本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-01-24 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
|
研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对基于III型分泌系统(T3SS)的工程化电路功能的影响,并开发了可诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了培养介质对T3SS工程化系统性能的影响,揭示了介质依赖性因素如何通过宿主资源分配策略影响分泌效率 | 研究仅基于沙门氏菌模型,未在其他细菌宿主中验证;提出的翻译和翻译后负担假设需要进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能,理解培养条件对T3SS功能的影响机制 | 沙门氏菌中的工程化III型分泌系统(iT3SS),包括PrgH-GFP融合蛋白和效应蛋白SptP | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析,GFP荧光监测,IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据,蛋白质分泌效率数据,RNA-seq转录组数据 | 在丰富LB培养基和葡萄糖最小培养基中培养的沙门氏菌细胞,使用不同IPTG浓度处理 | 基因融合,IPTG诱导系统 | 沙门氏菌(Salmonella enterica) | IPTG诱导的工程化III型分泌系统(iT3SS),将prgH基因与GFP编码序列融合以监测表达 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 642 | 2026-01-24 |
Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects
2025-Nov, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263
PMID:40961787
|
综述 | 本文综述了微藻生物技术的当前应用、关键挑战及未来前景,探讨了其在碳捕集、可再生能源生产、环境修复和高价值生物产品合成等方面的多功能潜力 | 系统整合了微藻生物技术的最新进展,包括生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥等低能耗采收技术,以及CRISPR/Cas基因组编辑、光生物反应器设计创新和生命周期评估,并提出了模块化生物精炼系统、智能过程控制和支持性政策框架等未来发展方向 | 未提供具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述,缺乏对特定技术经济障碍的定量分析 | 评估微藻生物技术的现状、挑战和未来潜力,以推动其大规模应用和可持续发展 | 微藻生物技术及其在能源、环境和生物产品领域的应用 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥、光生物反应器设计、生命周期评估 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 643 | 2026-01-24 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过具有3'-突出端的引物对进行高效定点诱变的优化方法 | 利用部分互补且具有3'-突出端的引物对设计,显著提高了诱变效率并降低了错误率 | NA | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | NA | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 644 | 2026-01-24 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
|
研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动力学和转运机制 | 首次通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据,阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排,并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 研究主要基于计算模拟,需要进一步的实验验证来确认预测的突变效果 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制,为工程化改造提供原子层面的见解 | 蓝藻的碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学与计算生物学 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | BicA二聚体的模拟数据(超过1毫秒) | NA | 蓝藻 | NA | 能源、粮食生产、气候变化应对 |
| 645 | 2026-01-24 |
Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling
2024-10-14, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885
PMID:39352143
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞工程与生物材料设计的平台PSC-MATRIX,用于通过基质引导的人工信号调控多能干细胞的分化 | 开发了PSC-MATRIX平台,首次将可编程生物材料与合成Notch工程化的人类多能干细胞结合,实现了时空控制转基因表达和人工信号引导的分化 | 研究仅进行了长达11天的培养,可能未覆盖长期分化效果;平台在多种分化协议中的应用潜力尚未完全验证 | 探究驱动多能干细胞分化的分子机制,并开发合成形态发生学工具以研究发育事件 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成Notch工程、正交信号、生物材料设计 | NA | NA | NA | 合成Notch | 人类多能干细胞 | 人工信号通路,用于时空控制转基因表达和分化事件 | 医学 |
| 646 | 2026-01-23 |
Development of a suite of activatable plant synthetic promoter systems using a bacterial LysR-type transcriptional regulator FdeR
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.005
PMID:41551741
|
研究论文 | 本文开发了一套基于细菌LysR型转录调控因子FdeR的可激活植物合成启动子系统,以丰富植物合成生物学工具包 | 利用细菌LysR型转录调控因子FdeR开发了52个合成启动子系统,这些系统在配体非依赖性方式下被激活,表达活性范围广泛,最高可达CaMV 35S启动子活性的约65% | NA | 开发正交且可调的遗传部件,以在植物中同时表达多个基因,推动植物合成生物学发展 | 土壤细菌中的LysR型转录调控因子FdeR及其对应操作子,以及基于此的合成启动子系统 | 合成生物学 | NA | MoClo-based plug-and-play组装系统、酵母预筛选平台 | NA | NA | NA | MoClo, Gibson Assembly | 烟草 | 基于FdeR的合成启动子系统,包括配体非依赖性激活的合成激活剂 | 农业 |
