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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
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综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学(NSB)在生物医学领域的应用,包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学,通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程,促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用,以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统(如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒)、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 582 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制,并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念,系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制,并前瞻性地讨论了合成生物学工具(如工程菌和靶向纳米抗生素)在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低,测序数据易受试剂污染和批次效应影响;真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制,探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群(包括细菌、真菌、病毒等)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学(涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计) | NA | NA | 医学(癌症精准诊断与治疗) |
| 583 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制,并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化(BCM)、生物诱导矿化(BIM)和微生物影响矿化(MIM)三种机制,弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低,MIM机制仍处于早期发展阶段,且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |
| 584 | 2026-01-30 |
Revolutionizing bio-hydrogen production: smart integration of nanotechnology, microbial engineering, and circular waste valorisation
2026-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-01001-4
PMID:41604032
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综述 | 本文全面综述了纳米技术、微生物工程和循环经济原则在生物制氢系统中的革命性整合 | 创新性地将纳米技术、先进微生物工程(包括CRISPR-Cas9合成生物学方法)与循环经济原则相结合,用于提升生物制氢效率和系统稳定性 | NA | 探索可持续能源替代方案,通过生物制氢实现碳中和能源生产并解决有机废物管理问题 | 生物制氢生产系统,包括可再生原料、微生物创新、纳米技术应用及纯化存储技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术、纳米金属催化剂、酶固定化技术、等离子体纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源、环境 |
| 585 | 2026-01-30 |
Isolation of Antigen-Specific Nanobodies From Synthetic Libraries Using a Protein Selection Strategy That Combines MACS-Based Screening of YSD and FLI-TRAP
2026-Jan-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5570
PMID:41607705
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研究论文 | 本文介绍了一种结合MACS酵母表面展示和FLI-TRAP细菌遗传选择系统的两阶段平台,用于高效筛选和优化抗原特异性纳米抗体 | 创新点在于整合了MACS酵母展示的高通量筛选与FLI-TRAP系统的胞内结合评估,通过Tat途径的共转运机制关联结合亲和力与抗生素抗性,提供了一种成本效益高且严格的胞内兼容性筛选方法 | NA | 研究目标是开发一种高效筛选和工程化高亲和力、特异性且功能表达的胞内蛋白质结合剂的方法 | 研究对象是抗原特异性纳米抗体,通过合成酵母展示库和细菌系统进行筛选 | 合成生物学 | NA | MACS酵母表面展示、FLI-TRAP细菌遗传选择系统、Tat途径共转运 | NA | NA | NA | 酵母表面展示、细菌遗传选择系统 | 酵母、细菌 | 利用Tat信号肽标记的蛋白质与β-内酰胺酶标记的抗原靶点共表达,设计基于共转运的筛选系统,仅高亲和力结合对能共转运至周质并赋予抗生素抗性 | 医学、合成生物学 |
| 586 | 2026-01-30 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 本研究通过域改组策略开发了一种合成FM启动子,其在植物中的活性比传统CaMV35S启动子高4倍,并成功应用于抗病毒肽的生产 | 通过Figwort花叶病毒和Mirabilis花叶病毒启动子的关键调控区域进行域改组,创建了具有超强活性的紧凑型合成启动子,并验证了其与CRISPR-dCas9转录激活系统的兼容性 | 研究主要在三种植株模型中进行验证,尚未在更多作物品种或田间条件下测试 | 开发高性能植物合成启动子以提高重组蛋白产量 | 植物合成启动子及其在重组蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | 基孔肯雅热 | 域改组、定量GUS检测、qRT-PCR、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、体外抗病毒实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质产量数据、抗病毒活性数据 | 三种模型植物(烟草、本氏烟草、矮牵牛)的瞬时表达系统,以及转基因烟草和拟南芥的稳定株系 | CRISPR-dCas9/VP64 | Nicotiana tabacum, Nicotiana benthamiana, Petunia × atkinsiana, Arabidopsis thaliana | 合成启动子(含as-1、G-Box、ABRE顺式元件),用于驱动抗病毒肽scytovirin的表达 | 农业, 医药 |
| 587 | 2026-01-30 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
|
综述 | 本文系统综述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的化学特性、作用机制、临床应用、生物合成途径,并展望了通过基因编辑和合成生物学策略提升其安全性与疗效的未来发展方向 | 重点探讨了CRISPR/Cas9等基因编辑技术在靶向敲除有毒成分基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展与潜力 | NA | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考,并展望其通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略实现安全性与疗效提升的未来发展 | 多烯大环内酯类抗生素制霉菌素 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术、I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 588 | 2026-01-30 |
A Paradigm Shift in Microbial Protein Manufacturing
2026-Jan-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16010129
PMID:41598284
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综述 | 本文系统分析了微生物作为结构材料在应对全球蛋白质危机中的三种关键策略:菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计功能蛋白 | 提出从结构模拟转向功能创造、建立去中心化生产网络以及发展动态4D打印食品的未来突破方向 | 规模化生产和风味优化方面仍存在挑战 | 探讨微生物作为多功能结构材料以解决全球蛋白质危机和替代蛋白质质地限制 | 微生物策略,包括菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计的功能蛋白 | NA | NA | 菌丝固态发酵、细菌纤维素支架技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物(如菌丝、细菌) | 定制功能蛋白的设计 | 食品、农业 |
| 589 | 2026-01-30 |
The Role of Genomics in Advancing and Standardising Bacteriophage Therapy
2026-Jan-04, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15010055
PMID:41594091
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综述 | 本文综述了基因组学在推动噬菌体疗法标准化和个性化发展中的关键作用 | 系统阐述了全基因组测序技术如何将噬菌体疗法从经验性实践转变为基于科学证据的标准化治疗模式,并展望了合成生物学与人工智能整合的未来方向 | NA | 探讨基因组学在解决噬菌体疗法安全性、标准化和疗效预测等挑战中的作用 | 噬菌体疗法及其基因组学应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 590 | 2026-01-30 |
Role of proteins in phytoremediation and mycoremediation for heavy metal removal: a focus on protein-based remediation
2026, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2025.2572308
PMID:41090394
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综述 | 本文综述了蛋白质和肽在植物修复和真菌修复重金属污染中的核心作用及其机制 | 强调蛋白质和肽在生物吸附、生物积累和生物转化中的机制性贡献,并整合合成生物学、纳米生物技术和组学驱动的蛋白质发现,提出基于设计的下一代修复框架 | 面临可扩展性、环境变异性和监管接受度方面的挑战 | 探讨植物修复和真菌修复中蛋白质和肽在重金属去除中的作用,并推动下一代修复技术的发展 | 重金属(如镉、铅、砷、铬、汞)污染的土壤、水体和生物体 | 环境生物技术 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、纳米生物技术、组学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物、真菌 | NA | 环境 |
| 591 | 2026-01-30 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
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研究论文 | 提出了一种名为DNABERT2-CAMP的混合深度学习模型,用于准确识别大肠杆菌的启动子序列 | 首次将预训练的DNABERT-2 Transformer与定制的CAMP模块(CNN-注意力-平均池化)相结合,以同时建模长距离基因组依赖性和细粒度局部基序 | NA | 开发一个强大的、可推广的基因组注释和合成生物学应用工具 | 大肠杆菌的启动子序列 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | Transformer, CNN | DNA序列 | 8720个经过实验验证的81-bp序列(正负样本) | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 592 | 2026-01-30 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
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研究论文 | 本研究通过系统工程和全局调控,开发了一种高效、可扩展的体外胆红素生物合成途径 | 揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏挑战,并通过竞争性铁螯合、质子化状态调控以及引入一氧化碳脱氢酶解决酶活性抑制问题,实现了胆红素合成效率的20倍提升 | 研究基于体外系统,其在体内应用的效果和稳定性仍需进一步验证 | 提高胆红素生物合成的产量和效率,解决合成生物学中血红素相关途径的稳定性问题 | 胆红素生物合成途径及其关键酶和中间体 | 合成生物学 | NA | DFT计算、酶筛选、机理分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 体外胆红素生物合成途径,包含血红素加氧酶、一氧化碳脱氢酶和甲酸脱氢酶(用于NADPH循环) | 工业生物技术 |
| 593 | 2026-01-30 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
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综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 系统总结了该藻类从模式生物向可扩展生物制造平台转型的整合策略,包括细胞器基因表达、DNA定点整合等新兴技术 | 当前仍存在产物产量不足、生物量限制和生产成本过高等工业化转化障碍 | 探讨三角褐指藻作为光合底盘在可持续生物生产中的潜力与优化路径 | 海洋硅藻三角褐指藻及其遗传改造菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 三角褐指藻 | 代谢途径工程(岩藻黄质、脂肪酸、三酰甘油增产)、异源产物合成途径(萜类、治疗性肽类、可持续材料) | 工业生物技术, 医药, 材料 |
| 594 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状,包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略,并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病,并系统评估了多种新兴微生物疗法(如噬菌体、合成生物学工具)在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 595 | 2026-01-30 |
A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02897-23
PMID:38294230
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学方法,用于构建和重启针对临床相关菌株的尾状噬菌体 | 利用合成生物学方法克隆和组装噬菌体基因组,并成功在酵母中重启,克服了天然噬菌体的宿主范围限制和抗性演化问题 | 研究中仅测试了四种噬菌体物种,且重启效率受噬菌体种类和细菌抗病毒防御系统影响,未全面评估所有临床菌株的适用性 | 旨在通过工程化噬菌体治疗抗生素耐药性细菌感染,特别是针对铜绿假单胞菌 | 针对临床相关铜绿假单胞菌菌株的尾状噬菌体,包括JG024和DMS3等物种 | 合成生物学 | 囊性纤维化相关感染 | 转化相关重组克隆技术 | NA | NA | 涉及四种噬菌体物种,在两种不同铜绿假单胞菌菌株中进行测试 | Gibson Assembly, TALEN | 酵母, 铜绿假单胞菌 | 噬菌体基因组组装和重启系统,用于构建工程化尾状噬菌体 | 医学 |
| 596 | 2026-01-29 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
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综述 | 本文系统综述了自诱导剂2(AI-2)作为微生物群落通用信号分子的分子机制、生态影响及应用 | 系统整合了AI-2的双重结构动态及其在细菌界中的受体多样性,并探讨了其在合成生物学和自然生态系统中的影响 | NA | 探讨AI-2在微生物群落中的信号传导作用及其在多个领域的应用潜力 | 自诱导剂2(AI-2)信号分子及其在微生物群落中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业, 环境生态 |
| 597 | 2026-01-29 |
Advanced applications of synthetic biology technology in biosynthesis of bioactive compounds from medicinal plants
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.006
PMID:41584698
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在药用植物来源生物活性化合物生物合成中的先进应用,重点关注调控工具的发展及其在克服生产瓶颈中的作用 | 系统总结了基于结构类型的生物活性化合物分类与生物合成途径,并重点阐述了调控工具在异源生产中的最新应用进展,为构建高效微生物细胞工厂奠定理论基础 | NA | 为基于微生物细胞工厂高效生产生物活性化合物建立基础,促进药用植物来源化合物的可持续生产 | 药用植物来源的生物活性化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 代谢途径, 生物传感器, 逻辑门 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 598 | 2026-01-29 |
Advances in microbial biosynthesis of indirubin
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.004
PMID:41584701
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综述 | 本文系统总结了靛玉红的生物合成机制、关键酶催化特性、工程菌构建策略及发酵条件进展,并提出潜在解决方案以促进其绿色生物制造 | 基于合成生物学和代谢工程的微生物合成技术为靛玉红高效生产提供了新途径,具有高效、环境可持续和生态友好等优势 | 靛玉红异构体分离困难、副产物抑制及工业化瓶颈等挑战仍需解决 | 促进靛玉红的绿色生物制造,以克服植物提取和化学合成方法的局限性 | 靛玉红(IND)这种具有显著药理活性的双吲哚生物碱 | 合成生物学 | 白血病 | 微生物合成技术、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 工程菌 | NA | 医药 |
| 599 | 2026-01-29 |
A review of Siraitia grosvenorii: Applications, breeding, and biosynthesis of mogrosides
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.005
PMID:41584700
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综述 | 本文系统综述了罗汉果的应用、育种以及罗汉果甜苷的生物合成研究进展 | 提出通过分子设计育种和构建三种合成生物学平台来提高罗汉果甜苷V含量的策略,以解决其应用受限的问题 | NA | 探讨罗汉果的应用、育种及罗汉果甜苷的生物合成,旨在提高其活性成分产量并扩大商业应用 | 罗汉果及其主要活性成分罗汉果甜苷 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 600 | 2026-01-29 |
Genome-wide identification and characterization of methyltransferase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis from Menispermum dauricum
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.007
PMID:41584705
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研究论文 | 本研究通过全基因组鉴定和生化分析,揭示了北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶的功能与特异性 | 首次系统鉴定了北豆根基因组中的甲基转移酶,并发现了四种关键酶(三种OMTs和一种NMT)在BIA结构多样化中的特异性作用 | 研究主要基于体外酶学实验,体内功能验证和调控机制尚未深入探讨 | 系统鉴定和表征北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶,明确其在BIA生物合成中的功能 | 北豆根(Menispermum dauricum)中的甲基转移酶基因及其编码的酶蛋白 | 植物代谢工程 | NA | 全基因组鉴定、体外酶学测定、蛋白质建模、分子对接 | NA | 基因组数据、酶学活性数据 | 75个甲基转移酶基因 | NA | NA | NA | 合成生物学、医药生物技术 |