合成生物学相关文章
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当前共找到 3482 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-07-24 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Jul-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 本文提出了一种生物分子自适应控制器，旨在优化基于干细胞的治疗，通过引导干细胞分化朝向特定细胞命运 | 设计了一种类似于非相干前馈环（IFFL）拓扑结构的生物分子自适应控制器，无需深入了解内源性网络机制即可实现细胞命运的定向控制 | 需要进一步实验验证控制器的实际应用效果以及在更复杂生物系统中的适用性 | 优化基于干细胞的治疗方法，提高特定细胞类型的产量 | 干细胞分化过程 | 合成生物学 | NA | 生物分子自适应控制技术 | Incoherent Feedforward Loop (IFFL) | 理论分析和计算模拟数据 | NA |
| 82 | 2025-07-24 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Jul-23, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为可持续食品生物技术潜在底盘的应用，包括其在多组学生物学、食品成分生产细胞工厂构建、合成生物学和代谢工程工具箱的进展，以及将食品废弃物转化为有价值产品的潜力 | 探讨了红酵母作为细胞工厂的潜力，特别是在食品废弃物增值方面的应用，并总结了当前在多组学信息挖掘、遗传工具箱效率及独特代谢特征理解方面的不足 | 红酵母的代谢工程受到多组学信息挖掘不足、遗传工具箱效率低下及独特代谢特征理解不深的限制 | 探索红酵母作为可持续食品生物技术底盘的应用潜力 | 红酵母（Rhodotorula spp.） | 食品生物技术 | NA | 多组学生物学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 83 | 2025-07-24 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨了计算生物学与肿瘤学的结合，特别是通过设计定制蛋白质和肽结合物来克服癌症治疗中的障碍 | 利用计算设计、定向进化和人工智能，设计具有高特异性、稳定性和治疗潜力的结合分子，突破了天然蛋白质支架的限制 | 计算算法如Rosetta和AlphaFold在无序区域和构象动力学方面的准确性存在局限 | 探索从头设计蛋白质和肽结合物的方法，以改善癌症的诊断和治疗 | 蛋白质和肽结合物 | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | NA | NA |
| 84 | 2025-07-24 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
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研究论文 | 本文开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法，利用两种不同的蛋白质单元在精心设计的条件下创建独特的管状结构 | 通过模仿肌动蛋白丝，将螺旋构象融入管状组装体，从而丰富了其结构多样性，并且这些组装体可以响应环境刺激可逆地解离和重组 | NA | 深化对蛋白质组装设计和复杂生物结构的理解，同时拓宽合成生物学和材料科学的视野 | 两种不同的蛋白质单元 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 85 | 2025-07-24 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation, engineering to synthetic biology
2025-Jul-21, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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研究论文 | 本文探讨了紫杉醇类化合物的生物合成途径多样性，提出了通过工程化关键酶和利用合成生物学策略来可持续生产紫杉醇类化合物的方法 | 提出了AI引导的CYP450s定向进化策略，用于设计具有所需特性的酶，促进新型紫杉醇衍生物的生产 | 目前仅对导致紫杉醇的一型紫杉烷骨架的生物合成途径接近完全阐明，其他类型紫杉烷骨架的途径尚不明确 | 扩大紫杉醇类化合物库并开发可持续的生产方法 | 紫杉醇类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因电路、AI引导的定向进化 | NA | NA | NA |
| 86 | 2025-07-24 |
Construction and phenotypic classification of synthetic dual-pole Escherichia coli cells
2025-Jul-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08495-w
PMID:40684034
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研究论文 | 本文介绍了一种第二代合成基因电路，使两种不同的支架蛋白能够在大肠杆菌的相反极定位 | 通过工程化PodJ片段作为第二个支架，并将SpmX与PopZ直接嵌合，有效将PopZ和PodJ限制在大肠杆菌的相反极 | NA | 研究合成生物学中可编程细胞分化的工具 | 大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | 神经网络 | NA | NA |
| 87 | 2025-07-24 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究揭示了噬菌体转录因子gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的机制 | 首次通过冷冻电镜结构解析了gp79如何取代宿主σ70并激活自身σ因子gp36的转录 | 研究仅针对大肠杆菌噬菌体phiEco32的转录调控机制，其他噬菌体可能存在不同机制 | 阐明噬菌体转录因子gp79的双重调控作用机制 | 大肠杆菌噬菌体phiEco32的转录因子gp79和σ因子gp36 | 分子生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 结构生物学数据 | NA |
| 88 | 2025-07-24 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 开发了一种基于群体感应和CRISPR干扰的动态代谢调控工具包QICi，用于优化微生物代谢通路 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰系统整合，实现细胞密度响应的动态基因调控 | 目前仅在枯草芽孢杆菌中验证，尚未在其他微生物系统中测试 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢通路 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、I型CRISPR干扰系统 | NA | NA | 5升补料分批发酵规模 |
| 89 | 2025-07-24 |
Quantum bioelectrochemical (QBIOL) software based on point stochastic processes
2025-Jul-19, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-025-01603-1
PMID:40683983
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研究论文 | 介绍了一种名为QBIOL的量子生物电化学软件，该软件结合分子动力学、应用数学、GPU编程和量子电荷传输，用于模拟生物电化学过程中的随机电子转移 | QBIOL软件首次整合了分子动力学、应用数学、GPU编程和量子电荷传输，能够模拟生物电化学过程中的随机电子转移，填补了现有模拟方法在捕捉分子运动和电子转移随机性方面的不足 | 论文未明确提及QBIOL软件在实际应用中的具体限制，如计算资源需求或模拟精度等 | 开发一种能够模拟生物电化学过程中随机电子转移的软件工具，以推动合成生物学、医疗保健和催化领域的研究 | 生物电化学过程，特别是电极附着的氧化还原标记DNA或纳米限制的氧化还原物种在电激励下的电流生成 | 生物电化学 | NA | 分子动力学、量子电荷传输、GPU编程 | NA | 模拟数据 | NA |
| 90 | 2025-07-24 |
Engineering bi-directional chemically-modulated synthetic condensates for cellular control
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61877-w
PMID:40675979
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研究论文 | 本文提出了一种基于雄激素受体（AR）及其临床药物的理性工程方法，创建了一个名为ARDrop的化学遗传平台，用于调控相分离凝聚体的形成与溶解 | 开发了一种可逆操控生物分子凝聚体的强大工具包，为合成生物学应用中的设计凝聚体工程奠定了基础 | 未明确提及具体局限性 | 开发精确操控相分离凝聚体的工具，实现复杂细胞信号传导的解析 | 雄激素受体（AR）及其临床药物 | 合成生物学 | NA | 化学遗传平台 | NA | NA | NA |
| 91 | 2025-07-24 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计具有强细胞类型特异性的人类合成增强子 | 采用迭代深度学习优化模型，设计出比内源增强子更具选择性的合成增强子，并验证了其细胞类型特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系，未涉及更广泛的细胞类型或体内环境 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题 | 人类合成增强子 | 合成生物学 | NA | 迭代深度学习 | 深度学习模型 | 增强子活性和染色质可及性数据 | 两种人类细胞系 |
| 92 | 2025-07-24 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 本文介绍了合成生物学与纳米医学结合的新概念——合成生物纳米医学，并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与差异 | 提出了合成生物纳米医学这一新概念，整合了合成生物学的基因工程策略与纳米医学 | 未提及具体实验数据或案例研究，主要停留在概念层面 | 探索合成生物学在纳米医学设计中的应用潜力 | 合成生物纳米医学的设计原理与方法 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 93 | 2025-07-24 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种用于检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 利用锌摄取调节器(Zur)控制的启动子与记忆电路结合，开发了一种能够检测和记录体内肠道炎症的生物传感器，并具有诊断和治疗功能 | 目前仅在两种独立的小鼠结肠炎模型中进行了验证 | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物体 | 肠道炎症 | 合成生物学 | 肠道炎症 | 合成生物学技术 | NA | 生物标志物数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 |
| 94 | 2025-07-24 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 本研究开发了一种结合氧气自供蓝藻与多功能前药纳米颗粒的生物治疗平台，用于增强光动力免疫治疗癌症的效果 | 创新点在于将蓝藻与多功能前药纳米颗粒结合，形成自供氧和纳米颗粒的生物治疗平台，同时实现光动力治疗和免疫调节 | 未提及具体的临床前或临床试验结果，可能缺乏实际应用验证 | 开发新型生物治疗平台以增强癌症的光动力免疫治疗效果 | 癌症治疗 | 纳米医学 | 癌症 | 光动力疗法、免疫疗法 | NA | NA | NA |
| 95 | 2025-07-24 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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研究论文 | 本文探讨了如何利用高通量突变筛选技术理解、抑制和设计膜转运蛋白 | 提出了高通量筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力，特别是在理解多特异性转运的分子基础、设计抑制剂以及工程化转运蛋白方面的创新应用 | 高通量筛选方法在转运蛋白领域的应用仍不广泛，影响有限 | 研究膜转运蛋白的功能和多特异性转运的分子基础 | 多特异性膜转运蛋白 | 生物技术 | NA | 高通量突变筛选 | NA | NA | NA |
| 96 | 2025-07-24 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 本研究通过调控藻胆素代谢，对蓝藻的藻胆蛋白和藻胆体进行功能修饰，实现了对光环境的适应性调整 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型7942 PEB1菌株，实现了藻胆体结构的可逆颜色变化和稳定嵌合藻胆体复合物的形成 | 未对PEB结合藻胆体复合物的具体性质进行详细表征 | 研究藻胆体在不同光环境下的适应机制及其在生物工程中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其藻胆蛋白和藻胆体 | 合成生物学 | NA | PEB合成酶(PebA和PebB)的异源表达 | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-07-24 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
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综述 | 本文综述了利用酵母隔离技术研究和工程化翻译后修饰酶（PTM-enzymes）的原理和方法 | 首次详细讨论了酵母内质网隔离技术，并综述了酵母表面展示和细胞质隔离等方法的创新应用 | 不同系统的测量和控制酶催化效率的能力存在局限性 | 探索PTM-enzymes的酶学和生物学机制，开发能够探测和调控它们的分子，并赋予它们改进和新功能 | 翻译后修饰酶（PTM-enzymes） | 合成生物学 | NA | 酵母隔离技术（包括酵母表面展示、细胞质隔离和内质网隔离） | NA | NA | NA |
| 98 | 2025-07-24 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 该研究利用多色光遗传学工具EL222和CcaSR在大肠杆菌中调控三种糖酵解途径的流量比例 | 首次展示了通过蓝光和绿/红光调控大肠杆菌中EMP、PP和ED三种糖酵解途径的流量比例 | 研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他生物体中验证 | 开发光遗传学工具调控代谢流量分布 | 大肠杆菌的糖酵解途径(EMP、PP和ED) | 合成生物学 | NA | 光遗传学(EL222和CcaSR系统) | NA | NA | NA |
| 99 | 2025-07-24 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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review | 本文回顾了CAR T细胞的当前逻辑能力、其局限性以及为解决这些问题所进行的工程改进，并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法的发展 | 提出了“合成免疫疗法”这一新子领域，展示了合成生物学如何赋予免疫细胞更复杂的逻辑能力 | 当前CAR T细胞疗法依赖单一类型传感器，导致对表达抗原的正常组织产生不必要的毒性，且未调节的激活会导致不必要的细胞因子毒性 | 探讨如何通过合成生物学改进CAR T细胞疗法，以实现更精确和有效的癌症治疗 | CAR T细胞及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 100 | 2025-07-23 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”在不同学科中的含义、意图和形式化，并试图构建一个跨学科的代码研究框架 | 提出了一个跨学科的视角，探讨代码在生物学、心理学、文化等多个领域的作用，并尝试构建一个基于代码的统一生命理论 | 文章主要是一个概念性综述，缺乏具体的实验验证或数据分析 | 探讨代码在不同学科中的多样性和共同点，以促进跨学科的统一理论 | 代码在数学、计算机科学、心理学、文化、生物学等多个学科中的应用和影响 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | NA | NA |