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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1361 | 2024-09-02 |
Switchable Control of Scaffold Protein Activity via Engineered Phosphoregulated Autoinhibition
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00122
PMID:35765959
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化和可切换的合成支架系统,该系统集成了支架介导的信号传导与可切换的激酶/磷酸酶输入控制 | 通过将磷酸化响应抑制肽基序融合到14-3-3蛋白上,生成具有附加调节肽基序的二聚体蛋白支架,实现了对支架蛋白活性的可控调节 | NA | 开发一种可控的支架平台,用于合成生物学中的调节过程 | 14-3-3蛋白支架及其在细胞信号传导中的作用 | 合成生物学 | NA | 磷酸化调节 | NA | 蛋白质 | 使用三种不同的激酶进行实验 |
1362 | 2024-09-02 |
The Origin of Life: What Is the Question?
2022-07, Astrobiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1089/ast.2021.0162
PMID:35594335
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research paper | 本文旨在梳理科学中关于生命起源问题的不同解读,并识别出三个主要维度:历史适宜性、自然自发性和与我们已知生命的相似性。 | 本文提出了生命起源问题的不同约束条件,并探讨了这些约束如何影响问题的认知状态和性质。 | 文章主要集中在理论分析上,未涉及具体的实验或数据支持。 | 探讨生命起源问题的不同解读及其对科学领域的影响。 | 生命起源问题的不同解读及其约束条件。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1363 | 2024-09-02 |
Biotechnological Approaches to Optimize the Production of Amaryllidaceae Alkaloids
2022-06-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12070893
PMID:35883449
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综述 | 本文综述了利用生物技术方法优化石蒜科生物碱(AAs)生产的现状 | 探讨了通过体外培养和合成生物学等生物技术手段提高AAs产量的方法 | AAs生产水平的变异性限制了其在制药领域的广泛应用 | 旨在提高石蒜科生物碱的生产效率,以满足日益增长的需求 | 石蒜科植物及其产生的生物碱 | NA | 阿尔茨海默病 | 体外培养、合成生物学 | NA | NA | NA |
1364 | 2024-09-02 |
Synthetic Cells: From Simple Bio-Inspired Modules to Sophisticated Integrated Systems
2022-04-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202110855
PMID:34856047
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综述 | 本文综述了自底向上的合成生物学方法在设计和构建合成细胞及细胞器方面的最新进展 | 介绍了多种策略和材料,使科学家能够工程化合成细胞和细胞器,模拟自然细胞的基本功能和行为 | NA | 展示代表性的复杂性逐渐增加的合成细胞以及解决自底向上合成生物学中特定挑战的策略 | 合成细胞和细胞器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1365 | 2024-09-02 |
From Biomass-Derived p-Hydroxycinnamic Acids to Novel Sustainable and Non-Toxic Phenolics-Based UV-Filters: A Multidisciplinary Journey
2022, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2022.886367
PMID:35864863
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综述 | 本文综述了从生物质中提取的p-羟基肉桂酸衍生物到新型可持续且无毒的酚类紫外线过滤剂的开发过程 | 采用多学科方法,结合生物技术、绿色化学、下游工艺和光化学,将生物质特别是木质素转化为高附加值的创新紫外线过滤剂 | NA | 寻找可持续且无毒的紫外线过滤剂,以解决现有有机紫外线过滤剂的化石来源和毒性问题 | 从生物质中提取的酚类化合物及其作为紫外线过滤剂的应用 | 绿色化学 | NA | 合成生物学/发酵/在线产品回收 | NA | 生物质 | NA |
1366 | 2024-09-01 |
Engineering immune-evasive allogeneic cellular immunotherapies
2024-Sep, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01022-8
PMID:38658708
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研究论文 | 本文讨论了如何通过赋予同种异体T细胞和自然杀伤(NK)细胞内在的免疫逃避特性,来防止或延迟它们的免疫排斥,从而扩大治疗窗口 | 探讨了利用基因编辑和合成生物学设计基于细胞的精准免疫疗法的前景,超越了编程靶向特异性,需要仔细考虑受体中的先天和适应性反应 | NA | 旨在改善现成的同种异体细胞疗法的持久性,并设计基于细胞的精准免疫疗法 | 同种异体T细胞和NK细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 基因编辑和合成生物学 | NA | NA | NA |
1367 | 2024-09-01 |
Cultivation optimization promotes ginsenoside and universal triterpenoid production by engineered yeast
2024-Aug-22, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.08.505
PMID:39181198
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research paper | 本文通过实验设计优化发酵条件,提高了工程酵母生产人参皂苷和通用三萜类化合物的产量 | 利用合成生物学、微生物工程和配方研究,实现了可持续生产高价值化合物,如三萜类合成 | NA | 优化发酵条件以提高工程酵母生产人参皂苷和三萜类化合物的产量 | 人参皂苷和三萜类化合物 | NA | NA | 发酵 | NA | NA | NA |
1368 | 2024-09-01 |
Phase Separation in Biology and Disease; Current Perspectives and Open Questions
2023-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.167971
PMID:36690068
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚物(biomolecular condensates)的存在、形成、生物功能及其与疾病关联的研究进展,并探讨了该领域的关键问题和未来方向 | 生物分子凝聚物通过相分离形成,这一发现革新了我们对细胞内生物分子空间和时间组织方式的理解 | 尽管在某些情况下,生物分子凝聚物的形成与生物功能之间的联系得到了严格证据的支持,但在许多其他情况下,这种联系的支持不够充分,导致了对相分离在生物学和疾病中普遍作用的合理审查 | 探讨生物分子凝聚物在多种生物过程和系统中的作用,以及其在正常和疾病细胞状态中的应用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 生物分子凝聚物及其在生物学和疾病中的作用 | 生物学 | 神经退行性疾病,癌症 | NA | NA | NA | NA |
1369 | 2024-09-01 |
New destination vectors facilitate Modular Cloning for Chlamydomonas
2022-Aug, Current genetics
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00294-022-01239-x
PMID:35429260
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研究论文 | 本文介绍了通过构建新的目的载体,简化Chlamydomonas reinhardtii中Modular Cloning(MoClo)策略的基因组装步骤 | 开发了五个新的目的载体,这些载体包含抗常用抗生素的基因和一个直接组装基本遗传部件的位点,使用红色/白色颜色选择,无需昂贵的化合物如X-gal和IPTG | NA | 旨在简化Chlamydomonas reinhardtii中MoClo策略的基因组装步骤 | Chlamydomonas reinhardtii中的基因组装 | 合成生物学 | NA | Modular Cloning (MoClo) | NA | 基因 | 五个新的目的载体 |
1370 | 2024-09-01 |
Ecological firewalls for synthetic biology
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104658
PMID:35832885
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研究论文 | 本文探讨了利用工程微生物菌株作为生态防火墙,保护生态系统免受不良临界点和生物多样性丧失的影响 | 提出了一种基于生态网络模式非线性吸引子动态的替代观点,设计生态防火墙执行新功能(如塑料去除),并在当地社区内实现 containment | NA | 研究如何利用工程微生物菌株保护生态系统 | 工程微生物菌株及其在生态系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1371 | 2024-09-01 |
Low-cost anti-mycobacterial drug discovery using engineered E. coli
2022-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31570-3
PMID:35798732
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research paper | 本文介绍了一种合成生物学框架,用于在工程改造的大肠杆菌中检测结核分枝杆菌(Mtb)的药物靶点,通过构建目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型,成功发现了一种针对Mtb丙氨酸消旋酶(Alr)的抑制剂——贝那普利。 | 本文创新性地利用工程改造的大肠杆菌作为筛选平台,替代直接使用结核分枝杆菌进行药物筛选,提高了筛选效率和安全性。 | 尽管在体外生物化学实验中验证了贝那普利的抑制机制,但尚未在临床环境中进行全面评估。 | 开发一种高效且低成本的抗结核分枝杆菌药物筛选方法。 | 结核分枝杆菌的药物靶点和潜在抑制剂。 | 合成生物学 | 结核病 | NA | 目标必需替代大肠杆菌(TESEC)模型 | NA | 涉及四种额外的目标靶点 |
1372 | 2024-09-01 |
Engineering consortia by polymeric microbial swarmbots
2022-07-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31467-1
PMID:35790722
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研究论文 | 本文展示了一种通过聚合物微胶囊封装微生物亚群来构建稳定微生物共生体的方法 | 提出了一种工程化的空间隔离方法,能够灵活精确地组装稳定的共生体 | NA | 探索合成生物学中新型的微生物共生体构建方法 | 微生物共生体的稳定性和功能性 | 合成生物学 | NA | 聚合物微胶囊技术 | NA | NA | NA |
1373 | 2024-09-01 |
Reprogramming Microbial CO2-Metabolizing Chassis With CRISPR-Cas Systems
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.897204
PMID:35814004
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在微生物CO2代谢底盘中的应用及其在碳负性生物技术中的革命性作用 | 介绍了CRISPR-Cas系统在蓝藻、醋酸菌和甲烷菌中的最新进展,并展望了未来基于CRISPR-Cas系统的创新技术,如碱基编辑、前导编辑和转座子介导的基因组编辑 | NA | 探讨如何利用合成生物学工具,特别是CRISPR-Cas系统,开发和应用微生物CO2代谢底盘,以实现碳中和和碳负性生物技术,从而应对全球变暖问题 | 微生物CO2代谢底盘,包括蓝藻、醋酸菌和甲烷菌 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
1374 | 2024-09-01 |
Molecular Advancements Establishing Chlamydomonas as a Host for Biotechnological Exploitation
2022, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2022.911483
PMID:35845675
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综述 | 本文综述了近期在利用莱茵衣藻作为生物技术平台的进展,包括核转基因表达的改进、MoClo合成生物学策略的应用、转基因设计和表达的优化以及CRISPR/Cas9基因编辑技术的进步。 | 文章介绍了莱茵衣藻作为生物技术平台的多个创新点,包括核转基因表达的稳定性和效率提升、MoClo合成生物学策略的发展、转基因设计的系统性改进以及CRISPR/Cas9技术的应用。 | NA | 探讨莱茵衣藻作为生物技术平台的潜力和应用前景。 | 莱茵衣藻的生物技术应用和合成生物学潜力。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
1375 | 2024-08-31 |
Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis
2024-Jul-30, Membranes
IF:3.3Q2
DOI:10.3390/membranes14080168
PMID:39195420
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研究论文 | 本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力,并通过酯水解反应验证了这一概念 | 首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性 | 催化反应速度比酶催化慢,催化转化数在10-7到10-8 s之间 | 探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用 | 脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用 | NA | NA | H-NMR | NA | 荧光 | NA |
1376 | 2024-08-31 |
Bifurcation drives the evolution of assembly-line biosynthesis
2022-06-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30950-z
PMID:35715397
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研究论文 | 本文探讨了生物合成装配线的重编程及其在抗生素结构进化中的作用 | 揭示了基因重复和新功能化如何导致生物合成途径的分支,以及这种分支如何促进抗生素结构的进化 | NA | 深入了解生物合成装配线的设计过程及其进化机制 | 抗结核药物wollamides的生物合成途径 | 生物技术 | 结核病 | 基因重复和新功能化 | NA | 基因组数据 | NA |
1377 | 2024-08-31 |
Chemical Communication in Artificial Cells: Basic Concepts, Design and Challenges
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.880525
PMID:35720123
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综述 | 本文综述了人工细胞间分子通信的基本概念、设计及挑战 | 强调了人工细胞间通信的重要性,并分类讨论了不同通信模式,如自分泌、邻分泌、旁分泌和内分泌信号 | NA | 探讨人工细胞间通信的设计及其在生物技术、高级胶体材料和再生医学中的应用潜力 | 人工细胞间的分子通信 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1378 | 2024-08-30 |
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51511-6
PMID:39187482
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研究论文 | 介绍了一种名为EasIFA的酶活性位点注释算法,该算法结合了蛋白质语言模型和3D结构编码器的潜在酶表示,并通过多模态交叉注意力框架将蛋白质级信息与酶反应知识对齐 | EasIFA算法在速度和准确性上均优于现有算法,实现了10倍的加速和显著的性能提升 | NA | 开发一种高效且准确的酶活性位点注释算法,以推动药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展 | 酶活性位点的自动注释 | 机器学习 | NA | 多模态深度学习 | 多模态交叉注意力框架 | 蛋白质结构数据 | NA |
1379 | 2024-08-30 |
Synthetic spatial patterning in bacteria: advances based on novel diffusible signals
2022-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13979
PMID:34843638
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综述 | 本文综述了细菌中合成空间模式化的进展,特别是基于新型可扩散信号的研究 | 介绍了新的潜在候选小分子信号,这些信号可以调节大肠杆菌中的基因表达,有助于合成生物学家设计更复杂、稳健和可调的空间结构 | NA | 探讨工程化多细胞模式化在理解模式形成基本规律中的作用,并可能对发育生物学领域做出贡献 | 细菌中的合成空间模式化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1380 | 2024-08-30 |
Phylogeny-Informed Synthetic Biology Reveals Unprecedented Structural Novelty in Type V Glycopeptide Antibiotics
2022-May-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c01389
PMID:35647273
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研究论文 | 本文通过结合系统发育引导的基因组挖掘策略和异源生产技术,利用GPAHex合成生物学平台,发现了五种新型V型糖肽抗生素,并对其结构和生物活性进行了表征 | 本文发现了具有前所未有结构新颖性的V型糖肽抗生素,包括rimomycin和misaugamycin,后者具有独特的N-C交叉连接和N-端酰化 | NA | 旨在发现能够克服糖肽抗生素抗性的新型糖肽抗生素 | 五种新型V型糖肽抗生素:rimomycin-A/B/C和misaugamycin-A/B | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘策略,异源生产技术 | GPAHex合成生物学平台 | 糖肽抗生素结构 | 五种新型V型糖肽抗生素 |