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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-11-27 |
NMR-guided rational exploration of co-factors in boosting the Pfu DNA polymerase
2025-Nov, Magnetic resonance letters
DOI:10.1016/j.mrl.2025.200218
PMID:41278258
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研究论文 | 本研究利用NMR技术指导探索能够增强Pfu DNA聚合酶性能的辅助因子 | 开发了一种不依赖结构数据或生物信息学的NMR引导方法,利用酶活性位点作为探针筛选辅助因子 | 方法验证仅使用了Tween-20作为模型系统,需要进一步在不同酶系统中验证普适性 | 优化DNA聚合酶的热稳定性和持续性,提升其性能 | Pfu DNA聚合酶及其辅助因子 | 合成生物学 | NA | 核磁共振(NMR)光谱技术 | NA | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1062 | 2025-11-27 |
A pipeline for screening small molecule-enhanced protein stability in a bacterial orphan receptor
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70330
PMID:41074865
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程,并以CU228转录因子为模型系统进行验证 | 建立了结合生物信息学分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR的多技术联用流程,成功识别出三种能显著提高孤儿PAS蛋白稳定性的小分子配体 | 研究仅使用了约760种化合物的片段库,可能未覆盖所有潜在配体;配体亲和力处于微摩尔级别,属于片段水平结合 | 开发筛选小分子配体的方法,用于表征和工程化孤儿PAS蛋白 | 来自Candidatus Solibacter usitatus的CU228转录因子(PAS-HTH型) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法, 微流控调制光谱, 饱和转移差示NMR, 生物信息学分析 | NA | 蛋白质结构数据, 热稳定性数据, 光谱数据 | 约760种化合物片段库,鉴定出3种有效配体 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |
| 1063 | 2025-11-27 |
Phenylpropanoid methyl esterase unlocks catabolism of aromatic biological nitrification inhibitors
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf251
PMID:41230824
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研究论文 | 本研究发现了微生物降解芳香族硝化抑制剂苯丙烷类甲酯的新途径 | 鉴定了一种先前未知的苯丙烷类甲酯降解微生物途径,并发现两种新型酶包括新鉴定的苯丙烷甲酯酶 | 仅初步揭示了微生物降解途径,对土壤中抑制剂降解的整体理解仍需进一步研究 | 研究微生物对芳香族硝化抑制剂的降解机制 | 苯丙烷类甲酯(一类芳香族硝化抑制剂)及其降解微生物 | 合成生物学 | NA | 转录组学、高通量功能基因组学、遗传分析、生化分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、生化数据 | NA | 基因转移 | 细菌 | 苯丙烷类甲酯降解途径 | 农业、环境 |
| 1064 | 2025-11-26 |
Spontaneous Formation of Oil-Rich Polymer-Only Droplet Interface Bilayers Assembled from PB-PEO Block Copolymers
2025-Nov-25, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c03308
PMID:41223304
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研究论文 | 本研究报道了由PB-PEO嵌段共聚物自发形成的纯聚合物液滴界面双层膜(pDIBs)的制备与表征 | 首次实现了无需磷脂、外部偏压或共溶剂的纯聚合物液滴界面双层膜的自发形成,其膜电阻和疏水厚度显著优于传统脂质膜 | 研究仅针对PB-PEO嵌段共聚物和两种烃类油,尚未探索更广泛的聚合物和油相体系 | 开发新型聚合物膜系统以克服传统脂质膜的机械脆弱性和组成限制 | 聚丁二烯-聚环氧乙烷(PB-PEO)两亲性嵌段共聚物在烃油中形成的界面膜 | 合成生物学 | NA | 界面张力测定法、电生理学、成像技术 | NA | 物理化学测量数据、电生理记录、图像数据 | NA | NA | NA | 仿生离子传导膜系统 | 合成生物学, 仿生材料, 组织工程 |
| 1065 | 2025-11-26 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Nov, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
|
综述 | 探讨富硒微生物作为新型有机硒补充策略在畜禽营养中的应用潜力 | 提出利用基因工程改造的富硒细菌作为可持续的有机硒补充新途径 | 菌株选择、发酵工艺、生物安全性、监管合规和长期饲喂试验效果验证等关键挑战尚未完全解决 | 研究富硒微生物在改善动物硒营养状况中的应用 | 家禽和反刍动物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化遗传电路 | 细菌 | 硒响应生物传感器、可控生物转化途径 | 农业, 生物医学, 环境修复 |
| 1066 | 2025-11-25 |
Photo-excited extracellular electron transfer of electroactive microorganism triggers RAFT polymerization
2025-Nov-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65119-x
PMID:41271685
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研究论文 | 本研究开发了一种利用电活性微生物触发RAFT聚合的新方法,通过希瓦氏菌分泌的黄素介导电子转移来持续产生自由基 | 首次实现了电活性微生物触发的无末端基团异质性聚合,将微生物胞外电子传递途径与光诱导电子转移相结合 | NA | 开发生物触发的高效可控聚合平台 | 希瓦氏菌及其分泌的黄素分子 | 合成生物学 | NA | RAFT聚合、光诱导电子转移、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学工具 | Shewanella oneidensis | 增强黄素生物合成和运输的基因回路 | 材料科学, 工业生物技术 |
| 1067 | 2025-11-25 |
Systems biology and microbiome innovations for personalized diabetic retinopathy management
2025-Nov-21, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00607-w
PMID:41271801
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综述 | 本文探讨利用系统生物学和微生物组创新技术开发糖尿病视网膜病变的个性化管理策略 | 提出通过工程化益生菌递送ACE2的创新疗法,并建立整合计算方法的个性化系统管理框架 | NA | 开发糖尿病视网膜病变的个性化管理系统 | 糖尿病视网膜病变及其与肠道微生物组的关联 | 系统生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 合成生物学、计算技术 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | 递送血管紧张素转换酶2(ACE2)的工程化系统 | 医学 |
| 1068 | 2025-11-24 |
Hierarchy of Hydrophobic and Electrostatic Interactions in DNA-Membrane Phase Selectivity
2025-Nov-19, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c13271
PMID:41217012
|
研究论文 | 本研究探讨疏水锚定和静电作用如何调控DNA在液相有序和液相无序脂质域中的分配行为 | 揭示了疏水锚定和静电作用在DNA-膜相选择性中的层级调控机制,建立了以疏水锚定控制相特异性、多价性调节结合强度、离子条件作为次级调控因子的设计层级 | 未涉及复杂生物膜环境中的验证 | 理解DNA-脂质界面在相分离膜中的设计原理 | DNA纳米结构与脂质膜的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、脂质膜相分离研究 | NA | 生物物理相互作用数据 | NA | DNA纳米结构功能化 | NA | 相选择性DNA-膜界面 | 药物递送,合成生物学,仿生DNA材料 |
| 1069 | 2025-11-24 |
From the bench to the reactor: engineered filamentous fungi for biochemical and biomaterial production
2025-Nov-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02712-8
PMID:41254789
|
综述 | 本文综述了工程化丝状真菌在生物化学品和生物材料生产中的应用进展与前景 | 重点介绍了CRISPR-Cas9介导的菌株改良等代谢工程和蛋白质工程最新进展,并探讨了真菌生物技术在循环经济和生物基经济中的整合潜力 | 丝状真菌的系统性合成生物学应用仍处于起步阶段,需要进一步发展基因工程和工艺设计 | 探讨工程化丝状真菌在生物化学品和生物材料生产中的工业应用潜力 | 丝状真菌及其工程化菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 代谢通路工程、蛋白质表达系统 | 工业生物技术, 材料, 食品, 环境 |
| 1070 | 2025-11-24 |
Engineered natural killer cells for cancer therapy
2025-Nov-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.013
PMID:41135520
|
综述 | 本文总结了工程化自然杀伤细胞在癌症治疗中的临床应用进展及合成生物学改进策略 | 系统阐述通过精准基因编辑增强CAR-NK细胞效应功能、持久性和抗肿瘤微环境能力的新方法 | 主要基于早期临床试验数据,尚未涉及大规模验证 | 推动工程化NK细胞在实体瘤治疗中的应用发展 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK) | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、高通量筛选平台 | NA | 临床试验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 自然杀伤细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计、多基因工程改造 | 医学 |
| 1071 | 2025-11-24 |
Multiscale metabolic engineering in biological lignin valorization
2025-Nov-03, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100993
PMID:41268496
|
综述 | 本文综述了合成生物学指导的多尺度代谢调控在木质素生物增值中的应用 | 提出合成生物学指导的多尺度代谢调控方法,协调木质素降解菌株的细胞内资源分配 | NA | 提高木质素生物转化效率,促进木质素基生物经济的可持续发展 | 木质素降解菌株及其代谢调控机制 | 合成生物学 | NA | 多尺度代谢调控、生物转化、基因组-表型分析、学习预测 | NA | NA | NA | NA | 木质素降解菌株 | 代谢通路网络、代谢通量平衡 | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 1072 | 2025-11-24 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
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研究论文 | 本研究通过培养和诱导人类肠道细菌中的温和噬菌体,揭示了前噬菌体多样性及其与宿主相互作用的机制 | 首次大规模表征人类肠道来源的可诱导前噬菌体,构建合成微生物组模型,发现人类宿主细胞产物可作为诱导剂 | 仅18%计算预测的前噬菌体能在纯培养中被诱导,培养条件可能无法完全模拟体内环境 | 理解人类肠道中温和噬菌体的生物学特性和功能 | 人类肠道细菌中的前噬菌体 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养组学、共培养技术 | NA | 基因组数据、实验数据 | 252株人类肠道细菌分离株,134个可诱导前噬菌体 | 合成生物学方法 | 人类肠道细菌 | 78成员合成微生物组 | 合成生物学, 生物技术, 微生物组 |
| 1073 | 2025-11-24 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
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研究论文 | 本研究揭示了SKIK肽标签能有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体停滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子EF-P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用 | 研究主要关注特定类型的停滞肽(WPPP和SecM AP),对其他类型停滞肽的适用性尚需验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体停滞肽(WPPP和SecM AP)及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1074 | 2025-11-23 |
Engineering sulfoxide synthases for efficient microbial production of ergothioneine: Mechanisms, strategies, and perspectives
2025-Dec-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.146618
PMID:41082819
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综述 | 本文系统综述了硫氧化物合酶在微生物合成麦角硫因过程中的分子机制与工程策略 | 首次全面整合硫氧化物合酶的分子机制与工程策略,为含硫化合物生物合成提供通用框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 提升麦角硫因微生物合成效率的酶工程策略研究 | 硫氧化物合酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 麦角硫因生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1075 | 2025-11-23 |
Potential biosafety risks of synthetic biology microorganism leakage in industry settings to drinking water: A review
2025-Nov-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.140169
PMID:41110321
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综述 | 综述工业环境中合成生物学微生物泄漏对饮用水生物安全的潜在风险 | 首次系统分析工业用合成生物学微生物通过废水排放进入自然水体后,其增强的消毒剂抗性及在饮用水系统中利用有限碳源生产生物产物的双重风险 | 未提出具体的监管框架或量化风险评估模型 | 探讨合成生物学微生物在工业应用中的生物安全风险及其对饮用水安全的影响 | 合成生物学微生物(SynBioMs)及其在工业环境中的泄漏途径 | 合成生物学 | NA | 膜工程、应激反应工程、转录因子工程 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 营养缺陷型设计、遗传回路 | 工业生物技术, 环境 |
| 1076 | 2025-11-23 |
Next-generation perspectives on microbially synthesized siderophores: molecular engineering, multi-omics insights, and applications for smart climate-resilient crops
2025-Oct-16, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04575-5
PMID:41099996
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综述 | 本文综述微生物合成铁载体的生物合成、调控机制及其在智能气候韧性作物中的应用前景 | 整合合成生物学与多组学技术揭示铁载体合成调控网络,开发纳米制剂和智能递送系统增强田间应用效果 | NA | 探讨微生物铁载体在可持续农业中的分子机制与应用策略 | 微生物铁载体及其合成基因簇,植物根际促生菌(PGPR) | 合成生物学 | NA | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学),CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物根际促生菌(PGPR) | 铁载体生物合成基因簇 | 农业 |
| 1077 | 2025-11-23 |
Application progress and biosafety challenges of gene editing and synthetic biotechnology in diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.002
PMID:41262458
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综述 | 本文系统综述了基因编辑和合成生物技术在传染病防治中的应用进展与生物安全挑战 | 系统分析了2015-2025年间CRISPR诊断技术、合成疫苗和工程益生菌在传染病防治中的最新应用,并首次全面评估其生物安全风险 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证;主要关注技术层面,社会接受度和经济可行性分析不足 | 评估合成生物技术在传染病诊断、治疗和预防中的应用进展及相关的生物安全挑战 | CRISPR诊断系统、合成疫苗平台和工程益生菌等合成生物技术产品 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR/Cas系统(DETECTR、SHERLOCK)、mRNA疫苗技术、病毒载体疫苗技术、工程益生菌技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cas13a | 工程益生菌 | 病原体检测生物传感器、免疫调节回路 | 医学 |
| 1078 | 2025-11-23 |
Beyond evolution: De novo designed protein toolkit rewriting the rules of synthetic biology
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.004
PMID:41262455
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综述 | 本文探讨人工智能驱动的蛋白质设计如何通过超越进化约束的全新蛋白质工具包革新合成生物学 | 提出超越已知结构模板和进化约束的全新蛋白质设计范式,建立从蛋白质设计到系统级实施的层次化框架 | 新型蛋白质在细胞系统中表达存在功能不可预测性,需要更完善的风险评估体系 | 系统分析AI驱动蛋白质设计的计算框架及其在合成生物学中的应用前景 | 从头设计的蛋白质工具包及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能蛋白质设计、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构导向的理性基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 1079 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
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综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 1080 | 2025-11-22 |
Dissecting native plasmid functions in Lactococcus lactis: Synergistic regulation of metabolism and industrially relevant traits
2025-Dec, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27053
PMID:41130394
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研究论文 | 本研究解析了乳酸乳球菌C20中3个天然质粒的功能及其对代谢和工业性状的协同调控作用 | 首次系统揭示了乳酸乳球菌C20中天然质粒的协同调控网络及其对工业性状的关键影响 | 研究仅针对C20菌株的3个质粒,未在其他乳酸乳球菌菌株中验证普适性 | 阐明乳酸乳球菌天然质粒的生物学功能及其在工业应用中的潜力 | 乳酸乳球菌C20菌株及其3个天然质粒(pLL1, pLL2, pLL3) | 合成生物学 | NA | 基因组分析、组合消除、功能表征 | NA | 基因组数据、代谢数据 | 乳酸乳球菌C20菌株及其质粒变异株 | 基因编辑、合成生物学 | 乳酸乳球菌 | 天然质粒调控网络 | 食品,制药,工业生物技术 |