本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-05 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
|
研究论文 | 本研究开发了一个用于构建重组腺相关病毒8型生产细胞系的合成生物学平台 | 将rAAV2生产细胞系构建平台成功扩展到rAAV8血清型,并通过增加AAV8 VP123基因拷贝数使病毒滴度提高20倍 | 初始构建的rAAV8生产细胞系生产力低于传统三质粒转染方法 | 建立稳定生产rAAV8病毒载体的细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型生产细胞系 | 合成生物学 | 基因治疗相关疾病 | 合成生物学平台、基因整合、细胞系构建 | NA | NA | 构建了四个rAAV8生产细胞系VH1-4 | 基因整合 | HEK293细胞 | 由基因组模块、复制模块和包装模块组成的遗传模块系统,其中包装模块用AAV8的cap基因替换了AAV2的cap基因 | 医学 |
| 782 | 2025-10-05 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
|
研究论文 | 通过基因工程改造高色氨酸表达菌株用于肿瘤免疫治疗,抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应 | 开发了能严格定植肿瘤的高色氨酸表达工程菌株,通过产生丁酸盐抑制IDO活性,同时提供色氨酸支持CD8+ T细胞活化 | NA | 开发基于合成生物学的肿瘤免疫治疗新策略 | 基因工程菌株L-Trp CB及其在肿瘤微环境中的作用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔子多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达工程菌株 | 医学 |
| 783 | 2025-10-05 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-06-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
|
综述 | 本文综述迷迭香酸的生物合成途径、分子机制及其生物技术生产方法 | 系统探讨了合成生物学和代谢工程在提高迷迭香酸工业产量方面的最新进展 | NA | 研究迷迭香酸的生物合成机制及其生物技术生产方法 | 迷迭香酸(一种咖啡酸酯类生物活性化合物) | 合成生物学 | NA | 植物细胞组织培养、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞(特别是药用植物) | 迷迭香酸生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 784 | 2025-06-19 |
Editorial: Immune responses at barrier tissues: insights from synthetic biology in therapeutics, diagnostics, mechanisms, and beyond
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621688
PMID:40529376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 785 | 2025-10-05 |
A basis set of de novo coiled-coil peptide oligomers for rational protein design and synthetic biology
2012-Jun-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb300028q
PMID:23651206
|
研究论文 | 本文开发了一套从头设计的α螺旋卷曲螺旋肽基础组件,用于蛋白质设计和合成生物学应用 | 建立了基于序列-结构关系的可预测肽组件库,并验证了与经验规则不同的设计原则 | NA | 为蛋白质工程和合成生物学提供可靠且可预测的肽组件工具包 | 从头设计的α螺旋卷曲螺旋肽寡聚体 | 合成生物学 | NA | 圆二色谱光谱分析, 分析超速离心, X射线晶体学 | NA | 结构数据, 光谱数据 | NA | NA | NA | 平行二聚体、三聚体和四聚体卷曲螺旋结构 | 医学, 工业生物技术 |
| 786 | 2025-10-05 |
'Intelligent' proteins
2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05770-1
PMID:40515853
|
研究论文 | 提出蛋白质分子具有基本形式'智能'的新观点,挑战传统将蛋白质视为简单分子机器的认知 | 将整合信息理论(IIT)应用于蛋白质研究,提出蛋白质智能的可量化参数Φ,并建立核心-外围平衡的智能框架 | 将智能概念应用于分子系统存在争议,创建适应性'智能'蛋白质面临技术挑战 | 探索蛋白质的信息处理能力、环境适应性和记忆样行为,重新定义蛋白质智能概念 | 蛋白质分子及其构象记忆、变构调控、内在无序等特性 | 系统生物学 | NA | 整合信息理论(IIT)、网络理论、变构理论分析 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 药物设计, 合成生物学 |
| 787 | 2025-10-05 |
Real-Time Fluorescence-Based Method for Dynamic Quantification of Droplet Network Assembly
2025-Jun-10, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c02156
PMID:40521463
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于荧光的分子信标方法,用于实时监测液滴网络的组装过程 | 与传统显微成像技术相比,该方法能够连续量化动态液滴相互作用,具有更高的灵敏度 | NA | 提高合成生物学和中尺度材料应用中液滴组装的精确度 | 液滴网络组装过程 | 合成生物学 | NA | 荧光分子信标方法,单链DNA信标技术 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于互补单链DNA序列结合的分子信标系统 | 环境监测,药物递送,生物传感 |
| 788 | 2025-10-05 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
|
研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了LuxRI群体感应系统,开发了一种细胞密度依赖的重组蛋白高效表达方法 | 首次在枯草芽孢杆菌中功能性重构Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统,并通过启动子工程和终止子优化实现了重组蛋白的高效表达 | NA | 开发一种不依赖化学诱导剂、能与细胞生长协调的重组蛋白高效表达系统 | 枯草芽孢杆菌中的重组蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统重构、启动子工程、终止子优化 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 枯草芽孢杆菌 | 基于LuxRI群体感应的细胞密度依赖型基因回路,包含工程化启动子和强终止子TB5 | 工业生物技术 |
| 789 | 2025-10-05 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
|
研究论文 | 开发了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 首次发现聚苏氨酸-丙氨酸重复序列能够形成具有可忽略成核势垒的淀粉样组装体,并可通过调整重复序列长度精确调控蛋白质饱和浓度 | NA | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系,开发控制蛋白质浓度阈值的实验工具 | 蛋白质自组装和相分离 | 合成生物学 | NA | 系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA | 遗传编码工具 | 细胞 | 基于聚TA重复序列的可调亲和融合标签系统 | 细胞生物学, 发育生物学, 合成生物学 |
| 790 | 2025-10-05 |
Multi-strategy ugt mining, modification and glycosyl donor synthesis facilitate the production of triterpenoid saponins
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1586295
PMID:40519597
|
综述 | 本文综述了三萜皂苷糖基化研究进展,重点探讨了UGT酶的挖掘、改造及糖基供体合成策略 | 整合多组学技术与合成生物学平台进行UGT高通量筛选,结合定向进化与理性设计进行酶功能改造 | NA | 提高三萜皂苷的生产效率和应用潜力 | UDP-糖基转移酶(UGTs)和三萜皂苷 | 合成生物学 | NA | 多组学方法(基因组学、转录组学、代谢组学)、系统发育分析、PSPG基序分析 | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 工程微生物 | 代谢途径优化 | 医药、营养补充剂 |
| 791 | 2025-10-05 |
Microbial electrosynthesis meets synthetic biology: Bioproduction from waste feedstocks
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.05.001
PMID:40519649
|
综述 | 本文探讨合成生物学如何促进微生物电合成技术发展,实现利用废弃物原料进行生物生产 | 将微生物电合成与合成生物学相结合,通过工程化改造微生物提升电子传递效率和代谢通路性能 | NA | 推动可持续化学品生产和脱碳技术发展 | 电活性微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 微生物电合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 电活性微生物 | 电子传递通路, 代谢通路 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 792 | 2025-10-05 |
Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52533-w
PMID:39294165
|
研究论文 | 提出基于几何图学习的酶功能预测模型GraphEC,通过ESMFold预测结构和预训练蛋白质语言模型准确预测EC编号、活性位点和最适pH | 首次将几何图学习应用于酶功能预测,结合ESMFold预测结构和活性位点信息,并通过标签扩散算法整合同源信息提升预测性能 | 依赖ESMFold预测的蛋白质结构准确性,未明确说明模型在哪些特定酶类别上表现较差 | 开发更准确的酶功能预测方法,特别关注酶活性位点和结构特征的重要性 | 酶蛋白质及其功能特征(EC编号、活性位点、最适pH) | 生物信息学 | NA | 几何图学习、ESMFold结构预测、蛋白质语言模型、标签扩散算法 | 图神经网络 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因组学 |
| 793 | 2025-10-05 |
Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching
2024-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52282-w
PMID:39289346
|
研究论文 | 本研究通过重编程酵母交配型转换机制实现可调控的细胞分化,促进合成微生物群落形成与协作 | 将天然酵母交配型转换机制改造为可诱导单倍体群体不对称性分化的遗传逻辑门 | NA | 开发可调控细胞分化的合成生物学方法以促进微生物群落协作 | 酿酒酵母单倍体群体 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | NA | NA | 遗传电路设计 | 酿酒酵母 | 基于交配型转换机制的可调谐分化逻辑门 | 工业生物技术 |
| 794 | 2025-10-05 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究生物能量应激如何增强细菌的抗生素耐药性和持久性 | 首次构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统,揭示了生物能量应激通过增强活性氧产生、诱变断裂修复和转录偶联修复促进抗生素耐药性进化的新机制 | 研究仅在大肠杆菌中进行,尚未在其他细菌物种中验证 | 探究抗生素诱导的生物能量应激对治疗结果的影响机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统 | 医学 |
| 795 | 2025-10-05 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
|
研究论文 | 本研究利用RNA折纸技术开发了一种名为'Traptamer'的RNA机器人装置,能够机械捕获并释放荧光适配体iSpinach | 首次将RNA折纸技术应用于创建具有传感、计算和执行功能的RNA机器人装置,实现了对RNA功能的可逆控制 | 目前仅为原型验证阶段,尚未在细胞系统中进行功能验证 | 开发能够感知、计算和执行的先进RNA机器人装置以增强对分子过程的控制 | RNA纳米机器人装置及其对荧光适配体的控制机制 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术, 冷冻电镜 | 布尔AND门逻辑电路 | 结构数据, 荧光数据 | NA | RNA折纸 | NA | 具有传感、计算和执行模块的RNA机器人装置,能够可逆控制荧光适配体功能 | 医学, 合成生物学 |
| 796 | 2025-10-05 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-02-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学方法调控细胞因子信号以增强CAR-T细胞功能并减少相关毒性的最新策略 | 系统总结了通过基因工程调控细胞因子信号通路来增强CAR-T细胞疗效和减轻毒副作用的新型合成生物学方法 | NA | 改善CAR-T细胞疗法的疗效和安全性 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T细胞) | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 基因工程、转录和表观遗传修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类T细胞 | 细胞因子信号通路调控、自分泌信号增强、合成信号分子 | 医学 |
| 797 | 2025-10-05 |
A metagenomic strategy for harnessing the chemical repertoire of the human microbiome
2019-12-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax9176
PMID:31582523
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合计算算法与合成生物学的宏基因组策略,用于挖掘人类微生物组编码的生物活性小分子 | 首次将新型计算算法与合成生物学相结合,直接从人类微生物组宏基因组测序数据中挖掘编码的生物活性小分子 | NA | 系统揭示人类微生物组编码的化学分子库,发现介导微生物组-宿主和微生物组-微生物组相互作用的分子介质 | 人类微生物组宏基因组测序数据及其编码的生物活性小分子 | 合成生物学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 798 | 2025-10-05 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
|
讨论论文 | 分析生物技术领域术语的语义模糊性问题并提出定义统一建议 | 首次系统分析生物技术领域核心术语的语义模糊性并提出标准化定义方案 | 属于概念性讨论论文,缺乏实证研究数据支持 | 解决生物技术领域术语定义不统一的问题 | 生物技术、生物制造、工程生物学和合成生物学等核心术语 | NA | NA | NA | NA | 文本分析 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 799 | 2025-10-05 |
MutS-mediated rapid and cost-effective error correction in in vitro DNA synthesis
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.05.002
PMID:40447215
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于MutS蛋白的快速、低成本体外DNA合成纠错方法 | 构建了十一种Cbm3-Egfp-MutS融合蛋白,发现TaMutS和TtMutS具有热稳定性并能有效识别错配DNA,建立了使用自制无定形纤维素旋转柱和过滤吸头的简单纠错方法 | NA | 开发简单、经济、高效的DNA合成纠错方法 | DNA寡核苷酸和较长目标分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重组表达与纯化,异源双链DNA结合分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 800 | 2025-10-05 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Jun-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
|
综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的策略 | 整合针对饲料作物和产甲烷古菌的双重基因编辑策略,提出跨学科解决方案 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等挑战 | 开发可持续农业的气候变化缓解方案 | 反刍动物甲烷排放机制及调控方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 甲烷生成代谢通路调控 | 农业, 环境 |