合成生物学相关文章

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当前共找到 5105 篇文献,本页显示第 1861 - 1880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1861 2025-10-05
Multiview Deep Learning Framework for Precise Prediction of Transcription Factor Binding Sites
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 提出一种多视图深度学习框架MDNet-TFP,用于精确预测转录因子结合位点 开发了双向反向互补模块(BiRC-Mamba)和多尺度卷积循环注意力网络(MCRAN),能够有效建模DNA序列的双向特性和多维度特征 NA 提高转录因子结合位点预测的准确性 DNA序列中的转录因子结合位点 生物信息学 NA ChIP-seq 多视图深度学习, 双向反向互补模块, 多尺度卷积循环注意力网络 DNA序列数据 165个ChIP-seq数据集(验证集)和690个ChIP-seq数据集(扩展测试集) NA NA NA 生物医学研究, 合成生物学
1862 2025-10-05
Evo-Inspired Engineering of Radical Phenotypes and Emergent Traits
2025-Sep-13, Integrative and comparative biology IF:2.2Q1
综述 探讨如何整合进化生物学见解与合成生物学技术来设计超越自然限制的全新细胞功能 提出将进化启示与高通量平台、人工智能工具结合,突破现有性状改造局限,开创合成生物学新前沿 NA 推动合成生物学从改造现有性状向设计全新细胞功能发展 极端适应表型、人工细胞、基因型-表型关系 合成生物学 NA 高通量平台、人工智能驱动设计工具 NA NA NA NA 非传统模式系统 激进表型、涌现性状 生物经济
1863 2025-10-05
Identification and application of bioparts for plant synthetic biology
2025-Oct, Molecules and cells IF:3.7Q2
综述 本文综述植物合成生物学中生物元件的鉴定与应用,重点关注启动子和终止子在基因表达调控中的作用 系统阐述双向启动子在基因叠加中的应用价值,以及启动子与终止子组合平衡对转基因表达稳定性的重要性 NA 探讨植物合成生物学中生物元件的鉴定方法和应用策略 植物合成生物学中的生物元件(启动子、终止子等) 合成生物学 NA ATAC-seq, STARR-seq, 深度学习 深度学习模型 基因组序列数据 NA NA 植物 基因回路设计,基因表达调控系统 医药,疫苗,生物燃料,生物材料
1864 2025-10-05
DNA Flipping as Facile Mechanism for Transmembrane Signaling in Synthetic Cells
2025-Sep-17, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文报道了一种基于胆固醇修饰单链DNA的跨膜信号传导机制,可在合成细胞中实现高效的内部信号处理和下游转录激活 首次发现胆固醇修饰单链DNA能通过成核驱动的缺陷介导过程自发翻转跨越脂质膜,并揭示了该过程由瞬时膜孔主导的机制 NA 开发合成细胞中简单可靠的跨膜信号传导机制 胆固醇修饰单链DNA和巨型单层脂质体 合成生物学 NA 荧光显微镜、核酸酶降解实验、膜通透性实验 NA NA NA NA 合成细胞/巨型单层脂质体 DNA翻转介导的信号传导系统,包含跨膜信号输入和内部转录激活的输出通路 合成生物学
1865 2025-10-05
Mechanisms, detection, and impact of horizontal gene transfer in plant functional evolution
2025-Sep-09, The Plant cell
综述 探讨水平基因转移在植物功能进化中的机制、检测方法及其影响 系统揭示植物界微生物-植物和植物-植物间水平基因转移的普遍性,并提出结合合成生物学与实验进化的未来研究方向 依赖现有植物基因组数据,尚未完全揭示水平基因转移的全貌 阐明水平基因转移在植物进化中的机制与适应性意义 植物界的水平基因转移事件 进化生物学 NA 系统发育基因组学方法、原位测序 NA 基因组序列数据 数百个近期测序的植物基因组 合成生物学 植物 NA NA
1866 2025-10-05
The Rise of Mechanobiology for Advanced Cell Engineering and Manufacturing
2025-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
综述 探讨力学生物学在细胞工程和制造中的最新进展及其应用潜力 强调机械信号作为关键工具增强或替代传统可溶性因子的创新理念 当前制造路线在生产效率、安全性、监管、成本效益和可扩展性方面存在局限 推动细胞工程和制造技术的发展以满足细胞治疗和再生医学需求 诱导多能干细胞、嵌合抗原受体T细胞等治疗性细胞 合成生物学 NA 微纳米技术、生物材料设计、机械限制 NA NA NA NA 哺乳动物细胞 NA 医学
1867 2025-10-05
Flux-Balance Analysis and Mobile CRISPRi-Guided Deletion of a Conditionally Essential Gene in Shewanella oneidensis MR-1
2022-10-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本研究结合通量平衡分析和移动CRISPRi技术,成功删除了Shewanella oneidensis MR-1中的一个条件必需基因 开发了计算分析与实验验证相结合的基因工程流程,首次实现了对条件必需基因的系统性评估和删除 研究仅针对单一菌株和特定基因,方法在其他生物系统中的普适性有待验证 开发改进合成生物学工具以工程化模式生物实现二氧化碳固定 Shewanella oneidensis MR-1细菌及其代谢基因 合成生物学 NA 通量平衡分析(FBA), 移动CRISPRi基因敲除系统 代谢网络模型 代谢通量数据, 基因敲除实验数据 NA CRISPRi Shewanella oneidensis MR-1 NA 能源, 环境
1868 2025-10-05
Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol
2025-Aug-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发模块化多酶级联平台,利用甘油可持续合成非经典氨基酸 通过定向进化OPSS酶将C-N键形成催化效率提升5.6倍,建立可扩展至2升反应系统的模块化平台 NA 开发绿色可持续的非经典氨基酸合成方法 非经典氨基酸(含C-S、C-Se和C-N侧链) 合成生物学 NA 定向进化、多酶级联催化 NA NA 22种非经典氨基酸,克至十克级规模 NA NA 模块化多酶级联系统 医药, 合成生物学, 生物材料
1869 2025-10-05
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews IF:10.1Q1
综述 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究,并探索合成微生物群落的计算机设计 NA 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 合成生物学 NA 基因组尺度代谢建模 代谢网络模型 基因组、宏基因组、表型数据 NA NA 植物、微生物 NA 农业
1870 2025-10-05
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
综述 提出通过微生物组工程构建合成微生物群落以增强农业气候韧性的综合框架 提出可编程全息生物体概念,整合微生物生态学、合成生物学和计算建模构建具有动态反馈和生态记忆的植物-微生物共生系统 NA 开发气候韧性农业的工程化微生物组解决方案 植物全息生物体(植物宿主及其微生物组) 合成生物学 NA CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 机器学习 NA NA CRISPR-Cas9 植物、微生物 生物传感器电路、群体感应模块、可编程微生物功能 农业
1871 2025-10-05
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了先天淋巴样细胞(ILCs)在免疫调节和疾病中的作用,并探讨了其作为生物标志物和免疫治疗新策略的潜力 系统阐述了ILCs作为新型免疫治疗蓝图的转化潜力,包括CAR-ILC工程、细胞扩增技术和多组学方法的应用 ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床应用的障碍 探讨ILCs在自身免疫疾病和癌症中作为预测、诊断和治疗靶点的作用 先天淋巴样细胞(ILCs)及其亚群(ILC1s、ILC2s、ILC3s、LTi细胞) 免疫学 自身免疫疾病,癌症 多组学技术、单细胞图谱、合成生物学方法 NA NA NA CAR工程 脐带血、多能干细胞 嵌合抗原受体(CAR)工程 医学
1872 2025-10-05
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell IF:45.5Q1
综述 本文回顾疫苗学发展历程并展望未来技术变革,重点介绍mRNA疫苗等突破性技术对疫苗领域的革新作用 系统梳理疫苗学关键技术演进,强调反向疫苗学、合成生物学和mRNA平台等革命性技术如何将失败转化为成功疫苗 未涉及具体实验数据或临床研究,主要基于历史视角和技术展望 探讨疫苗学技术发展历程及未来变革方向 疫苗技术发展历程及免疫机制研究 疫苗学 传染病(脑膜炎B型、呼吸道合胞病毒等) 反向疫苗学、合成生物学、结构设计、mRNA技术 NA NA NA NA NA NA 医学
1873 2025-10-05
Integrating kinetic models, gene circuits, and biofilm dynamics for enhanced exopolysaccharide production in nitrifying bacterial consortia
2025-Oct, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4
研究论文 本研究通过动力学模型和合成生物学方法优化硝化细菌群落胞外多糖生产和氮去除性能 整合动力学模型与基因电路设计来优化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除效率 NA 优化硝化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除性能 从生活废水中富集的细菌群落 合成生物学 NA 动力学模型, 基因电路设计, 扫描电子显微镜, PCR Monod模型, Verhulst模型 生物量浓度, 多糖产量, 氮浓度数据, 显微镜图像 生活废水中富集的细菌群落 基因电路设计 硝化细菌群落 BUFFER门逻辑基因电路用于控制琥珀聚糖生产 环境, 废水处理
1874 2025-10-05
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
综述 系统阐述工程化微生物在癌症治疗中的设计策略、功能优化及生物医学应用 整合合成生物学与纳米技术实现微生物的精准药物递送和时空调控功能 临床转化面临挑战,需要跨学科整合 开发基于工程微生物的下一代癌症治疗方法 工程化微生物及其在肿瘤治疗中的应用 合成生物学 癌症 基因编辑、表面修饰 NA NA NA CRISPR-Cas9 微生物 药物释放系统、免疫调节回路 医学
1875 2025-10-05
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials IF:4.6Q2
综述 探讨益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 系统整合了益生菌作为生物杂交药物载体的多种工程化策略(包括细菌幽灵、外膜囊泡等),并重点探讨了与纳米颗粒系统的整合方法 NA 分析益生菌在靶向药物递送领域的最新进展和未来发展方向 益生菌及其工程化衍生物(细菌幽灵、外膜囊泡、孢子等) 合成生物学 癌症, 胃肠道疾病 基因工程, 纳米技术, 合成生物学 NA NA NA 质粒表达, 基因组整合 益生菌 靶向治疗系统, 免疫调节系统, 刺激响应机制 医药
1876 2025-10-05
Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy
2025-Sep, Biotechnology journal IF:3.2Q2
综述 本文系统评述三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用 首次全面评估三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制,并探讨合成生物学和精准医疗等创新策略 存在化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战,相关代谢物的生物活性知识仍存在空白 探讨三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用 三尖杉属植物及其生物活性代谢物(特别是高三尖杉酯碱) NA 白血病, 实体瘤 合成生物学, 先进药物递送系统 NA NA NA NA NA NA 医药
1877 2025-10-05
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 采用农杆菌介导的瞬时表达技术实现萜类生物合成的亚细胞区室化 NA 开发快速构建萜类化合物合成通路并实现区室化生产的方法 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物合成通路 合成生物学 NA 农杆菌介导的瞬时表达技术 NA NA NA 农杆菌介导的转化 本氏烟草 萜类化合物合成通路的区室化设计(质体、细胞质、脂滴表面) 工业生物技术
1878 2025-10-05
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 探讨工程化生物系统中空间计算实现的原理与应用 提出超越传统单细胞逻辑系统的空间分布式计算框架,模拟形态发生梯度等自然现象 NA 研究如何通过空间和适应性计算解决复杂计算挑战 工程化生物计算系统 合成生物学 NA 空间计算框架 NA NA NA NA NA 空间计算系统、形态发生梯度模拟、细胞区室化 医疗,环境,诊断
1879 2025-10-05
Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation
2025-Sep, Yi chuan = Hereditas
综述 系统探讨发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景 首次系统梳理发育调控因子在克服遗传转化技术瓶颈中的多重作用机制 NA 探讨发育调控因子如何提升作物遗传转化技术的效率和应用范围 主要农作物及其遗传转化技术体系 农业生物技术 NA 农杆菌介导转化、基因枪技术 NA NA NA NA 农作物 NA 农业
1880 2025-10-05
Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies
2022-04-14, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过模块化工程设计开发了合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs),用于编程治疗性细胞的基因调控 采用临床驱动设计流程构建受体,展示了系统模块化工程可生成具有可调传感和转录反应能力的受体平台 NA 开发用于治疗性细胞程序化基因调控的合成受体 合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)和人类原代T细胞 合成生物学 NA 调节性跨膜蛋白水解技术 NA NA NA 模块化工程 人类原代T细胞 合成跨膜蛋白水解受体,具有多抗原识别和剂量控制生物活性载荷产生能力 医学
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