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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-17 |
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16030164
PMID:41893315
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制,并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 | 系统总结了宿主来源的化学信号(如根系分泌物和氧脂素)作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇(BGCs)的主要触发因素,并批判性地评估了空间代谢组学(如MALDI-MSI)在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 | 本文是一篇综述,未报告原始实验数据,其结论基于对过去十年文献的系统调查,可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 | 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制,并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 | 药用植物及其相关的内生真菌 | NA | NA | 空间代谢组学(MALDI-MSI)、共培养模型、植物体内模型、结构解析 | NA | NA | NA | NA | 药用植物,内生真菌 | NA | 医药,工业生物技术 |
| 42 | 2026-04-17 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用,以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统,实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制,并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 包括递送、转基因稳定性和在生理相关模型中稳健的时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据 | 系统级模型、AI引导的电路设计 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学 |
| 43 | 2026-04-17 |
Identification and treatment of heme depletion attributed to overexpression of a lineage of evolved P450 monooxygenases
2012-Nov-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1212287109
PMID:23129650
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法分析并优化了在酿酒酵母中过表达P450单加氧酶引起的宿主应激,识别出血红素耗竭为主要应激源,并通过过表达内源性血红素生物合成途径的限速酶来缓解应激并提高酶活性 | 结合系统生物学和合成生物学方法,首次识别出P450单加氧酶过表达导致的血红素耗竭是主要宿主应激源,并证明通过工程化内源性血红素生物合成途径可以缓解应激并提升酶活性 | 研究主要聚焦于酿酒酵母中的P450单加氧酶,可能不直接适用于其他宿主或酶系统,且应激源的相互作用可能更复杂 | 分析并优化微生物中异源酶表达引起的宿主应激,以提高生物合成途径的性能 | 在酿酒酵母中过表达的一系列进化P450单加氧酶变体及其对宿主细胞的影响 | 代谢工程 | NA | 系统生物学方法、酶活性测定 | NA | 酶活性数据、应激响应模式 | 一系列进化P450单加氧酶变体 | CRISPR-Cas9, 基因过表达 | 酿酒酵母 | 内源性血红素生物合成途径的工程化 | 工业生物技术 |
| 44 | 2026-04-16 |
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2026.114886
PMID:41881186
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研究论文 | 本文通过基因组测序和注释,揭示了药用植物Dodonaea viscosa中二类二萜环化酶的发现与生化特性,为合成生物学规模化生产生物活性二萜类化合物提供了基础 | 首次报道了Dodonaea viscosa的核基因组草图及完整叶绿体和线粒体基因组序列,并鉴定出两个新的二类二萜环化酶DvCPS和DvKPS,催化形成labdane和clerodane二萜类生物活性化合物的前体 | NA | 阐明Dodonaea viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径,以支持通过合成生物学实现规模化生产 | 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组序列和二萜环化酶 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生化表征 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 45 | 2026-04-16 |
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-Apr-15, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00726
PMID:41919686
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研究论文 | 本文介绍了一种基于滚环扩增技术的仿生囊泡平台,可在巨型囊泡内构建DNA网络以增强结构稳定性 | 首次在合成囊泡中通过滚环扩增构建类细胞骨架的DNA网络,实现分子尺度生化活动与介观尺度机械行为的耦合 | NA | 开发具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞 | 巨型囊泡和DNA网络结构 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增技术 | NA | NA | NA | DNA折纸术 | NA | DNA网络结构(类细胞骨架) | 合成生物学、生物制造、仿生材料 |
| 46 | 2026-04-16 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了利用酵母(如酿酒酵母、毕赤酵母和粟酒裂殖酵母)通过减轻细胞内天然产物积累的代谢负担来增强天然产物(特别是萜类)合成的近期进展 | 聚焦于通过减轻代谢负担来提升酵母中天然产物合成的策略,包括转运蛋白过表达与工程化、膜结构改变和提取方法,总结了未来研究方向 | NA | 增强微生物细胞工厂中天然产物的合成效率,通过减轻代谢负担策略 | 酵母物种(酿酒酵母、毕赤酵母、粟酒裂殖酵母)及其在天然产物(尤其是萜类)合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 粟酒裂殖酵母 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 47 | 2026-04-16 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 本文通过结合半理性筛选和理性设计策略,工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,以高效生产2'-岩藻糖基乳糖 | 采用双蛋白工程策略,包括理性计算设计和基于工程化l-岩藻糖响应生物传感器的半理性筛选,实现了无副产物的高效2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | NA | 工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,以消除副产物并提高2'-岩藻糖基乳糖的生物合成效率 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体,用于2'-岩藻糖基乳糖生产 | 合成生物学 | NA | 理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)、半理性筛选、饱和诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | l-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P),用于筛选突变库 | 工业生物技术 |
| 48 | 2026-04-16 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-Apr-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 本文开发了PHYCUT系统,一种基于质粒的CRISPR/Cas9工具,用于实现硅藻中的可扩展多重基因组编辑 | 利用Csy4内切核糖核酸酶处理多向导RNA阵列,首次在硅藻中建立了高效的多重CRISPR/Cas9编辑系统 | 未在摘要中明确提及具体限制,但暗示了先前缺乏稳健的多重编辑系统是硅藻基因组工程的一个障碍 | 开发一种可扩展的多重CRISPR/Cas9编辑工具,以优化硅藻的基因组工程,特别是针对糖基化途径的人源化改造 | 海洋硅藻Phaeodactylum tricornutum,重点关注其α(1,3)核心岩藻糖基化相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑,Csy4内切核糖核酸酶处理 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Csy4 | Phaeodactylum tricornutum | 多向导RNA阵列处理系统,用于多重基因编辑 | 工业生物技术, 医药 |
| 49 | 2026-04-16 |
mRNA medicine for cardiovascular disease
2026-Apr-14, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00804-8
PMID:41981145
|
综述 | 本文综述了mRNA技术在心血管疾病治疗中的进展、应用及未来挑战 | 系统总结了mRNA技术(包括修饰、递送平台、基因组/表观基因组编辑及基于mRNA的嵌合抗原受体)在心血管疾病治疗中的最新进展,并整合了纳米技术、基因编辑和RNA合成生物学等交叉领域的发展 | NA | 探讨mRNA技术作为心血管疾病新型治疗策略的潜力与转化前景 | 心血管疾病(包括高胆固醇血症、动脉粥样硬化、缺血性心脏损伤、心脏纤维化和心脏淀粉样变性等) | NA | 心血管疾病 | mRNA技术、纳米技术、基因组编辑、RNA合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 50 | 2026-04-16 |
Stomata as a Defence Nexus: Integrating Drought and Pathogen Stress Signalling
2026-Apr-14, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70542
PMID:41982084
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综述 | 本文综述了植物气孔在协调病原体入侵和干旱胁迫响应中的双重防御角色,强调了在复合压力下气孔动态的协同与拮抗机制 | 将气孔视为防御中枢,整合干旱和病原体胁迫信号,揭示了复杂的信号网络交叉对话,并探讨了工程化优化气孔响应以增强作物抗逆性的前沿方向 | 未解决防御与生长之间的权衡、信号通路干扰以及组织特异性功能冗余等关键问题 | 研究气孔在整合干旱和病原体胁迫信号中的防御作用,以增强作物对气候变化的复合胁迫抗性 | 植物气孔及其在胁迫响应中的功能 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 51 | 2026-04-16 |
TargetGAN: A generative AI framework for designing plant core promoters with targeted activity
2026-Apr-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 本研究提出了一个名为TargetGAN的深度学习框架,用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将生成对抗网络与预训练活性预测器相结合,实现了用户自定义活性的植物核心启动子从头设计,并成功生成了超越天然启动子活性的合成启动子 | 预测活性与实验活性之间仅呈现中等相关性(PCC=0.6435),且仅对部分合成启动子进行了功能验证 | 开发一个能够设计具有目标活性植物核心启动子的生成式人工智能框架 | 植物核心启动子 | 合成生物学 | NA | STARR-seq、荧光素酶报告基因检测 | GAN | 基因序列数据 | 76,851个天然启动子用于训练,55,296个合成启动子生成,其中5,250个用于高通量验证,2,909个成功表征 | NA | 植物系统 | 具有目标活性的合成启动子设计 | 农业、工业生物技术 |
| 52 | 2026-04-16 |
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70350
PMID:41968466
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综述 | 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用、工程化策略及面临的挑战 | 系统总结了利用分子与合成生物学技术(如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术)对bEVs进行定向生物工程改造的最新进展,以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化bEVs | 指出bEVs技术转化仍面临可扩展性、安全性、标准化和监管框架等关键挑战 | 探讨细菌胞外囊泡在生物医学领域的应用潜力及临床转化前景 | 细菌胞外囊泡 | NA | NA | 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 53 | 2026-04-16 |
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70329
PMID:41973552
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研究论文 | 本研究开发了一种细胞-机器接口系统(Segregostat),用于在工业生物反应器扰动条件下可靠控制微生物的应激响应 | 首次在工业生物反应器典型扰动条件下评估并验证了Segregostat系统对微生物应激响应的鲁棒控制能力 | 研究仅针对大肠杆菌和酿酒酵母两种模式生物,未在更广泛的工业菌株或复杂共培养体系中验证 | 开发在工业生物过程扰动条件下可靠控制微生物应激响应的细胞-机器接口系统 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的通用应激响应 | 合成生物学 | NA | 规模缩小生物反应器实验、自动化流式细胞术 | NA | 流式细胞术数据、生物过程参数 | NA | 细胞-机器接口 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 应激响应控制系统(Segregostat) | 工业生物技术 |
| 54 | 2026-04-16 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 本文综述了用于人类医疗应用的基因工程微生物的生物安全策略进展 | 系统总结了多种生物安全策略的单独和组合应用,并强调了标准化测试的重要性 | NA | 探讨基因工程微生物在医疗应用中的生物安全策略 | 基因工程微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | 毒素-抗毒素系统、杀死开关、营养缺陷型、基于CRISPR的DNA靶向降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 55 | 2026-04-16 |
Heterologous expression of Vibrio natriegens transporters enhances the growth of Escherichia coli and Bacillus subtilis on glutamate
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100264
PMID:41982386
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研究论文 | 本研究通过异源表达Vibrio natriegens的谷氨酸转运蛋白,有效提升了Escherichia coli和Bacillus subtilis在谷氨酸碳源上的生长速率 | 首次发现跨物种底物转运蛋白可改变细菌细胞资源分配,为调控微生物生物量生长提供了新的遗传策略 | NA | 探索通过异源表达转运蛋白改善细菌在特定碳源上生长性能的方法 | Escherichia coli和Bacillus subtilis两种细菌 | 合成生物学 | NA | 异源表达技术 | NA | 生长实验数据 | NA | 异源表达系统 | Escherichia coli, Bacillus subtilis | 谷氨酸转运蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 56 | 2026-04-16 |
Advances in polyethylene biodegradation and bioconversion: Microbial, enzymatic, and biotechnological insights
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100255
PMID:41982382
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综述 | 本文系统总结了聚乙烯(PE)生物降解与生物转化的最新进展,包括降解效率评估方法、微生物与酶的降解机制、已鉴定的微生物与酶资源,以及增强降解效率的物理化学策略与生物方法的整合 | 将合成生物学和机器学习等前沿生物技术工具与传统生物降解方法相结合,以加速PE降解速率并实现更可持续的塑料废物管理 | NA | 开发可持续的解决方案以缓解顽固性聚烯烃(如聚乙烯)对环境造成的负担 | 聚乙烯(PE)塑料 | NA | NA | 生物降解、生物转化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 57 | 2026-04-16 |
Genetically encoded biosensors enabled high-throughput screening of microbial cell factories
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100258
PMID:41982388
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综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在高通量筛选微生物细胞工厂中的应用、关键特征、工程策略及优化挑战 | 系统总结了生物传感器在高通量筛选中的关键性能特征,并详细阐述了通过合成生物学策略对生物传感器进行工程改造的最新进展 | NA | 为开发用于高通量筛选的基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂优化中的应用提供全面指导 | 基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂高通量筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选(HTS)、合成生物学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物细胞工厂 | 生物传感器(用于检测天然与非天然产物) | 工业生物技术 |
| 58 | 2026-04-16 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
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综述 | 本文系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用,包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与标准疗法的协同潜力 | 利用合成生物学将细菌工程化为精确的活体治疗剂,实现局部药物递送、靶向免疫调节和肿瘤微环境重塑,并探讨其与化疗、放疗和免疫疗法的协同作用 | NA | 开发基于细菌的创新癌症治疗策略,克服传统治疗的耐药性 | 工程化细菌及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 59 | 2026-04-16 |
Advances in synthetic microbial ecosystems approach for studying ecological interactions and their influencing factors
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100205
PMID:41982405
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综述 | 本文综述了合成微生物生态系统在生态相互作用及其影响因素研究方面的进展 | 系统整合了当前关于合成微生物生态系统的知识,并强调了其相较于自然生态系统的简化性和可控性优势 | NA | 增强对微生物群落相互作用的理解,特别是群落稳定性、关键物种识别和群落结构调控等生态学关键问题 | 合成微生物生态系统及其中的生态相互作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 60 | 2026-04-16 |
The Kongming defense: Host-pathogen battles take a new face
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100209
PMID:41982408
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评论 | 本文评论了Kongming细菌防御系统的新机制,该系统利用噬菌体衍生的酶合成dITP,通过消耗NAD+触发宿主免疫,揭示了宿主与病原体间持续的进化军备竞赛 | 首次揭示了Kongming防御系统利用噬菌体酶合成dITP并触发NAD+消耗的独特免疫机制,以及噬菌体相应进化出对抗策略 | NA | 探讨细菌免疫系统与噬菌体之间的进化相互作用机制 | 细菌防御系统(特别是Kongming系统)与噬菌体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |