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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1501 | 2024-08-05 |
Beyond natural biology: rewiring cellular networks to study innate immunity
2023-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2023.102349
PMID:37269786
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综述 | 本文描述了合成生物学在研究固有免疫网络中的应用 | 提出了通过合成生物学方法重新连接细胞网络,创新性地研究模式识别受体信号传导及其与病毒的相互作用 | 文中未提及具体的实验数据或样本分析 | 研究合成生物学如何促进对固有免疫信号的理解 | 模式识别受体信号传导、病毒-宿主相互作用和系统性细胞因子反应 | 合成生物学 | NA | 化学输入或光遗传学输入 | NA | NA | NA |
1502 | 2024-08-05 |
Exploring the synthetic biology potential of bacteriophages for engineering non-model bacteria
2020-10-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19124-x
PMID:33082347
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研究论文 | 探讨了细菌病毒在工程非模式细菌中的合成生物学潜力。 | 提出了利用尚未开发的细菌病毒作为代谢调节剂和正交功能元件来扩展合成生物学工具箱的概念。 | 缺少特定物种的生物部件的可用性限制了可靠遗传电路的构建。 | 优化关键基因组编辑和重组工具,以释放非模式细菌的合成生物学潜力。 | 非模式细菌,如假单胞菌和乳酸菌等。 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑和重组 | NA | NA | NA |
1503 | 2024-08-05 |
Synthetic Biology-derived triterpenes as efficacious immunomodulating adjuvants
2020-10-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73868-6
PMID:33051497
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研究论文 | 本研究展示了一种合成生物学平台用于生成三萜油,并证明其在疫苗佐剂中的有效性 | 创新点在于使用合成生物学方法(酵母)生产三萜油,作为安全有效的疫苗佐剂替代传统的鲨鱼肝油 | 研究主要基于小鼠模型,缺乏在人类临床试验中的验证 | 探索替代传统三萜油来源的合成生物学生产平台的效果和安全性 | 本研究的对象包括合成生物学生产的三萜油和疫苗佐剂的免疫调节作用 | 合成生物学 | 流感 | 合成生物学 | 小鼠模型 | 免疫学数据 | NA |
1504 | 2024-08-05 |
Advancing Antimicrobial Resistance Research Through Quantitative Modeling and Synthetic Biology
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.583415
PMID:33072732
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研究论文 | 本文探讨了量化建模和合成生物学在抗微生物耐药性研究中的应用 | 提出了通过数学模型和合成基因网络来理解和预测抗药性进化的新方法 | 尚未进行广泛的临床验证,主要集中在理论模型和实验室研究 | 旨在揭示抗微生物耐药性的机制并寻找有效的治疗方法 | 重点研究基因网络与药物抵抗性之间的关系 | 合成生物学 | 抗微生物耐药性 | 数学建模、合成基因网络 | NA | 实验数据 | NA |
1505 | 2024-08-05 |
Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_531
PMID:39083471
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研究论文 | 本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展 | 强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展 | NA | 探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用 | 自然产物及其生物活性二次代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学化合物 | NA |
1506 | 2024-08-05 |
Removal of the large inverted repeat from the plastid genome reveals gene dosage effects and leads to increased genome copy number
2024-06, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01709-9
PMID:38802561
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研究论文 | 本研究揭示了去除叶绿体基因组中的大型倒置重复对基因剂量效应的影响及其导致基因组拷贝数增加的机制 | 本研究首次系统性地证明了叶绿体中的倒置重复区可以增强翻译能力,并探讨了基因组大小与拷贝数之间的关系 | 本研究主要基于烟草的叶绿体基因组,可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨叶绿体基因组中倒置重复区的功能重要性及其对基因剂量效应的影响 | 烟草的叶绿体基因组及其功能特性 | 数字病理 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 生成了具有显著减少叶绿体基因组大小的植物 |
1507 | 2024-08-07 |
Cutting Out COVID: Tackling COVID (and more) with synthetic biology
2023-Mar-01, Scientific American
IF:3.1Q1
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1508 | 2024-08-05 |
Expanding application of CRISPR-Cas9 system in microorganisms
2020-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2020.08.001
PMID:32913902
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综述 | 本文讨论了CRISPR-Cas9系统在微生物中的应用及其优化方法 | 对CRISPR-Cas9工具在新型微生物中的扩展应用进行了深入探讨 | 对非传统遗传操作工具的应用挑战仍然存在 | 研究CRISPR-Cas9在微生物中的应用及优化方式 | 针对各种微生物进行基因组编辑和基因表达控制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
1509 | 2024-08-05 |
Engineering regulatory networks for complex phenotypes in E. coli
2020-08-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17721-4
PMID:32792485
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研究论文 | 本文设计、构建并映射了一个包含110,120个特定突变的广泛调控网络库 | 提出了一种方便有效的调控网络库构建方法,能够支持针对不同表型的筛选 | 对不同表型的研究可能存在局限性,具体适用性尚需进一步验证 | 研究调控网络在代谢重编程中的应用及其对不同表型的影响 | E. coli中82个调控因子的特定突变 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 突变数据 | 82个调控因子的110,120个特定突变 |
1510 | 2024-08-05 |
Inducible asymmetric cell division and cell differentiation in a bacterium
2019-09, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-019-0340-4
PMID:31406376
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研究论文 | 本文展示了一种工程化的基因电路,可诱导大肠杆菌的不对称细胞分裂和细胞分化 | 创新之处在于利用简单的基因电路实现了细胞类型的编程分化 | 该研究未探讨基因电路在复杂环境中的应用效果 | 研究目的在于实现大肠杆菌的可编程细胞分化 | 研究对象为大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
1511 | 2024-08-05 |
Highly multiplexed, fast and accurate nanopore sequencing for verification of synthetic DNA constructs and sequence libraries
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz025
PMID:32995546
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研究论文 | 本文提出了一种利用纳米孔技术进行快速准确的DNA组装序列验证的工作流程。 | 介绍了一种新型的样本条形码系统和定制的数据分析算法,能够通过统计分析克服高错误率的问题,实现单碱基分辨率的准确序列分析。 | 研究中仍然依赖于定制的数据分析,可能对没有相关技术的实验室造成使用障碍。 | 旨在提供一种高效、低成本的DNA测序方法,以快速验证合成DNA构建。 | 处理576个DNA构建的序列验证。 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | 576个构建 |
1512 | 2024-08-05 |
High-quality combinatorial protein libraries using the binary patterning approach
2014, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-1486-9_6
PMID:25213413
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研究论文 | 本文介绍了一种通过二元图案化方法构建高质量组合蛋白质库的技术 | 提出了一种结合理性设计与组合多样性的蛋白质库设计方法 | 未提及具体的实验验证与应用实例 | 探索用于新分子的蛋白质组合库的构建方法 | de novo及天然蛋白质的二元图案化库 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
1513 | 2024-08-05 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-Jul-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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研究论文 | 本研究介绍了一种工程化的自组装蛋白质笼,能够独立招募两种不同的蛋白质。 | 该研究通过SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学反应,成功实现了对单一蛋白质笼的多种蛋白质的定向功能化。 | 研究集中于特定类型的蛋白质,可能无法广泛应用于所有POI的功能化。 | 旨在开发一种灵活的蛋白质笼平台,以实现双重功能化。 | 采用荧光蛋白作为模型,探索对两种不同POI的次序控制。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 荧光蛋白 | NA |
1514 | 2024-08-05 |
An Enzymatic Prodrug-like Route to Thio and Selenoamides
2024-07-29, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202404243
PMID:38747847
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研究论文 | 本文揭示了一种酶促的前药样途径,用于硫和硒酰胺的合成 | 首次系统阐明了6-硫鸟嘌呤的生物合成机制和相关酶的功能,并发现了前药样的硫结合物中间体 | 未充分探索硫转移机制中的所有潜在中间体 | 研究细菌中稀有硫酰胺的形成机制 | 关注Erwinia amylovorans产生的6-硫鸟嘌呤及其生物合成途径 | 合成生物学 | 肿瘤 | 酶促反应重组 | NA | 化学物质 | 使用多种底物进行反应,样本数量未详细说明 |
1515 | 2024-08-05 |
Direct α-Hydroxy Acid Loading onto a Bacterial Thiotemplate Assembly Line via a Multienzyme Gateway
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405165
PMID:38728443
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研究论文 | 本研究揭示了将α-羟基酸直接加载到细菌非核糖体肽合成酶模块的过程 | 首次报告了细菌中将α-羟基酸直接加载到非核糖体肽合成酶模块的专门通道,拓展了合成生物学工具箱 | 部分研究步骤依赖于突变分析和酶活性测定,可能限制了结果的普遍性 | 研究α-羟基酸在细菌非核糖体肽合成中作为构建块的加载机制 | 焦链酸的加载过程及相关酶的功能 | 合成生物学 | NA | 生物信息学,代谢组学,生化分析 | NA | 生物化学数据 | NA |
1516 | 2024-08-05 |
Leveraging DNA-Encoded Cell-Mimics for Environment-Adaptive Transmembrane Channel Release-Induced Cell Death
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406186
PMID:38738850
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的DNA编码的人工T细胞模型,能够模拟T细胞的行为并诱导细胞死亡 | 提出了一种基于DNA的人工T细胞模仿物,能够在肿瘤微环境下响应酸性条件,并选择性释放嵌入脂质和胆固醇的DNA链 | NA | 研究环境适应性细胞死亡的机制 | DNA编码的人工T细胞模仿物(ARTC) | 生物医学工程 | 肿瘤 | DNA编码 | NA | NA | NA |
1517 | 2024-08-05 |
Structural Insights Into the Terpene Cyclization Domains of Two Fungal Sesterterpene Synthases and Enzymatic Engineering for Sesterterpene Diversification
2024-06-03, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405140
PMID:38584136
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研究论文 | 本文报道了两种真菌sesterterpene合酶的萜烯环化结构与酶工程研究 | 首次揭示了sesterterpene合酶的晶体结构及其催化机制,从而推动了sesterterpene的结构多样性扩展 | 对sesterterpene合酶的研究仍不够全面,进一步的结构-功能研究仍然必要 | 探讨sesterterpene合酶的结构与催化机制以推进结构多样性的工程 | 两种真菌的sesterterpene合酶NfSS和PbSS | 数字病理学 | NA | 晶体学,理论与实验相结合的研究方法 | NA | 结构数据,催化机制信息 | 两个酶合酶的结构样本 |
1518 | 2024-08-05 |
Gene synthesis design: a pythonic approach
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17750
PMID:39076781
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研究论文 | 本文提出了一种Python程序用于设计基因合成的DNA片段 | 提供了一种新的算法,通过Python程序设计DNA片段,且源代码可供所有用户免费使用 | 尚未提及具体的限制条件 | 旨在开发一种实用的基因合成片段设计工具 | DNA片段的合成和设计 | 合成生物学 | NA | PCR组装 | NA | NA | 通过实验验证算法的可行性 |
1519 | 2024-08-05 |
Soil microbiome engineering for sustainability in a changing environment
2023-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01932-3
PMID:37903921
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评论 | 本文讨论了微生物生态学和合成生物学在土壤微生物组工程中的应用,旨在提高土壤生态系统的可持续性 | 强调了在微生物组工程中的科学和技术进展,包括微生物的特征分析和基因工程方法的开发 | NA | 探讨针对土壤生态系统的微生物解决方案的需求及其开发和应用 | 自然和合成土壤微生物群落,植物生长促进 | 数字病理学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
1520 | 2024-08-05 |
Advances in stress-tolerance elements for microbial cell factories
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.06.008
PMID:39072145
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review | 本文回顾了微生物细胞工厂中的抗压元素进展 | 探讨了多种抗压元素的挖掘和重新设计策略,优化细胞工厂在极端条件下的表现 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 旨在优化微生物细胞工厂在不同极端条件下的性能 | 针对微生物特别是极端微生物的抗压元素 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |