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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-13 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
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综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 探讨了利用合成生物学工具优化底盘,实现从天然代谢物到异源化合物的生产,并提出了新兴改进策略 | 存在产品产量不足、生物量限制和生产成本高等挑战,阻碍工业化转化 | 评估三角褐指藻作为生物生产平台的潜力,并探讨提升其工业应用性的策略 | 海洋硅藻三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | 转基因元件优化、CRISPR-Cas基因组编辑、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | Phaeodactylum tricornutum | NA | 工业生物技术 |
| 42 | 2026-01-13 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本研究展示了将工程细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 首次将工程细菌作为活体生物传感器集成到皮肤纹身中,实现了对生化线索和生物物理线索的双重检测 | 研究仅在皮肤模型中进行验证,尚未进行活体动物或人体试验 | 开发基于工程细菌的活体纹身生物传感器平台 | 工程细菌、水凝胶微珠、皮肤模型 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、RNA温度计 | NA | 荧光信号 | NA | 遗传电路 | 细菌 | 生物传感器、感应/响应功能 | 医学 |
| 43 | 2026-01-12 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR,用于RNA信号转导 | 首次开发了可编程的RNA触发激活核酶,实现RNA的直接功能转导,具有单核苷酸特异性和模块化设计 | NA | 开发一种通用的RNA检测和功能转导平台 | microRNA、病毒RNA序列以及非编码RNA效应子如sgRNA、shRNA和适体 | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞游离传感、蛋白质游离扩增 | NA | RNA序列 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程RNA触发激活双位点自切割核酶,具有模块化传感域和切割产物 | 合成生物学、诊断学、基因调控 |
| 44 | 2026-01-12 |
Design of a Multienzyme Derived from Mouse Fatty Acid Synthase for the Compartmentalized Production of 2-Pyrone Polyketides
2026-Jan-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511726
PMID:41243670
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研究论文 | 本研究设计了一种基于小鼠脂肪酸合酶的多酶体系,用于在区室化环境中生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 通过在小鼠非还原型脂肪酸合酶的酮合酶结构域引入两个氨基酸突变,显著提升了酶活性;并利用SpyTag/SpyCatcher系统整合了4-香豆酸连接酶加载模块,实现了肉桂酸衍生物的直接活化与转移 | NA | 开发区室化生物合成平台以高效生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 小鼠非还原型脂肪酸合酶衍生的多酶体系及其催化的2-吡喃酮合成反应 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、化学酶法平台 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | NA | 基于非还原型脂肪酸合酶的多酶区室化合成途径,用于生产2-吡喃酮类化合物 | 医药 |
| 45 | 2026-01-12 |
Recognition of unnatural base pairs by a eukaryotic DNA polymerase enables universal sequencing of an expanded genetic alphabet
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1460
PMID:41505089
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研究论文 | 本文探索了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的高效特异性合成与延伸能力,并基于此建立了一种测序方法,用于定位含有非天然碱基的DNA | 首次系统研究了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的复制活性,并开发了一种通用测序方法,能够高通量测序含有多种非天然碱基的DNA | NA | 探索非天然碱基对在真核DNA复制系统中的整合潜力,并为扩展遗传字母表的DNA测序提供技术基础 | 非天然碱基对(如dNaM-dTPT3、dCNMO-dTPT3及其功能化衍生物)和含有这些碱基的DNA | 合成生物学 | NA | Sanger测序、深度测序、DNA聚合酶介导的引物延伸 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 46 | 2026-01-12 |
Design of bacterial DNT sensors based on computational models
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1482
PMID:41505102
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研究论文 | 本研究通过计算模型设计并优化了基于大肠杆菌的细菌生物传感器,用于高灵敏度和特异性检测爆炸物副产物2,4-二硝基甲苯(DNT) | 整合计算建模与合成生物学技术,通过分析DNT暴露下的启动子数据生成367个新变体,显著提升了生物传感器的信号强度和响应速度 | 未明确说明传感器在复杂环境中的长期稳定性或实际现场应用的验证结果 | 开发用于环境监测的高性能DNT生物传感器 | 基于大肠杆菌的细菌生物传感器及其启动子-报告基因融合系统 | 合成生物学 | NA | 计算建模、数据分析和合成生物学技术 | NA | 启动子序列数据和生物发光信号数据 | 367个新生成的启动子变体 | 质粒构建、基因融合 | 大肠杆菌 | 基于启动子作为传感元件与微生物生物发光报告基因盒融合的生物传感器电路 | 环境监测 |
| 47 | 2026-01-12 |
A unified computational framework for quantitative design and optimization of transcriptional regulation across bacterial species
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1472
PMID:41505101
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化热力学建模框架T-Pro,用于预测和优化跨细菌物种的转录调控,并通过实验验证其在多种细菌中的性能提升 | 提出了一种具有机制清晰性、可组合性和可扩展性的统一计算框架,显著提高了转录性能指标,并在仅三个设计-构建-测试-学习循环中实现优化 | NA | 开发一个计算框架以定量设计和优化跨细菌物种的转录调控 | 细菌物种(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌)的转录调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学建模 | 模块化热力学模型 | NA | 涉及三种细菌物种的实验验证 | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 多物种细菌通信电路 | 工业生物技术 |
| 48 | 2026-01-12 |
DNA Origami and Its Applications in Synthetic Biology
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513357
PMID:41310154
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综述 | 本文全面概述了DNA折纸技术在合成生物学中的创新应用,包括从细胞外到细胞内的多个领域 | 强调了DNA折纸技术与无细胞合成生物学的协同作用,通过体外组装与细胞调控的结合,为人工生命系统的理性设计开辟了新途径 | NA | 概述DNA折纸技术在合成生物学各领域的创新应用及其与无细胞合成生物学的协同作用 | DNA折纸技术及其构建的纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 49 | 2026-01-12 |
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501621
PMID:40820708
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研究论文 | 本研究开发了一种活体治疗性生物杂交体,结合工程化微生物原位产生硫化氢和自矿化硫化铜纳米颗粒,实现协同的HS气体-光热癌症治疗 | 创新点在于构建了Bac@CuS活体生物杂交体,首次将工程化细菌的HS气体疗法与CuS纳米颗粒的光热效应相结合,通过合成生物学与纳米技术融合,提供了一种新型高效癌症根除方法 | NA | 开发一种新型生物杂交治疗平台,用于高效根除癌症 | 工程化兼性厌氧细菌Vibrio natriegens、硫化铜纳米颗粒、乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 工程化微生物技术、纳米颗粒合成技术、光热疗法 | NA | NA | 乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学工具 | Vibrio natriegens | 工程化细菌持续产生HS并合成CuS纳米颗粒的生物杂交系统 | 医学 |
| 50 | 2026-01-12 |
Resource Competition and Growth Dilution Modulate Synthetic Gene Cascade Dynamics
2025-Dec-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00606
PMID:41457566
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研究论文 | 本文通过构建和表征不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架的抑制性基因级联库,探讨了资源竞争和生长稀释对合成基因电路动态行为的影响 | 揭示了增加下游模块表达可能通过竞争共享细胞资源意外降低上游调控模块表达,将单向抑制级联转化为非预期的反馈回路,并强调了生长稀释在重塑基因表达模式中的作用 | NA | 设计稳健稳定的遗传电路以实现准确可预测的行为,并研究资源竞争和生长稀释对电路模块性的影响 | 抑制性基因级联库,包括不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架的变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 51 | 2026-01-11 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PanForest的工具,它使用随机森林分类器来预测基因组中基因的存在与缺失,并分析基因间的共现与避免模式 | PanForest利用随机森林模型预测基因存在/缺失,并输出性能统计以揭示基因可预测性及基因间重要性,支持并行计算以处理大规模泛基因组数据 | NA | 研究基因共现与避免模式,以理解基因组组织的基本原理,应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌基因组中的12,741个辅助基因 | 机器学习 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1,000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学, 合成生物学, 分子生态学 |
| 52 | 2026-01-11 |
Directed evolution of functional intrinsically disordered proteins
2026-Jan-09, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02128-3
PMID:41513854
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研究论文 | 本文提出了一种系统性的定向进化方法,用于在活细胞中进化能够介导多种相行为的合成内在无序蛋白质(synIDPs) | 开发了系统性的定向进化方法,克服了序列依赖性相互作用协同性与细胞过程适应性影响之间关系理解不足的设计限制,实现了在活细胞中进化具有不同相行为和热响应特征的synIDPs工具箱 | NA | 开发能够调控生物分子凝聚和蛋白质溶解度的合成内在无序蛋白质,并应用于合成生物学和生物技术 | 合成内在无序蛋白质(synIDPs) | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 活细胞 | 蛋白质电路,用于调控细胞内蛋白质活性和逆转抗生素抗性 | 合成生物学, 生物技术 |
| 53 | 2026-01-11 |
Plant epidermis-derived secretory structures: from glandular trichomes to secretory cavities
2026-Jan-09, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70892
PMID:41517861
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综述 | 本文比较了维管植物中表皮衍生的分泌结构(如腺毛和分泌腔)的发育调控机制及次生代谢物生物合成 | 通过对比腺毛和分泌腔的发育与代谢调控,为合成生物学应用提供基础知识,强调转录因子和信号通路的作用 | NA | 探讨植物表皮衍生的分泌结构的发育调控和次生代谢物生物合成机制 | 维管植物中的腺毛和分泌腔 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 54 | 2026-01-11 |
Model acetogens as chassis for CO2-driven bioproduction
2026-Jan-08, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103423
PMID:41512746
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综述 | 本文综述了模型产乙酸菌在厌氧CO2转化中的核心作用,探讨其代谢能力、菌株开发及新兴生物工艺策略,以释放其在低碳生物制造中的潜力 | 强调模型产乙酸菌作为微生物细胞工厂,通过Wood-Ljungdahl途径高效固定CO2,并结合代谢工程和合成生物学扩展生产谱,推动可持续气体发酵 | 与合成气应用相比,纯CO2生物转化在能量上更具挑战性,需在菌株开发、生物工艺优化和可再生能源整合方面创新解决方案 | 探索产乙酸菌作为微生物细胞工厂,通过气体发酵实现可持续生物生产,特别是CO2驱动的低碳生物制造 | 模型产乙酸菌及其代谢途径、生物工艺和工程应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、气体发酵 | NA | NA | NA | NA | 产乙酸菌 | Wood-Ljungdahl途径(乙酰辅酶A合成途径),耦合氢或一氧化碳氧化至CO2固定 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 55 | 2026-01-11 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Jan-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何利用合成生物学、基因组学、人工智能和化学等跨学科前沿技术,通过工程化优化生物质来革新可持续生物能源生产,并以自发光植物为例进行了深入案例分析 | 提出了通过整合组学、工程学和农艺学的跨学科方法来解决复杂生物工程问题,并展望了生成式人工智能将推动从特定领域研究向多学科融合整体模型的范式转变 | NA | 探讨如何克服传统生物质转化在效率、成本和多功能性方面的限制,推动可持续生物能源制造 | 能源作物、生物质、自发光植物(特别是利用真菌生物发光途径的植物) | NA | NA | 基因组编辑、人工智能、组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 真菌生物发光途径(FBP),用于将光合作用能量直接转化为可持续可见光的生物传感器/发光途径 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 56 | 2026-01-11 |
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Jan-06, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118371
PMID:41512477
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研究论文 | 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化转录因子(TF)羧酸生物传感器的框架,通过整合控制TF可用性和启动子序列来提升性能 | 开发了一种系统化框架,通过调节TF供应和重新设计启动子元件,显著提高了无细胞系统中TF生物传感器的灵敏度、动态范围和剂量反应曲线 | NA | 优化无细胞系统中的转录因子生物传感器,以用于小分子代谢物的快速精确检测 | 衣康酸(ITA)响应型生物传感器(由ItcR调节)和3-羟基丙酸响应型生物传感器 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统(CFS)、启动子工程、转录因子调控 | NA | NA | NA | 启动子工程、转录因子调控 | 无细胞系统 | 转录因子(TF)基生物传感器,用于检测衣康酸和3-羟基丙酸等小分子代谢物 | 合成生物学、代谢工程、高通量筛选、自动化生物制造 |
| 57 | 2026-01-11 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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综述 | 本文综述了利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势、挑战与前景 | 重点探讨了合成生物学在拓展非谷物原料(超越传统甲醇等一碳原料至CO₂)多样性、多功能应用及混合生物系统整合方面的突破 | 当前SCP规模化面临菌株鲁棒性有限、基因组编辑精度不足、低密度非谷物原料物流挑战及电化学能源载体安全风险等制约 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案,以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料(如CO₂)及通过微生物发酵生产的单细胞蛋白(SCP) | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 食品、农业、能源、环境 |
| 58 | 2026-01-11 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
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综述 | 本文探讨了利用生物技术保护蜜蜂健康、应对多种压力因素的创新解决方案 | 结合人工智能引导的组学工具、分子生物处理及合成生物学,为蜜蜂健康提供精准、非化学的干预措施 | NA | 通过生物技术创新保护蜜蜂种群,确保全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂及其种群健康 | NA | NA | 组学工具、分子生物处理、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 工程化肠道微生物组、传粉者友好作物、人工饲料 | 农业、环境 |
| 59 | 2026-01-11 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文介绍了一种完全基于蛋白质的三维微打印机器人结构的构建方法,该结构由最小化的肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建并驱动的三维机器人结构,通过肌动球蛋白皮层实现自主驱动 | 实验过程耗时较长(需15天完成),且需要用户在生物材料领域具备专业知识 | 将生物分子活动组装并放大至人造设备中以执行工作,推动合成生物学在机器人技术中的应用 | 基于蛋白质的三维微打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维微打印技术、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机器人技术、合成细胞组装、智能三维微芯片 |
| 60 | 2026-01-11 |
Exploring Fecal Microbiota Transplantation: Potential Benefits, Associated Risks, and Challenges in Cancer Treatment
2026-Jan, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70455
PMID:41496455
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综述 | 本文综述了粪菌移植在癌症治疗中的潜在益处、相关风险与挑战 | 系统总结了粪菌移植在肿瘤学中的最新证据,并探讨了精准微生物联合体、合成生物学等新兴创新技术以解决现有局限 | 标准化不足、监管框架不完善、机制理解不充分,以及病原体传播、免疫失调等风险限制了其临床转化 | 评估粪菌移植在调节肠道微生物组及改善癌症治疗效果中的作用与前景 | 粪菌移植在肿瘤治疗中的应用 | NA | 癌症 | 粪菌移植 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |