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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-16 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
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研究论文 | 基于工程化益生菌EcN开发模块化程序性策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,保护抗生素暴露后机体免受铜绿假单胞菌感染 | 首次将丁酸过度合成与抗原展示外膜囊泡释放功能整合于单一益生菌平台,实现代谢免疫协同保护 | 仅在抗生素暴露小鼠模型中验证,尚未在临床样本或复杂微生物群落中测试 | 开发替代抗生素依赖的感染控制新策略 | 抗生素暴露后的小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染性疾病 | 外膜囊泡工程、丁酸代谢工程 | NA | 动物实验数据 | 抗生素暴露后小鼠模型(具体数量未说明) | 合成生物学菌株构建 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸代谢通路(丁酸过度合成)及抗原展示回路(外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原) | 医学 |
| 42 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
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研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 43 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关,实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关,通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性,并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性,且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关,用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关,包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 44 | 2026-06-16 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
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研究论文 | 利用体外合成生物学平台超快速高滴度生产海藻糖-6-磷酸 | 设计并验证了一条不含辅酶的新型最小酶途径,避免了对ATP或UDP等昂贵辅酶的依赖,实现了海藻糖-6-磷酸的高效生物制造 | 研究未涉及大规模工业应用的长期稳定性或经济可行性评估 | 开发一种可扩展且成本竞争力的体外生物制造方法用于海藻糖-6-磷酸的生产 | 海藻糖-6-磷酸的体外酶催化合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶学优化、生物反应器放大 | NA | 实验数据(产量、产率等) | NA | 体外合成生物学平台 | NA | 三酶级联途径(包含麦芽糖磷酸化酶、海藻糖-6-磷酸磷酸化酶和多磷酸葡萄糖激酶) | 农业 |
| 45 | 2026-06-16 |
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11858-z
PMID:42033527
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综述 | 主要探讨了瘤内菌群在调节肿瘤微环境中的作用及其作为临床干预靶点的潜力 | 系统总结了瘤内菌群通过多种机制促进肿瘤进展和影响治疗反应的研究进展,并提出了基于菌群-微环境相互作用的创新干预策略 | 瘤内菌群的时空动态变化尚未完全阐明,其与宿主细胞的机制相互作用需要进一步研究,临床转化面临安全性和有效性挑战 | 解码和利用瘤内菌群以改善肿瘤治疗 | 瘤内菌群及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 多种癌症 | 空间多组学,合成生物学,纳米技术 | NA | NA | NA | 工程菌,噬菌体疗法,细菌细胞外囊泡 | NA | NA | 医学 |
| 46 | 2026-06-16 |
Progress in cell-based immunotherapies for solid tumors
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05092-z
PMID:42033573
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综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体肿瘤治疗中的进展,包括CAR-T、NK细胞和TCR-T等疗法 | 全面分析了多种细胞免疫疗法在实体瘤应用中面临的主要障碍和未来突破方向 | 未提供具体的实验数据或比较分析,仅为文献综述 | 总结细胞免疫疗法在实体瘤中的进展、挑战和未来方向 | 实体瘤的细胞免疫疗法 | 数字病理学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 47 | 2026-06-16 |
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04975-1
PMID:42033624
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综述 | 系统综述利用微生物细胞工厂合成稀有糖的生物合成策略,重点关注代谢工程、酶工程和发酵过程优化 | 全面总结了多种代表性稀有糖(包括阿洛酮糖、塔格糖、阿洛糖等)的生理功能与应用,并系统梳理了多层面工程策略的整合进展 | 未对具体工程策略的定量比较和经济性评估进行深入分析 | 为稀有糖的可持续工业化生产提供工程策略指导 | 稀有糖(D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖) | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 酶工程, 生物催化, 发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 稀有糖生物合成途径 | 食品, 医药, 健康产业 |
| 48 | 2026-06-16 |
Gene Exchange Mechanisms in Natural and Engineered Probiotics Within the Human Gut Implications for Antibiotic Resistance and Metabolic Modulation
2026-Apr-22, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11029-3
PMID:42020676
|
综述 | 批判性审视自然与工程益生菌在人体肠道内通过水平基因转移传播抗生素抗性及调节代谢的机制与意义 | 综合论述益生菌基因交换的双重性,既强调益生特性传递也警示抗性基因扩散风险,并提出基于情境的风险评估框架 | 未提供具体实验数据验证风险,主要基于文献综合分析 | 探讨人体肠道中自然与工程益生菌的基因交换机制及其对抗生素抗性传播和代谢调节的影响 | 人体肠道微生物组中的自然益生菌和工程益生菌 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 宏基因组学、微生物生态学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 染色体整合、自杀开关、营养缺陷型、正交电路设计 | 肠道微生物(未特指具体宿主) | 生物遏制电路(包括自杀开关、正交电路) | 医学、农业 |
| 49 | 2026-06-16 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
|
研究论文 | 利用合成生物学在酿酒酵母中实现bulnesol和elemol的可持续生产 | 首次在体内证明pH对萜烯合酶产物谱的影响,并通过代谢工程优化前体和辅因子供应,无需半乳糖诱导剂 | NA | 实现bulnesol和elemol的可持续微生物生产 | Bulnesia sarmentoi树心材中的guaiac油及其主要成分bulnesol | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) | 萜类合成途径(bulnesol/elemol生物合成) | 工业生物技术, 可持续化学 |
| 50 | 2026-06-16 |
Advances, opportunities, and challenges in microbial community construction: from environmental remediation to biomanufacturing
2026-Apr-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04867-w
PMID:41944847
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综述 | 综述人工微生物群落构建从环境修复到生物制造的进展、机遇与挑战 | 首次系统整合DBTL框架与多组学技术及AI驱动动态建模用于优化微生物群落性能 | 尚未详细讨论自动化设备开发和标准化安全框架的具体实施细节 | 探索人工微生物群落构建在环境修复和生物制造中的应用潜力 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | NA | 多组学技术、DBTL框架、AI动态建模 | AI动态模型 | 多组学数据 | NA | 合成生物学工具 | 多种微生物 | 定制化微生物群落互作回路 | 环境修复, 生物制造 |
| 51 | 2026-06-16 |
Marine Antimicrobial Peptides: From Ocean Biodiversity to Genome Mining, Multi-Omics Discovery, and Biotechnological Innovation in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2026-Apr-07, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10959-2
PMID:41944926
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综述 | 从海洋生物多样性到基因组挖掘、多组学发现和生物技术创新,全面探讨海洋抗菌肽在应对抗菌素耐药性中的应用 | 综合海洋生物多样性与现代生物技术工具(如组学发现、重组表达系统、肽工程和纳米递送平台)来开发海洋抗菌肽,并提出将海洋AMP应用于生物医药、水产养殖和工业生物技术等领域的创新策略 | 海洋AMP在稳定性、成本和递送方面仍存在挑战 | 综述海洋来源抗菌肽的多样性、类型、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的生物技术创新应用 | 海洋来源的抗菌肽(AMPs) | 数字病理学 | 抗菌素耐药性 | 多组学发现、重组表达系统、肽工程、纳米递送平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌 | 代谢通路 | 生物医药, 水产养殖, 工业生物技术 |
| 52 | 2026-06-16 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
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研究论文 | 开发并验证了一种基于课程的本科研经历(CURE),通过病毒载体快速筛选导向RNA(gRNA)效率,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 创新性地将CURE模式应用于植物合成生物学,利用病毒递送gRNA实现高通量快速筛选,解决植物转化周期长的难题 | 未明确说明局限性 | 开发适用于植物合成生物学的CURE框架,快速筛选靶向Cas9转录抑制因子的gRNA | 本科学员及三个基因的启动子区域 | 数字病理学 | NA | 病毒载体递送gRNA, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 12个新gRNA,稳定转基因系 | CRISPR-Cas9 | 植物 | Cas9转录抑制因子回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 53 | 2026-06-15 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了工程化大肠杆菌用于高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的最新进展,并强调了增强其作为可持续生物塑料生产底盘的新兴策略 | 系统总结了合成生物学和代谢工程在大肠杆菌中优化前体供应、增强还原力、微调途径表达等策略,特别是工程化糖酵解途径、引入还原性甘氨酸和苏氨酸旁路路径、删除竞争途径、表达phasin、优化启动子和辅因子再生策略的协同作用 | NA | 综述工程化大肠杆菌高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的研究进展,并展望其作为可持续生物塑料生产平台的未来前景 | 大肠杆菌工程化菌株用于聚(3-羟基丁酸酯)生产 | 合成生物学,代谢工程 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 聚(3-羟基丁酸酯)生物合成途径,包括前体优化、辅因子再生等代谢路径工程 | 工业生物技术,环境,材料 |
| 54 | 2026-06-15 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
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综述 | 文章综述了从天然生物聚合物到工程蛋白支架,再到细菌微区室等蛋白质基支架在酶固定化中的应用进展 | 采用分层次视角,从天然生物聚合物支架逐步过渡到工程蛋白支架,并最终聚焦细菌微区室作为新兴类细胞器平台的潜力,强调其空间精度和选择性通透性 | 未详细讨论传统载体的某些优势,如成本效益和工业适用性,且对细菌微区室的实际大规模应用挑战提及较少 | 探讨蛋白质基支架在酶固定化中的结构多样性、功能特性及其在生物催化中的应用前景 | 天然生物聚合物支架、工程蛋白支架、细菌微区室等蛋白质基支架系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联路径、代谢途径设计 | 工业生物技术、生物医学 |
| 55 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术,通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增,通过多序列检测显著减少假阳性,并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及,但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器,适用于即时检测场景 | 核酸序列(DNA和RNA)的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 56 | 2026-06-15 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述转录因子作为第三代核心传感元件在食品污染物低成本、现场快速检测技术中的应用进展 | 提出近端突变策略和与人工智能辅助分析相结合的系统优化方法,以提升转录因子传感器性能 | 仍面临识别元件工程化、信号转导集成及实际样本复杂性等挑战 | 综述转录因子在食品安全检测中的传感应用及工程优化策略 | 转录因子及其DNA结合位点 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 生物传感器(转录因子作为识别元件) | 食品, 环境 |
| 57 | 2026-06-15 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-09, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
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综述 | 本文综述了ecDHFR去稳定化结构域系统通过配体诱导稳定实现蛋白质稳定性条件控制的机制、性能及优化方法 | 系统总结了ecDHFR-DD系统在不同生物体中的跨物种应用优势,并探讨了其在功能基因组学、合成生物学及生物医学等新兴领域的潜力,同时首次提出在害虫和病媒管理中的应用前景 | 未深入比较该系统与DNA/RNA调控系统的长期稳定性及在复杂多细胞生物体内的脱靶效应 | 综合评估ecDHFR-DD系统的机制、性能及优化策略,并拓展其应用领域 | ecDHFR去稳定化结构域(DD)系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质稳定性调控 | NA | NA | NA | NA | 酵母、无脊椎动物模型、哺乳动物细胞 | 配体诱导的蛋白质稳定化调控回路 | 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫和病媒管理 |
| 58 | 2026-06-15 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架,测试基因组语言模型在进化上不可能序列中对功能突变的理解能力 | 首次引入Nullsettes框架评估gLMs对合成表达盒中功能突变的理解,揭示模型依赖进化模式匹配而非机制性理解的局限 | 研究仅关注特定类型的合成表达盒,未涵盖所有可能的序列功能;且仅测试了LOF突变,未涉及其他突变类型 | 评估基因组语言模型对DNA功能的理解能力,而非简单的模式记忆 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 自然语言处理 | NA | NGS | 基因组语言模型 (gLM) | 序列数据 | NA | NA | NA | 合成表达盒 | 合成生物学 |
| 59 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性,并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节,仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 60 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,显著提升其催化活性,并构建了最小功能化突变体s149FvPolX,拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化,缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶,克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |