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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本研究开发了一种在植物中可预测编程的遗传开关装置 | 首次在植物中实现了基于定量表征遗传元件和计算机模型指导的遗传开关电路设计 | 需要更广泛的遗传元件定量表征和数学建模支持 | 开发可预测和可编程的植物遗传装置 | 植物遗传元件和遗传开关电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、数学建模 | 计算机模型 | 遗传元件定量数据 | 稳定工程化植物 | 遗传电路组装 | 植物 | 遗传开关(相互抑制基因调控装置) | 农业, 环境 |
| 762 | 2025-10-05 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
|
研究论文 | 提出了一种基于整合酶的细菌接合介导的细胞间DNA信息传递策略 | 首次将整合酶应用于通过水平基因转移实现细胞间DNA信息传递和逻辑控制 | NA | 开发基于整合酶的细胞间DNA信息传递系统 | 大肠杆菌菌株和接合质粒 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | 布尔逻辑门 | NA | NA | 整合酶 | 大肠杆菌 | 双层布尔逻辑门、四层单处理通路、双层多处理系统 | 合成生物学 |
| 763 | 2025-10-05 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
|
综述 | 通过系统生物学视角探讨细胞异质性,提出从细胞角度概念化异质性的框架并总结相关研究工具 | 提出将细胞视为'命运之轮'的系统生物学框架,强调细胞异质性的生物学意义而非技术变异 | NA | 探索细胞异质性的本质及其在干细胞研究和再生医学中的意义 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 发育生物学 |
| 764 | 2025-10-05 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
|
研究论文 | 本文报道了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的四组氨酸和羧化赖氨酸配位中心及非典型催化机制 | 发现具有独特四组氨酸-羧化赖氨酸配位中心的非典型非血红素铁双加氧酶,揭示了修饰Kcx在促进C-C键断裂中的关键作用 | NA | 研究BTG13相关金属酶的配位模式和催化机制及其在合成生物学中的应用潜力 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | NA | NA | 分子动力学模拟、量子化学计算、系统发育分析 | NA | NA | NA | NA | 多种生物体 | NA | 合成生物学 |
| 765 | 2025-10-05 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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综述 | 探讨非编码RNA的结构预测方法及其在生物医学中的功能与应用 | 整合计算与实验技术推进非编码RNA结构预测,并展望多组学数据融合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模精度不足,对RNA动态折叠机制理解有限 | 解析非编码RNA结构以理解其生物功能并开发治疗策略 | microRNAs、小干扰RNA、长链非编码RNA等非编码RNA分子 | 计算生物学 | NA | 计算方法与实验技术结合 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 766 | 2025-10-05 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
|
综述 | 探讨生物技术在应对蜜蜂种群威胁、保护传粉服务方面的创新解决方案 | 提出结合人工智能的组学工具、分子生物处理及合成生物学技术(如工程化肠道微生物组)来增强蜜蜂适应能力 | 未提及具体技术实施的生态风险评估或规模化应用挑战 | 通过生物技术手段保护蜜蜂种群健康以维持全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂种群及其传粉服务系统 | 生物技术 | NA | 组学工具、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道微生物 | 工程化肠道微生物组、人工饲料生物合成通路 | 农业,环境 |
| 767 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程策略及其在不同工业领域的应用 | 系统总结了合成生物学工具(如CRISPR-Cas和动态调控回路)在优化糖酸生物生产中的应用进展 | NA | 探讨通过代谢工程优化微生物菌株实现高效糖酸生物合成的策略 | C5和C6糖酸及其生产微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶转化、全细胞生物转化、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 动态调控回路 | 食品, 建筑, 医疗, 纺织, 聚合物工业 |
| 768 | 2025-10-05 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 开发基于可编程多输入处理CRISPR引导RNA的内源基因逻辑调控系统 | 设计条件性gRNA实现高达130倍动态范围和三输入逻辑门(A OR (B AND C))的基因调控 | 未在其他Cas效应器或宿主生物中全面验证系统兼容性 | 实现内源基因的精确逻辑调控以控制代谢过程和细胞形态 | 大肠杆菌内源代谢基因(lacZ、malT、poxB)和细胞骨架基因(ftsZ、mreB) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统, RNA合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 逻辑门电路(包括三输入逻辑门A OR (B AND C)和三种两输入逻辑门), 生物传感器 | 工业生物技术 |
| 769 | 2025-10-05 |
A systematic review on the implementation of advanced and evolutionary biotechnological tools for efficient bioremediation of organophosphorus pesticides
2023-Feb, Chemosphere
IF:8.1Q1
|
综述 | 系统综述先进生物技术工具在有机磷农药生物修复中的应用前景与挑战 | 建立了多种生物修复技术的比较分析框架,提出组合修复策略的协同优势 | NA | 评估高效生物修复有机磷农药的先进生物技术工具实施策略 | 微生物、植物、酶系统及合成生物系统 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学、生物信息学、结构生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑、全细胞生物传感器、酶生物传感器 | 植物根际促生菌(PGPR)、微生物 | 代谢通路工程、酶表达调控系统、生物传感系统 | 环境 |
| 770 | 2025-10-05 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
|
综述 | 探讨生物组织自组织模式在胚胎发育和成体组织中的形成机制及其在健康与疾病中的作用 | 提出自组织模式生成是组织稳态和修复的核心机制,并探索通过工程化模式驱动分子回路应用于合成生物学和类器官构建 | NA | 综述组织自组织模式的形成原理及其在生理和病理条件下的作用 | 胚胎组织和成体组织的自组织模式 | 发育生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式驱动分子回路 | 医学、合成生物学 |
| 771 | 2025-10-05 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
|
研究论文 | 开发了针对高产细菌纤维素菌株Kosakonia oryzendophytica的合成生物学工具包 | 首次在该底盘菌中系统表征调控元件库并建立高效CRISPR/Cas9无疤痕基因组编辑系统 | NA | 构建用于遗传操作的合成生物学工具包以开发新一代纤维素基功能材料 | Kosakonia oryzendophytica菌株及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑、λ Red重组、扫描电子显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | NA | CRISPR-Cas9, λ Red重组系统 | Kosakonia oryzendophytica | 可调表达模块(启动子、核糖体结合位点、终止子)和精确基因组编辑系统 | 材料, 工业生物技术 |
| 772 | 2025-10-05 |
Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae
2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02665-y
PMID:40533766
|
综述 | 本文综述了微藻中萜类化合物生物合成的代谢工程研究进展与前景 | 系统总结了利用代谢工程工具和合成生物学策略优化微藻天然萜类生物合成途径的最新进展 | NA | 探讨代谢工程方法在微藻萜类化合物生物合成中的应用 | 微藻及其萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 萜类化合物生物合成途径、碳流向重定向 | 医药、营养保健品、工业生物技术 |
| 773 | 2025-10-05 |
Addressing challenges in microbial manufacturing: Systematic microbial biotechnology
2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100871
PMID:40528882
|
研究论文 | 提出系统微生物生物技术框架以解决微生物制造中的挑战 | 提出系统化方法整合多学科技术,通过流程简化、步骤重组和耦合来整体优化微生物制造过程 | NA | 开发定制化技术框架以解决微生物制造工业应用中的瓶颈问题 | 微生物制造过程 | 工业生物技术 | NA | 酶学、合成生物学、代谢工程、发酵、分离工程、人工智能技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 774 | 2025-10-05 |
Polymeric Giant Unilamellar Vesicles Support Longevity of Native Nuclei in Protocells
2025-Jun, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400622
PMID:40529862
|
研究论文 | 通过将天然细胞核整合到聚合物巨型单层囊泡中,创建能够长期维持核功能完整性的原细胞系统 | 首次使用双乳液微流控技术将天然细胞核成功整合到聚合物巨型单层囊泡中,并证明能长期保持核结构和功能完整性 | NA | 开发能够维持天然细胞器功能的简化仿生系统 | 天然细胞核和聚合物巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 双乳液微流控技术 | NA | NA | NA | 微流控 | NA | 具有核定位信号的多区室胶束递送系统 | 合成生物学, 生物材料 |
| 775 | 2025-10-05 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
|
综述 | 介绍基于病毒载体的瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用优势与实施策略 | 提出将病毒载体瞬时表达系统作为传统稳定遗传转化在本科院校的替代方案,实现单学期内完成有意义的本科生研究项目 | NA | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用 | 植物病毒载体(如TMV或双生病毒)及其在植物中的瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 病毒载体瞬时表达、农杆菌浸润 | NA | NA | NA | 农杆菌浸润 | 植物 | 基于植物病毒载体的基因瞬时表达系统 | 教育, 工业生物技术 |
| 776 | 2025-10-05 |
"Open science" meets commercial realities: a qualitative study of factors influencing sharing in synthetic biology research in Australia
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1604509
PMID:40529177
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研究论文 | 本研究通过质性方法探讨澳大利亚合成生物学研究中数据与材料共享的影响因素,特别关注知识产权监管与商业化需求对共享行为的影响 | 首次对合成生物学领域共享行为进行社会法律视角的交叉研究,揭示研究人员在开放科学与商业化需求间的双重管理策略 | 研究范围限于澳大利亚,样本可能无法完全代表全球合成生物学研究现状 | 分析合成生物学研究中数据与材料共享的驱动因素和障碍 | 大学和商业机构的合成生物学家及商业化专业人士 | 合成生物学 | NA | 质性研究方法 | NA | 访谈数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 777 | 2025-10-05 |
Emerging technologies transforming the future of global biosecurity
2025, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2025.1622123
PMID:40534823
|
综述 | 探讨人工智能与合成生物学融合如何改变全球生物安全格局,分析其机遇与挑战 | 首次系统分析AI与合成生物学在生物安全领域的协同效应及治理需求 | 未涉及具体技术实施细节和定量风险评估 | 批判性审视新兴技术对全球生物安全的影响 | 人工智能应用、合成生物学技术、生物安全治理框架 | 生物安全 | NA | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、公共安全 |
| 778 | 2025-10-05 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本研究开发并验证了pXpressome工具包,用于稳健表达和改造α-羧酶体 | 开发了首个能够稳定表达完整功能性α-羧酶体的质粒工具包,并发现通过调节顶点和面形成蛋白比例可理性调控羧酶体形态 | NA | 开发合成生物学工具包以促进羧酶体研究和重新设计 | α-羧酶体及其组成蛋白 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记、蛋白质纯化 | NA | 蛋白质表达数据、形态学观察数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 羧酶体合成途径、纳米封装平台 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 779 | 2025-10-05 |
Cardiac Regeneration From Scar to Syncytium: Mitigating the Formation of Scar Tissue
2025-Jun-18, Cardiology in review
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/CRD.0000000000000972
PMID:40530862
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综述 | 本文综述了当前心脏再生医学领域的主要策略与技术进展 | 系统整合了从细胞疗法到合成生物学的多学科创新方法,重点关注直接心脏重编程和基因编辑等突破性技术 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 探讨如何重建受损心脏组织并改善心脏功能 | 心肌细胞、成纤维细胞、干细胞、细胞外囊泡 | 心血管医学 | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、直接心脏重编程、组织工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 780 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven induction of mature TLS formation enhances antitumor immunity in colorectal cancer
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ado8395
PMID:40531967
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建工程菌株诱导成熟三级淋巴结构形成,增强结直肠癌抗肿瘤免疫 | 首次利用合成生物学工程菌株特异性诱导肿瘤部位三级淋巴结构成熟,并阐明LIGHT-HVEM信号通路在ILC3细胞中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发通过诱导成熟三级淋巴结构增强结直肠癌免疫治疗效果的新方法 | 结直肠癌小鼠模型、工程菌株SLC、三级淋巴结构、免疫细胞 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 基因工程、免疫荧光分析、动物模型 | NA | 实验数据、免疫组化数据 | 两种不同的结直肠癌小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 工程菌株 | LIGHT蛋白表达系统 | 医学 |