合成生物学相关文章
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当前共找到 183 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
Multiplex Functional Characterization of Protein Variant Libraries in Mammalian Cells with Single-Copy Genomic Integration and High-Throughput DNA Sequencing
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_10
PMID:38441763
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研究论文 | 本文开发了一种利用Bxb1噬菌体DNA重组酶在细胞基因组中预设的“着陆垫”位点插入单个无启动子质粒的哺乳动物合成生物学平台，以实现大规模并行遗传分析 | 该平台通过基因组整合的启动子确保每个细胞只表达一个转基因，保持严格的基因型-表型联系，并能对选定的细胞进行测序以赋予每个变体表型评分 | NA | 开发一种新的方法来同时表征编码数千种独特蛋白质变体的库的基因型-表型关系 | 蛋白质变体库在哺乳动物细胞中的功能表征 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序 | NA | DNA序列 | 数千种独特蛋白质变体 |
| 102 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel，用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统，独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能，并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究，并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 |
| 103 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全，旨在保护人类隐私、自主权和安全，与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险，并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法，以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA |
| 104 | 2024-08-07 |
Novel processing strategies to enhance the bioaccessibility and bioavailability of functional components in wheat bran
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2022.2129582
PMID:36190261
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综述 | 本文综述了小麦麸皮中的功能性成分，分析了改性方法，并重点介绍了新型固态发酵（SSF）策略在释放功能性成分中的应用 | 利用传统发酵食品中的高效微生物资源，探索细胞群落间的物质交换规律，构建稳定的自调节共培养系统，以及结合新兴的物理场预处理技术 | NA | 探讨如何通过新型处理策略提高小麦麸皮中功能性成分的生物可及性和生物利用度 | 小麦麸皮中的功能性成分，如膳食纤维、多糖和酚类 | NA | NA | 固态发酵（SSF）、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-07 |
Intelligent computation in cancer gene therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1252246
PMID:38549859
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综述 | 本文综述了利用合成基因调控网络实现人工神经网络在癌症基因治疗中的应用及其最新计算进展 | 提出通过合成生物学领域的合成基因电路来实时精细调控治疗基因表达的新方法 | NA | 探讨如何利用新兴的计算能力生成更安全有效的基因治疗方法 | 癌症基因治疗中的合成基因调控网络及人工神经网络的实现 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路 | 人工神经网络 | NA | NA |
| 106 | 2024-08-07 |
The roles of SARP family regulators involved in secondary metabolism in Streptomyces
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1368809
PMID:38550856
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综述 | 本文总结了SARP家族调控因子在次级代谢中的作用，特别是在次级代谢物生物合成中的调控机制及其在生物技术中的应用 | NA | NA | 帮助研究人员全面理解SARP家族调控因子在次级代谢物生物合成中的作用，为未来在合成生物学中的应用打下坚实基础 | SARP家族调控因子在次级代谢中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
A systems framework for investigating the roles of multiple transporters and their impact on drug resistance
2024-Jan-23, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyae007
PMID:38537223
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研究论文 | 本文开发了一个系统框架，用于研究多种转运蛋白在药物抗性中的作用及其相互作用 | 创新性地创建了一个结构化的系统框架，用于评估多种转运蛋白对药物外排和药物抗性的影响 | NA | 旨在深入理解转运蛋白在药物抗性中的系统级功能和作用 | 多种转运蛋白及其与药物的相互作用和调控机制 | 生物医学工程 | NA | 计算和分析方法 | 系统框架 | NA | NA |
| 108 | 2024-08-07 |
Sugarcane breeding: a fantastic past and promising future driven by technology and methods
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1375934
PMID:38525140
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review | 本文从技术和方法的角度回顾了甘蔗育种的主要历史，指出了当前的状况和挑战，并对智能育种的前景进行了合理展望 | 本文提出了利用现代生物技术（如全基因组选择、转基因、基因编辑和合成生物学）和信息技术（如遥感和深度学习）来实现甘蔗育种的跨越式发展 | 由于遗传基础狭窄、品种退化严重、缺乏突破性品种以及育种周期长和基因聚合概率低等问题，甘蔗育种面临挑战 | 探讨如何利用新技术和方法推动甘蔗育种的发展，以应对未来世界人口爆炸、可耕种土地减少和各种生物及非生物胁迫的威胁 | 甘蔗育种 | NA | NA | 全基因组选择、转基因、基因编辑、合成生物学、遥感、深度学习 | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-07 |
Flapjack: Data Management and Analysis for Genetic Circuit Characterization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_23
PMID:38468101
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research paper | Flapjack平台为合成基因电路工程的DBTL循环中的设计、构建、测试和学习阶段提供了一个全面的数据管理和分析解决方案 | Flapjack平台通过其用户友好的界面和与外部软件的兼容性，为合成生物学研究提供了一个实用的工具 | NA | 解决合成基因电路工程DBTL循环中的挑战，促进基因电路的表征和优化 | 合成基因电路的表征和优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据和相关元数据 | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本文研究了通过重组DNA甲基化酶来抑制IIS型限制酶活性的方法 | 开发了可用于合成生物学和DNA组装技术的重组DNA甲基化酶 | NA | 生产能够体外抑制IIS型限制酶的重组DNA甲基化酶 | DNA甲基化酶及其在抑制IIS型限制酶活性中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA甲基化 | NA | DNA | 十种甲基化酶 |
| 111 | 2024-08-07 |
'Seeing' the electromagnetic spectrum: spotlight on the cryptochrome photocycle
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1340304
PMID:38495372
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review | 本文综述了植物隐花色素如何获得光感应功能的机制 | 讨论了隐花色素光循环中产生的反应性氧物种（ROS）及其在生物应激反应中的作用，以及隐花色素对电磁场的响应和在光遗传学中的应用 | NA | 探讨植物隐花色素如何获得光感应功能及其在生物学和医学中的潜在应用 | 植物隐花色素及其光循环机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-07 |
High-throughput prediction of enzyme promiscuity based on substrate-product pairs
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae089
PMID:38487850
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研究论文 | 本文开发了一种基于底物-产物对的酶混杂性预测模型SPEPP，利用迁移学习和变换器架构进行预测 | SPEPP模型通过迁移学习和变换器架构，无需先验反应知识，允许用户自定义候选酶库，具有较强的外推能力 | NA | 解决现有基于底物和反应相似性的工具在代谢工程和合成生物学中应用的局限性 | 酶混杂性预测及其在代谢工程、从头途径设计和有害物质降解中的应用 | 代谢工程 | NA | 迁移学习 | 变换器架构 | 底物-产物对数据 | NA |
| 113 | 2024-08-07 |
The whack-a-mole governance challenge for AI-enabled synthetic biology: literature review and emerging frameworks
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1359768
PMID:38481570
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综述 | 本文综述了AI驱动的合成生物学带来的治理挑战，并描述了新兴的治理框架 | 提出了‘打地鼠’治理模式，以应对AI驱动合成生物学带来的不断变化的挑战 | 文章主要基于文献综述，缺乏实证研究 | 探讨如何有效治理AI驱动的合成生物学，以平衡创新与生物安全 | AI驱动的合成生物学及其治理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
Self-driving laboratories to autonomously navigate the protein fitness landscape
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00002-4
PMID:38468718
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研究论文 | 本文介绍了用于全自动蛋白质工程的自主驾驶机器平台SAMPLE，该平台通过智能代理学习蛋白质序列-功能关系，设计新蛋白质并通过自动化机器人系统进行实验测试 | 提出了SAMPLE平台，实现了蛋白质工程的自动化和加速，提高了蛋白质设计的效率 | NA | 旨在通过自主驾驶实验室平台加速蛋白质工程，特别是提高糖苷水解酶的热稳定性 | 糖苷水解酶酶 | 蛋白质工程 | NA | 自动化机器人系统 | 智能代理 | 蛋白质序列 | 四个SAMPLE代理 |
| 115 | 2024-08-07 |
Plant Engineering to Enable Platforms for Sustainable Bioproduction of Terpenoids
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_1
PMID:38468079
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综述 | 本文综述了利用植物工程技术开发可持续生产萜类化合物的平台，并强调了优化已知途径、细胞内途径的区室化以及为复杂生物合成途径工程开发的遗传工具等策略。 | 本文介绍了利用植物作为可持续生产平台，通过代谢工程和合成生物学技术，提高萜类化合物的产量和生产效率。 | NA | 开发可持续的解决方案，通过工程化宿主生物中的生物合成途径来生产萜类化合物。 | 萜类化合物及其在工业中的应用，如绿色溶剂、香料和香精、营养补充品、着色剂和治疗药物。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
Construction of Xylose-Utilizing Cyanobacterial Chassis for Bioproduction Under Photomixotrophic Conditions
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_4
PMID:38468082
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，以快速生长的蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973为例，构建了一种新的能够利用木糖的蓝细菌底盘，以增加乙酰辅酶A用于生物生产 | 本文首次开发了一种合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘 | NA | 开发一种新的合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘 | 蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-07 |
Multiplex Marker-Less Genome Integration in Pichia pastoris Using CRISPR/Cas9
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_10
PMID:38468088
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研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9系统在Pichia pastoris中实现多基因无标记整合，构建细胞工厂 | 首次在Pichia pastoris中应用CRISPR/Cas9系统进行多基因整合，为C1生物转化提供平台 | NA | 开发Pichia pastoris中的合成生物学工具，特别是多基因路径的操作 | Pichia pastoris细胞工厂的构建 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-07 |
Genome Editing, Transcriptional Regulation, and Forward Genetic Screening Using CRISPR-Cas12a Systems in Yarrowia lipolytica
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_11
PMID:38468089
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研究论文 | 本文介绍了在工业相关的油质酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas12a系统进行基因编辑、转录调控和功能基因组筛选的方法 | 开发了一套CRISPR-Cas12a载体，用于简单多重基因敲除、抑制和激活，并构建了一个全基因组范围的引导库，用于功能基因组筛选 | NA | 扩展CRISPR-Cas12a系统在工业重要宿主中的合成生物学工具 | Yarrowia lipolytica中的基因编辑、转录调控和功能基因组筛选 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a | 机器学习算法 | 基因组数据 | 全基因组范围的引导库，每个基因有八倍覆盖 |
| 119 | 2024-08-07 |
A Machine Learning Approach for Predicting Essentiality of Metabolic Genes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_20
PMID:38468098
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研究论文 | 本文描述了一种使用二元分类算法预测代谢基因必需性的策略 | 该方法结合了基因组规模代谢模型、有向图和机器学习，形成了一个可以在小规模敲除数据上训练的预测模型 | NA | 识别必需基因，特别是在将原料转化为有价值产品的代谢途径工程中 | 代谢基因的必需性 | 机器学习 | NA | 二元分类算法 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | 小规模敲除数据 |
| 120 | 2024-08-07 |
Programming Juxtacrine-Based Synthetic Signaling Networks in a Cellular Potts Framework
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_17
PMID:38468095
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research paper | 本文开发了一种计算框架，使用模拟细胞系（ISCL）来设计和测试合成信号网络，以促进组织形成和形态发生 | 提出了一个包含基本可修改特征（如粘附、运动、生长和分裂）的模拟细胞系（ISCL），并能在其中快速工程化定制遗传电路以测试和改进不同的信号网络设计 | NA | 旨在重新编程高等真核细胞以促进组织形成和形态发生 | 合成生物学领域的合成发展 | synthetic biology | NA | cellular Potts modeling | NA | NA | NA |