合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-07-29	Bioactive metabolites and extracellular vesicles from the marine chlorophyte genus Tetraselmis: Review 2025-Jul-24, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108662 PMID:40714169	综述	本文综述了海洋绿藻属Tetraselmis的生物活性代谢物和细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的潜在应用	探讨了Tetraselmis物种的代谢灵活性、生物活性化合物生产及其细胞外囊泡的治疗潜力，并提出了利用人工智能和合成生物学优化培养策略的新机会	NA	探索Tetraselmis物种及其细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的多样化应用	海洋绿藻属Tetraselmis及其细胞外囊泡	生物技术	NA	NA	NA	NA	NA
42	2025-07-29	Advances in sphingan production: Biosynthesis and synthetic biology strain modification strategies based on Sphingomonas 2025-Jul-23, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108659 PMID:40712756	综述	本文综述了鞘氨醇单胞菌属在鞘聚糖生产中的研究进展，包括其分类学地位、结构、生物合成途径、分子遗传学及基因工程应用	综合了鞘聚糖的结构、生物合成途径及遗传工程研究，并展望了未来研究方向	未涉及鞘聚糖在工业应用中的具体挑战或经济效益分析	探讨鞘氨醇单胞菌属在鞘聚糖生产中的潜力及未来研究方向	鞘氨醇单胞菌属及其产生的鞘聚糖	合成生物学	NA	分子遗传学、基因工程	NA	文献数据	NA
43	2025-07-29	Bacteria-algae synergy in carbon sequestration: Molecular mechanisms, ecological dynamics, and biotechnological innovations 2025-Jul-21, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108655 PMID:40701356	综述	本文系统综述了细菌-藻类协同作用在碳封存中的分子机制、生态动态及生物技术创新	首次将分子机制（如群体感应）、生态碳转化过程（如难降解溶解有机碳的形成）与合成生物学应用（如CRISPR工程菌群）整合到一个统一框架中，并提出增强碳汇的新策略“微生物相互作用网络优化”	存在规模化挑战，包括光生物反应器中的光照限制以及合成菌群的生态风险	探索细菌-藻类协同作用在碳封存中的潜力，以实现碳中和	微藻（如小球藻和三角褐指藻）和大型藻类（如巨藻和海带）与细菌的联合体	微生物生态学与合成生物学	NA	CRISPR工程菌群、群体感应、水平基因转移	NA	NA	NA
44	2025-07-29	A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology 2025-Jul, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.70084 PMID:40713804	综述	本文系统总结了合成生物学中当前使用的主要无限制重叠序列克隆（RFOSC）技术，并探讨了它们的发展、效率、实用性和具体应用	全面评估了多种RFOSC技术，包括体外和体内方法，并提出了未来技术发展的趋势	未明确指出每种技术的具体限制条件或适用范围	总结和评估合成生物学中的DNA克隆技术	DNA克隆技术，特别是无限制重叠序列克隆技术	合成生物学	NA	Gibson Assembly, CPEC, PIPE, OEC, UDG-Cloning, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA	NA	NA	NA
45	2025-07-29	Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review 2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-025-04379-7 PMID:40555885	综述	探讨产色素链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成及生物技术应用	综述了CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默生物合成基因簇以提高色素产量方面的最新进展	毒性评估、工业条件下色素稳定性、未探索链霉菌菌株的高通量筛选以及AI预测工具在途径优化中的整合等方面存在研究空白	寻找天然、环保的色素替代品以解决合成色素带来的健康和环保问题	产色素的链霉菌	生物技术	NA	CRISPR/Cas基因编辑	NA	NA	NA
46	2025-07-29	Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane 2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202500327 PMID:40400158	综述	本文综述了SLIPT-PM化学遗传学平台的开发、主要特点、当前应用及未来挑战，该平台用于在活细胞中操控质膜信号传导	开发了一种新型的化学遗传学平台SLIPT-PM，能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜，并具有可控的可逆性和重复性	未明确提及具体限制，但提到未来挑战，可能涉及技术的进一步优化和应用扩展	开发并优化一种用于操控细胞信号传导网络的化学遗传学工具	哺乳动物细胞中的信号蛋白和脂质	化学生物学与合成生物学	NA	SLIPT（自定位配体诱导蛋白转位）技术	NA	NA	NA
47	2025-07-29	Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells 2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.05.651767 PMID:40654943	research paper	本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，以增强其激活和扩增Vγ9Vδ2 T细胞的能力，从而提高抗结核疫苗的效果	首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来积累HMBPP，利用宿主对HMBPP的自我-非我识别机制增强疫苗效果	虽然GcpE过表达成功诱导了Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但MEP途径多个基因的异位表达可能导致反馈抑制，仍需进一步研究以开发更有效的疫苗	开发更有效的抗结核疫苗	BCG疫苗和Vγ9Vδ2 T细胞	合成生物学	结核病	合成生物学方法，基因工程	NA	基因组数据，细胞实验数据	356个调查基因组和人类Vγ9Vδ2 T细胞刺激实验
48	2025-07-29	Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina 2025-Jan-15, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004 PMID:39778579	研究论文	本文提出了一种主动学习方法来训练模型，以区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子	采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样，迭代训练模型以区分功能相反的CRX结合位点	模型可能仍无法完全解释转录因子在不同背景下激活或抑制转录的具体机制	开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型	光感受器转录因子CRX的结合位点	机器学习	NA	主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测	深度学习模型	基因组序列	几乎所有基因组中结合的CRX位点
49	2025-07-29	LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling 2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-01915-z PMID:39117617	研究论文	研究发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路，提高CD8+ T细胞的干细胞样特性及抗肿瘤能力	首次揭示LMO4通过结合JAK1增强STAT3信号传导，促进CD8+ T细胞的干细胞样特性和抗肿瘤功能	研究主要基于体外和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索增强CD8+ T细胞干细胞样特性以提升T细胞疗法效果的分子机制	CD8+ T细胞	免疫治疗	肿瘤	CRISPR激活筛选、合成生物学方法、CRISPR/Cas9基因编辑	NA	基因表达数据、细胞功能实验数据	NA
50	2025-07-29	Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System 2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/66595 PMID:38526087	研究论文	本文展示了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法	提出了一种基于封装和无细胞表达反应的方法，成功在合成细胞中重构膜蛋白	方法仅针对细菌谷氨酸受体进行了验证，未广泛测试其他膜蛋白	开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法	细菌谷氨酸受体(GluR0)和蛋白视紫红质信号肽	合成生物学	NA	无细胞表达系统(CFE)	NA	NA	NA
51	2025-07-29	Activation domains can decouple the mean and noise of gene expression 2022-07-19, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2022.111118 PMID:35858548	research paper	研究探讨了激活结构域（ADs）如何影响基因表达的平均水平和噪声	揭示了激活结构域的强度和核浓度如何独立调控基因表达噪声，而不依赖于ADs类别的差异	未涉及具体疾病模型或临床应用验证	探索基因表达噪声的调控机制及其潜在应用	基因表达的随机波动（噪声）	合成生物学	NA	NA	NA	理论分析	NA
52	2025-07-28	Recent advances in engineering microbial lipases for industrial applications 2025-Jul-21, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108658 PMID:40701353	review	本文综述了微生物脂肪酶的分类、特性、工业生产及应用，以及通过合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶的最新进展	整合合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶，以及利用蛋白质工程、固定化技术和AI工具提升脂肪酶催化性能	微生物脂肪酶存在多种异构体，限制了其应用并需要昂贵的纯化过程	开发新型脂肪酶以提升其在工业应用中的稳定性、活性和特异性	微生物脂肪酶及其在农业、生物燃料、化妆品、化工、食品、制药和纺织等工业中的应用	合成生物学	NA	蛋白质工程、固定化技术、AI工具	NA	NA	NA
53	2025-07-28	Revolutionizing keratinase science: Biocatalytic advances, sustainable innovation, and industrial perspectives 2025-Jul-21, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108657 PMID:40701354	综述	本文系统回顾了角蛋白酶的研究历史、分类、催化机制及其在多个领域的应用，并探讨了未来研究方向	整合了蛋白质工程、人工智能辅助酶设计和合成生物学等前沿技术来提升角蛋白酶的性能	工业生产应用仍受限于高成本、酶稳定性不足和监管复杂性	推动角蛋白酶研究及其在可持续发展和资源管理中的转化应用	角蛋白酶及其在环境修复和循环生物经济中的应用	生物催化	NA	蛋白质工程、人工智能辅助酶设计、合成生物学	NA	NA	NA
54	2025-07-28	Unlocking the algae toolbox: Cutting-edge tools for environmental and biotechnological solutions 2025-Jul-20, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108652 PMID:40695391	综述	本文全面评述了藻类研究中的最新工具和方法，特别是在环境管理和生物技术中的应用	整合了CRISPR-Cas9基因编辑、高通量组学、机器学习建模和遥感监测等前沿技术	大规模生产仍面临经济可行性和环境可持续性的挑战	推动藻类生物技术和全球可持续发展	藻类及其在生物技术、环境管理和可持续产业中的应用	生物技术	NA	CRISPR-Cas9, 高通量组学, 机器学习, 遥感, 光学传感器, 流式细胞术, 生物传感器, 环境DNA	机器学习驱动建模	组学数据, 遥感数据, 传感器数据	NA
55	2025-07-26	Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: metabolic diversity, eco-physiology and biotechnological opportunities 2025-Jul-25, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf314 PMID:40707021	综述	本文全面评估了不同微藻类群中异戊二烯类化合物的生物合成与调控，并探讨了其生理生态意义和生物技术潜力	系统比较了叶绿体定位的MEP途径和胞质MVA途径的差异，揭示了藻类特有的酶适应和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶	对异戊二烯类生态功能的认识仍存在未解决的问题	阐明微藻中内源性异戊二烯类生物合成及其调控网络	真核浮游植物（微藻）中的异戊二烯类代谢	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
56	2025-07-26	Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides 2025-Jul-24, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575 PMID:40705854	研究论文	本研究利用合成生物学方法全面调查了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成，并开发了高效生产大黄素葡萄糖苷的策略	评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs），并开发了一种全细胞催化系统，实现了78.9%的高转化率	植物源蛋白在丝状真菌中的表达存在挑战，进一步优化受到阻碍	开发高效生产大黄素葡萄糖苷的策略	大黄素-6-β-d-葡萄糖苷（E6G）和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷（E8G）	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	十种EUGTs
57	2025-07-26	Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens 2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00727-25 PMID:40464557	研究论文	研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用	揭示了c-di-GMP通过调控多血红素细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因表达，影响整个胞外电子传递过程	c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚	探究c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用	Geobacter metallireducens细菌	微生物学	NA	合成生物学方法	NA	基因表达数据	三种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L)
58	2025-07-26	Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation 2025-Jul-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf703 PMID:40705927	研究论文	本文设计了一种遗传'过期日期'电路，用于控制合成细菌的寿命，以实现安全的生物修复	通过前馈激活网络设计可调节寿命的遗传电路，结合合成小调控RNA和基于asd的辅助营养系统优化电路，降低基因表达泄漏	NA	开发一种生物控制策略，安全部署合成细菌于实际应用中	合成酚清除大肠杆菌	合成生物学	NA	遗传电路设计，合成小调控RNA	NA	NA	NA
59	2025-07-26	Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00482 PMID:39705005	研究论文	该研究设计了一种名为EPDA的合成受体平台，用于实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信	开发了EPDA受体平台，通过肽配体二聚化实现可逆的细胞响应，并利用新型计算算法PETEI筛选最优单抗体	研究中仅测试了30种基于预测结合亲和力的单抗体，可能未涵盖所有潜在有效受体	桥接合成生物学和生物材料领域，开发能够感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体	哺乳动物细胞和3D生物材料	合成生物学	NA	硫醇-降冰片烯化学，PETEI计算算法	EPDA受体平台	荧光信号（GFP）	超过2000种候选单抗体，最终测试了30种
60	2025-07-26	Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of Polyhydroxyalkanoates 2025-Jul-17, Letters in applied microbiology IF:2.0Q4 DOI:10.1093/lambio/ovaf096 PMID:40674061	研究论文	本研究通过宏基因组分析和高通量筛选技术，探索海洋环境中生产聚羟基脂肪酸酯（PHA）的微生物资源	结合宏基因组预测和荧光定量技术，有效解决了荧光筛选中的假阳性问题，并成功分离出高效PHA生产菌株	研究仅针对海洋环境，未涉及其他生态系统的PHA生产者	开发可持续生产生物降解材料PHA的微生物资源和技术平台	海洋环境中的微生物群落及其PHA合成潜力	生物技术	NA	宏基因组分析、气相色谱（GC）、高通量筛选	NA	宏基因组数据、荧光定量数据	从不同海洋生境中分离出102株PHA生产菌株