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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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801 | 2024-11-26 |
Synthetic cooperation in engineered yeast populations
2007-Feb-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.0610575104
PMID:17267602
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研究论文 | 本文展示了通过引入少量遗传修饰,可以在先前无相互作用的细胞群体中实现持久合作 | 构建了一个名为CoSMO的合成强制合作系统,该系统由一对非交配酵母菌株组成,每株菌株为另一株提供必需代谢物 | 合作系统中存在未预料到的限制,如饥饿耐受性的不对称性和营养物质释放延迟 | 展示如何通过遗传工程实现持久合作,并探讨其在农业、污染物处理和医学等领域的潜在应用 | 非交配酵母菌株及其合作行为 | 合成生物学 | NA | 遗传修饰 | NA | 实验数据 | 一对非交配酵母菌株 |
802 | 2024-11-24 |
Biosensing strategies using recombinant luminescent proteins and their use for food and environmental analysis
2024-Dec, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-024-05552-x
PMID:39325139
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综述 | 本文综述了基于重组发光蛋白(RLPs)的生物传感策略及其在食品和环境分析中的应用 | 本文介绍了新型融合蛋白和优化表达系统,以提高发光生物传感器的稳定性、亮度和光谱特性 | 本文未提及具体的实验数据或技术细节 | 综述基于重组发光蛋白的生物传感技术在食品和环境监测中的最新进展 | 重组发光蛋白及其在生物传感器中的应用 | 生物技术 | NA | 重组发光蛋白 | NA | NA | NA |
803 | 2024-11-19 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2024-Nov-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文综述了甘草属植物的分类、药理学、活性成分生物合成和合成生物学 | 整合了来自不同领域的知识,提供了一个全面理解甘草属植物的独特视角 | NA | 提供一个全面的视角,为未来的分子育种和合成生物学研究奠定基础 | 甘草属植物的分类、活性成分及其药理活性、甘草的组学、活性化合物的生物合成途径和代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
804 | 2024-11-24 |
Bottom-up synthetic immunology
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01744-9
PMID:39187581
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研究论文 | 本文探讨了自下而上的合成免疫学作为治疗和预防传染病及癌症的新兴领域 | 提出了一种基于纳米技术的自下而上合成免疫学方法,以克服传统基因工程免疫细胞的局限性 | 目前主要限于体外应用,且受到免疫功能固有的复杂调控机制的限制 | 探索利用纳米技术进行免疫系统工程化的新方法,以改善预防和治疗策略 | 传染病和癌症的免疫机制 | 合成生物学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
805 | 2024-11-24 |
Rewiring gene circuitry for plant improvement
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01806-7
PMID:39075207
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综述 | 本文综述了在特定细胞中,随着发育和响应时间的推移,基因调控活动的最新进展及其对植物表型变异的影响 | 介绍了新的合成生物学工具和基因编辑技术,这些技术允许对转基因进行可调节的时空调控,并能够操纵内源基因的调控 | NA | 探讨如何通过重新布线基因电路来解决农业、能源和环境中的最大挑战 | 植物基因调控活动及其对表型的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
806 | 2024-11-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 本文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制 | 提出了酶通过相分离自组织成近似最优大小和间隔的集群,并通过数学模型验证了其对代谢通量和毒性代谢物的显著改善 | 主要基于数学模型研究,缺乏实验验证 | 研究酶集群在细胞内的最优组织方式及其对代谢效率的影响 | 酶集群的形成机制及其对代谢通量和毒性代谢物的影响 | 代谢工程 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
807 | 2024-11-23 |
Enzyme cascades for in vitro and in vivo FMN prenylation and UbiD (de)carboxylase activation under aerobic conditions
2024, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2024.10.015
PMID:39572138
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研究论文 | 本文介绍了在有氧条件下使用酶级联系统进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD(脱)羧酶激活的两种方法 | 开发了在有氧条件下进行FMN法尼基化和UbiD激活的稳健方法,以促进异源活性UbiD酶的生产 | 目前对FMN法尼基化和UbiD激活的实验复杂性了解有限,导致重组UbiD酶的活性不足 | 开发高效的方法进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD激活,以促进活性UbiD酶的异源生产 | UbiD(脱)羧酶及其辅因子FMN的法尼基化 | 生物催化 | NA | 酶级联系统 | NA | NA | 使用重组大肠杆菌细胞进行实验 |
808 | 2024-11-22 |
Superior Photostability of the Unnatural Base 6-Amino-5-nitropyridin-2-ol: A Case Study Using Ultrafast Broadband Fluorescence, Transient Absorption, and Theoretical Computation
2024-Nov-21, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.4c02751
PMID:39526600
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研究论文 | 研究了非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z)在不同溶剂中的激发态动力学 | 首次全面研究了Z的激发态动力学,发现其具有优越的光稳定性 | NA | 探讨非天然碱基Z的光稳定性及其在生物和环境应用中的潜力 | 非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z) | NA | NA | 超快宽带时间分辨荧光光谱和瞬态吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
809 | 2024-11-22 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
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研究论文 | 本文研究了使用平衡和不平衡数据集训练卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM)对CRISPR sgRNA活性的预测效果 | 通过在训练集中添加合成sgRNA,提高了在不平衡数据集上预测sgRNA活性的准确性 | 未提及 | 探讨平衡训练集对深度学习模型预测CRISPR sgRNA活性的影响 | CRISPR-Cas12a筛选数据生成的平衡和不平衡数据集 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas12a筛选 | 卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM) | 文本 | 未提及具体数量 |
810 | 2024-11-22 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究进展,重点介绍了古代代谢途径及其在生物创新重建中的应用 | 本文整合了微生物学、古生物学和进化合成生物学,形成了一个新兴的跨学科领域,用于重建古代生物创新 | 将分子遗传学、群体生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物研究仍然是一个重大挑战 | 探讨早期微生物生命的进化及其对地球生态系统的影响 | 早期微生物生命及其代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
811 | 2024-11-22 |
Standardization of Fluorescent Reporter Assays in Synthetic Biology across the Visible Light Spectrum
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00386
PMID:37981737
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研究论文 | 本文介绍了一种标准化荧光报告基因检测方法,用于合成生物学中可见光谱范围内的荧光报告基因 | 提出了一个简单且易于访问的校准方法,将设备特定的输出转换为标准化的输出,表达每孔的荧光量作为已知等效荧光染料浓度每细胞 | 仅限于可见光谱范围内的荧光报告基因 | 提高不同实验室间板读取器实验结果的可比性和可交换性 | 荧光报告基因的表达水平 | 合成生物学 | NA | 荧光报告基因检测 | NA | 荧光数据 | NA |
812 | 2024-11-22 |
At-Home, Cell-Free Synthetic Biology Education Modules for Transcriptional Regulation and Environmental Water Quality Monitoring
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00223
PMID:37699423
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研究论文 | 开发了四个稳定的无细胞生物传感教育模块,用于转录调控和环境水质监测 | 开发了无需专业实验室设备的稳定无细胞生物传感教育模块,适用于家庭和课堂使用 | 仅在K-12教师和高中生中进行了试点测试,需要进一步验证其在大规模教育中的有效性 | 解决合成生物学领域教育资源不平等的问题,提供易于使用的教育模块 | 无细胞生物传感教育模块,用于转录调控和环境水质监测 | 合成生物学 | NA | 无细胞生物传感技术 | NA | NA | 130名高中生和K-12教师 |
813 | 2024-11-22 |
Systems Metabolic Engineering of Escherichia coli
2016-05, EcoSal Plus
DOI:10.1128/ecosalplus.ESP-0010-2015
PMID:27223822
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综述 | 本文综述了系统代谢工程及其在埃希氏大肠杆菌中的应用 | 系统代谢工程结合了系统生物学、合成生物学和进化工程,使微生物能够系统性地生产超出其天然能力的化学品 | NA | 探讨系统代谢工程在埃希氏大肠杆菌中的策略和应用 | 埃希氏大肠杆菌及其在化学品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
814 | 2024-11-21 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2024-Nov-14, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程酵母的新技术,用于从工业废水中去除铅 | 开发了一种新的操作技术,基于工程酵母的机制理解和响应面优化方法,解决了大规模处理污染物的高操作成本和技术限制问题 | NA | 解决铅污染问题,降低操作成本,实现工程酵母在工业应用中的规模化 | 工程酵母、铅污染的工业废水 | 生物工程 | NA | 基因敲除、响应面优化 | NA | NA | NA |
815 | 2024-11-21 |
High-throughput development and characterization of new functional nanobodies for gene regulation and epigenetic control in human cells
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621523
PMID:39554150
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研究论文 | 开发并表征用于基因调控和表观遗传控制的新型功能性纳米抗体 | 开发了一种新方法,通过酵母展示和高通量筛选,生成针对人类染色质调节因子的小型纳米抗体,用于基因表达的抑制或激活 | NA | 开发新的纳米抗体用于基因表达和染色质状态的调控 | 人类细胞中的基因表达和染色质状态 | NA | NA | 酵母展示 | NA | NA | 数十个功能性纳米抗体 |
816 | 2024-11-20 |
Developing filamentous fungal chassis for natural product production
2025-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131703
PMID:39477163
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综述 | 本文综述了利用丝状真菌作为底盘细胞生产天然产物的发展现状 | 强调了丝状真菌作为底盘细胞的优势,包括其天然的次级代谢产物生产能力和丰富的生物合成前体 | NA | 总结丝状真菌作为底盘细胞的最新进展,并展望其未来在工程和应用中的发展 | 丝状真菌底盘细胞的开发和应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
817 | 2024-11-20 |
The Enigma of Transcriptional Activation Domains
2024-Nov-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168766
PMID:39214280
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review | 本文综述了真核基因激活域(ADs)的机制模型,提出了一种基于表面活性剂样近随机交互作用的新模型 | 提出了基于表面活性剂样近随机交互作用的新机制模型,与传统生物化学原理不同 | NA | 重新思考和解释真核基因激活域的功能机制 | 真核基因激活域及其与基因启动子核小体的交互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
818 | 2024-11-20 |
Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology
2024-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007
PMID:38622041
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综述 | 本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在合成生物学工具开发、化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha具有快速生长、耐热性和广泛的底物谱等独特特性,通过合成生物学改造,可用于生产高附加值化学品 | NA | 探讨Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha及其在化学品生产和系统生物学中的应用 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
819 | 2024-11-20 |
A new era of synthetic biology-microbial community design
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae011
PMID:39086602
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在微生物群落设计中的最新进展,并提出了基于模块化建模的无机体方法 | 提出了将合成生物学与计算模型完全整合的新方法,强调模块化建模在设计多物种群落中的应用 | 尚未完全实现模型与合成设计过程的整合 | 探讨合成生物学在微生物群落设计中的应用,并提出新的设计方法 | 微生物群落及其功能模块 | 合成生物学 | NA | NA | 模块化计算模型 | NA | NA |
820 | 2024-11-20 |
Data hazards in synthetic biology
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae010
PMID:38973982
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研究论文 | 本文介绍了在合成生物学中数据科学应用的潜在风险,并提出了一个社区开发的框架来评估这些数据风险 | 提出了一个社区开发的框架来评估合成生物学中的数据风险,并应用于两个案例研究 | 未详细说明具体的案例研究细节和框架的具体实施步骤 | 探讨数据科学在合成生物学中的应用风险,并提出相应的评估框架 | 合成生物学中的数据风险 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据 | 两个合成生物学案例研究 |