合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
161	2025-07-19	Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis 2025, Frontiers in nutrition IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fnut.2025.1581971 PMID:40667443	综述	本文综述了利用下一代益生菌和工程化细菌外膜囊泡（BEVs）进行骨质疏松精准治疗的潜力	提出结合工程化益生菌和BEV技术的新型治疗策略，通过靶向肠道-骨骼轴提供骨保护作用	标准化和安全性方面仍存在挑战	探索基于微生物组的干预措施在骨质疏松治疗中的应用	骨质疏松患者	精准医疗	骨质疏松症	合成生物学、工程化BEVs	NA	NA	NA
162	2025-07-19	Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity 2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.14.599076 PMID:38915713	研究论文	本文应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子	利用迭代深度学习方法设计合成增强子，实现细胞类型特异性，并通过实验验证和优化提高了增强子的特异性	研究仅针对两种人类细胞系，可能不适用于其他细胞类型	解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型基因表达的问题	人类细胞系中的合成增强子	合成生物学	NA	深度学习	NA	基因组序列数据	两种人类细胞系
163	2025-07-18	Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase 2025-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001 PMID:40320002	研究论文	本研究通过工程化改造硫解酶，开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物的新代谢途径	通过定向进化改造Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B（CnBktB），显著提高了其对glycolyl-CoA和acetyl-CoA的催化效率，并开发了可直接利用PET衍生的乙二醇的上游模块	NA	开发可持续的生物制造路线，将PET衍生的乙二醇转化为高价值的四碳化合物	大肠杆菌（Escherichia coli）和Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B（CnBktB）	合成生物学	NA	定向进化、代谢工程	NA	NA	NA
164	2025-07-18	Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism 2025-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007 PMID:40532756	研究论文	本研究开发了一种响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统，用于动态调控微生物细胞工厂中中心代谢的代谢流分布，以提高有价值化合物的生产性能	建立了PdhR生物传感器系统，能够动态调控中心代谢的代谢流分布，并通过筛选多种PdhR同源物和计算分析优化了生物传感器性能	大多数遗传工具具有途径或中间体特异性，限制了其在合成生物学中的广泛应用，且其在平衡细胞生长和产物形成之间的代谢流潜力尚未充分探索	开发能够动态调控中心代谢的遗传调控工具，以提高微生物细胞工厂中有价值化合物的生产性能	微生物细胞工厂中的中心代谢	合成生物学	NA	生物传感器系统、定点诱变	NA	NA	NA
165	2025-07-18	Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae 2025-Jul-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00199 PMID:40670299	综述	本文综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展	探讨了人工智能和机器学习在菌株设计和过程控制中的应用，以克服代谢瓶颈和扩大生产规模	面临代谢负担等挑战	推动化妆品行业向天然和可持续成分发展	酿酒酵母	合成生物学	NA	遗传和代谢工程、途径模块化、发酵优化	NA	NA	NA
166	2025-07-18	Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells 2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c09950 PMID:40670353	研究论文	本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡（GUNs），作为合成细胞的稳健、经济平台	提出巨型单层囊泡（GUNs）作为新型合成细胞模型，具有优异的膜流动性和对小分子及质子的选择性通透性，无需嵌入转运蛋白	未提及长期稳定性或在复杂生物环境中的表现	开发一种更稳定、经济且具有优异膜特性的合成细胞模型	巨型单层囊泡（GUNs）	合成生物学	NA	微流控技术	NA	NA	NA
167	2025-07-18	Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy 2025-Jul-14, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023 PMID:40669653	研究论文	本文探讨了利用微生物策略从食物垃圾中生产聚羟基脂肪酸酯以支持循环生物经济的方法	强调了代谢工程和合成生物学在聚羟基脂肪酸酯生产中的应用	需要进一步深入研究微生物策略	探索食物垃圾的高效利用以支持循环生物经济	食物垃圾和聚羟基脂肪酸酯	生物工程	NA	代谢工程和合成生物学	NA	NA	NA
168	2025-07-18	Polymer sailing on rafts within lipid membranes 2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2503203122 PMID:40608678	研究论文	研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学，揭示了聚合物吸附对脂质筏的诱导和稳定作用	发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分，诱导并稳定单个脂质筏，同时聚合物受到动态限制，表现出独特的扩散行为	研究主要基于模拟和单分子追踪实验，可能无法完全反映真实细胞膜的复杂性	阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用	线性聚合物和二元脂质膜	生物物理学	NA	流体动力学模拟和单分子追踪实验	Zimm模型和Saffman-Delbrück模型	模拟数据和实验数据	未明确说明具体样本数量
169	2025-07-18	A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor 2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.07.03.663076 PMID:40631274	研究论文	本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程，应用于细菌孤儿受体	通过生物信息学和结构分析预测PAS域，利用片段库筛选出三种能显著提高CU228热稳定性的配体，并采用多种技术验证其结合特性	研究仅针对CU228这一特定蛋白质，未验证其在更广泛PAS蛋白中的适用性	开发一种筛选小分子配体的方法，用于增强孤儿PAS蛋白的稳定性	细菌孤儿受体CU228（一种PAS-HTH转录因子）	合成生物学	NA	差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR	NA	蛋白质结构数据、光谱数据	约760种化合物的片段库
170	2025-07-17	Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family 2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry IF:2.9Q1 DOI:10.1039/d5ob00766f PMID:40576641	研究论文	本研究通过结合合成生物学与合成电化学，开发了一种环境友好的方法来合成吲哚咔唑类化合物，并扩展了其化学空间	首次将合成生物学与合成电化学结合，实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成，并发现了N-N同源二聚化的新结构	未明确提及实验规模或工业化应用的可行性	开发绿色合成方法以扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性	吲哚咔唑类化合物及其衍生物	合成化学	NA	合成生物学、合成电化学、酶促糖基化	NA	化学合成数据	17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试
171	2025-07-17	Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology 2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173 PMID:40600973	研究论文	本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架，旨在通过将代谢抽象为管道和阀门的网络，简化食品合成生物学中的设计和工程过程	提出了管道代谢模型，将代谢网络抽象为管道和阀门，分离酶水平控制和途径水平优化，简化设计逻辑	模型的实际应用效果和广泛适用性尚未经过大规模验证	降低合成生物学研究的障碍，促进可持续食品生产的创新	功能性食品分子（如碳水化合物、蛋白质和脂肪）的生产	合成生物学	NA	代谢工程	管道代谢模型	NA	NA
172	2025-07-17	Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles 2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.5c06134 PMID:40605254	研究论文	本研究介绍了一种由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂质聚合物的合成	通过将聚脯氨酸链锚定在膜上，实现了可逆的相分离，高温形成簇，冷却后分散，动态控制局部膜组成	NA	探索新型脂质聚合物在膜微区形成和渗透性控制方面的应用	由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物	合成生物学	NA	共聚焦显微镜和FRAP分析	NA	NA	NA
173	2025-07-17	Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide 2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053 PMID:40611812	研究论文	本研究开发了一种灵活的无细胞（膜）蛋白质合成系统（CF(M)PS），用于研究与膜蛋白相关的糖生物学，并成功应用于糖缀合物的生产	开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统，用于膜蛋白的转录翻译耦合和溶解，成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并启动了EPS合成	研究未提及该系统在大规模生产中的效率或成本效益	扩展合成生物学工具包，研究细胞外多糖的合成途径	微生物细胞外多糖（EPS）及其合成途径中的关键酶和膜相关生化反应	合成生物学	NA	无细胞蛋白质合成系统（CF(M)PS），纳米脂质体膜模拟物	NA	生化反应数据	未明确提及具体样本数量，但使用了CGMCC 2876的膜结合磷酸糖基转移酶
174	2025-07-17	Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside 2025-Jul-16, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00712-25 PMID:40668011	研究论文	通过代谢工程改造酿酒酵母，实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成	优化了酿酒酵母菌株，实现了羟基酪醇和红景天苷的高效生物合成，并通过增强UDP-葡萄糖供应显著提高了红景天苷的产量	研究中未提及菌株的长期稳定性或大规模生产中的潜在问题	开发高效生物合成羟基酪醇和红景天苷的方法，以解决其自然提取产量低和化学合成复杂的问题	酿酒酵母菌株及其代谢途径	合成生物学	NA	代谢工程、发酵技术	NA	NA	使用了优化的酿酒酵母菌株（ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3），并在摇瓶和15 L生物反应器中进行发酵
175	2025-07-17	Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review 2025-Jul-16, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5nr01369k PMID:40668604	综述	本文综述了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学中的应用	系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其多功能应用，特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化中的潜力	面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战	探讨铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学领域的应用	铁蛋白纳米颗粒	生物医学	神经退行性疾病	化学修饰、基因工程、仿生矿化	NA	NA	NA
176	2025-07-17	A digital plating platform for robust and versatile microbial detection and analysis 2025-Jul-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-11525-6 PMID:40653544	research paper	介绍了一种数字平板（DP）平台，该平台结合了传统平板培养和数字生物检测技术，用于微生物的快速分离、定量和表型特征分析	提出了一个结合传统平板培养和数字生物检测技术的数字平板平台，实现了微生物的快速检测和分析，显著缩短了检测时间并提高了单细胞分辨率	未提及具体的技术限制或潜在问题	开发一种快速、高效的微生物检测和分析平台	微生物（如大肠杆菌）及其在混合微生物群落中的行为	microbiology	NA	digital bioassay technology, high-density picoliter microwell array chip	NA	microbial data	未提及具体样本数量，但涉及多种微生物实验（如大肠杆菌）
177	2025-07-17	Synthetic biology for space exploration 2025-Jul-12, NPJ microgravity IF:4.4Q1 DOI:10.1038/s41526-025-00488-7 PMID:40651964	research paper	本文探讨了合成生物学在太空探索中的潜在应用，包括资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康等关键主题	提出合成生物学作为推动人类太空和行星探索的有力工具，并为短期、中期和长期发展提供建议	NA	探索合成生物学在解决太空探索挑战中的应用	太空探索中的资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
178	2025-07-17	Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds 2025-Jul-09, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641 PMID:40645511	综述	本文综述了酵母作为C1细胞工厂，将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望	探讨了合成甲基营养在非甲基营养酵母中的应用，以及通过非理性基因组工程和理性设计揭示C1途径和底物耐受机制	C1气体生物转化技术尚未解决的技术限制仍阻碍其工业应用	研究如何利用酵母将温室气体转化为高价值生化产品，以实现可持续的工业脱碳	工业酵母及其对甲醇和甲酸盐的耐受和同化能力	合成生物学	NA	合成甲基营养、非理性基因组工程、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合	NA	NA	NA
179	2025-07-17	The XNA alphabet 2025-Jul-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf635 PMID:40650979	综述	本文综述了50年来化学家设计和合成的糖修饰核酸（XNA）系统，探讨了其在生物技术和合成生物学中的应用	系统总结了XNA的构象行为及其与天然核酸的正交性，为XNA复制和进化提供了更理性的方法	未提及具体实验数据或样本量，主要为基础性综述	探讨糖修饰核酸（XNA）的构象特性及其在合成生物学等领域的应用潜力	糖修饰核酸（XNA）系统	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
180	2025-07-17	Expanding genetic engineering capabilities in Vibrio natriegens with the Vnat Collection 2025-Jul-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf580 PMID:40650977	研究论文	本文介绍了Vnat Collection，一个专为Vibrio natriegens设计的模块化工具包，旨在克服其遗传工程工具的不足	通过优化的Golden Gate克隆策略和改进的连接序列，实现了组装效率的300倍提升，并引入了新型操作子连接器和精确的基因调控系统	NA	扩展Vibrio natriegens的遗传工程能力，以充分发挥其在合成生物学中的潜力	Vibrio natriegens	合成生物学	NA	Golden Gate克隆策略、NT-CRISPR方法	NA	NA	超过220个经过严格验证的模块化组件