| 647 | 2026-01-23 |
Advancing cellulose degradation through synthetic biology: engineered pathways and microbial systems for sustainable biomass conversion
2026-Jan-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01328-0
PMID:41555463
|
综述 | 本文综述了合成生物学在改善纤维素降解方面的最新进展,并强调了这些工具如何优化可持续农业和工业应用中的纤维利用 | 结合人工智能,合成生物学实现了微生物菌株的预测筛选和精准工程,以高效降解纤维素 | NA | 克服纤维素降解中的关键技术障碍,以支持循环生物经济原则 | 纤维素,作为植物纤维的主要成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,包括工程基因、合成调节因子和优化酶的引入 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物系统 | 多酶复合物的理性重新设计,以改善纤维素酶的分泌和催化效率 | 农业, 工业生物技术 |
| 648 | 2026-01-23 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
|
研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组,开发了一种基于噬菌体的生物传感器,用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组,实现快速、准确、灵活的基因组修饰,并通过生物正交反应结合磁性纳米颗粒,显著提高检测效率和灵敏度 | NA | 开发一种基于合成生物学的噬菌体工程方法,以应对饮用水中有害病原体和指示性非致病菌的检测挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 生物传感器设计,通过基因组重编码实现炔烃修饰非经典氨基酸的掺入,并与叠氮化物共轭磁性纳米颗粒进行生物正交环加成反应 | 环境监测, 公共卫生 |
| 649 | 2026-01-23 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
|
研究论文 | 本文开发了一种人工多结构域核糖体合成和翻译后修饰肽酶系统,用于生成法尼基化肽库 | 设计了一种简单而稳健的方法,通过融合多个生物合成基因到一个高表达、可溶的构建体中,实现了大环肽的生产和酪氨酸侧链上C、C或C类异戊二烯的选择性修饰 | NA | 开发合成生物学方法以创建具有药物特性的肽基化学库 | 蓝细菌素生物合成途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)途径 | NA | NA | 估计最大规模为260万肽衍生物的库 | Gibson Assembly, BioBrick | 活体生物(未具体指定) | 多结构域酶融合构建体,用于大环化和异戊二烯化 | 药物发现 |
| 650 | 2026-01-23 |
Editorial: Synthetic biology and metabolomics: novel insight in oncology research
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1768397
PMID:41568228
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 651 | 2026-01-22 |
A growth-coupled progesterone-responsive biosensor for high-throughput microfluidic screening in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.004
PMID:41551738
|
研究论文 | 本研究开发了一种在酿酒酵母中基于生长耦合的孕酮响应生物传感器,结合微流控高通量筛选平台,用于筛选能高效转化孕烯诺龙为孕酮的酵母菌株 | 开发了首个将孕酮形成与细胞生长和荧光直接耦合的生物传感器,并整合了羟丙基-β-环糊精系统以提高细胞内类固醇的可利用性,同时利用IPTG诱导型lac操纵子和3-氨基三唑精确调控筛选严格性 | 研究主要针对孕烯诺龙到孕酮的转化,尚未验证其对其他类固醇前体或更复杂生物合成途径的普适性 | 解决类固醇前体水溶性差导致的微生物生物转化效率低和高通量菌株筛选困难的问题,以促进菌株改良和工业应用 | 酿酒酵母菌株及其对孕烯诺龙到孕酮的生物转化能力 | 合成生物学 | NA | 大气室温等离子体诱变、微流控液滴封装、荧光检测 | NA | 荧光信号、生长曲线、产物浓度数据 | 通过ARTP诱变和筛选获得5个酵母变异株 | CRISPR-Cas9, iGEM | 酿酒酵母 | 生长耦合型生物传感器,包含孕酮响应元件、荧光报告基因和与细胞生长关联的筛选标记 | 工业生物技术, 医药 |
| 652 | 2026-01-22 |
Engineering a broad-spectrum glucose oxidase via substrate channel and linker design for enhanced lignocellulose bioconversion
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.016
PMID:41551740
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学和蛋白质工程策略,设计了一种广谱葡萄糖氧化酶,用于增强木质纤维素生物转化 | 通过底物通道和连接子设计,工程化广谱葡萄糖氧化酶,显著扩展了酶的底物谱,并增强了与纤维素酶的协同作用 | NA | 工程化广谱葡萄糖氧化酶以提升复杂生物转化过程(如农业废弃物增值)中的应用潜力 | 来自 sp. 的葡萄糖氧化酶(AreGOD) | 合成生物学 | NA | 定点诱变、连接子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程 | NA | NA | 农业、环境、工业生物技术 |
| 653 | 2026-01-22 |
Regulating protein glycosylation modification enhances the synthesis of taxadiene in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.012
PMID:41551745
|
研究论文 | 本研究通过调控酿酒酵母中的蛋白质糖基化修饰,显著提高了紫杉二烯的合成产量 | 首次发现敲除内源蛋白质糖基化基因(特别是糖基转移酶基因)可显著提升异源蛋白表达效率,并将该策略应用于紫杉二烯合成途径的优化 | 研究主要集中于酿酒酵母体系,未在其他真核系统中验证普适性;发酵条件优化可能受限于特定实验设备 | 提高紫杉醇关键前体紫杉二烯在微生物细胞工厂中的合成效率 | 酿酒酵母工程菌株及其紫杉二烯合成途径 | 合成生物学 | 癌症(通过紫杉醇前体合成间接关联) | 基因敲除、多拷贝整合、分批补料发酵 | NA | 代谢产物产量数据、基因表达数据 | 系列工程菌株(具体数量未明确说明) | CRISPR-Cas9(基于合成生物学方法推断) | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 紫杉二烯合成代谢途径(包含紫杉二烯合酶、香叶基香叶基二磷酸合成模块) | 医药(紫杉醇前体生产) |
| 654 | 2026-01-22 |
Metabolic reprogramming of abscisic acid-producing strain Botrytis cinerea TB-31 toward terpenoid biosynthesis using a CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein system
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.002
PMID:41551747
|
研究论文 | 本研究在丝状真菌TB-31中建立了基于CRISPR/Cas9的基因编辑系统,并利用该系统对菌株进行代谢重编程,以促进萜类化合物的生物合成 | 首次在ABA生产菌株TB-31中建立了高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统,实现了单基因/多基因敲除、大片段删除和异源蛋白表达,并通过完全敲除ABA生物合成基因簇成功将代谢流重定向至萜类前体合成 | 研究主要针对特定工业菌株TB-31,其策略在其他丝状真菌中的普适性尚未验证 | 开发丝状真菌的合成生物学工具,并将其改造为萜类化合物生产底盘菌株 | ABA生产菌株Botrytis cinerea TB-31 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Botrytis cinerea TB-31 | 通过敲除ABA生物合成基因簇实现代谢通路重编程,将代谢流转向萜类前体合成 | 工业生物技术 |
| 655 | 2026-01-22 |
Bacterial synthesis of personalized biomimetic biological cornea
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.047
PMID:41551761
|
研究论文 | 本研究利用细菌合成生物学技术,结合曲率定制模型和醛基修饰系统,开发了一种具有纳米纤维网络结构、曲率和形态可定制的个性化仿生生物角膜(DBC@L-Cel) | 首次将细菌合成生物学与曲率定制模型、醛基修饰系统相结合,制备出光学和机械性能与天然角膜匹配、且具有抗瘢痕和促进修复功能的个性化仿生角膜 | 研究目前仅在大规模兔角膜缺损模型中进行验证,尚未进入人体临床试验 | 开发一种可用于角膜盲个性化移植治疗的仿生生物角膜 | 个性化仿生生物角膜(DBC@L-Cel) | 合成生物学 | 角膜盲 | 细菌合成生物学、醛基修饰系统 | NA | NA | 大规模兔角膜缺损模型 | 细菌合成生物学 | 细菌 | 醛基修饰系统 | 医学 |
| 656 | 2026-01-22 |
From aroma to off-flavor: Metabolomics unveils the metabolic double-sided nature of traditional Chinese fermented foods
2026-Feb-15, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147635
PMID:41447972
|
综述 | 本文系统综述了代谢组学在揭示中国传统发酵食品风味形成机制中的应用,并提出了精准调控风味的系统性策略 | 首次系统性地将代谢组学应用于六大类中国传统发酵食品的风味研究,并提出整合多组学、先进工程、智能监控和合成生物学的数据驱动智能生产策略 | 综述性文章,未进行原始实验研究;异味的感知具有主观性,受消费者背景和文化差异影响 | 阐明中国传统发酵食品风味(香气与异味)形成的代谢机制,并提出精准调控策略 | 中国传统发酵食品,包括谷物、豆类、乳制品、蔬菜、肉类和茶叶六大类 | NA | NA | 代谢组学,多组学分析 | NA | 代谢组学数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品,工业生物技术 |
| 657 | 2026-01-22 |
High-throughput mechanical characterization of giant unilamellar vesicles by real-time deformability cytometry
2026-Jan-21, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01140j
PMID:41416886
|
研究论文 | 本研究将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的高通量力学表征,并开发了基于模拟的模型和拟合策略来提取囊泡的面积膨胀模量 | 首次将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的力学表征,开发了两种互补的拟合策略和一种组合拟合方法,实现了无接触、高通量的囊泡群体力学分析 | NA | 开发一种高通量、无接触的方法来表征巨单层囊泡的力学性质 | 巨单层囊泡 | 软物质研究 | NA | 实时变形流式细胞术、相场模拟 | 基于模拟的力学模型 | 变形数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质研究 |
| 658 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
|
综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用,重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略(如序列变异分析)在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新,包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解,并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统,包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(如细菌、酵母) | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 659 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
|
研究论文 | 本文介绍了InSillyClo,一个开源网络应用程序,用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具,提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 660 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
|
研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中,揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性,为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物,并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形,无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统,可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUVs) | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块,结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |