本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
|
研究论文 | 本研究开发了能够体外选择性抑制IIS型限制性内切酶活性的重组DNA甲基化酶 | 成功表达并验证了非切换型和切换型甲基化酶对IIS型限制性内切酶活性的位点选择性抑制能力 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内应用验证 | 开发用于合成生物学和DNA组装技术的新型分子工具 | I型和II型限制修饰系统中的DNA甲基化酶 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、DNA甲基化分析、限制性内切酶消化 | NA | 酶活性分析数据 | 10种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 | His标签纯化、分子克隆 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 22 | 2025-10-05 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
|
综述 | 本文探讨了合成最小细胞系统中信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的概念设计 | 通过囊泡系统人工重构了展示递归生长和分裂周期的合成最小细胞,避免了使用生物细胞中复杂的分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装体中产生,以及支撑这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 信息分子、代谢途径和囊泡繁殖的简化设计 | NA |
| 23 | 2025-10-05 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于PYR1受体、具有可重编程配体结合特异性的正交化化学诱导二聚化模块 | 设计了带有二聚界面盐桥的正交化PYR1*模块,创建了对特定配体具有纳摩尔级敏感性的新型CID系统 | NA | 扩展PYR1化学诱导二聚化系统,开发可重编程配体结合特异性的正交化模块 | PYR1受体、HAB1磷酸酶及其正交化变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化分析、体内分析 | NA | 晶体结构数据、生化数据、体内功能数据 | NA | CID系统设计 | 拟南芥, 酿酒酵母 | 化学诱导二聚化模块、多输入/输出遗传电路、生物传感器 | 环境监测, 合成生物学 |
| 24 | 2025-10-05 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
|
研究论文 | 本研究利用植物副逆转录病毒遗传资源开发了一种高效的三元合成启动子MFH17,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 首次将三种副逆转录病毒来源的启动子元件(MMV、FMV、HRLV)通过理性设计和DNA改组技术组合成新型三元杂交启动子MFH17 | NA | 开发适用于高水平基因表达的高效合成启动子,丰富植物组成型启动子库 | 植物副逆转录病毒启动子元件及其合成变体 | 合成生物学 | NA | DNA改组技术、转基因技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因拟南芥和烟草植物 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 拟南芥, 烟草 | 组成型启动子设计,包含as-1元件的合成启动子 | 农业, 工业生物技术 |
| 25 | 2025-10-05 |
Closing the loop: establishing an autonomous test-learn cycle to optimize induction of bacterial systems using a robotic platform
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1528224
PMID:39911814
|
研究论文 | 开发了一个软件框架,使机器人平台能够自主调整测试参数,实现完全自动化的设计-构建-测试-学习循环 | 将静态机器人平台转变为动态平台,实现无需人工干预的自主测试-学习循环 | 仅使用绿色荧光蛋白作为目标产物进行评估,未涉及更复杂的生物系统 | 建立完全自动化的设计-构建-测试-学习循环来优化细菌系统的诱导条件 | 细菌系统中的诱导浓度优化和诱导剂与饲料释放的组合优化 | 合成生物学 | NA | 机器人平台自动化技术 | 探索与利用平衡的优化算法 | 测量数据 | NA | 机器人平台 | 细菌 | 诱导表达系统 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
Public attitudes to genetic technology for invasive pest control and preferences for engagement and information: a segmentation analysis
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1388512
PMID:39911817
|
研究论文 | 通过调查分析公众对基因技术用于入侵害虫控制的态度、参与偏好和信息需求 | 首次将公众对基因技术的态度分为四个细分群体,并针对不同群体提出差异化的公众参与策略 | 样本仅来自澳大利亚,可能无法代表其他国家的公众态度 | 了解公众对基因技术用于入侵害虫控制的认知和态度,探索公众参与路径和信息需求 | 1149名澳大利亚公众 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | 调查问卷数据 | 1149名澳大利亚受访者 | NA | NA | NA | 环境 |
| 27 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
|
综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养保健品中的新兴应用 | 系统整合了基因工程、代谢途径操纵和合成生物学在提高真菌次级代谢产物产量方面的最新进展,并强调了组学技术在理解次级代谢产物生物合成调控中的重要性 | NA | 分析真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、环境和生物技术领域的应用潜力 | 真菌次级代谢产物及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操纵、合成生物学、组学技术、发酵技术、生物加工、共培养方法 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 医疗保健, 农业, 环境, 营养保健品, 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-06 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
|
综述 | 本文总结了细菌载体在癌症治疗中的药物递送应用及其临床转化前景 | 系统阐述细菌载体通过趋化性靶向肿瘤组织并激活抗肿瘤免疫反应的新型药物递送策略 | NA | 探讨细菌载体递送系统在癌症治疗中的潜力与临床应用前景 | 细菌载体递送的抗癌药物及其递送系统 | NA | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 29 | 2025-10-06 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
|
研究论文 | 开发了一种基于亲和钳蛋白检测短肽标签的连续荧光测定方法,用于非经典氨基酸的体外翻译检测 | 首次创建了与ncAAs兼容的连续荧光检测方法,克服了传统放射性终点测定和荧光蛋白方法的局限性 | NA | 开发适用于非经典氨基酸的高通量体外翻译检测方法 | 体外翻译系统、非经典氨基酸、tRNA密码子特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光测定、mRNA展示、质谱分析 | NA | 荧光数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 30 | 2025-01-05 |
Inert splint-driven oligonucleotide assembly
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae019
PMID:39734808
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的寡核苷酸片段组装方法,称为splint-driven assembly reaction | 该方法使用了一种一管式的splint-driven组装反应,不同于依赖短且高度纯化的寡核苷酸的聚合酶链式组装和连接酶链式组装 | NA | 开发一种新的寡核苷酸片段组装方法,用于合成生物学、定向进化、功能蛋白测定等领域 | 寡核苷酸片段 | 合成生物学 | NA | Oxford Nanopore测序、Sanger测序 | NA | DNA序列 | 741-bp基因片段 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-01-05 |
Harnessing lactic acid bacteria for nicotinamide mononucleotide biosynthesis: a review of strategies and future directions
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1492179
PMID:39735184
|
综述 | 本文综述了利用乳酸菌(LAB)进行烟酰胺单核苷酸(NMN)生物合成的策略和未来方向 | 本文深入分析了多种代谢工程策略,包括酶优化、途径重连和发酵过程增强,以提高LAB中NMN的产量,并探讨了CRISPR/Cas9和传统方法在关键生物合成途径中的应用 | NA | 研究目的是开发可扩展且工业相关的NMN生产工艺,以满足不断增长的市场需求 | 研究对象是乳酸菌(LAB)及其在NMN生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 代谢工程, 发酵过程优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-01-05 |
Engineering Nicotiana benthamiana for chrysoeriol production using synthetic biology approaches
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1458916
PMID:39741678
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术在本氏烟草中生产甲基化黄酮chrysoeriol,并优化了其生物合成途径 | 通过合成生物学技术将chrysoeriol的生物合成途径从八步缩短至四步,并成功在本氏烟草中实现高效生产 | 研究仅在本氏烟草中进行,未在其他植物或系统中验证其普适性 | 提高黄酮类化合物的生产效率,解决其天然含量低和化学合成困难的问题 | 本氏烟草及chrysoeriol的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-01-05 |
Research and application of intelligent diagnosis and treatment engineering bacteria
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1524376
PMID:39744595
|
研究论文 | 本文探讨了智能诊断和治疗工程细菌的研究与应用,包括菌株选择、生物传感系统设计和释放策略规划 | 利用合成生物学技术开发具有增强智能的基因工程细菌,能够自主检测环境信号并表达功能蛋白,结合人工智能、纳米材料和光学技术,拓展了临床应用 | NA | 研究智能诊断和治疗工程细菌的开发及其在疾病治疗中的应用 | 智能诊断和治疗工程细菌 | 合成生物学 | 代谢疾病、炎症疾病、肿瘤、感染疾病 | 合成生物学、人工智能、纳米材料、光学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-12-28 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae018
PMID:39722801
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具,用于减少细菌中非预期基因表达 | CryptKeeper是一个新的软件管道,能够可视化基因表达信号的预测并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 减少细菌中非预期基因表达,以解决克隆挑战和避免实验失败 | 细菌中的非预期基因表达 | 合成生物学 | NA | 计算工具 | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-12-20 |
Advancing microbiota therapeutics: the role of synthetic biology in engineering microbial communities for precision medicine
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1511149
PMID:39698189
|
综述 | 本文综述了合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的变革潜力,探讨了其在精准医学中的应用 | 本文整合了计算机科学、工程学和生物学,利用CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程和合成寡核苷酸合成等前沿技术,为个性化益生菌和工程微生物等靶向治疗铺平道路 | 本文讨论了遗传稳定性、环境安全性和健全的监管框架等挑战,强调了持续研究以确保安全有效的微生物组干预的重要性 | 探讨合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的作用,特别是其在精准医学中的应用 | 微生物组、合成生物学技术、肠道微生物在疾病中的作用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程、合成寡核苷酸合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
|
综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法,以激活生物合成基因簇(BGCs)的表达,并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低,且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇,以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-12-13 |
Using Euf1 transcription factor as a titrator of erythritol-inducible promoters in Yarrowia lipolytica; insight into the structure, splicing, and regulation mechanism
2024-Jan-09, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foae027
PMID:39169472
|
研究论文 | 本研究使用Euf1转录因子作为调节因子,探索其在Yarrowia lipolytica中对赤藓糖醇诱导型启动子的调控机制 | 通过使用Euf1转录因子作为启动子调节因子,扩展了合成启动子的可调性,并提出了Euf1调控启动子作用的新机制 | 研究中Euf1的过表达导致启动子的赤藓糖醇诱导特性丧失 | 探索合成生物学中可控调节元件的调控机制 | Euf1转录因子及其在Yarrowia lipolytica中的调控作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子调控 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-12-12 |
T7 phage-assisted evolution of riboswitches using error-prone replication and dual selection
2024-01-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52049-9
PMID:38287027
|
研究论文 | 本文展示了利用T7噬菌体辅助进化技术,通过错误倾向复制和双重选择系统,成功进化了茶碱核开关 | 本文创新性地设计了T7AE技术,通过双重选择系统实现了对功能性核开关的有效筛选和富集 | NA | 开发一种新的技术来进化和改进基因开关,特别是基于非编码RNA的开关 | 茶碱核开关及其在T7噬菌体中的进化 | 合成生物学 | NA | 错误倾向复制 | NA | DNA | 65,536个工程化的T7噬菌体 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-12-10 |
Toolbox of Characterized Genetic Parts for Staphylococcus aureus
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00325
PMID:38064657
|
研究论文 | 本文报道了首个用于金黄色葡萄球菌的标准化遗传部件工具箱,包括来自多种细菌的启动子、核糖体结合位点、终止子和质粒复制子,用于精确控制基因表达 | 首次为金黄色葡萄球菌建立了标准化的遗传部件工具箱,并展示了其在理性设计和工程化中的应用 | NA | 开发适用于金黄色葡萄球菌的合成生物学工具 | 金黄色葡萄球菌的遗传部件 | 合成生物学 | NA | DNA组装策略 | NA | 基因表达数据 | 24个组成型启动子,金黄色葡萄球菌ATCC 12600 | NA | NA | NA | NA |