合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-07-22	In situ chromatin interactomics using a chemical bait and trap approach 2020-06, Nature chemistry IF:19.2Q1 DOI:10.1038/s41557-020-0474-8 PMID:32472103	研究论文	本文介绍了一种利用化学诱饵和捕获方法研究染色质原位相互作用组学的新技术	开发了一种合成生物学方法，在天然染色质中设置hPTM控制的光亲和陷阱，用于捕获瞬时相互作用因子	NA	探索表观遗传调控和失调的分子机制	组蛋白翻译后修饰(hPTMs)的生理结合伙伴	表观遗传学	癌症	光亲和标记技术，定量蛋白质组学	NA	蛋白质组数据	NA
122	2025-07-21	Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives 2025-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932 PMID:40609762	综述	本文综述了中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）的微生物生产现状与未来展望	提出了一种适用于不同链长的通用生物合成途径，并探讨了合成生物学、适应性实验室进化和AI驱动酶设计等未来研究方向	微生物底盘选择和优化速度较慢，限速酶活性不足，中间体和终产物毒性问题尚未完全解决	开发可持续的中链长度二醇生物生产方法以替代化石基工业过程	中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）	合成生物学	NA	代谢工程策略、高级蛋白质工程技术、过程优化	NA	NA	NA
123	2025-07-21	Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast 2025-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936 PMID:40614874	综述	本文综述了酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展，重点介绍了代谢工程策略和发酵优化方法	强调了结构相关衍生物共有的生物合成逻辑，并将其分为两大类：叶黄素类（如角黄素、玉米黄质等）和类胡萝卜素衍生物（如藏红花酸、视黄醇等）	未来工作可能需要扩大不同酵母宿主中的产物多样性并提高生物合成效率以实现更可持续的生产	探索酵母作为生产宿主在β-胡萝卜素及其衍生物可持续微生物生产中的潜力	酵母（特别是酿酒酵母和解脂耶氏酵母）中β-胡萝卜素及其衍生物的生物合成	合成生物学	NA	代谢工程策略和发酵优化	NA	NA	NA
124	2025-07-21	Biohybrid technologies for CO2 conversion to fuels and chemicals: Advances in bio-electro-, bio-photoelectro-, and bio-photocatalysis 2025-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132949 PMID:40639626	综述	本文综述了生物杂交技术在二氧化碳转化为燃料和化学品中的最新进展，重点介绍了生物电催化、生物光电催化和生物光催化三种关键技术	总结了生物杂交技术在二氧化碳转化中的创新应用，包括界面电子转移、生物相容性优化以及系统耦合反应	讨论了经济可行性方面的关键挑战，未提及具体技术在实际应用中的大规模推广限制	探索高效、可持续的二氧化碳转化技术，以实现碳中和社会	二氧化碳转化技术及其在燃料和化学品生产中的应用	生物技术与化学工程	NA	生物电催化(BEC)、生物光电催化(BPEC)、生物光催化(BPC)	NA	NA	NA
125	2025-07-21	Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature 2025-Aug-15, Journal of proteomics IF:2.8Q2 DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479 PMID:40482852	研究论文	研究揭示了多极端环境微生物Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温的交叉与独特适应策略	首次全面分析了N. thermophilus的热适应机制，并阐明了之前未探索的碱性特异性调控过程	对碱性适应的分子机制仍不够充分，对热适应的理解仅限于基因组分析	研究N. thermophilus在多种极端环境下的生存机制及其潜在的生物技术应用	多极端环境微生物Natranaerobius thermophilus	微生物学	NA	iTRAQ定量蛋白质组学分析	NA	蛋白质组数据	NA
126	2025-07-21	A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine 2025-Aug, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2025.102613 PMID:40449069	研究论文	探讨噬菌体作为精准医学手段在解决抗生素耐药性细菌感染中的潜力	结合基因工程、合成生物学和人工智能技术，定制化设计噬菌体以扩大宿主范围、克服细菌免疫系统并表达有利蛋白质	NA	解决抗生素耐药性细菌感染的全球健康挑战	噬菌体及其在精准医学中的应用	精准医学	细菌感染	基因工程、合成生物学、人工智能	NA	NA	NA
127	2025-07-21	Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana 2025-Jul-20, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.70213 PMID:40684353	研究论文	本研究通过瞬时表达技术在Nicotiana benthamiana中实现了复杂甾体生物碱和皂苷的多样化工程合成	发现了一种新的番茄糖基转移酶SlGAME2-NEW，并成功在异源宿主中重建了20种甾体终产物的生物合成途径	研究仅在模式植物N. benthamiana中进行验证，尚未在商业化作物中测试	开发合成生物学平台生产高价值甾体代谢产物	茄科植物甾体糖生物碱(SGAs)和甾体皂苷	合成生物学	NA	瞬时基因表达技术	NA	代谢组数据	涉及9-15个基因组合表达
128	2025-07-21	De novo designed protein guiding targeted protein degradation 2025-Jul-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-62050-z PMID:40676011	研究论文	开发了一种名为GPlad的引导蛋白质标记和降解系统，用于精确降解多种蛋白质	使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶（McsB）实现精确蛋白质降解，无需预先融合降解标签或化学降解剂	目前仅在Escherichia coli中验证，尚未在其他生物系统中测试	开发一种可调谐、即插即用的蛋白质降解策略，用于合成生物学和代谢工程	荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质等多种蛋白质	合成生物学	NA	从头蛋白质设计	NA	蛋白质数据	多种蛋白质（包括荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质）
129	2025-07-21	Efficient, cell-type-specific production of flavonols by multiplexed CRISPR activation of a suite of metabolic enzymes 2025-Jul-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-61742-w PMID:40670339	研究论文	本文介绍了一种高效的CRISPR激活系统，能够在稳定细胞系中以细胞类型特异性方式驱动基因表达，并应用于植物代谢途径的重编程	开发了首个能够在稳定植物细胞系中实现细胞类型特异性基因激活的CRISPR系统，突破了现有技术只能实现瞬时或泛在表达的局限	需要依赖荧光报告基因系在细胞水平评估表达效果，可能增加实验复杂度	开发植物合成生物学工具以实现细胞类型特异性的多基因协同调控	植物根系组织（内皮层和表皮层）	合成生物学	NA	CRISPR基因激活系统	NA	荧光成像数据	使用myb12突变体作为研究模型
130	2025-07-21	Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative 2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00865 PMID:40134314	研究论文	本文研究了一种酒精依赖的半萜途径在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的广泛特异性	揭示了ADH模块的第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性，并展示了ADH模块和异戊二烯基转移酶的组合特异性足以在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物	NA	探索半萜途径在合成生物学中扩展化学空间的潜力	酒精依赖的半萜途径及其酶	合成生物学	NA	ADH途径	NA	NA	NA
131	2025-07-21	Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems 2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598 PMID:40252292	综述	本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征，重点讨论了内共生体和宿主在进化过程中的分子变化	讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征，并探讨了实验室工程化内共生的研究进展	未提及具体的研究数据或实验结果的局限性	探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用	线粒体和叶绿体等内共生细胞器	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
132	2025-07-21	Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast 2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.12.557247 PMID:37745555	research paper	该研究通过PADDLE预测器系统性地鉴定了植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域	首次在全基因组范围内探索非转录因子蛋白中的激活域，并验证了这些域在转录调控中的作用	研究仅针对两种模式真核生物（植物和酵母），结果可能不适用于其他生物	系统鉴定非转录因子蛋白中的转录激活域并探索其功能	植物和酵母中的非转录因子蛋白	合成生物学	NA	PADDLE预测器	NA	蛋白质序列数据	>800个非转录因子基因的18,000个片段
133	2025-07-21	Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases 2023-07-14, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adh1114 PMID:37440620	综述	本文探讨了人工智能在检测、治疗和理解传染病中的应用及其进展	强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解及诊断加速中的快速进展	未具体说明人工智能技术在特定传染病案例中的应用限制	探讨人工智能如何助力控制传染病爆发和大流行	传染病及其防控	人工智能	传染病	人工智能	NA	NA	NA
134	2025-07-20	The secret life of RNA and lipids 2025-Dec, RNA biology IF:3.6Q2 DOI:10.1080/15476286.2025.2526903 PMID:40613519	综述	探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义	揭示了RNA可以序列依赖性地选择性结合脂质膜，为工程化RNA传感器和调控元件提供了新思路	NA	探索RNA与脂质相互作用的基础化学原理及其在合成生物学和细胞调控中的应用	RNA和脂质	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
135	2025-07-20	A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules 2025-Feb-12, Cell host & microbe IF:20.6Q1 DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002 PMID:39947133	meta-analysis	通过元分析研究炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs)，发现与克罗恩病(CD)相关的两种梭菌衍生BGCs及其产物	首次鉴定了与克罗恩病相关的特定微生物小分子，并揭示了这些分子通过破坏肠道通透性加剧疾病的机制	研究结果主要基于小鼠模型，在人体中的直接作用机制仍需进一步验证	探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病发病机制中的作用	炎症性肠病患者的肠道微生物组及其代谢产物	微生物组学	炎症性肠病(包括克罗恩病)	元分析、合成生物学、质谱分析	NA	宏基因组数据、代谢组数据	IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本
136	2025-07-20	Orthogonalized human protease control of secreted signals 2025-Jan-15, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01831-x PMID:39814991	research paper	该研究开发了一种名为hDIRECT的平台，利用人类来源的蛋白质控制细胞因子活性，以支持基于细胞的疗法	使用人类来源的蛋白质构建正交化合成电路，避免了非人类来源蛋白质的免疫原性风险	研究仍处于概念验证阶段，尚未进行大规模临床应用验证	开发能够控制细胞因子活性的合成生物学平台，支持细胞疗法	人类蛋白酶及其抑制剂，以及工程化细胞因子(IL-2、IL-6和IL-10)	合成生物学	癌症免疫治疗、肌肉再生	蛋白质工程、蛋白酶调控	NA	蛋白质活性数据	NA
137	2025-07-20	Transforming vaccinology 2024-Sep-19, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021 PMID:39303685	review	本文回顾了疫苗学的历史创新和最新进展，探讨了未来疫苗发展的潜力	强调了mRNA疫苗、反向疫苗学、合成生物学和结构设计等技术革命对疫苗开发的深远影响	未提及具体实验数据或样本规模的详细信息	探讨疫苗学领域的技术进步和未来发展方向	疫苗开发技术和人类免疫反应	疫苗学	COVID-19, 脑膜炎球菌B, 呼吸道合胞病毒(RSV)	mRNA疫苗, 反向疫苗学, 合成生物学, 结构设计	NA	NA	NA
138	2025-07-20	Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists 2024-Jun-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49626-x PMID:38926339	研究论文	提出一个跨尺度的合成生物学培训框架，旨在为学生提供整合跨学科概念的工具	通过解构生物技术在不同尺度（分子、电路/网络、细胞/无细胞系统、生物群落和社会）的应用，提供了一个全面的培训框架	未提及具体实施中的挑战或学生反馈的局限性	开发一个跨学科的合成生物学培训框架，以促进生物技术的负责任创新	合成生物学学生和教育者	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
139	2025-07-20	Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types 2024-Apr-22, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00424-5 PMID:38649904	研究论文	本研究探讨了水通道蛋白Aquaporin-1（Aqp1）作为磁共振成像遗传报告基因的安全性和有效性	证明Aqp1过表达不会影响细胞活力或形态，且不引起ER应激，消除了其作为深度组织报告基因的安全顾虑	研究仅在小鼠和人类多种细胞系中进行，尚未在完整生物体内验证	评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的应用安全性	小鼠和人类多种细胞系	合成生物学	NA	磁共振成像	NA	细胞影像数据	多种小鼠和人类细胞系（未明确数量）
140	2025-07-20	From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00637 PMID:38587290	研究论文	该研究从自然微生物筛选到外源宿主中实现持续的几丁质酶活性	通过筛选海洋水样发现具有几丁质酶活性的微生物，优化转化方法并在异源宿主中实现持续几丁质酶活性	几丁质酶在异源宿主中表达可能产生毒性副作用	实现持续的几丁质酶活性以应用于工业	海洋微生物及几丁质酶基因	合成生物学	NA	全基因组测序与分析、异源表达	NA	基因组数据	海洋水样中的微生物