合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
581	2025-01-23	A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii 2025-Jan-22, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15360 PMID:39838873	研究论文	本研究利用DD/Shield-1系统在Chlamydomonas reinhardtii中实现了外源基因表达的快速、稳定和可逆调控	首次在微藻中应用DD/Shield-1系统，展示了其作为分子开关的潜力，并成功构建了基因编辑蛋白LbCas12a的诱导表达菌株	研究中未提及该系统在其他微藻或更广泛生物系统中的适用性	开发一种在Chlamydomonas reinhardtii中调控外源基因表达的新方法	Chlamydomonas reinhardtii	合成生物学	NA	DD/Shield-1系统	NA	NA	NA
582	2025-01-23	Metabolic Engineering of Yeast 2025-Jan-21, Annual review of biophysics IF:10.4Q1 DOI:10.1146/annurev-biophys-070924-103134 PMID:39836878	综述	本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景，包括用于生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株的开发，以及合成生物学工具和数学建模的进展	本文强调了合成生物学和代谢模型在加速代谢工程设计-构建-测试-学习周期中的重要作用，展示了酵母菌株在复杂表型开发中的潜力	本文主要关注酵母代谢工程，未涉及其他微生物细胞工厂的应用和比较	探讨酵母作为工业生物技术平台细胞工厂的代谢工程进展	酵母菌株	合成生物学	NA	合成生物学工具和数学建模	NA	NA	NA
583	2025-01-23	Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells 2025-Jan-21, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BST20231285 PMID:39838922	研究论文	本文讨论了在合成细胞中从头构建机械敏感信号通路的最新进展	将机械敏感通道整合到合成细胞中，创建新的机械敏感信号通路	NA	研究机械转导的机制，并开发新的生物技术应用	合成细胞和机械敏感信号通路	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
584	2025-01-23	Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00689 PMID:39709556	review	本文回顾了自1961年Jacob和Monod描述操纵子以来，基于转录因子的生物传感器的发展历程，并探讨了其未来的前景和挑战	分析了从1960年代到2000年代的基础研究里程碑以及2000年代以后的工程策略，提供了对未来视角的深入见解	尽管取得了许多进展，但仍有许多障碍需要克服，以充分发挥生物传感器技术的潜力	回顾和总结基于转录因子的生物传感器的发展历程，并探讨其未来的应用前景	基于转录因子的生物传感器	合成生物学	NA	高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程	NA	NA	NA
585	2025-01-23	Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00551 PMID:39754601	研究论文	本文通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过结合这两种调制方法来微调开关特性	首次系统地探索了宿主环境和核糖体结合位点调制在遗传开关设计中的联合应用，揭示了宿主环境对性能的显著影响	研究仅涉及九种核糖体结合位点组成和三种宿主环境，可能未涵盖所有可能的组合	探索遗传开关的设计空间，以优化其性能特性	遗传开关的27种变体	合成生物学	NA	核糖体结合位点调制和宿主环境变化	NA	遗传开关输出和宿主生长动态数据	27种电路变体
586	2025-01-23	ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00697 PMID:39754602	研究论文	本研究扩展了PURE系统，通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，实现了从丙酮酸再生ATP	提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有的肌酸基系统结合使用，显著提高了蛋白质合成效率	需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM），这可能会在某些应用中受到限制	工程化PURE系统，以增强其在无细胞合成生物学和合成细胞构建中的应用	PURE系统及其ATP再生途径	合成生物学	NA	ATP再生系统	NA	NA	多个批次的自制PURE系统和商业系统（如PURExpress）
587	2025-01-23	Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System 2025-Jan-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00618 PMID:39757539	研究论文	本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成反应寿命和提高产量	使用易于组装的商业组件构建中尺度透析系统，实现了PURE系统中蛋白质合成的长期稳定性和高产率	需要定期更换喂养溶液，且系统依赖于商业组件，可能限制了其广泛应用	延长PURE无细胞系统中的蛋白质合成反应寿命和提高产量	PURE无细胞系统	合成生物学	NA	透析技术	NA	NA	NA
588	2025-01-23	A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study 2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts IF:3.3Q3 DOI:10.1186/s13068-024-02599-x PMID:39825460	研究论文	本文介绍了一种利用平行生物反应器快速绘制特定产物形成速率、特定底物利用速率和特定生长速率之间生长耦合关系的方法，并以甲羟戊酸为例进行了研究	使用平行生物反应器快速评估生产力和生长速率与产物收率系数之间的生长耦合关系，并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成	研究中形成的乙酸盐可能会减缓生长并在下游处理中引起问题	研究生物制造的经济可行性，特别是通过工程微生物从可再生原料生产化合物	甲羟戊酸的生产	合成生物学	NA	基因编辑	NA	实验数据	使用大肠杆菌BW25113进行实验
589	2025-01-23	Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy 2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England) DOI:10.1007/s12032-024-02578-0 PMID:39666238	综述	本文综述了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用，特别是其在改善肿瘤微环境（TME）方面的潜力	沙门氏菌因其广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性，成为癌症免疫治疗中的领先候选者	开发更安全、更有效的基于沙门氏菌的癌症免疫疗法仍面临挑战	探讨沙门氏菌在调节肿瘤微环境（TME）中的应用，以增强癌症免疫治疗的疗效	沙门氏菌及其在癌症免疫治疗中的应用	癌症免疫治疗	癌症	合成生物学、基因工程	NA	NA	NA
590	2025-01-23	Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00420 PMID:39413025	研究论文	本文通过细胞内水凝胶化技术，将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌扩展到病原菌，探索其在生物医学应用中的潜力	将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株扩展到病原菌，并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应	仅研究了特定病原菌株，未涵盖所有可能的病原菌类型	探索通过细胞内水凝胶化技术改造病原菌，以应用于生物医学领域	不同菌株的病原菌	合成生物学	NA	细胞内水凝胶化技术	NA	实验数据	多种病原菌株
591	2025-01-22	A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates 2025-Jan-21, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1 DOI:10.1111/jipb.13838 PMID:39835880	研究论文	本文介绍了一种合成生物学方法，通过在大肠杆菌中建立的重构系统，识别负责从特定蛋白质底物上去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶	利用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统，用于识别植物SUMO化酶	NA	识别负责去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶	植物泛素样蛋白酶	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
592	2025-01-22	Orthogonalized human protease control of secreted signals 2025-Jan-15, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01831-x PMID:39814991	研究论文	本文介绍了一种名为hDIRECT的平台，用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性，以支持基于细胞的疗法	开发了hDIRECT平台，利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂来控制细胞因子的活性，实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用	研究仍处于概念验证阶段，尚未进行大规模临床试验	开发一种能够控制细胞因子活性的平台，以支持基于细胞的疗法	细胞因子（IL-2、IL-6和IL-10）及其活性控制	合成生物学	癌症免疫疗法	人类蛋白酶及其抑制剂的使用	NA	蛋白质数据	NA
593	2025-01-22	Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae 2025-Jan, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.202400712 PMID:39834096	研究论文	本文主要探讨了在酿酒酵母中异源表达萜类化合物的方法，以提高其大规模生产的效率	利用合成生物学和代谢工程技术，构建高效的微生物细胞工厂，通过细胞微区室、关键P450酶的高效表达策略以及宿主代谢的调控和优化来增强萜类化合物的合成	当前仍面临一些挑战，需要进一步优化酵母底盘以提高萜类化合物的生产效率	提高萜类化合物的大规模生产效率	酿酒酵母	合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	NA
594	2025-01-22	Orthogonalized human protease control of secreted signals 2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.18.576308 PMID:39484520	研究论文	本文介绍了一种名为hDIRECT的平台，用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性，以支持基于细胞的治疗	开发了hDIRECT平台，利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂，通过蛋白水解切割激活和消除细胞因子的活性，实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用	未提及具体的临床实验结果或长期效果评估	开发一种能够控制细胞因子活性的人类化合成生物学平台，以支持基于细胞的治疗	人类细胞因子（IL-2, IL-6, IL-10）及其活性控制	合成生物学	癌症免疫治疗	蛋白水解切割	NA	蛋白质数据	未提及具体样本数量
595	2025-01-22	Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling 2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013 PMID:36738860	研究论文	本文介绍了用于成熟多能干细胞来源的肝细胞的工程平台，用于疾病建模	使用先进技术（如蛋白质微图案化、控制大小的球体、多细胞类型和层次的类器官、3D生物打印、微流体设备和合成生物学）显著改善肝细胞样细胞（HLCs）的成熟	传统方法产生的HLCs表型不成熟，需要进一步改进	开发用于疾病建模的成熟多能干细胞来源的肝细胞平台	多能干细胞来源的肝细胞样细胞（HLCs）	生物医学工程	肝病	蛋白质微图案化、3D生物打印、微流体设备、合成生物学	NA	细胞数据	NA
596	2025-01-21	Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes 2025-Jan-17, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111541 PMID:39811667	研究论文	本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达	通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性变体，显著提高了蛋白质表达水平	未提及具体局限性	开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率	T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶	合成生物学	NA	定向进化技术	NA	NA	NA
597	2025-01-21	The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora 2024-Dec-29, Chemistry & biodiversity IF:2.3Q3 DOI:10.1002/cbdv.202402999 PMID:39737746	review	本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展，重点介绍了两种研究策略及其在生物合成酶发现中的应用	提出了基于天然产物优先和酶优先的两种策略，用于发现Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶	未提及具体的研究局限性	探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究策略及其生物合成机制	Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶	合成生物学	NA	基因组分析、生物信息学工具	NA	基因组数据、酶序列数据	NA
598	2025-01-21	Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes 2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.25.614978 PMID:39386662	研究论文	本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达	通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性的变体，显著提高了在真核系统中的蛋白表达水平	NA	开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率	T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶	合成生物学	NA	定向进化	NA	NA	NA
599	2025-01-21	Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00353 PMID:38194520	研究论文	本文介绍了一种新的连续荧光检测方法，用于体外翻译实验，该方法与非经典氨基酸（ncAAs）兼容	开发了一种基于亲和夹蛋白的连续荧光检测方法，能够快速验证多种非经典氨基酸的掺入并测试多种tRNA的密码子读取特异性	该方法依赖于亲和夹蛋白的荧光特性变化，可能对某些特定ncAAs的检测存在局限性	开发一种适用于非经典氨基酸的体外翻译连续检测方法，以促进药物发现和合成生物学中的翻译装置工程	非经典氨基酸（ncAAs）和tRNA的密码子读取特异性	合成生物学	NA	连续荧光检测	NA	荧光数据	384孔板格式的实验
600	2025-01-20	Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications 2025-Mar, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2024.128026 PMID:39705832	综述	本文综述了微生物中液-液相分离（LLPS）的存在、功能及其应用，探讨了LLPS在微生物中的形成和调控机制	本文首次系统整合了微生物中LLPS的研究成果，强调了LLPS在环境适应、应激响应和细胞过程中的作用，并提出了LLPS作为合成生物学和病原微生物治疗干预的潜在靶点	目前对微生物中LLPS的分子调控机制了解仍有限，且相关研究技术存在挑战，需要进一步研究以揭示详细的分子机制并开发新的应用	探讨微生物中液-液相分离的形成、调控机制及其在环境适应和细胞过程中的作用	微生物中的液-液相分离现象	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA