在酵母中构建了从巴卡亭III合成紫杉醇的人工生物合成途径 | 首次在酵母中构建了仅需三个酶促步骤即可将巴卡亭III转化为紫杉醇的人工途径,并展示了β-苯丙氨酰辅酶A连接酶(PCLs)的广泛底物范围 | 需要进一步系统代谢工程以克服多个瓶颈,当前知识尚不足以实现规模化生物技术生产 | 实现紫杉醇的可持续生物合成,提供替代传统昂贵半合成方法的新策略 | 酵母中人工紫杉醇生物合成途径的构建和优化 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程 | 结构-活性分析 | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母(S. cerevisiae) | 人工紫杉醇生物合成途径(包含β-苯丙氨酰辅酶A连接酶和巴卡亭III:3-氨基-3-苯丙酰转移酶) | 医药 |
| 127 | 2026-06-11 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-05-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
|
综述 | 综述了爆炸物与微生物相互作用中的降解动力学,涵盖降解途径、关键酶及最新研究进展 | 将传统降解动力学与合成生物学工具(如CRISPR/Cas系统)结合,提出通过工程化微生物菌株提升降解活性 | 未详细讨论工程菌株的实际应用效果及环境影响评估 | 提供爆炸物降解动力学的研究现状概述 | 微生物(细菌和真菌)与爆炸物(如硝胺、硝基取代芳香族化合物、苦味酸、TETRYL、HEXYL、RDX等)的相互作用 | 环境科学 | NA | 降解动力学分析、生物组学(Bio-omics)、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 微生物(细菌、真菌) | NA | 环境科学 |
| 128 | 2026-06-11 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
|
综述 | 综述人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测、环境监测和抗菌素耐药性分析 | 首次系统整合AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍及监管考虑,涵盖深度学习(如CNN)和集成模型在多传感器数据集中的应用 | 未提供具体实验数据或性能比较,缺乏对混合系统长期稳定性和临床验证的深入讨论 | 分析AI-微生物混合生物传感器作为下一代病原体检测和适应性生物监测平台的关键方面 | AI-微生物混合生物传感器系统 | 机器学习, 数字病理学 | 感染性疾病(病原体相关) | 卷积神经网络, 集成模型, 电化学阻抗谱, 拉曼光谱, 高光谱显微镜 | CNN, 集成模型 | 多传感器数据集(电化学阻抗、拉曼光谱、高光谱显微镜图像) | NA | CRISPR(CRISPR介导的传感) | 微生物(未具体指定) | 生物传感器电路(合成生物学相关) | 医学, 环境监测 |
| 129 | 2026-06-11 |
From fundamental understanding to engineering of carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
|
综述 | 本文综述了羧基体的分子机制及其在合成生物学和生物工程中的应用潜力 | 强调了羧基体作为可编程模块在提高碳固定效率和改造为多功能纳米材料方面的创新应用 | 精确控制壳通透性、高效封装货物及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 总结羧基体结构与功能的理解,并探索其工程化改造用于生物技术应用 | 羧基体及其组分Rubisco和碳酸酐酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 130 | 2026-06-11 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 综述了核碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用,涵盖其催化原理、三种主要工作模式及未来发展方向 | 系统总结了核碱基编辑酶在生物传感和成像中的三种应用模式(碱基转换、修饰/去修饰、碱基擦除),并强调其高特异性、高效扩增和生理兼容性 | 讨论该领域面临的挑战,包括酶工程、递送策略和多回路集成的改进需求 | 概述核碱基编辑酶作为可编程分子工具在生物传感和生物成像中的应用现状与前景 | 核碱基编辑酶,包括脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶和DNA糖基化酶 | 数字病理学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器, 分子回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 131 | 2026-06-11 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
|
综述 | 文章综合了PANoptosis分子架构的最新进展,并提出了将细胞死亡机制与临床转化相结合的药物发现框架 | 提出了临床极性与时间模型,区分了诱导或抑制PANoptosis的不同疾病情境,并探索了从共价GSDMD拮抗剂到合成生物学方法的药物发现前沿 | 未明确说明 | 将PANoptosis作为治疗靶点和辅助框架,通过选择性调控改善感染、炎症、肿瘤和神经退行性疾病的治疗 | PANoptosis相关的细胞死亡机制、药物干预策略及生物标志物 | 机器学习 | 感染性疾病、炎症性疾病、肿瘤、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 132 | 2026-06-11 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
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综述 | 综述真菌聚酮合酶在异源表达和工程化改造中的关键方面,包括宿主选择和工程策略 | 系统总结了真菌PKS工程化的两个关键设计原则(宿主选择和工程策略),并展望了结合计算工具的未来方向 | 未详细讨论具体实验数据和定量比较不同工程策略的优劣 | 总结真菌聚酮合酶工程化的当前进展和未来方向 | 真菌聚酮合酶(PKS)及其异源表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 133 | 2026-06-11 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
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综述 | 综述了利用代谢工程和合成生物学策略实现己二酸微生物合成的现状与未来方向 | 综述了己二酸生物合成的代谢工程和合成生物学策略,包括先进的代谢工程工具和途径设计,以克服原料利用率低、菌株转化效率低、发酵过程复杂、下游分离成本高等挑战 | 产业化可行的己二酸生物合成技术仍受限于原料利用率、转化效率、发酵工艺和分离成本等问题 | 综述己二酸微生物合成的研究现状,为商业化可用的生物基己二酸生产提供研究方向和指导 | 己二酸生物合成途径、代谢工程策略、细胞工厂构建、发酵工艺和下游分离技术 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 代谢工程工具 | 微生物 | 己二酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 134 | 2026-06-11 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 通过重新定位前体肽中的前导序列,研究graspetide生物合成中的底物选择性修饰和嵌合RiPP产物的生成 | 将graspetide前体肽的N端前导序列重新定位至C端,并证明修饰酶ThfB仍能保留底物选择性,同时利用双前导序列(N端和C端)生成同时受lasso肽和graspetide家族酶修饰的嵌合RiPP产物,扩展了RiPP的结构多样性 | 重新定位前导序列后,酶促修饰速率降低约2倍,可能影响整体效率 | 探索前导序列重新定位对RiPP生物合成中酶修饰的影响,并生成具有新翻译后修饰的机械互锁肽产物 | fuscimiditide前体肽及其修饰酶ThfB | 合成生物学 | NA | RiPP生物合成、前导序列重新定位、嵌合酶修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | 双前导序列引导的嵌合RiPP生物合成通路 | 合成生物学、生物技术 |
| 135 | 2026-06-11 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 全面分析鸟氨酸脂质及其他酰氧基酰基氨基脂质的最新研究进展,包括其合成途径、功能修饰及在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析编码鸟氨酸脂质合成酶的基因在细菌中的分类分布,并总结了新型OL合成酶、修饰酶及其结构的发现,以及真核生物对OL等氨基脂质的感知机制 | 未提供具体实验数据验证预测的基因分布,部分机制如OL与TLR4相互作用的详细分子机制尚不明确 | 综述鸟氨酸脂质及其类似物在细菌中的合成、功能、修饰及在合成生物学中的应用前景 | 鸟氨酸脂质及其类似酰氧基酰基氨基脂质 | 分子生物学 | NA | 基因序列分析, 生物信息学 | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 136 | 2026-06-11 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
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研究论文 | 通过多维确定性筛选设计,优化低成本的细胞无细胞基因表达试剂配方,实现高产且可重复的蛋白质生产 | 首次采用多维确定性筛选设计从1231种配方中优选出仅含12种成分的简化试剂配方,大幅降低成本并提高产量,同时验证了配方在不同条件下的稳健性 | 未明确说明,但可能包括对特定蛋白质类型的适用性限制或大规模生产时的稳定性挑战 | 优化细胞无细胞基因表达系统的试剂配方,降低成本和复杂性,提高可重复性和产量 | 细胞无细胞基因表达系统中的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 细胞无细胞基因表达 | NA | 配方组成数据及蛋白产量数据 | 1,231种不同试剂配方,以及超过20种不同蛋白质的合成测试 | NA | 大肠杆菌细胞裂解液 | 无细胞基因表达系统(用于蛋白质合成) | 生物技术,合成生物学,蛋白质生产 |
| 137 | 2026-06-11 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 该文章综述了通过工程化酵母可持续生产色氨酸衍生芳香族化合物的最新进展 | 系统总结了利用酵母细胞工厂生产色氨酸衍生物的最新策略与合成生物学工具 | 讨论了实现高效、可扩展和经济可行的酵母生物合成所面临的挑战 | 推动酵母在可持续生物生产中替代传统化学合成以应对气候变化和资源枯竭 | 酵母细胞工厂和色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 酵母 | 色氨酸代谢通路 | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药工业 |
| 138 | 2026-06-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
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研究论文 | 表征具有末端冗余基因组的噬菌体AbpL及其对耐药鲍曼不动杆菌感染的治疗潜力 | 首次分离并全面表征了具有400 bp末端冗余的噬菌体AbpL,评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌的体内外疗效,并作为合成生物学工程候选平台 | 主要依赖小鼠模型,未涉及人体临床试验或长期安全性评估 | 评估噬菌体AbpL作为替代抗生素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌感染的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)和噬菌体AbpL | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 实验数据(形态、生长特性、基因组、治疗结果) | 52%的临床MDR-AB分离株和40只小鼠(脓毒症模型) | NA | NA | NA | 医学 |
| 139 | 2026-06-10 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 综述了人工智能驱动的多组学与表型组学整合闭环框架,用于系统性的抗逆作物工程 | 提出从边缘到云的闭环框架,融合多组学、实时表型组学和合成生物学,利用Transformer和图神经网络解码基因型-环境-管理互作的非线性动力学,并从被动预测转向主动设计,通过生成式AI加速设计-构建-测试-学习循环 | 未明确讨论具体实施中的计算资源需求、数据整合标准缺失以及实地验证的潜在挑战 | 系统性地将作物改良转变为可预测的工程学科,以应对气候变化下的粮食安全挑战 | 作物基因型、表型及环境互作系统 | 机器学习 | NA | NA | Transformer架构、图神经网络、生成式AI、基础模型 | 多组学数据、表型组学数据 | NA | 合成生物学、基因电路设计 | 作物 | 抗逆蛋白和基因电路 | 农业 |
| 140 | 2026-06-10 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 综述巨噬细胞通过表型转换重塑细胞外基质结构及其作为治疗靶点的潜力 | 系统整合了巨噬细胞发育起源、组织特异性表型异质性及其在细胞外基质重塑中的作用,并提出了基于合成生物学和AI辅助生物材料的智能治疗策略 | 在实现时空精确调控和平衡修复与纤维化结局方面仍存在挑战 | 探讨巨噬细胞通过表型转换在组织稳态维持中的作用机制及治疗潜力 | 巨噬细胞及其在组织稳态、细胞外基质重塑、免疫监视中的作用 | 机器学, 合成生物学 | 纤维化疾病, 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 巨噬细胞 | 智能治疗回路 | 医学 |