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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-10-05 |
Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514
PMID:39755221
|
综述 | 本文系统评述了细菌糖蛋白工程领域的最新技术进展、挑战与未来发展方向 | 从合成生物学和代谢工程角度全面分析细菌蛋白糖基化系统,重点关注糖蛋白治疗剂和疫苗开发 | NA | 探讨利用细菌糖基化系统生产高价值糖蛋白的方法与策略 | 细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白糖链偶联技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 糖基化系统优化(糖基转移酶、载体蛋白、糖基供体、宿主细菌) | 医学, 诊断 |
| 1242 | 2025-10-05 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
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综述 | 本文总结了丹参中丹参酮生物活性的研究进展及提高其产量的生物技术策略 | 系统整合了丹参酮生物合成途径、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学等多维度研究进展 | NA | 开发高质量的丹参资源并提高丹参酮产量 | 丹参及其活性成分丹参酮 | 合成生物学 | 心脑血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 丹参 | 丹参酮生物合成途径 | 医药 |
| 1243 | 2025-10-05 |
Customized design of host-independent T7 expression system (HITES) for a broad host range
2025-Feb, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.12.012
PMID:39778814
|
研究论文 | 开发了一种宿主非依赖性T7表达系统(HITES)的定制设计方法,用于在多种宿主中实现高效蛋白表达和目标化学品生产 | 发现EL值在T7表达系统构建中的关键作用,并提出基于EL值指导的宿主非依赖性T7表达系统定制设计方法 | NA | 开发适用于广泛宿主范围的通用蛋白表达系统 | T7表达系统在不同宿主菌株中的构建和优化 | 合成生物学 | NA | T7表达系统构建、蛋白表达分析 | NA | 酶活性测量数据、蛋白表达数据 | 13种宿主菌株 | T7表达系统 | 大肠杆菌DH5α, 其他12种宿主菌株 | 宿主非依赖性T7表达系统(HITES),包含T7 RNA聚合酶活性调控策略 | 工业生物技术 |
| 1244 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
|
综述 | 本文系统回顾了遗传密码扩展技术的最新进展及其在生物学和医学领域的应用 | 全面总结了遗传密码扩展技术在氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统优化、翻译系统工程和非经典氨基酸生物合成方面的最新突破 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体细节 | 系统梳理遗传密码扩展技术的发展现状、挑战机遇及其在生物学和医学领域的应用前景 | 遗传密码扩展技术及其相关应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 文献资料 | NA | 氨基酸酰基-tRNA合成酶/tRNA系统 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 1245 | 2025-10-05 |
A systematic study of regulating inorganic polyphosphates production in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.04.004
PMID:40291979
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研究论文 | 本研究系统性地探究了酿酒酵母中无机多聚磷酸盐合成的遗传调控机制,并通过基因工程策略成功构建了高产长链多聚磷酸盐的工程菌株 | 首次系统筛选了55个单基因敲除菌株对多聚磷酸盐代谢的影响,发现协同增强多聚磷酸盐合成和链长的双突变组合,并利用CRISPR/Cas9技术构建了高产工程菌株 | 研究仅限于酿酒酵母模型,未在其他微生物系统中验证;对多聚磷酸盐的具体生物学功能机制仍需进一步研究 | 阐明酿酒酵母中多聚磷酸盐代谢的遗传调控机制,并开发高产多聚磷酸盐的工程菌株 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其基因敲除突变株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除筛选、CRISPR/Cas9基因编辑、qRT-PCR分析 | NA | 基因表达数据、代谢物定量数据 | 55个单基因敲除菌株库及组合突变株 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 多聚磷酸盐生物合成途径调控,包括增强ATP供应和抑制多聚磷酸酶活性 | 工业生物技术 |
| 1246 | 2025-10-05 |
Synthetically Engineered Bacterial Extracellular Vesicles and IL-4-Encapsulated Hydrogels Sequentially Promote Osteoporotic Fracture Repair
2025-04-29, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c03106
PMID:40237831
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学细菌胞外囊泡和IL-4水凝胶的序贯治疗系统,用于促进骨质疏松性骨折修复 | 首次构建了负载pBMP-2-VEGF的工程化细菌胞外囊泡并与IL-4共同封装在GelMA水凝胶中,形成具有时序治疗功能的复合材料 | 目前仅在小鼠模型中验证疗效,尚未进行临床前大动物实验或临床试验 | 开发新型骨质疏松性骨折治疗策略 | 骨质疏松性骨折修复过程 | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、水凝胶封装技术 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | pBMP-2-VEGF基因负载系统 | 医学 |
| 1247 | 2025-10-05 |
New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation
2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14081439
PMID:40282840
|
综述 | 探讨微生物通过发酵和合成生物学技术从农业食品及副产品中生产高价值生物活性分子的最新研究 | 系统关联微生物利用与特定高价值分子生产,强调合成生物学在食品营养领域的应用潜力 | NA | 研究微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的生物活性分子 | 具有特定性状的选育微生物及农业食品副产品 | NA | NA | 发酵技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 选育微生物 | NA | 食品工业, 营养保健品 |
| 1248 | 2025-10-05 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
|
研究论文 | 通过非平均单分子3D结构确定研究局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET)分析每个单元细胞粒子的非平均3D结构,揭示DNA折纸二维晶格异质性的分子起源 | 研究仅针对特定DNA折纸八面体笼结构,未验证其他类型的蛋白质或DNA结构 | 研究局部异质性对DNA导向蛋白质二维晶格结构的影响 | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格 | 结构生物学 | NA | 个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET), 分子动力学模拟 | NA | 3D冷冻电镜图像 | 铁蛋白负载百分比为100%、70%和0%的DNA笼样品 | DNA折纸 | NA | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格结构 | 合成生物学, 纳米催化, 生物器件 |
| 1249 | 2025-10-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
|
综述 | 本文全面总结了木质素生物降解的前沿策略、酶系统、代谢途径及降解菌株,并探讨了木质素增值化的创新方法 | 系统整合生物催化与合成生物学策略,提出人工智能驱动技术突破木质素增值化瓶颈的创新路径 | NA | 开发木质素生物增值化技术,实现木质素资源的高效利用 | 木质素聚合物及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环等代谢通路重定向 | 能源, 材料, 工业生物技术, 食品 |
| 1250 | 2025-10-05 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究发现了甘薯曲叶病毒卫星DNA中的SBG51序列能显著增强基因表达,并鉴定出关键ATAAA/TTAAA重复元件 | 首次发现双生病毒卫星DNA的3'侧翼序列具有增强基因表达功能,并证明人工合成含ATAAA/TTAAA重复序列具有类似基质附着区的功能 | NA | 探索合成生物学中新型基因表达元件 | 病毒来源的DNA序列及其对基因表达的增强作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达分析、转基因技术 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据 | 本氏烟叶片、拟南芥转基因植株、酵母 | 基因表达载体构建 | 本氏烟, 拟南芥, 酵母 | 基因表达增强元件,含ATAAA/TTAAA重复序列的人工合成序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 1251 | 2025-10-05 |
Generalized Orthogonal de Bruijn and Kautz Sequences
2025-Mar-30, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27040366
PMID:40282601
|
研究论文 | 本文研究正交de Bruijn序列和Kautz序列的三种实用推广形式 | 提出了正交de Bruijn序列的三种推广形式,并给出了固定权重正交de Bruijn序列数量的上下界 | NA | 探索正交de Bruijn序列和Kautz序列的推广形式及其理论性质 | de Bruijn序列、正交de Bruijn序列、Kautz序列 | 编码理论 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1252 | 2025-10-05 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
|
研究论文 | 本研究开发了一种工程化的睾丸酮丛毛单胞菌菌株,可将聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)升级转化为生物塑料聚羟基丁酸酯(PHB) | 首次将睾丸酮丛毛单胞菌RW31工程化改造,使其能异源表达PET降解酶并直接将PET废物转化为PHB生物塑料 | 体外和体内PET降解效率存在差异(37.1% vs 0.83%),体内降解效率较低 | 开发PET废物的生物升级回收策略 | 睾丸酮丛毛单胞菌RW31及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物降解、生物合成 | NA | 实验数据 | 工程菌株及其野生型 | CRISPR-Cas9 | Comamonas testosteroni | PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase融合表达系统 | 环境,工业生物技术 |
| 1253 | 2025-10-05 |
Extracellular electron transfer-dependent bioremediation of uranium-contaminated groundwater: Advancements and challenges
2025-Mar-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2024.122957
PMID:39708382
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综述 | 探讨利用微生物胞外电子转移过程修复铀污染地下水的潜力与挑战 | 系统评述了基于胞外电子转移的铀生物修复分子机制及结合合成生物学与机器学习的前沿策略 | NA | 铀污染地下水修复技术开发 | 异化金属还原菌(如地杆菌和希瓦氏菌)及其胞外电子转移过程 | 环境生物技术 | NA | 胞外电子转移、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 地杆菌, 希瓦氏菌 | 电子传递优化系统 | 环境 |
| 1254 | 2025-10-05 |
Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications
2025-Mar, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.128026
PMID:39705832
|
综述 | 本文系统综述了微生物中液-液相分离(LLPS)的存在机制、功能作用及应用前景 | 首次整合微生物LLPS多维度研究,揭示其与环境适应性的关联,并提出作为合成生物学和病原微生物治疗新靶点的潜力 | 微生物LLPS形成与调控机制研究尚不充分,分子调控细节和实际应用仍需深入探索 | 阐明微生物中液-液相分离的生物学功能及其在生物技术中的应用价值 | 微生物体内的生物分子凝聚物及其相分离现象 | 合成生物学 | NA | 相分离研究技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 1255 | 2025-10-05 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度生成模型CasGen,用于设计新型CRISPR Cas蛋白 | 提出了结合分类过滤、贝叶斯优化和结构验证的Cas蛋白生成框架,首次将边界潜在空间正则化应用于Cas蛋白设计 | 生成的Cas蛋白序列与已知变体存在28%-55%的相似性,可能限制了完全新颖蛋白的发现 | 扩展基因组编辑工具包,设计更多样化的Cas蛋白变体 | Cas9和Cas12蛋白序列 | 合成生物学 | NA | Transformer深度学习,AlphaFold结构预测,BLAST序列比对 | Transformer,深度生成模型 | 蛋白质序列数据 | 3,021条Cas9序列,597条Cas12序列,597条非Cas序列 | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 1256 | 2025-10-05 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 本研究开发了一种通过小细胞外囊泡递送LRRK2 siRNA的合成生物学策略,用于减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 利用遗传回路实现siRNA在体内自组装并通过小细胞外囊泡靶向递送至黑质区 | 仅在帕金森病小鼠模型中验证疗效,尚未进行临床研究 | 开发帕金森病的基因治疗策略 | LRRK2R1441G帕金森病小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | siRNA技术、遗传回路设计 | NA | NA | 两种小鼠模型 | 遗传回路 | 小鼠肝细胞 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的遗传回路,受CMV启动子控制 | 医学 |
| 1257 | 2025-10-05 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-Feb-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 开发了一种创新的酵母文库转化方法HEEL,通过热激-电穿孔组合技术显著提高单质粒转化效率 | 结合热激和电穿孔的双重方法,将酵母单质粒转化细胞比例从20%提升至70%以上,实现了近乎完美的表型-基因型关联 | NA | 开发高质量的酵母DNA文库转化方法,解决多质粒摄取问题 | 酵母细胞和DNA文库 | 合成生物学 | NA | 热激-电穿孔组合技术(HEEL), Sanger测序 | NA | 基因型数据, 表型数据 | 每反应超过10^10个酵母细胞 | 电穿孔, 热激转化 | 酵母 | 双条形码设计,包含单核苷酸多态性和高多样性区域 | 分子生物学, 蛋白质工程 |
| 1258 | 2025-10-05 |
Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders
2025-Feb, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2024.2444364
PMID:39688950
|
综述 | 探讨基于细菌及其衍生物作为药物递送系统治疗中枢神经系统疾病的新策略 | 利用细菌的趋化性、生物相容性和靶向能力突破血脑屏障,实现精准药物递送 | 存在生物安全性、免疫排斥和大规模生产等挑战 | 开发基于细菌的药物递送系统用于中枢神经系统疾病治疗 | 细菌载体及其衍生物(如OMVs、细菌幽灵) | 合成生物学 | 中枢神经系统疾病 | 基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 | 生物传感器、代谢通路 | 医药 |
| 1259 | 2025-10-05 |
Multi-enzyme assemblies both in the cell membrane and cytoplasm boost intracellular lycopene production
2025-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138654
PMID:39689805
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Mi3蛋白质笼和ReverseTag/ReverseCatcher肽标签系统的多酶组装策略,显著提高了体外酶催化效率和细胞内番茄红素产量 | 首次将二十面体蛋白质笼Mi3与酯键肽标签系统结合,构建了同时位于细胞质和细胞膜的多酶组装系统 | NA | 提高酶催化效率和代谢产物产量 | 多酶组装系统及其在番茄红素生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶组装技术 | NA | 酶动力学数据、代谢产物产量数据 | NA | ReverseTag/ReverseCatcher系统 | NA | 多酶组装系统、代谢通路工程 | 工业生物技术 |
| 1260 | 2025-10-05 |
All Roads Lead to Rome: Pathways to Engineering Disease Resistance in Plants
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412223
PMID:39691979
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综述 | 本文系统阐述了植物与病原体相互作用的基本机制,并详细综述了利用基因工程和合成生物学技术开发植物抗病性的多种策略 | 全面整合了植物抗病性开发的最新策略,包括基因编辑和合成生物学方法,并针对主要作物提供了可用于抗病育种的潜在基因资源 | 讨论了现有抗病策略存在的局限性及其可能的解决方案 | 开发具有持久和广谱抗病性的植物品种 | 植物抗病性机制和工程化策略 | 合成生物学 | 植物病害 | 基因编辑, 合成生物学, 基因操作和转化方法 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |