合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-07-24	Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control 2024-08-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00094 PMID:39038807	研究论文	本研究通过调控藻胆素代谢，对蓝藻的藻胆蛋白和藻胆体进行功能修饰，实现了对光环境的适应性调整	构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型7942 PEB1菌株，实现了藻胆体结构的可逆颜色变化和稳定嵌合藻胆体复合物的形成	未对PEB结合藻胆体复合物的具体性质进行详细表征	研究藻胆体在不同光环境下的适应机制及其在生物工程中的应用	淡水蓝藻PCC 7942及其藻胆蛋白和藻胆体	合成生物学	NA	PEB合成酶(PebA和PebB)的异源表达	NA	NA	NA
102	2025-07-24	Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes 2024-03, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28621 PMID:38079116	综述	本文综述了利用酵母隔离技术研究和工程化翻译后修饰酶（PTM-enzymes）的原理和方法	首次详细讨论了酵母内质网隔离技术，并综述了酵母表面展示和细胞质隔离等方法的创新应用	不同系统的测量和控制酶催化效率的能力存在局限性	探索PTM-enzymes的酶学和生物学机制，开发能够探测和调控它们的分子，并赋予它们改进和新功能	翻译后修饰酶（PTM-enzymes）	合成生物学	NA	酵母隔离技术（包括酵母表面展示、细胞质隔离和内质网隔离）	NA	NA	NA
103	2025-07-24	Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli 2024-03, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28628 PMID:38116710	研究论文	该研究利用多色光遗传学工具EL222和CcaSR在大肠杆菌中调控三种糖酵解途径的流量比例	首次展示了通过蓝光和绿/红光调控大肠杆菌中EMP、PP和ED三种糖酵解途径的流量比例	研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他生物体中验证	开发光遗传学工具调控代谢流量分布	大肠杆菌的糖酵解途径(EMP、PP和ED)	合成生物学	NA	光遗传学(EL222和CcaSR系统)	NA	NA	NA
104	2025-07-24	Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities 2022-09, Transplantation and cellular therapy IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001 PMID:35691572	review	本文回顾了CAR T细胞的当前逻辑能力、其局限性以及为解决这些问题所进行的工程改进，并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法的发展	提出了“合成免疫疗法”这一新子领域，展示了合成生物学如何赋予免疫细胞更复杂的逻辑能力	当前CAR T细胞疗法依赖单一类型传感器，导致对表达抗原的正常组织产生不必要的毒性，且未调节的激活会导致不必要的细胞因子毒性	探讨如何通过合成生物学改进CAR T细胞疗法，以实现更精确和有效的癌症治疗	CAR T细胞及其在癌症治疗中的应用	合成生物学	癌症	合成生物学技术	NA	NA	NA
105	2025-07-23	Codes across (life)sciences 2025-Aug, Bio Systems DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515 PMID:40490067	综述	本文探讨了“代码”在不同学科中的含义、意图和形式化，并试图构建一个跨学科的代码研究框架	提出了一个跨学科的视角，探讨代码在生物学、心理学、文化等多个领域的作用，并尝试构建一个基于代码的统一生命理论	文章主要是一个概念性综述，缺乏具体的实验验证或数据分析	探讨代码在不同学科中的多样性和共同点，以促进跨学科的统一理论	代码在数学、计算机科学、心理学、文化、生物学等多个学科中的应用和影响	跨学科研究	NA	NA	NA	NA	NA
106	2025-07-23	Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments 2025-Jul, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881 PMID:40473172	综述	本文全面分析了基于支架的递送系统在癌症免疫治疗中的最新创新，重点关注工程化蛋白质支架作为多功能平台的设计原则、合成方法和治疗应用	探讨了能够同时解决系统性毒性、肿瘤穿透不足和免疫抑制性肿瘤微环境治疗不足等挑战的多功能蛋白质支架平台，并整合了AI驱动的生成模型和强化学习算法等先进技术	未提及具体的临床转化障碍或人体试验数据	开发能够同时实现治疗递送和肿瘤微环境分子成像的双模态癌症应用平台	工程化蛋白质支架及其在癌症免疫治疗中的应用	合成生物学	癌症	AI驱动的生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制	NA	NA	NA
107	2025-07-23	Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review 2025-Jul, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133 PMID:40499858	综述	本文综述了β-葡萄糖苷酶（BGL）的分子工程和生物技术进展及其工业应用	探讨了多种酶工程策略，包括异源表达、CRISPR-Cas9基因编辑和组学方法，以提高BGL的催化性能和工业适用性	尽管有多种改进策略，BGL的低催化效率、底物特异性窄和对操作条件的敏感性仍限制其大规模应用	提高β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性，以促进可持续和经济的生物转化过程	β-葡萄糖苷酶（BGL）	生物技术	NA	CRISPR-Cas9, 组学方法（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）, 酶固定化	NA	NA	NA
108	2025-07-23	Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila 2025-Jul, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253 PMID:40517854	研究论文	本研究在全基因组范围内鉴定了Ophiorrhiza pumila中的15种10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs)，并对其中的Op10HGO1、Op10HGO2和Op10HGO3进行了酶活性测定，发现Op10HGO2和Op10HGO3在NADP存在下能将10-羟基香叶醇转化为10-氧代香叶醇、10-氧代香叶醛和10-羟基香叶醛，而Op10HGO1催化产生10-氧代香叶醇和10-羟基香叶醛	首次在全基因组范围内鉴定了Ophiorrhiza pumila中的10HGOs，并明确了Op10HGO2在喜树碱生物合成中的关键作用	仅对三种10HGOs进行了功能验证，未全面研究所有15种10HGOs的功能	通过鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因，为利用合成生物学工具在异源系统中重建喜树碱生物合成途径提供元件	Ophiorrhiza pumila中的10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs)	合成生物学	癌症	基因组学分析、酶活性测定、转基因技术	NA	基因组数据、酶活性数据	15种10HGOs基因，其中3种进行了功能验证
109	2025-07-23	Ultra-high throughput mapping of genetic design space 2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.03.16.532704 PMID:36993481	研究论文	介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，用于高通量评估任意长度构建体的表达谱	结合长读长和短读长NGS技术，实现对多kb长度尺度上基因电路设计的定量评估	未提及具体的技术限制或实验条件限制	加速合成生物学研究，通过高通量筛选揭示基因部件的可组合性规则	人类细胞中的基因电路设计	合成生物学	NA	NGS（长读长和短读长测序）	ML（机器学习模型）	基因序列数据	超过10种基因电路设计（5-20 kb长度）
110	2025-07-23	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用其他物种的酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和老年相关疾病	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和老年相关疾病的未开发资源	NA	探讨通过代谢调控延缓衰老和老年相关疾病的策略	来自低等生物的一组酶，这些酶影响与年龄相关过程的代谢参数	合成生物学	老年疾病	NA	NA	NA	NA
111	2025-07-23	Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells 2025-02-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00569 PMID:39898483	研究论文	该研究通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，测试了三种dCas9-DNMT3A/3L变体在不同人类细胞系和原代人类T细胞中的表现	研究发现DNMT3A催化核心的突变可以稳定dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达，同时不牺牲DNA甲基化或基因沉默性能	研究主要局限于细胞系和原代T细胞，可能限制了在其他细胞类型或体内环境中的适用性	扩展表观遗传编辑的合成生物学工具包，并为工程化dCas基础的DNMTs在原代哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图	人类细胞系和原代供体来源的人类T细胞	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, DNA甲基转移酶技术	dCas9-DNMT3A/3L变体	基因表达和DNA甲基化数据	多种人类细胞系和原代供体来源的人类T细胞
112	2025-07-23	Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease 2025-02, Nature reviews. Drug discovery DOI:10.1038/s41573-024-01089-x PMID:39681737	review	本文综述了调节性T细胞（Treg细胞）在疾病治疗中的应用及其生物学机制	探讨了利用纳米医学和合成生物学技术精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验	存在重要的未解决问题和局限性，如临床试验的结果尚不明确	研究调节性T细胞在疾病治疗中的潜力及其生物学机制	调节性T细胞（Treg细胞）	免疫学	过敏、移植、自身免疫病、癌症	NA	NA	NA	NA
113	2025-07-23	Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation 2024-Dec, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01035-6 PMID:39174659	研究论文	本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议，使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力	提出了一种将细菌转化为单寿命设备的新方法，结合了合成材料的工程简单性和自然细胞的功能性	协议的实施需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识	开发一种新型细胞底盘，用于生物技术、生物医学工程和活体治疗	细菌细胞	合成生物学	NA	细胞内水凝胶化	NA	NA	NA
114	2025-07-23	Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel 2024-Oct, Materials today. Bio DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226 PMID:39328785	研究论文	本文通过使用不同结构的细胞内水凝胶，展示了控制Cyborg Bacteria物理和生化特性的多样性	通过调节细胞内水凝胶成分，实现对Cyborg Bacteria功能和结构的调控，开创了细胞内材料工程的新领域	目前仅使用了有限种类的水凝胶成分进行实验，可能未涵盖所有潜在有用的材料组合	探索通过细胞内材料工程控制改造细菌功能的方法	Cyborg Bacteria（改造细菌）	合成生物学	NA	细胞内水凝胶技术	NA	生化数据	未明确说明具体样本数量
115	2025-07-23	Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents 2024-06-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00181 PMID:38733599	研究论文	本文介绍了一种创新的生物工程平台，通过细菌发酵高产大规模生产生物小干扰RNA（BioRNA/siRNA）制剂	开发了一种新的tRNA融合pre-miRNA载体，可在宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA制剂，成功率高且产量大	未提及在更复杂生物系统中的验证或长期效果评估	推进合成生物学领域，为研究和药物开发提供功能siRNA制剂的生物工程新平台	生物小干扰RNA（BioRNA/siRNA）制剂	合成生物学	NA	细菌发酵、tRNA融合pre-miRNA载体技术	NA	分子生物学数据	0.25 L细菌培养物中生产3-10 mg BioRNA/siRNA
116	2025-07-22	Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction 2025-Jul-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00234 PMID:40689784	研究论文	本研究展示了一种通过水凝胶固定多酶系统实现无细胞化学生物生产的方法	利用PEGDA-甘油水凝胶共固定多种无细胞表达酶，显著提高了酶的稳定性、可重用性和活性	研究仅测试了三种异源酶系统，未验证更复杂酶系统的适用性	开发可重复使用且稳定的无细胞多酶生物生产系统	聚乙二醇二丙烯酸酯(PEGDA)水凝胶固定化酶系统	合成生物学	NA	小角X射线散射(SAXS)、荧光测量	NA	生物化学数据	三种异源无细胞表达酶系统
117	2025-07-22	Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential 2025-Jul, Archiv der Pharmazie IF:4.3Q1 DOI:10.1002/ardp.70058 PMID:40685808	综述	本文全面概述了几种重要的香豆素衍生物的抗癌机制，并探讨了提高其疗效的方法	探讨了合成生物学、生物信息学和人工智能在提高香豆素疗效方面的应用	香豆素的临床应用面临生物利用度低、代谢快、水溶性差和制剂困难等挑战	评估香豆素衍生物在癌症治疗中的机制和临床潜力	香豆素衍生物（如香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异嗪皮啶和补骨脂素）	癌症治疗	乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌	合成生物学、生物信息学、人工智能	NA	NA	NA
118	2025-07-22	Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding 2025-Jan-28, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.4c10720 PMID:39895733	research paper	本文介绍了一种无需淬灭剂的荧光监测方法，用于观察G-四链体结构的折叠过程	提出了一种仅需单一染料标记、无需淬灭剂的FRET类似格式监测G-四链体展开过渡的新方法	未明确提及方法在复杂生物环境中的适用性或与其他技术的比较	开发低成本、高通量的工具以监测G-四链体结构的折叠与展开过渡	富含鸟嘌呤的DNA序列及其形成的G-四链体结构	合成生物学	NA	荧光共振能量转移(FRET)类似技术	NA	荧光信号数据	多种G-四链体形成DNA序列（具体数量未说明）
119	2025-07-22	Robust genetic codes enhance protein evolvability 2024-May, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.3002594 PMID:38754362	研究论文	本文探讨了标准遗传密码的稳健性如何影响蛋白质的可进化性，并通过大规模并行序列到功能实验分析了多种重连遗传密码的效果	首次通过实验数据构建并分析了数百万种重连遗传密码下的适应性景观，揭示了稳健遗传密码如何通过平滑适应性景观增强蛋白质可进化性	研究结果在一定程度上依赖于氨基酸序列与蛋白质功能之间的具体关系，可能无法完全推广到所有蛋白质系统	探究遗传密码的稳健性对蛋白质可进化性的影响，并为蛋白质工程和合成生物学提供设计原则	遗传密码和蛋白质可进化性	合成生物学	NA	大规模并行序列到功能实验	NA	mRNA序列数据	超过1600万条mRNA序列
120	2025-07-22	ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799 PMID:39301026	综述	本文综述了CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤治疗中的革命性进展及其在更广泛肿瘤应用中面临的挑战	强调了CAR T细胞工程、新型抗原靶向策略、肿瘤微环境中递送和持久性的改进，以及异体CAR T细胞作为现成疗法的发展	未提及具体临床试验数据或定量分析结果	探讨如何克服CAR T细胞疗法在实体瘤中的局限性，提高其安全性、有效性和可及性	CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用	合成生物学与工程	血液恶性肿瘤与实体瘤	CAR T细胞工程、抗原靶向策略	NA	NA	NA