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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-15 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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research paper | 提出了一种开放式的合成生物学设计方法,强调设计的新颖性与实现目标同等重要 | 提出将新颖性作为生物设计的重要考量,而不仅仅是优化单一最佳设计,以突破工程生物学中性能提升的瓶颈 | 未具体说明开放式设计方法在实际应用中的具体操作步骤或验证案例 | 探索合成生物学中更具创造性的设计方法,以克服当前系统复杂性瓶颈和实验室到实际应用的转化难题 | 合成生物学设计方法 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2025-05-29 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本研究旨在生产能够体外抑制IIS型限制酶BsaI、BpiI或LguI活性的重组DNA甲基化酶 | 通过克隆和表达来自I型和II型R-M系统的甲基化酶,优化其表达条件,并验证其在体外选择性抑制IIS型限制酶活性的能力 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内应用或更复杂的生物系统 | 开发新型分子和合成生物学工具,特别是用于DNA组装技术 | DNA甲基化酶及其对IIS型限制酶活性的抑制作用 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质表达与纯化、DNA甲基化分析 | NA | NA | 十种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 |
3 | 2025-05-09 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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review | 本文回顾了合成最小细胞系统的概念,包括信息分子、代谢途径和囊泡繁殖,并与生物细胞进行了比较 | 提出了合成最小细胞系统,展示了递归生长和分裂周期,避免了使用生物细胞的复杂分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装中产生,以及支持这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
4 | 2025-04-26 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本文设计了一种基于PYR1的正交化CID模块,具有可重新编程的配体结合特异性 | 开发了正交化的PYR1*/HAB1*模块,具有纳摩尔级敏感度,可用于活体生物传感器和多输入/输出遗传电路 | 未明确提及具体限制 | 扩展PYR1系统,用于植物和真核合成生物学中的多通道CID系统 | 拟南芥和酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化和体内分析 | NA | NA | NA |
5 | 2025-02-23 |
A zinc finger transcription factor enables social behaviors while controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex
2024-Jan-25, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02775-5
PMID:38272911
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法重新编程ZFP189转录因子的功能,揭示了其在啮齿动物前额叶皮层中对社交行为的保护作用及其对转座子和免疫反应基因表达的调控 | 创新性地设计了合成ZFP189转录因子,并展示了其对前额叶皮层神经元成熟树突棘形态的促进作用,以及其对社交行为、转座子和免疫相关基因表达的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类或其他高等动物中进行验证 | 探究ZFP189转录因子在前额叶皮层中对社交行为的调控机制及其对转座子和免疫反应的影响 | 小鼠前额叶皮层神经元 | 神经生物学 | NA | 合成生物学方法、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠前额叶皮层组织 |
6 | 2025-02-08 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究旨在通过开发高效的合成启动子来增加植物基因工程中使用的组成型启动子库,特别是针对高水平基因表达的启动子 | 开发了一种新的三杂交启动子MuasFuasH17(MFH17),该启动子在双子叶和单子叶植物中均表现出高度的组成型和高效性 | 研究中未提及该启动子在所有植物种类中的广泛适用性,且未详细讨论其在环境压力下的表现 | 增加植物基因工程中使用的组成型启动子库,特别是针对高水平基因表达的启动子 | 植物合成生物学中的基因调控元件(启动子) | 植物合成生物学 | NA | DNA shuffling技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因植物幼苗 |
7 | 2025-02-08 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
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研究论文 | 本文介绍了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环 | 开发了一个软件框架,将静态机器人平台转变为动态平台,实现自主调整测试参数,推动完全自动化的DBTL循环 | 尽管机器人平台可以显著加快数据收集过程,但数据的整理和分析仍然需要人工干预 | 优化细菌系统的诱导过程,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环 | 细菌系统和绿色荧光报告蛋白(GFP) | 合成生物学 | NA | 机器人平台和软件框架 | NA | 测量数据 | NA |
8 | 2025-02-08 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
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研究论文 | 本文通过调查1149名澳大利亚人,分析了公众对基因技术用于入侵性害虫控制的态度,并探讨了公众参与和信息需求的差异 | 通过将样本分为四类态度群体(Certain Objectors, Fence Sitters, Cautious Supporters, Certain Supporters),揭示了公众对基因技术的多样化观点及其相关的信念和情感 | 研究仅基于澳大利亚样本,可能无法完全代表其他地区或文化背景的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵性害虫控制的看法,并探索公众参与和信息需求的差异 | 1149名澳大利亚人 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查数据 | 1149名澳大利亚人 |
9 | 2025-01-25 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
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综述 | 本文全面分析了真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养品中的新兴应用 | 综述了基因工程、代谢途径操作和合成生物学的最新进展,以提高次级代谢产物的产量,并强调了组学技术在理解次级代谢产物调控和生物合成中的重要性 | NA | 探讨真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业和环境可持续性中的应用 | 真菌及其次级代谢产物 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操作、合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA |
10 | 2025-01-25 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
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综述 | 本文总结了细菌载体在抗癌药物递送中的应用及其优缺点,并强调了细菌载体递送系统在临床转化中的潜力 | 细菌载体递送系统利用细菌的趋化性和抗肿瘤免疫反应激活能力,结合纳米医学和合成生物学技术,为克服传统癌症治疗方案的局限性提供了新的策略 | 细菌载体递送系统在临床应用中仍面临安全性、稳定性和规模化生产等挑战 | 探索细菌载体递送系统在癌症治疗中的应用潜力 | 细菌载体递送的抗癌药物 | 生物医学工程 | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA |
11 | 2025-01-21 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
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研究论文 | 本文介绍了一种新的连续荧光检测方法,用于体外翻译实验,该方法与非经典氨基酸(ncAAs)兼容 | 开发了一种基于亲和夹蛋白的连续荧光检测方法,能够快速验证多种非经典氨基酸的掺入并测试多种tRNA的密码子读取特异性 | 该方法依赖于亲和夹蛋白的荧光特性变化,可能对某些特定ncAAs的检测存在局限性 | 开发一种适用于非经典氨基酸的体外翻译连续检测方法,以促进药物发现和合成生物学中的翻译装置工程 | 非经典氨基酸(ncAAs)和tRNA的密码子读取特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光检测 | NA | 荧光数据 | 384孔板格式的实验 |
12 | 2025-01-05 |
Inert splint-driven oligonucleotide assembly
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae019
PMID:39734808
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研究论文 | 本文介绍了一种新的寡核苷酸片段组装方法,称为splint-driven assembly reaction | 该方法使用了一种一管式的splint-driven组装反应,不同于依赖短且高度纯化的寡核苷酸的聚合酶链式组装和连接酶链式组装 | NA | 开发一种新的寡核苷酸片段组装方法,用于合成生物学、定向进化、功能蛋白测定等领域 | 寡核苷酸片段 | 合成生物学 | NA | Oxford Nanopore测序、Sanger测序 | NA | DNA序列 | 741-bp基因片段 |
13 | 2025-01-05 |
Harnessing lactic acid bacteria for nicotinamide mononucleotide biosynthesis: a review of strategies and future directions
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1492179
PMID:39735184
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌(LAB)进行烟酰胺单核苷酸(NMN)生物合成的策略和未来方向 | 本文深入分析了多种代谢工程策略,包括酶优化、途径重连和发酵过程增强,以提高LAB中NMN的产量,并探讨了CRISPR/Cas9和传统方法在关键生物合成途径中的应用 | NA | 研究目的是开发可扩展且工业相关的NMN生产工艺,以满足不断增长的市场需求 | 研究对象是乳酸菌(LAB)及其在NMN生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 代谢工程, 发酵过程优化 | NA | NA | NA |
14 | 2025-01-05 |
Engineering Nicotiana benthamiana for chrysoeriol production using synthetic biology approaches
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1458916
PMID:39741678
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术在本氏烟草中生产甲基化黄酮chrysoeriol,并优化了其生物合成途径 | 通过合成生物学技术将chrysoeriol的生物合成途径从八步缩短至四步,并成功在本氏烟草中实现高效生产 | 研究仅在本氏烟草中进行,未在其他植物或系统中验证其普适性 | 提高黄酮类化合物的生产效率,解决其天然含量低和化学合成困难的问题 | 本氏烟草及chrysoeriol的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
15 | 2025-01-05 |
Research and application of intelligent diagnosis and treatment engineering bacteria
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1524376
PMID:39744595
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研究论文 | 本文探讨了智能诊断和治疗工程细菌的研究与应用,包括菌株选择、生物传感系统设计和释放策略规划 | 利用合成生物学技术开发具有增强智能的基因工程细菌,能够自主检测环境信号并表达功能蛋白,结合人工智能、纳米材料和光学技术,拓展了临床应用 | NA | 研究智能诊断和治疗工程细菌的开发及其在疾病治疗中的应用 | 智能诊断和治疗工程细菌 | 合成生物学 | 代谢疾病、炎症疾病、肿瘤、感染疾病 | 合成生物学、人工智能、纳米材料、光学技术 | NA | NA | NA |
16 | 2024-12-28 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae018
PMID:39722801
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具,用于减少细菌中非预期基因表达 | CryptKeeper是一个新的软件管道,能够可视化基因表达信号的预测并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 减少细菌中非预期基因表达,以解决克隆挑战和避免实验失败 | 细菌中的非预期基因表达 | 合成生物学 | NA | 计算工具 | NA | DNA序列 | NA |
17 | 2024-12-20 |
Advancing microbiota therapeutics: the role of synthetic biology in engineering microbial communities for precision medicine
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1511149
PMID:39698189
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综述 | 本文综述了合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的变革潜力,探讨了其在精准医学中的应用 | 本文整合了计算机科学、工程学和生物学,利用CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程和合成寡核苷酸合成等前沿技术,为个性化益生菌和工程微生物等靶向治疗铺平道路 | 本文讨论了遗传稳定性、环境安全性和健全的监管框架等挑战,强调了持续研究以确保安全有效的微生物组干预的重要性 | 探讨合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的作用,特别是其在精准医学中的应用 | 微生物组、合成生物学技术、肠道微生物在疾病中的作用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程、合成寡核苷酸合成 | NA | NA | NA |
18 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
19 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
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综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法,以激活生物合成基因簇(BGCs)的表达,并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低,且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇,以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
20 | 2024-12-13 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本文开发并优化了Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱,以促进脂肪酸生产 | 验证并表征了一组诱导性和组成性启动子,设计并测试了RBS库,研究了密码子优化对基因表达的影响 | 仍需克服一些障碍,使C. necator广泛用于生物合成过程 | 开发和优化Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱 | Cupriavidus necator中的启动子、RBS和密码子优化 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 一组诱导性和组成性启动子,一个RBS库,gfp和mCherry基因的密码子优化变体 |