合成生物学相关文章
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当前共找到 3856 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-21 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
|
研究论文 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台，实现高效双DNA负载单拷贝整合到人诱导多能干细胞 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA负载，效率达100%，且一周内完成 | NA | 开发高效基因工程平台用于干细胞精准工程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs) | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 基因表达数据 | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统，四环素诱导系统，基因回路设计 | 医学 |
| 162 | 2025-10-21 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 深入探讨了Cupriavidus necator从克纳尔加斯细菌发展为有前景的生物制造宿主的演化历程 | 系统总结了C. necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略领域取得的显著技术进步 | NA | 推动从化石燃料经济向可持续生物经济的转型，促进可持续生物加工和生物产品开发的未来发展 | Cupriavidus necator微生物及其在生物制造中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 163 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系，并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养，并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低，即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |
| 164 | 2025-10-18 |
HinZip: Combining Hin Recombinase and FosW to Mimic HD-Zip Plant Proteins
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00386
PMID:40977316
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研究论文 | 本研究设计了一种名为HinZip的新型DNA结合蛋白，通过融合Hin重组酶DNA结合域和FosW亮氨酸拉链来模拟植物HD-Zip转录因子功能 | 首次成功将不相关的蛋白质模块（Hin重组酶DNA结合域和FosW亮氨酸拉链）整合设计出功能性的'融合蛋白'，能够高亲和力特异性结合24+碱基对的DNA序列 | 缺乏结构指导的蛋白质设计方法，可能限制设计的精确性和效率 | 开发定制化DNA结合蛋白用于合成生物学和疾病治疗应用 | HinZip融合蛋白及其DNA结合特性 | 合成生物学 | NA | 电泳迁移率变动分析、圆二色谱、动态光散射、细菌单杂交实验 | NA | 蛋白质-DNA相互作用数据、光谱数据 | NA | 蛋白质工程 | 细菌（用于单杂交实验） | DNA结合蛋白设计，模拟HD-Zip转录因子的DNA识别和二聚化功能 | 医学, 合成生物学 |
| 165 | 2025-10-18 |
Structure-Guided Design of Artificial Transcription Factor for a Progesterone Biosensor
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00488
PMID:40977514
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研究论文 | 通过结构引导设计人工转录因子开发孕酮生物传感器 | 将真核生物转录因子逆向转移到原核生物，并通过MD模拟和连接子优化设计人工转录因子ProB | NA | 开发高灵敏度的孕酮生物传感器 | 人工转录因子ProB及其在合成启动子QT上的作用 | 合成生物学 | NA | MD模拟、细菌富集策略 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 由QF、配体结合域、连接子和QF组装的人工转录因子ProB，作用于由QUAS、10-bp间隔区、T7和RBS组成的合成启动子QT | 医学 |
| 166 | 2025-10-18 |
Neural CRNs: A Natural Implementation of Learning in Chemical Reaction Networks
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00099
PMID:40981009
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研究论文 | 提出了一种基于化学动力学连续时间演化的神经网络计算方法，可实现合成生化系统中的自主学习 | 将神经网络计算建模为分子浓度的连续时间演化，与化学动力学计算自然契合，实现了仅需两个顺序阶段的端到端监督学习流程 | NA | 开发能够在合成生化系统中实现自主学习行为的分子电路 | 化学反应网络和分子电路 | 合成生物学 | NA | 化学动力学模拟 | 连续时间神经网络 | 分子浓度数据 | NA | NA | NA | 使用单分子和双分子反应实现线性和非线性建模电路 | 生物工程, 合成生物学 |
| 167 | 2025-10-18 |
Trusted Codon Fingerprint: A Streamlined Platform for Deep and Reversible Bacterial Cell Labeling
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00263
PMID:40983931
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研究论文 | 开发了一种名为可信密码子指纹(TCF)的平台，通过同义密码子替换在质粒抗生素抗性基因中集成识别信息，实现细菌细胞的深度可逆标记 | 利用同义密码子替换在抗生素抗性基因中建立独特密码子指纹，结合抗生素选择和纠错码实现无需验证步骤的高效细胞标记 | NA | 开发高效精确的合成生物学细胞标记和识别平台 | 工程化细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 长读长测序，同义密码子替换 | NA | 基因组测序数据 | 数千个克隆 | 温度敏感质粒，基因组修饰 | 细菌 | 密码子指纹标记系统，可逆细胞标签 | 工业生物技术 |
| 168 | 2025-10-18 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
|
综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何推动具有环境响应功能的可编程纳米材料发展 | 将生物相容性从静态属性重新定义为动态可编程特性，实现纳米材料像复杂生物实体一样自主响应生物信号 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在重大挑战 | 开发具有动态生物界面和自适应功能的下一代绿色纳米材料 | 可编程纳米材料及其生物界面 | 纳米医学 | NA | 无细胞合成生物学、DNA纳米技术、代谢工程、4D生物打印 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 工程微生物系统 | 遗传电路驱动响应、刺激响应结构、分子计算、逻辑运算 | 医学 |
| 169 | 2025-10-18 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
|
综述 | 回顾SBOL Visual标准在过去十年中的发展历程及其在合成生物学领域的应用 | 首次系统总结SBOL Visual标准从21个简单符号发展为完整图解语言的演进过程 | 尚未实现完全合规性和最佳实践的普遍采用 | 分析SBOL Visual标准的采用趋势和发展历程 | SBOL Visual标准及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图解数据 | NA | SBOL Visual | NA | 遗传设计图解表示标准 | 工业生物技术 |
| 170 | 2025-10-18 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-Oct-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
|
研究论文 | 本研究结合全细胞模型和机器学习加速大肠杆菌简化基因组的设计 | 使用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%，并成功设计出移除40%基因的简化大肠杆菌基因组 | 全细胞模型运行时间较长是主要限制因素 | 开发加速基因组设计的计算方法 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 全细胞建模、机器学习 | 机器学习代理模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 简化基因组设计 | 工业生物技术 |
| 171 | 2025-10-18 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Oct, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
|
研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶进行了克隆、生化和结构表征 | 首次报道了二聚体氯酸歧化酶在原子分辨率(0.99Å)下的晶体结构，并对其催化机制提供了新见解 | NA | 表征铜绿假单胞菌氯酸歧化酶的生化特性和结构特征 | 铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、稳态动力学 | NA | 结构数据、动力学数据 | NA | 克隆 | 铜绿假单胞菌 | NA | 环境、生物医学、合成生物学 |
| 172 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
|
研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库，可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白（一种推测的PAS-HTH转录因子） | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 173 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
|
研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统，避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子（IL-2、IL-6、IL-10）和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症，肌肉再生疾病 | 蛋白质工程，蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路，包含激活和失活机制 | 医学 |
| 174 | 2025-10-14 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
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研究论文 | 本研究开发了一种可编程控制细菌细胞器空间定位的双蛋白系统 | 首次实现了对多种细菌细胞器类型的可编程空间控制，建立了合成生物学中反应位置可控的新设计原则 | NA | 探索细菌细胞器的空间组织机制并开发工程化控制方法 | 细菌细胞器（包括羧酶体、包裹蛋白、生物分子凝聚体和膜结合细胞器） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、细胞器异源表达 | NA | NA | NA | McdAB双蛋白系统 | 大肠杆菌 | 细胞器空间定位控制系统 | 工业生物技术 |
| 175 | 2025-10-14 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本研究通过开发foldtuned蛋白质语言模型库，大规模探索了蛋白质序列-结构映射中未开发的区域 | 提出foldtuning方法，将蛋白质语言模型重新设计为能够探索与天然蛋白质无同源性的序列空间的探针，同时保持核心结构约束 | NA | 探索远离天然序列的蛋白质序列-结构映射景观，揭示未被地球进化触及但符合生物物理规律的蛋白质折叠空间 | 700多种天然折叠结构，包括GPCRs、小GTPases、细胞表面受体、DNA结合域和信号调节域 | 计算生物学 | NA | 蛋白质语言模型(PLMs)、foldtuning方法 | 语言模型 | 蛋白质序列和结构数据 | SCOP数据库中700多种天然折叠 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 176 | 2025-10-13 |
Multigene engineering in plants: Technologies, applications, and future prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108697
PMID:40882716
|
综述 | 本文综述了植物多基因工程的技术、应用及未来前景，重点介绍了合成生物学驱动的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了多基因工程在合成生物学DBTL框架下的完整技术流程，并提出了优化路径和未来发展方向 | 在多基因构建稳定性、协调性基因表达和调控可预测性方面仍存在挑战 | 促进多基因工程在可持续农业中的部署应用 | 植物多基因工程技术体系 | 合成生物学 | NA | 多基因工程 | 计算建模 | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 代谢通路、调控通路 | 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 177 | 2025-10-13 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
|
综述 | 总结类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 系统阐述代谢工程和合成生物学在异源生物合成中的应用，重点关注类胡萝卜素裂解酶的研究进展 | NA | 探讨类胡萝卜素及其裂解产物的可持续微生物生产策略 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径的代谢通路设计 | 制药，医疗保健，化妆品，食品 |
| 178 | 2025-10-13 |
Intersecting precision fermentation for global cell-based food production innovation: Challenges and opportunities
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108712
PMID:40930311
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综述 | 探讨精准发酵与全球细胞基食品生产交叉领域的挑战与机遇 | 提出融合合成生物学与精准营养的愿景框架，分析计算机辅助工程和人工智能在发酵过程中的应用潜力 | 存在技术扩展瓶颈、监管碎片化、区域可及性和消费者接受度等实施障碍 | 推动发酵食品生产向高效可持续制造转型 | 微生物细胞工厂生产的食品成分 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、代谢工程、计算机辅助工程(CAE)、人工智能(AI)、自动化 | NA | 案例研究、建模分析 | NA | 合成生物学工具、代谢工程工具 | 微生物细胞工厂 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 179 | 2025-10-13 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
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综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料废物生物降解与转化平台的最新进展 | 将PET水解酶在工程化大肠杆菌中进行异源表达和蛋白质工程改造，并整合合成生物学策略构建多酶级联系统和表面展示系统 | NA | 开发能够实现PET塑料高效生物降解和转化的工程微生物平台 | 基因工程改造的大肠杆菌及其在PET生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 多酶级联系统、表面展示系统、代谢通路 | 环境 |
| 180 | 2025-10-13 |
Turing patterns in a morphogenetic model with single regulatory function
2025-Nov, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2025.109536
PMID:40972714
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研究论文 | 本研究通过数学建模分析合成Nodal-Lefty系统中图灵模式的形成机制 | 首次在单调控函数控制的双形态素系统中证明亚临界图灵不稳定性对耗散结构形成的关键作用 | 理论分析基于简化模型，未考虑生物系统中复杂的多尺度相互作用 | 验证图灵形态发生理论在合成生物学系统中的应用 | 合成哺乳动物模式形成系统中的Nodal-Lefty反应扩散系统 | 合成生物学 | NA | 线性稳定性分析、弱非线性分析、多时间尺度方法 | 反应扩散模型 | 数学模型 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 基于短程激活因子Nodal和长程抑制因子Lefty的图灵模式生成系统 | 医学 |