合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2024-08-07	Tailored bacteria tackling with environmental mercury: Inspired by natural mercuric detoxification operons 2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2023.123016 PMID:38008253	综述	本文综述了基于mer操纵子的细菌在检测、吸收、生物积累和解毒环境汞中的作用	利用mer操纵子的四个组成部分（MerR调节因子、mer启动子、解毒因子MerA和MerB）构建合成细菌，以处理污染物汞	NA	探讨基于mer操纵子的设计细菌在环境汞生物修复中的潜力	环境中的汞及其对生态系统和人类健康的影响	NA	NA	合成生物学、蛋白质工程和代谢工程	NA	NA	NA
182	2024-08-07	Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16 PMID:38066374	研究论文	本文详细介绍了生产无细胞壁的L型细菌及其在激活感染革兰氏阳性宿主物种的合成噬菌体基因组中的应用	本文开发了新型无标记基因组编辑方法，用于改进治疗性噬菌体，并详细介绍了合成生物学在体外组装改良噬菌体基因组的应用	在难以转化的革兰氏阳性细菌中激活合成噬菌体基因组可能具有挑战性	研究替代抗菌剂，特别是噬菌体，以治疗抗生素耐药性病原体感染	L型细菌和合成噬菌体基因组	NA	NA	基因编辑	NA	NA	NA
183	2024-08-07	Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17 PMID:38066375	研究论文	本文探讨了利用合成生物学技术开发新型分子生物学方法，以构建具有新功能的特化噬菌体	介绍了两种成功用于遗传工程噬菌体基因组的策略：噬菌体重组电穿孔DNA（BRED）和基于酵母的噬菌体工程平台	NA	开发新型分子生物学技术，以构建具有新功能的特化噬菌体	噬菌体及其在病原体控制、检测、靶向药物递送和新材料组装中的应用	合成生物学	NA	噬菌体重组电穿孔DNA（BRED）和基于酵母的噬菌体工程平台	NA	NA	NA
184	2024-08-07	Characterization and optimization of 5´ untranslated region containing poly-adenine tracts in Kluyveromyces marxianus using machine-learning model 2024-Jan-03, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-023-02271-3 PMID:38172836	研究论文	本文研究了Kluyveromyces marxianus中含多聚腺苷酸（poly(A)）的5´非翻译区（5´ UTR）对蛋白质生产的影响，并利用机器学习模型对其进行优化	首次构建了包含5´ UTR poly(A)特征的机器学习模型，用于预测蛋白质产量	删除或减少poly(A)对mRNA水平的影响不一致，表明其对蛋白质生产的抑制作用可能与mRNA水平无关	构建机器学习模型，研究5´ UTR poly(A)对蛋白质生产的影响并进行优化	Kluyveromyces marxianus中的5´ UTR poly(A)及其对蛋白质生产的影响	机器学习	NA	机器学习模型	多层感知器神经网络（MLP-NN）	序列数据	207个含poly(A)的5´ UTR和34个不含poly(A)的5´ UTR
185	2024-08-07	Heterologous production of 3-hydroxypropionic acid in Methylorubrum extorquens by introducing the mcr gene via a multi-round chromosomal integration system based on cre-lox71/lox66 and transposon 2024-Jan-03, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-023-02275-z PMID:38172868	研究论文	本研究通过构建基于cre-lox71/lox66和转座子的多轮染色体整合系统，在Methylorubrum extorquens中异源生产3-羟基丙酸（3-HP）。	本研究开发了一种新的遗传工具，通过多轮染色体整合系统，实现了在M. extorquens中异源基因的高效表达。	NA	本研究旨在通过整合现有技术，如转座子介导的染色体整合和cre-lox介导的重组，实现目标基因在M. extorquens AM1中的多样化表达。	Methylorubrum extorquens AM1	合成生物学	NA	转座子介导的染色体整合，cre-lox介导的重组	NA	基因表达	两个染色体整合拷贝
186	2024-08-07	CO2-based production of phytase from highly stable expression plasmids in Cupriavidus necator H16 2024-Jan-03, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-023-02280-2 PMID:38172920	研究论文	本研究介绍了一种新型表达质粒，通过电穿孔技术在Cupriavidus necator H16中高效生产源自大肠杆菌的AppA植酸酶。	该研究引入了一种新型表达质粒，包含分区系统以提高分离稳定性，无需选择压力，并成功在C. necator H16中生产了植酸酶。	NA	建立稳定的、高拷贝数质粒，支持利用C. necator从CO2生产单细胞蛋白，并探索其在饲料工业中利用CO2的潜力。	Cupriavidus necator H16中的植酸酶生产。	合成生物学	NA	电穿孔技术	NA	蛋白质	在1升分批补料气体发酵系统中进行了放大实验。
187	2024-08-07	Enhancing the production of recombinant adeno-associated virus in synthetic cell lines through systematic characterization 2024-01, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28562 PMID:37749931	研究论文	本文通过系统性表征病毒生产动力学，优化了合成细胞系中重组腺相关病毒（rAAV）的生产	采用合成生物学方法生成稳定细胞系，通过条件表达基因和优化诱导条件，提高了rAAV的生产效率	NA	提高合成细胞系中rAAV的生产效率	重组腺相关病毒（rAAV）的生产	合成生物学	NA	定量蛋白质组学	NA	蛋白质	NA
188	2024-08-07	Dual Engineering of Olivetolic Acid Cyclase and Tetraketide Synthase for the Formation of Longer Alkyl-Chain Olivetolic Acid Analogs and Their Antibacterial Activities 2024, Chemical & pharmaceutical bulletin IF:1.5Q3 DOI:10.1248/cpb.c23-00692 PMID:38171898	综述	本文综述了通过双工程化橄榄酸环化酶和四酮合成酶来形成更长烷基链的橄榄酸类似物及其抗菌活性的研究	通过混合不同生物合成途径的基因或工程化次级代谢酶以扩展底物和产物特异性，理论上可以生成新的非天然化合物	NA	探讨通过工程化酶来扩展非天然大麻素中C-3烷基部分的可能性，以开发具有治疗效益的大麻素	橄榄酸环化酶和四酮合成酶的结构基础双工程化及其对橄榄酸类似物抗菌活性的影响	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
189	2024-08-07	A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology 2024-Jan, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14146 PMID:37882352	研究论文	本文介绍了一种基于自主生物发光的新型低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统	该系统利用Neonothopanus nambi真菌的完整生物发光循环途径构建了一个自维持的报告系统，无需外源性提供荧光素酶底物，并通过HispS基因作为报告系统的转录入口点，显著提高了输出的动态范围	NA	旨在为植物合成生物学中的合成基因电路优化提供快速、丰富的数据集	植物基因表达的定量测量	合成生物学	NA	生物发光	NA	基因表达数据	涉及N. benthamiana等植物样本
190	2024-08-07	Fruit development and ripening orchestrating the biosynthesis and regulation of Lycium barbarum polysaccharides in goji berry 2024-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.127970 PMID:37944729	研究论文	本研究探讨了枸杞果实发育和成熟过程中枸杞多糖的生物合成与调控机制	首次通过生理指标监测、蛋白质组和转录组分析以及基因共表达网络分析，揭示了枸杞多糖的生物合成途径和调控因子	NA	揭示枸杞果实中枸杞多糖的生物合成与调控机制	枸杞果实中的枸杞多糖	NA	NA	蛋白质组学、转录组学、基因共表达网络分析	NA	生物分子数据	6410个差异表达基因和2052个差异表达蛋白质
191	2024-08-07	Recent advances in microalgal production, harvesting, prediction, optimization, and control strategies 2024-Jan, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2023.129924 PMID:37925082	综述	本文综述了微藻生产、收获、预测、优化和控制策略的最新进展	探讨了合成生物学、气泡生成、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝以及人工智能集成等策略在微藻生产中的应用	现有微藻生物加工方法面临低生物量和生物产品产量、监测效率低下及收获成本高等挑战	旨在分析现有微藻生物加工方法的挑战并指出未来研究方向	微藻及其在医药、营养保健品、化妆品和水产/动物饲料行业的应用	NA	NA	合成生物学、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝、人工智能	NA	NA	NA
192	2024-08-07	Turning waste into treasure: Biosynthesis of value-added 2-O-α-glucosyl glycerol and d-allulose from waste cane molasses through an in vitro synthetic biology platform 2024-Jan, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2023.129982 PMID:37926357	研究论文	本文通过体外合成生物学平台，利用蔗糖磷酸化酶和D-阿洛酮糖3-表异构酶系统，从废甘蔗糖蜜中生产2-O-α-葡糖基甘油和D-阿洛酮糖	本文创新性地构建了一种体外合成双酶系统，有效解决了农业废弃物转化为糖苷和稀有糖的挑战	乳酸在甘蔗糖蜜中显著抑制D-阿洛酮糖3-表异构酶的催化性能，仅在存在Na和K的情况下，抑制率达到75%	探索从农业废弃物中高效经济地生产糖苷和稀有糖的方法	甘蔗糖蜜中的2-O-α-葡糖基甘油和D-阿洛酮糖	NA	NA	体外合成生物学平台	双酶系统	化学物质	从500 mM蔗糖中合成了116 g/L 2-O-α-葡糖基甘油和51 g/L D-阿洛酮糖
193	2024-08-07	Systematic metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for the enhanced production of erythritol 2024-Jan, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2023.129918 PMID:37884093	研究论文	本研究利用CRISPR/Cas9系统在染色体水平上对Yarrowia lipolytica进行遗传改造，以提高赤藓糖醇的生产效率	采用CRISPR/Cas9系统进行基因编辑，实现了快速构建高产赤藓糖醇菌株，并通过模块化途径工程和形态工程进一步提高产量	NA	探索和优化微生物菌株以提高赤藓糖醇的生产能力	Yarrowia lipolytica菌株及其赤藓糖醇生产能力	NA	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	最佳工程菌株E326在5升生物反应器中生产256克/升赤藓糖醇