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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
|
综述 | 本文全面探讨如何通过合成生物学、工程学和经济视角解决CAR-T细胞疗法在实体瘤疗效、安全性和可及性方面的挑战 | 整合合成生物学与工程学方法开发同种异体CAR-T细胞,提出新型抗原靶向策略及联合治疗方案 | NA | 突破CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限并提升其安全性与可及性 | CAR-T细胞疗法及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤与实体瘤 | CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 2 | 2025-10-05 |
Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0049
PMID:39301524
|
研究论文 | 本研究探讨了通过动态基因表达策略优化工程化细菌在癌症治疗中的疗效,防止突变逃逸 | 首次发现PFO表达会导致细菌裂解并引发突变逃逸,并提出动态诱导策略来维持治疗性细菌种群 | NA | 优化工程化细菌在肿瘤治疗中的持久定植和持续有效载荷释放 | 表达Perfringolysin O(PFO)细菌毒素的非致病性工程细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 分子动力学,数学模型,微流体系统,测序 | 种群动态数学模型 | 实验数据,测序数据,模拟数据 | NA | 合成生物学工具 | 工程细菌 | 动态基因表达系统,PFO毒素表达回路 | 医学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
|
研究论文 | 本文介绍利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 | 采用农杆菌介导的瞬时表达技术实现萜类生物合成的亚细胞区室化 | NA | 开发快速构建萜类化合物合成通路并实现区室化生产的方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物合成通路 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达技术 | NA | NA | NA | 农杆菌介导的转化 | 本氏烟草 | 萜类化合物合成通路的区室化设计(质体、细胞质、脂滴表面) | 工业生物技术 |
| 4 | 2025-10-05 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
|
研究论文 | 本文开发了用户友好的BarMap-QA流程,用于评估共转录折叠模拟的质量 | 改进了原有BarMap软件,开发了专门针对共转录折叠场景的用户友好流程,并通过迭代工作流程以最小计算资源获得可靠的动力学模拟 | 原始BarMap方法基于简化的二级结构表示,仅保留少量低能局部极小值和能量势垒,存在近似处理 | 改进共转录折叠模拟方法,验证合成核糖开关设计的功能性 | RNA共转录折叠过程,特别是合成转录调控核糖开关 | 计算生物学 | NA | BarMap方法,粗粒度表示,马尔可夫过程建模 | 马尔可夫过程模型 | RNA二级结构数据 | NA | NA | NA | 合成转录调控核糖开关 | 合成生物学 |
| 5 | 2025-10-05 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-01-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
|
综述 | 概述简单苯丙素类化合物的生物活性、不同物种的生物合成途径及微生物生产工程策略 | 系统比较植物/细菌/真菌的生物合成路径差异,总结近十年微生物生产的关键工程策略 | 基于文献综述未涉及原始实验数据 | 探讨简单苯丙素类化合物的可持续微生物生产方案 | 简单苯丙素类化合物(C6-C3骨架天然产物) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径工程 | 香料,营养品,生物材料,制药 |
| 6 | 2025-10-05 |
Genetic Transformation of Plasmid DNA into Escherichia coli Using High Frequency Electromagnetic Energy
2024-01-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c03464
PMID:38194429
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用高频电磁能介导细菌细胞遗传转化的新技术 | 开发了基于高频电磁能的独特遗传转化方法,具有高效、成本低且生理条件温和的优势 | NA | 开发新型细菌遗传转化技术 | 大肠杆菌JM109细胞和pGLO质粒DNA | 合成生物学 | NA | 高频电磁能转化、共聚焦扫描显微镜、流式细胞术、冷冻透射电子显微镜 | NA | 显微镜图像、流式细胞数据 | NA | 质粒转化 | 大肠杆菌 | GFP报告基因系统 | 医学, 合成生物学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Organization of an Artificial Multicellular System with a Tunable DNA Patch on a Membrane Surface
2024-01-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c04249
PMID:38112415
|
研究论文 | 开发了一种基于DNA贴片的策略,通过调控膜表面DNA杂交链式反应构建具有高阶结构的人工多细胞系统 | 利用膜表面DNA杂交链式反应开发DNA贴片策略,首次实现通过调控异质性粘附直接构建高阶结构人工多细胞系统 | NA | 开发构建具有可控排列的人工多细胞系统的简便策略 | 人工囊泡和活细胞组成的混合系统 | 合成生物学 | NA | DNA杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA杂交链式反应 | 人工囊泡, 活细胞 | 基于DNA贴片的异质性粘附系统,用于调控囊泡间连接和高阶结构组装 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 8 | 2025-10-05 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
|
研究论文 | 本研究通过合成内质网膜驻留多蛋白诱导内质网大规模扩张,系统表征了由此形成的膜结构及其特性 | 首次详细表征了由合成多蛋白诱导的内质网衍生膜区室,揭示了胞质面寡聚化结构域的关键作用及区室与内质网间的扩散屏障 | 研究主要局限于烟草和拟南芥两种模式植物,尚未在其他植物物种中验证 | 探索合成生物学方法改造植物内质网膜结构的可行性及其应用潜力 | 烟草和拟南芥植物细胞中的内质网衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术、定量图像分析 | NA | 荧光显微镜图像 | 转基因烟草和拟南芥植株 | 重组蛋白表达 | 烟草, 拟南芥 | 内质网膜驻留多蛋白系统,包含胞质面寡聚化结构域 | 农业, 工业生物技术 |
| 9 | 2025-10-05 |
Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00456
PMID:38070167
|
综述 | 本文系统回顾并分析了合成生物学引发的伦理问题,重点关注生命干预的道德考量与生物安全风险 | 突破传统有机体与机器的二元对立框架,首次系统梳理合成生物学伦理研究的关注点分布与缺失 | 缺乏对实验室日常研究中实际伦理问题的系统性调查 | 探讨合成生物学的伦理与社会影响 | 合成生物学伦理研究文献 | NA | NA | 系统综述、主题分析 | NA | 文本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-10-05 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
|
研究论文 | 提出合成生物学中的开放式设计方法,强调设计新颖性与功能目标同等重要 | 将开放式设计理念引入合成生物学,主张设计新颖性至少与功能实现同等重要,突破传统目标导向设计的局限 | NA | 探索合成生物学中开放式设计方法,推动生物设计的持续创新 | 合成生物学设计方法论 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
|
研究论文 | 本研究开发了能够体外选择性抑制IIS型限制性内切酶活性的重组DNA甲基化酶 | 成功表达并验证了非切换型和切换型甲基化酶对IIS型限制性内切酶活性的位点选择性抑制能力 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内应用验证 | 开发用于合成生物学和DNA组装技术的新型分子工具 | I型和II型限制修饰系统中的DNA甲基化酶 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、DNA甲基化分析、限制性内切酶消化 | NA | 酶活性分析数据 | 10种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 | His标签纯化、分子克隆 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-05 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
|
综述 | 本文探讨了合成最小细胞系统中信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的概念设计 | 通过囊泡系统人工重构了展示递归生长和分裂周期的合成最小细胞,避免了使用生物细胞中复杂的分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装体中产生,以及支撑这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的简化设计 | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本研究开发了一种基于PYR1受体、具有可重编程配体结合特异性的正交化化学诱导二聚化模块 | 设计了带有二聚界面盐桥的正交化PYR1*模块,创建了对特定配体具有纳摩尔级敏感性的新型CID系统 | NA | 扩展PYR1化学诱导二聚化系统,开发可重编程配体结合特异性的正交化模块 | PYR1受体、HAB1磷酸酶及其正交化变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化分析、体内分析 | NA | 晶体结构数据、生化数据、体内功能数据 | NA | CID系统设计 | 拟南芥, 酿酒酵母 | 化学诱导二聚化模块、多输入/输出遗传电路、生物传感器 | 环境监测, 合成生物学 |
| 14 | 2025-10-05 |
A zinc finger transcription factor enables social behaviors while controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex
2024-Jan-25, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02775-5
PMID:38272911
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研究论文 | 通过合成生物学方法改造转录因子ZFP189,揭示其在调控前额叶皮层社会行为中的关键作用 | 创建了功能相反的合成ZFP189转录因子,首次发现其对转座因子和免疫基因的调控与社会行为直接相关 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在其它物种验证 | 探究ZFP189转录因子在前额叶皮层中调控社会行为的神经生物学机制 | 小鼠前额叶皮层神经元 | 合成生物学 | NA | RNA测序、病毒载体递送 | NA | 基因表达数据、行为数据 | NA | 病毒载体 | 小鼠 | 转录调控回路 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究利用植物副逆转录病毒遗传资源开发了一种高效的三元合成启动子MFH17,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 首次将三种副逆转录病毒来源的启动子元件(MMV、FMV、HRLV)通过理性设计和DNA改组技术组合成新型三元杂交启动子MFH17 | NA | 开发适用于高水平基因表达的高效合成启动子,丰富植物组成型启动子库 | 植物副逆转录病毒启动子元件及其合成变体 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术、转基因技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因拟南芥和烟草植物 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 拟南芥, 烟草 | 组成型启动子设计,包含as-1元件的合成启动子 | 农业, 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
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研究论文 | 开发了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习循环 | 将静态机器人平台转变为动态平台,实现无需人工干预的自主测试-学习循环 | 仅使用绿色荧光蛋白作为目标产物进行评估,未涉及更复杂的生物系统 | 建立完全自动化的设计-构建-测试-学习循环来优化细菌系统的诱导条件 | 细菌系统中的诱导浓度优化和诱导剂与饲料释放的组合优化 | 合成生物学 | NA | 机器人平台自动化技术 | 探索与利用平衡的优化算法 | 测量数据 | NA | 机器人平台 | 细菌 | 诱导表达系统 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
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研究论文 | 通过调查分析公众对基因技术用于入侵害虫控制的态度、参与偏好和信息需求 | 首次将公众对基因技术的态度分为四个细分群体,并针对不同群体提出差异化的公众参与策略 | 样本仅来自澳大利亚,可能无法代表其他国家的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵害虫控制的认知和态度,探索公众参与路径和信息需求 | 1149名澳大利亚公众 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查问卷数据 | 1149名澳大利亚受访者 | NA | NA | NA | 环境 |
| 18 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
|
综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养保健品中的新兴应用 | 系统整合了基因工程、代谢途径操纵和合成生物学在提高真菌次级代谢产物产量方面的最新进展,并强调了组学技术在理解次级代谢产物生物合成调控中的重要性 | NA | 分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、环境和生物技术领域的应用潜力 | 真菌次级代谢产物及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操纵、合成生物学、组学技术、发酵技术、生物加工、共培养方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 医疗保健, 农业, 环境, 营养保健品, 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-06 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
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综述 | 本文总结了细菌载体在癌症治疗中的药物递送应用及其临床转化前景 | 系统阐述细菌载体通过趋化性靶向肿瘤组织并激活抗肿瘤免疫反应的新型药物递送策略 | NA | 探讨细菌载体递送系统在癌症治疗中的潜力与临床应用前景 | 细菌载体递送的抗癌药物及其递送系统 | NA | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 20 | 2025-10-06 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
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研究论文 | 开发了一种基于亲和钳蛋白检测短肽标签的连续荧光测定方法,用于非经典氨基酸的体外翻译检测 | 首次创建了与ncAAs兼容的连续荧光检测方法,克服了传统放射性终点测定和荧光蛋白方法的局限性 | NA | 开发适用于非经典氨基酸的高通量体外翻译检测方法 | 体外翻译系统、非经典氨基酸、tRNA密码子特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光测定、mRNA展示、质谱分析 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |