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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-10-05 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
|
综述 | 本文综述了在酿酒酵母中异源合成萜类化合物的策略与方法 | 系统阐述了利用细胞微区室技术、P450酶高效表达策略及宿主代谢调控来优化萜类合成途径 | NA | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 萜类化合物的生物合成途径与酿酒酵母代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 萜类化合物生物合成途径 | 医药、保健品、香料 |
| 1222 | 2025-10-05 |
SynNotch CAR-T cell, when synthetic biology and immunology meet again
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545270
PMID:40308611
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综述 | 探讨合成Notch受体与CAR-T细胞疗法的革命性整合,以克服传统方法在实体瘤治疗中的局限性 | 引入合成Notch(synNotch)受体作为分子逻辑门,实现T细胞活化的多抗原精准调控 | NA | 通过合成生物学方法改进CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的特异性、安全性和适应性 | 合成Notch受体工程化T细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程 | 分子逻辑门 | NA | NA | synNotch | T细胞 | 基于天然受体-配体相互作用的可编程信号平台,实现时空控制基因表达 | 医学 |
| 1223 | 2025-10-05 |
CYP98A monooxygenases: a key enzyme family in plant phenolic compound biosynthesis
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf074
PMID:40303436
|
综述 | 本文系统综述了CYP98A单加氧酶家族在植物酚类化合物生物合成中的分子特征与功能 | 首次对碎片化的CYP98A氧化酶家族研究进行系统性总结,提出通过代谢工程和合成生物学优化该酶的应用潜力 | 当前针对该氧化酶家族的研究仍较为分散,缺乏系统性的实验验证 | 阐明CYP98A单加氧酶在植物酚类化合物生物合成中的作用机制与应用前景 | CYP98A单加氧酶家族及其催化的酚类化合物生物合成途径 | 植物代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 代谢工程 | 园艺植物 | 酚类化合物生物合成途径 | 农业,医药,食品工业 |
| 1224 | 2025-10-05 |
Elucidation of the Ultrafast Origin of Multiphasic Dynamics in a Far-Red-Sensing Cyanobacteriochrome
2025-May-01, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00487
PMID:40256925
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研究论文 | 本研究通过飞秒分辨荧光和吸收方法揭示了远红光/橙光感知蓝细菌色素的光异构化动力学机制 | 首次在远红光吸收态中观察到独特的动态光谱调谐现象,并在橙光吸收态中发现明显的动态斯托克斯位移 | NA | 阐明蓝细菌色素的激发态光化学和结构动力学机制 | 新发现的远红光/橙光吸收蓝细菌色素 | 生物物理学 | NA | 飞秒分辨荧光光谱、飞秒分辨吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 基于藻蓝胆素的光敏系统 | 生物技术 |
| 1225 | 2025-10-05 |
Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516
PMID:39793936
|
综述 | 本文综述了针对Ralstonia eutropha H16开发的合成生物学工具及其在代谢工程中生产高附加值化学品的应用 | 整合了多组学数据与完整基因组注释,为高效重编程代谢网络提供了强大遗传框架 | NA | 开发合成生物学工具并改造Ralstonia eutropha H16代谢途径以生产高附加值化学品 | Ralstonia eutropha H16细菌及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、基因组工程 | NA | 多组学数据、基因组序列 | NA | 表达载体构建、调控元件设计、转化技术 | Ralstonia eutropha H16 | 代谢网络重编程、自养和异养生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1226 | 2025-10-05 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文提出并系统阐述了'合成脂质生物学'这一新兴交叉领域,整合了化学、生物学、物理学和工程学方法研究脂质和生物膜 | 首次正式提出'合成脂质生物学'概念,将多学科方法系统整合用于构建、操纵和分析脂质与生物膜 | 该领域仍处于萌芽阶段,尚未形成完整的理论体系和技术框架 | 建立对脂质和生物膜特性、行为及功能的更清晰描述 | 生物脂质、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 1227 | 2025-10-05 |
CAR-T cell therapy for breast cancer: Current status and future perspective
2025-Feb, Cancer treatment reviews
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.ctrv.2024.102868
PMID:39798230
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综述 | 本文综述CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的现状与未来发展方向 | 系统总结CAR-T疗法在乳腺癌应用中的创新策略,包括合成生物学靶向、逻辑门控CAR设计、装甲CAR改造等技术 | 目前CAR-T疗法在乳腺癌中的疗效仍远未达到血液肿瘤的成功水平,主要受限于肿瘤特异性抗原缺乏和免疫抑制微环境 | 探讨CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的应用前景和改进策略 | 乳腺癌患者,特别是转移性乳腺癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 乳腺癌 | CAR-T细胞疗法,合成生物学技术 | NA | 临床前和临床数据 | NA | 合成生物学,基因工程 | T细胞 | 逻辑门控CAR,可诱导基因开关,趋化因子受体工程 | 医学 |
| 1228 | 2025-10-05 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
|
综述 | 本文综述了心肌细胞工程领域的最新进展,重点关注转录因子、信号网络、代谢和功能在直接心脏重编程中的整合作用 | 特别关注合成生物学特别是CRISPR系统在靶向转化特定成纤维细胞亚群为心肌细胞方面的潜力 | 尽管有多种新开发的方法,获得功能和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 总结当前关于人类心脏成纤维细胞功能和多样性以及体外人类心肌细胞模型替代细胞来源的知识 | 人类心脏成纤维细胞、诱导心肌细胞、转录因子 | 合成生物学 | 心血管疾病 | CRISPR、直接心脏重编程 | NA | NA | NA | CRISPR | 人类细胞 | NA | 医学 |
| 1229 | 2025-10-05 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
|
研究论文 | 本研究通过可重构DNA纳米筏构建合成细胞模型,实现了从纳米尺度到微米尺度的形态重塑和膜通道形成 | 将信号响应型DNA纳米筏与生物孔蛋白结合,首次实现了合成细胞的可编程形态重塑和可密封合成通道的形成 | NA | 开发可重构DNA纳米结构与合成细胞接口的多功能平台 | DNA纳米筏、生物孔蛋白、巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 可重构DNA纳米筏系统,能够在脂质膜上发生各向同性态与短程有序态之间的可逆转变 | 合成生物学, 生物技术 |
| 1230 | 2025-10-05 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究结合量子隧穿传输和机器学习技术,实现了对人工合成DNA碱基的高精度电识别 | 首次将量子隧穿纳米间隙结与机器学习相结合用于人工DNA序列识别,实现了接近100%的碱基识别准确率 | 仅针对八种人工合成DNA碱基进行测试,未涉及更复杂的天然DNA序列 | 开发快速精确的人工DNA电识别方法 | 八种人工合成DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输,机器学习 | 机器学习模型 | 电传输信号,电流读数 | 八种人工DNA碱基的数据集 | NA | NA | NA | 遗传研究,基因数据存储,合成生物学,诊断 |
| 1231 | 2025-10-05 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
|
综述 | 综述曲霉基因工程策略在有机酸生产中的最新进展与未来方向 | 重点探讨了CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用与挑战 | NA | 提高工业有机酸生产效率 | 曲霉(Aspergillus) | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR | 曲霉(Aspergillus) | 代谢途径重构、副产物消除、调控途径修饰、菌丝形态工程 | 工业生物技术 |
| 1232 | 2025-10-05 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
|
研究论文 | 本研究开发了一种跨物种诱导系统,用于增强细菌中的蛋白质表达和多通路代谢途径的精细调控 | 设计了可在三种不同模型微生物中工作的跨物种诱导系统,并开发了能够同时激活和抑制基因表达的单输入遗传电路 | NA | 开发适用于多种细菌的通用型诱导表达系统 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌三种模型微生物 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、蛋白质表达分析 | NA | NA | NA | T7 RNA聚合酶,dCas12a | 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,谷氨酸棒状杆菌 | 2,4-二乙酰基间苯三酚诱导系统PphlF3R1、脱水四环素诱导系统Ptet2R2*、单输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 1233 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
|
综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的最新进展 | 重点介绍了微生物联合体的协同作用机制及其在提高诊断准确性和治疗效果方面的创新应用 | 存在细菌长期存活与安全性保障、非模式菌株基因编辑技术缺乏、潜在毒性控制及与宿主微生物组相互作用机制不明确等挑战 | 系统总结工程化细菌在疾病诊断与治疗领域的研究现状与发展前景 | 经过合成生物学改造的工程细菌及微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症, 肠道疾病, 代谢疾病 | 合成生物学技术, 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌 | 微生物联合体协同作用系统 | 医学 |
| 1234 | 2025-10-05 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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综述 | 本文综述了从极端微生物宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从极端环境样本中挖掘新型糖苷水解酶,无需实验室培养极端微生物 | 极端微生物来源基因在常温宿主中表达困难、酶活性产量低以及规模化应用挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的来源,用于工业应用 | 极端微生物宏基因组中的糖苷水解酶基因 | 宏基因组学 | NA | 高通量测序, 生物信息学分析, 蛋白质工程 | 机器学习 | 环境DNA序列数据 | NA | 合成生物学工具 | 常温宿主 | NA | 工业生物技术 |
| 1235 | 2025-10-05 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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综述 | 本文系统总结了植物合成生物学中用于黄酮类化合物生产的分子元件的酶动力学特性 | 首次从不同植物物种来源系统比较天然和工程化分子元件的酶动力学特性,为黄酮类化合物生物合成途径优化提供新见解 | NA | 通过植物合成生物学方法实现黄酮类化合物的可持续生产 | 黄酮类化合物生物合成相关的分子元件和酶 | 合成生物学 | NA | 酶动力学分析、代谢工程 | NA | 酶动力学数据 | NA | NA | 植物、微生物 | 黄酮类化合物生物合成途径重构 | 制药、营养保健品、化妆品 |
| 1236 | 2025-10-05 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究开发了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择压力下的稳定性 | 采用开源硬件微流控技术,通过凝胶微滴培养单细胞并利用荧光显微镜定量分析微菌落,实现了对质粒稳定性的高通量并行分析 | 目前研究主要使用大肠杆菌作为实验模型,在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发一种无需抗生素选择即可分析质粒稳定性的高通量方法 | 质粒在大肠杆菌中的稳定性 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、荧光蛋白表达 | NA | 荧光图像数据 | 大量微滴和微菌落的并行分析 | NA | 大肠杆菌 | 质粒表达的荧光蛋白生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1237 | 2025-10-05 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从甜槠转录组中筛选并鉴定了两个查尔酮合酶基因,通过生物信息学分析和功能验证揭示了其在查尔酮生物合成中的作用 | 首次从甜槠中鉴定出两个CHS基因,并证明其在大肠杆菌中与外来基因共表达可催化合成根皮素 | 仅验证了两个CHS基因在体外系统中的功能,未在植物体内进行功能验证 | 探究甜槠查尔酮合酶基因家族在查尔酮合成中的功能 | 甜槠(Lithocarpus litseifolius)的查尔酮合酶基因LlCHS1和LlCHS2 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、生物信息学分析、系统发育分析、异源表达 | NA | 转录组数据、蛋白质序列数据 | 两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢通路工程,将LlCHS1/LlCHS2与Aa4CL共表达构建根皮素合成途径 | 工业生物技术 |
| 1238 | 2025-10-05 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程改造微生物生产萜类食品配料的方法与策略 | 提出通过多维度优化异源合成途径、整合合成调控电路和工程化长期遗传稳定性来提升萜类食品配料的生产效率 | NA | 开发高效的微生物细胞工厂以生产萜类食品配料 | 微生物细胞工厂和萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 合成调控电路、代谢途径优化 | 食品, 工业生物技术 |
| 1239 | 2025-10-05 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟结合实验验证,探究了外加电场对人工设计肽孔结构动力学的影响 | 在GENESIS分子动力学模拟软件中实现了均匀外加电场功能,用于研究从头设计肽孔的构象动力学 | NA | 研究膜电位对人工设计肽孔结构稳定性和动力学的影响 | 从头设计的肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据,实验数据 | NA | NA | NA | 人工离子通道和孔设计 | 医学 |
| 1240 | 2025-10-05 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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研究论文 | 开发了一种在哺乳动物细胞中进行定向进化的正交RNA复制系统 | 创建了正交甲病毒RNA复制系统,实现RNA复制酶辅助的连续进化,克服了现有方法的宿主基因组干扰、文库规模小和不可控突变等瓶颈 | NA | 推进哺乳动物合成生物学和细胞工程应用 | RNA基器件、荧光蛋白、转录因子 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统、定向进化 | NA | NA | NA | 正交甲病毒RNA复制系统 | 哺乳动物细胞 | RNA复制酶辅助连续进化系统,通过复制酶限制模式和诱导突变实现RNA多样性 | 医学, 工业生物技术 |