合成生物学相关文章
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当前共找到 3043 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-03-04 |
Combating Infectious Diseases with Synthetic Biology
2022-02-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00576
PMID:35077138
|
研究论文 | 本文探讨了合成生物学在传染病诊断和治疗中的应用 | 提出了利用合成生物学设计合成系统和设备作为治疗人类疾病的有力工具 | 未具体提及研究的具体限制 | 开发新型、特异、灵敏且有效的传染病诊断和治疗方法 | 传染病，包括寄生虫、真菌、细菌和病毒感染 | 合成生物学 | 传染病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 382 | 2025-03-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
|
研究论文 | 本文探讨了计算代谢建模方法的演变，并提出了将生物分子模拟和机器学习预测结合以指导结构导向的合成生物学应用的新阶段 | 首次将生物分子模拟与代谢模型相结合，开创了结构导向的合成生物学应用的新范式 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型结合的具体技术细节和实现方法 | 优化和理解代谢途径，以改善蛋白质和小分子产品的生物生产，应用于健康、环境、能源和可持续性领域 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟，机器学习 | NA | NA | NA |
| 383 | 2025-03-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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review | 本文综述了蛋白质工程在设计功能性治疗和生物技术应用的生物纳米分子组装体方面的最新进展 | 利用AI工具（如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN）显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计中的应用及其在生物技术和生物医学领域的潜力 | 有限组装体（如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构）和扩展组装体（如丝状体和2D/3D晶格） | 生物技术 | NA | AI工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN） | NA | NA | NA |
| 384 | 2025-03-03 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
|
研究论文 | 本文讨论了机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用，以及如何通过机器学习增强从单个组件到电路层面的工程设计 | 提出了机器学习与机制建模相结合的混合方法，以利用数据驱动模型的优势与基于机制的模型的规范性能力 | 需要克服的挑战包括如何有效地整合机器学习与机制建模，以及如何在实际应用中实现这些方法的潜力 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的应用，以解决设计空间大、组件与宿主细胞机器之间复杂交互的挑战 | 合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型（机器学习与机制建模） | NA | NA |
| 385 | 2025-03-03 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
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综述 | 本文综述了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展，特别是L-苹果酸（L-MA）和琥珀酸（SA）的生产 | 总结了利用合成生物学和高通量筛选等新技术改进有机酸生物合成的最新进展 | 微生物发酵的低产量和长发酵周期限制了其工业应用 | 改进有机酸生物合成，特别是L-苹果酸和琥珀酸的生产 | 工业上重要的工程微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA |
| 386 | 2025-03-03 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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研究论文 | 本文探讨了通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌细胞工厂的底物范围，以利用多样化的废弃物底物 | 提出了通过代谢工程和合成生物学手段增强假单胞菌的底物利用能力，以应对工业生物技术中的新挑战 | 自然分离的假单胞菌并不总是适合高要求的生物技术应用，需要进一步的工程改造 | 探索和扩展假单胞菌细胞工厂的底物范围，以利用多样化的废弃物底物 | 假单胞菌物种 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、实验室进化 | NA | NA | NA |
| 387 | 2025-03-03 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 本研究探讨了重组人胶原XVII（RHCXVII）在保护皮肤基底膜完整性方面的功效及其作用机制 | 首次揭示了RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路的磷酸化来保护皮肤基底膜完整性的机制 | 研究仅基于体外实验，未涉及体内实验或临床试验 | 阐明RHCXVII在保护皮肤基底膜完整性中的作用机制 | 人类HaCaT角质形成细胞 | 生物医学 | 皮肤损伤 | 逆转录定量PCR、蛋白质印迹分析、磷酸化抗体阵列 | NA | 细胞实验数据 | UVB照射的HaCaT细胞 |
| 388 | 2025-03-03 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物，能够通过活性粒子诱导的网络张力波动进行重塑 | 开发了一种毫米大小的脂质泡沫组织模拟物，具有自愈能力，并展示了由游泳细菌驱动的网络张力波动促进组织重塑 | 现有原型组织的横向尺寸较小或缺乏重塑能力 | 理解和模拟生物组织的结构和力学特性 | 脂质泡沫组织模拟物 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
| 389 | 2025-03-03 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
|
综述 | 本文讨论了利用酵母细胞器隔离技术研究和工程化翻译后修饰酶（PTM-enzymes）的原理和方法 | 首次详细讨论了酵母内质网隔离技术，并介绍了基于酵母表面展示和酶介导的转录激活的细胞质隔离方法 | 不同系统的测量和控制酶催化效率的能力存在局限性 | 旨在通过高通量功能筛选和选择方法，解析PTM-enzymes的酶学和生物学机制，开发能够探测和调控它们的分子，并赋予它们改进和新功能 | 翻译后修饰酶（PTM-enzymes），包括蛋白酶、蛋白质连接酶、氧化还原酶、激酶和其他转移酶 | 合成生物学 | NA | 酵母细胞器隔离技术 | NA | NA | NA |
| 390 | 2025-03-03 |
Next-generation biocontainment systems for engineered organisms
2018-06, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0056-x
PMID:29769737
|
研究论文 | 本文讨论了工程生物在工业、临床和环境应用中日益增加的使用，以及由此带来的生物安全风险，并介绍了合成生物学中的新技术如何用于开发新型生物防护系统 | 本文强调了合成生物学中的新技术（如基因电路工程、基因组编辑和基因表达调控）在开发新型生物防护系统中的应用 | 本文未具体提及现有生物防护系统的具体局限性 | 研究目的是开发更有效的生物防护系统，以应对工程生物在环境中的潜在风险 | 研究对象是工程生物及其在工业、临床和环境中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因电路工程、基因组编辑、基因表达调控 | NA | NA | NA |
| 391 | 2025-03-02 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
|
研究论文 | 本文通过调查13个欧洲国家的公众态度，探讨了合成细胞技术在抗癌治疗、CO2排放转化为生物燃料和工业废物回收等领域的潜在应用 | 首次在多个欧洲国家进行大规模调查，探讨公众对合成细胞技术的态度，并使用数据驱动技术构建决策树模型分析影响因素 | 调查仅涵盖欧洲国家，可能无法代表全球公众态度 | 探讨公众对合成细胞技术的态度及其潜在应用 | 13个欧洲国家的8,382名公众 | 合成生物学 | 癌症 | 数据驱动技术 | 决策树模型 | 调查数据 | 8,382名来自13个欧洲国家的公众 |
| 392 | 2025-03-01 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
|
研究论文 | 本文介绍了一种在哺乳动物细胞中实现定向进化和达尔文适应的正交RNA复制系统 | 开发了一种正交的RNA复制系统，通过RNA复制酶辅助的连续进化（REPLACE）在增殖的哺乳动物细胞中进行定向进化 | NA | 推进合成生物学和细胞工程应用 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统 | NA | RNA | NA |
| 393 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法，揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径，以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶（nrPKSs）和特异性O-甲基转移酶（OMTs）的平行进化起源，并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济，从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
| 394 | 2025-03-01 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-Feb-25, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源天然产物生物合成中的关键作用，特别是在下游合成途径和骨架合成后的结构修饰中的重要性 | 强调了细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的关键催化步骤，并概述了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 探讨细胞色素P450酶在植物源天然产物生物合成中的作用，以促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源天然产物，包括萜类、生物碱、黄酮类、甾体皂苷等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2025-03-01 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
|
研究论文 | 本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的次级代谢生物合成基因簇，发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin | NA | 研究SPC6菌株的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 耐盐放线菌SPC6及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据 | 1株耐盐放线菌SPC6 |
| 396 | 2025-03-01 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
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综述 | 本文更新并批判性地讨论了水稻微生物组的多样性、功能角色以及增强生物施肥和抗逆性的微生物组工程策略 | 强调了微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的进展，以及利用微生物组塑造基因（M基因）提高作物抗逆性的创新方法 | 需要进一步探索M基因以培育抗病性状，且商业化成功的关键因素包括土壤特性、实际环境条件和植物基因型 | 增强水稻的生物施肥、抗逆性和气候适应能力，以实现可持续水稻生产 | 水稻及其微生物组 | 农业生物技术 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 397 | 2025-03-01 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文探讨了同义密码子替换如何通过调节反义RNA的产生来影响上游基因的转录和翻译 | 揭示了同义密码子替换不仅影响单个基因的表达，还能显著影响邻近基因的表达，特别是通过反义RNA的产生 | 研究仅限于质粒编码的基因，未涉及更广泛的基因组环境 | 研究同义密码子替换对邻近基因表达的影响 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游的四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 九种同义重编码的CAT基因序列 |
| 398 | 2025-03-01 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
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研究论文 | 本文探讨了设计的新型小型结合蛋白（minibinders）在细胞工程工具中的应用潜力 | 展示了小型结合蛋白LCB1在下一代蛋白水解受体SNIPR和嵌合抗原受体（CAR）中的广泛应用，相比传统抗体具有更快的生产周期和独特的靶向特性 | 研究主要集中于SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体，未广泛测试其他抗原 | 探索小型结合蛋白在细胞工程工具中的通用性和应用潜力 | SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质序列和功能数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 399 | 2025-02-28 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了现有的MoClo工具包，用于在大肠杆菌中进行模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包，构建了低拷贝和中拷贝载体，实现了蛋白质表达范围的500倍差异，并通过选择性生长实验验证了低表达水平对乙醇依赖生长的优化作用 | 研究仅限于大肠杆菌中的蛋白质表达，未涉及其他宿主系统 | 扩展MoClo工具包，优化蛋白质表达水平，以支持合成生物学研究 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | DNA序列 | NA |
| 400 | 2025-02-28 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
|
研究论文 | 本文研究了自然发生的DNA倒位系统在合成生物学中的应用，特别是Shufflon倒位酶（SI）的改进和扩展 | 鉴定了14个以前未测试的SI基因及其位点，并建立了一种基于单分子测序的检测方法，以量化这些酶的倒位速率，并确定了正交SI/对 | 研究中仅使用了单一酶，且重组速率中等，这可能限制了SI的广泛应用 | 扩展合成生物学工具包，特别是Shufflon样重组系统的应用 | Shufflon倒位酶（SI）及其基因 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列 | 14个SI基因 |