本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-14 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
|
综述 | 探讨基于CRISPR工具包的成功基因组编辑应用设计原则 | 提出整合Cpf1和dCas9的一锅法质粒系统构建策略,并讨论降低脱靶效应的先进方法 | 未提供具体实验验证数据,主要集中于策略性讨论 | 开发微生物宿主中稳健的CRISPR基因编辑系统 | CRISPR-Cas系统及其在微生物宿主中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因编辑系统,一锅法质粒系统 | 工业生物技术 |
| 42 | 2025-11-14 |
Systematic and synthetic biology insights into copper homeostasis in Escherichia coli
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113715
PMID:41210969
|
研究论文 | 通过系统与合成生物学方法研究大肠杆菌铜稳态调控机制 | 揭示了Cus系统特异性响应Cu⁺而非Cu²⁺,发现CusR存在信号串扰导致基线表达,并阐明CusS根据铜存在状态兼具激酶和磷酸酶功能 | NA | 阐明大肠杆菌铜稳态调控机制 | 大肠杆菌铜稳态调控系统(cueR和cus) | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 铜稳态调控网络 | 工业生物技术 |
| 43 | 2025-11-14 |
Phenylpropanoid methyl esterase unlocks catabolism of aromatic biological nitrification inhibitors
2025-Nov-13, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf251
PMID:41230824
|
研究论文 | 本研究发现了微生物降解芳香族硝化抑制剂苯丙烷类甲酯的新途径 | 首次鉴定出苯丙烷类甲酯降解的关键基因和两种新型酶,包括新发现的苯丙烷类甲酯酶 | 仅初步揭示了微生物降解途径,对土壤中抑制剂降解的完整机制仍需进一步研究 | 阐明微生物降解芳香族硝化抑制剂的分子机制 | 苯丙烷类甲酯(一类芳香族硝化抑制剂)及其降解微生物 | 合成生物学 | NA | 转录组学、高通量功能基因组学、遗传分析、生化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、生化数据 | NA | 基因转移 | 细菌 | 苯丙烷类甲酯降解途径 | 农业,环境 |
| 44 | 2025-11-14 |
Rational Construction of a Robust Bacillus amyloliquefaciens Cell Factory for Acid-Stable α Amylase Production
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04227
PMID:41165493
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了能够高效生产耐酸α-淀粉酶的解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 建立了高效的CRISPR-nCas9编辑流程,理性删除了导致细胞自溶的前噬菌体基因簇和阻碍外源蛋白表达的次级代谢生物合成基因簇 | 研究主要针对解淀粉芽孢杆菌,结果在其他底盘细胞中的适用性需要进一步验证 | 开发高效的工业蛋白生产底盘细胞 | 解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | CRISPR-nCas9基因编辑,分批补料发酵 | NA | NA | 5升发酵规模 | CRISPR-Cas9 | 解淀粉芽孢杆菌 | 前噬菌体基因簇删除,次级代谢生物合成基因簇优化 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-11-14 |
From Plants to Microbes: Harnessing Enzyme Promiscuity for Natural Product Synthesis
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c09273
PMID:41171120
|
综述 | 系统探讨酶混杂性在微生物天然产物合成中的表现及缓解策略 | 首次系统剖析酶混杂性在微生物天然产物生物合成中的双重作用并评估当代缓解策略 | 未涉及具体实验验证,主要基于文献综述 | 推进对酶混杂性机制的理解并建立高效生物合成平台基础框架 | 植物和微生物系统中的酶混杂性现象 | 合成生物学 | NA | 生物催化、生物合成、蛋白质工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 天然产物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 46 | 2025-11-14 |
Spontaneous Formation of Oil-Rich Polymer-Only Droplet Interface Bilayers Assembled from PB-PEO Block Copolymers
2025-Nov-12, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c03308
PMID:41223304
|
研究论文 | 报道了由PB-PEO嵌段共聚物自发形成的聚合物液滴界面双层膜(pDIBs)的制备与表征 | 首次实现了无需外部偏压、额外脂质或共溶剂的聚合物双层膜自发形成,其电压缩和电润湿系数比脂质膜高1000倍 | 未研究其他类型两亲性嵌段共聚物和油相,膜厚度较大限制了某些应用 | 开发新型聚合物膜系统以克服脂质基膜的机械脆弱性和组成限制 | 聚丁二烯-聚环氧乙烷(PB-PEO)嵌段共聚物在碳氢油相中形成的界面双层膜 | 合成生物学 | NA | 界面张力测定法、电生理学、成像技术 | NA | 物理化学测量数据、电生理数据、图像数据 | NA | NA | NA | 仿生离子传导膜系统 | 合成生物学, 可编程仿生材料, 仿生组织样组装 |
| 47 | 2025-11-14 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 系统总结了三角褐指藻从模式生物向可扩展生物制造平台的转型路径,提出了整合基因工具开发、底盘优化和规模化策略的新范式 | 当前存在产物产量欠佳、生物量限制和生产成本过高等工业转化障碍 | 探讨三角褐指藻作为可持续生物生产平台的开发策略与应用潜力 | 海洋硅藻三角褐指藻及其遗传改造系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 三角褐指藻 | 叶绿体基因表达、DNA位点特异性整合、营养方式改造 | 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 48 | 2025-11-14 |
Engineered natural killer cells for cancer therapy
2025-Nov-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.013
PMID:41135520
|
综述 | 本文综述了工程化自然杀伤细胞在癌症治疗中的最新进展,重点关注CAR-NK细胞的临床转化和合成生物学方法 | 利用精准基因编辑技术增强NK细胞效应功能,开发高通量发现平台识别可操作基因靶点,设计多工程化CAR-NK细胞应对实体瘤挑战 | NA | 改善自然杀伤细胞免疫疗法在癌症治疗中的效果,特别是针对实体瘤的治疗 | 工程化自然杀伤细胞,特别是CAR-NK细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑,高通量发现平台 | NA | 临床试验数据 | NA | 基因编辑 | 自然杀伤细胞 | 嵌合抗原受体设计,细胞重编程 | 医学 |
| 49 | 2025-11-14 |
Engineering artificial biosynthetic pathways for efficient microbial production of psilocybin and psilocin
2025-Nov-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.11.002
PMID:41202968
|
研究论文 | 本研究通过设计和优化人工生物合成途径,在大肠杆菌中实现了裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素的高效微生物生产 | 开发了绕过天然途径中CYP450羟化酶(PsiH)瓶颈的人工生物合成途径,创下了裸盖菇素生产的最高记录 | NA | 开发高效的微生物生产方法以替代从天然蘑菇中提取裸盖菇素 | 裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素 | 合成生物学 | 抑郁症 | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 人工生物合成途径,代谢途径工程 | 医药 |
| 50 | 2025-11-14 |
Biotransformation of Pesticides across Biological Systems: Molecular Mechanisms, Omics Insights, and Biotechnological Advances for Environmental Sustainability
2025-Nov-04, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06484
PMID:41210834
|
综述 | 全面探讨农药在不同生物系统中的生物转化机制、关键酶类、环境影响因素及生物技术应用 | 整合组学技术和合成生物学最新进展,系统分析农药生物转化产物的环境归趋 | 存在未解决的科学问题和技术挑战,部分转化产物的环境行为尚不明确 | 阐明农药生物转化机制以减轻化学污染,促进环境可持续发展 | 有机磷、有机氯和三嗪类农药在微生物、植物和动物系统中的生物转化过程 | 环境生物技术 | NA | 组学技术(omics)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物、植物、动物 | 增强降解能力的工程化设计 | 环境、农业 |
| 51 | 2025-11-14 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
|
综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用,包括疫苗抗原的合理设计、口服递送方式及其免疫益处 | 提出利用合成生物学和鱼类免疫代谢研究推动微藻疫苗创新的新思路 | NA | 开发可持续的水产养殖疫苗以增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 微藻疫苗及其在水产养殖中的应用 | 合成生物学 | 水产疾病 | 口服疫苗技术 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 疫苗抗原设计 | 农业, 水产养殖 |
| 52 | 2025-11-14 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
|
研究论文 | 本文探讨在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计,在大肠杆菌和酵母线粒体中实现部分固氮酶重构,并通过低氧环境规避氧敏感性限制 | 尚未完全解决能量需求高和氮水平反馈调节的问题 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在非豆科植物中的功能表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、人工智能辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 固氮酶代谢通路重构 | 农业, 环境 |
| 53 | 2025-11-14 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
|
综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的研究进展与挑战 | 提出通过同时编辑饲料作物和瘤胃产甲烷古菌基因组来减少甲烷排放的创新策略 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等方面的挑战 | 开发可持续农业中减少反刍动物甲烷排放的有效解决方案 | 反刍动物、饲料作物、瘤胃产甲烷古菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 产甲烷途径干扰、脂质和次级代谢物合成途径增强 | 农业, 环境 |
| 54 | 2025-11-14 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发了一种内含子优化的双碱基编辑器,用于增强构巢曲霉中棘球白素B的耐受性并优化调控回路 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中的翻译,开发了PAM-less SpRY-CABE系统,实现了高效双碱基编辑 | NA | 解决棘球白素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘球白素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子诱变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 调控回路优化、启动子工程、β-1,3-葡聚糖合成酶进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 55 | 2025-11-14 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
perspective | 提出新的分类概念来描述非树状进化模式的生物体 | 引入epaktovars和xenotypes两个互补概念,为描述水平基因转移导致的进化模式提供新框架 | 概念性论文,缺乏实证数据验证 | 澄清和统一描述非树状进化生物体的术语 | 具有水平基因转移特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 56 | 2025-11-14 |
Biparental plastid inheritance and its implications in plastid genome engineering
2025-Oct-10, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03631-6
PMID:41073605
|
综述 | 本文综述了植物质体双亲遗传的机制及其在质体基因组工程中的应用潜力 | 系统探讨了通过调控遗传和环境因素将母系质体遗传转变为双亲遗传的机制,及其在植物适应性和质体工程中的重要意义 | 质体双亲遗传机制相对研究不足,许多具体分子机制尚不明确 | 探讨质体遗传模式(特别是双亲遗传)的机制、进化意义及在植物工程中的应用 | 植物质体(叶绿体)和线粒体的遗传模式 | 植物遗传学 | NA | 质体基因组工程 | NA | 文献综述数据 | 约20%的被子植物表现出双亲质体遗传 | NA | 被子植物 | NA | 农业,合成生物学 |
| 57 | 2025-11-14 |
Engineering microorganisms for enhanced tolerance to toxic end-products and intermediates
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf053
PMID:41137716
|
综述 | 系统概述通过合成生物学策略增强微生物对有毒终产物和中间体耐受性的方法 | 全面总结细胞包膜工程、胞内组分工程和胞外工程等多元化的耐受性增强策略 | NA | 促进有毒终产物和中间体微生物生产的工业转化和商业化 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-11-14 |
Biotechnological advancements enabling cannabinoid biosynthesis in engineered fungi: a mini review
2025, Frontiers in fungal biology
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/ffunb.2025.1660661
PMID:41209486
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程技术在工程真菌中生物合成大麻素的最新进展 | 利用工程真菌作为大麻素生物合成的替代生产平台,克服传统植物提取的限制 | 面临产物毒性、代谢负担和监管考虑等持续挑战 | 探索大麻素微生物生物合成的生物技术进展 | 工程真菌中的大麻素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、代谢工程、途径重建 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 真菌 | 大麻素生物合成途径 | 医药、保健品、工业生物技术 |
| 59 | 2025-11-14 |
Prokaryotic homeostasis - a solution to thrive and survive
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1704789
PMID:41209587
|
综述 | 本文探讨原核生物通过复杂调控机制维持细胞内稳态的能力及其科学应用价值 | 系统性地将细菌确立为单细胞稳态研究的理想模型,并阐明其稳态调控网络在合成生物学和抗菌治疗中的转化潜力 | 未涉及具体实验验证或定量分析,主要为理论框架梳理 | 解析细菌维持内外环境稳态的分子机制及其应用意义 | 原核生物(细菌)的稳态调控系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 稳态调控网络(包括转录网络、第二信使系统、DNA拓扑结构调控) | 医学, 工业生物技术 |
| 60 | 2025-11-13 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-Nov-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
|
观点文章 | 探讨利用真菌分泌系统改进精密发酵技术以高效生产食品蛋白质 | 提出通过数据驱动的分泌途径工程化改造提升蛋白质分泌效率,推动精密发酵食品蛋白从试验生产向工业化规模转化 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论分析和前景展望 | 提高精密发酵生产食品蛋白质的成本效益和规模化能力 | 酵母和丝状真菌的蛋白质分泌系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质分泌技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径工程改造 | 食品, 工业生物技术 |