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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上,实现无需去垢剂的脂质体膜插入,解耦了蛋白质设计与脂质体设计,便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制,但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略,用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像(电子显微镜)、荧光信号(流式细胞术) | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体,具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 22 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略,包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果,主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法,突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |
| 23 | 2026-06-20 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用,并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库,为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 | 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库,并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布,为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 | 未提及具体局限性,但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 | 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用,建立功能二萜合酶数据库,并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 | 二萜合酶和二萜类化合物 | 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 | 不适用 | 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 | 不适用 | 序列和功能数据(562个功能表征的二萜合酶) | 562个功能表征的二萜合酶 | 不适用 | 微生物细胞工厂(具体未指定,如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品 |
| 24 | 2026-06-20 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架,测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 | 通过进化上不可信的序列设计,区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 | 未能检测到强功能丧失突变,预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 | 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | Transformer | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 25 | 2026-06-20 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
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综述 | 综述了大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现条件性蛋白控制的机制与应用 | 从翻译后调控层面系统总结了ecDHFR-DD系统的机制、性能及跨物种优化,并提出了在害虫及媒介控制等应用生物学中的新方向 | 未提及具体实验验证或定量比较与其他系统的性能差异 | 综合评估ecDHFR-DD系统在条件性蛋白调控中的优势与局限,并展望其跨学科应用潜力 | ecDHFR去稳定域系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | ecDHFR-DD系统 | NA | NA | NA | Trimethoprim, 大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域 | 酵母、无脊椎动物、哺乳动物细胞 | 配体诱导稳定化的去稳定域电路 | 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫及媒介管理 |
| 26 | 2026-06-20 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
|
研究论文 | 开发基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的模块化可编程益生菌策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,在抗生素暴露后预防铜绿假单胞菌感染 | 首次将代谢物补充(丁酸)与抗原特异性黏膜免疫模块整合于同一益生菌平台,实现独立模块的灵活组合与协同保护 | 仅在抗生素暴露后的小鼠模型中验证,尚未评估在无菌动物或人类中的效果 | 开发一种抗生素暴露后恢复微生物稳态并激发黏膜免疫的益生菌策略,用于预防铜绿假单胞菌感染 | 抗生素暴露后的小鼠模型 | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染 | NA | NA | NA | 小鼠模型(具体数量未说明) | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸过量生产模块、外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原模块 | 医学 |
| 27 | 2026-06-20 |
Special Issue on Mammalian Cell Synthetic Biology
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00447
PMID:42317055
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2026-06-20 |
A Plug-and-Play Cytochrome P450 System Enables De Novo Biosynthesis of 2-Phenylethanol Derivatives
2026-Jun-18, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102493
PMID:42314827
|
研究论文 | 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统,用于从头生物合成2-苯乙醇衍生物 | 首次将结构导向的定向进化与系统级代谢工程结合,创建了高区域选择性和对映选择性的P450BM3变体,并在解脂耶氏酵母中实现了(R)-苯乙醇二醇和红景天苷的高效从头生物合成 | 未具体说明局限性,且某些副反应(如糖基转移酶活性)的发现具有一定偶然性 | 实现高价值芳香族化合物的可持续生物合成 | 2-苯乙醇衍生物((R)-苯乙醇二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷) | 合成生物学 | NA | 定向进化、系统级代谢工程、结构引导酶工程 | NA | 实验数据 | 5升生物反应器规模 | CRISPR-Cas9, 定向进化 | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 细胞色素P450驱动的即插即用系统,包含脂肪酸羟化酶P450BM3工程化变体及优化代谢通路 | 工业生物技术 |
| 29 | 2026-06-20 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Jun-16, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
|
综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成策略 | 提出超越光合作用3.5亿年进化垄断的人工合成策略,并首次整合电化学还原、酶级联反应与杂合生物人工系统,强调AI驱动催化剂设计与模块化合成生物学的融合 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡以及经济竞争力不足是当前实现实际部署的主要障碍 | 为建立经济可行的人工碳水化合物生产系统提供路径规划,推动分布式制造和循环碳经济 | 人工碳水化合物合成途径的设计与整合 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径(包括直接电化学CO2还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统) | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 30 | 2026-06-20 |
Targeting the phenolic A-ring unifies the toxicology and remediation of environmental estrogens in aquatic environments
2026-Jun-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125044
PMID:42297271
|
综述 | 综述环境雌激素的结构特征、毒性机制及去除策略,提出以酚A环为靶点的统一处理思路 | 提出以酚A环结构特征统一环境雌激素的毒理学机制与去除策略,并讨论了合成生物学在靶向生物降解中的潜力 | 未提供具体的实验验证数据,且对复杂污染物混合物(如微塑料的“特洛伊木马”效应)的量化分析不足 | 总结环境雌激素的毒性机制,并探索基于结构特征的去除策略 | 环境雌激素及其在环境中的行为 | 环境科学 | NA | NA | NA | 综述数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 农业, 水产 |
| 31 | 2026-06-20 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Jun-11, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
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研究论文 | 报道一种双功能工程化副干酪乳杆菌,通过合成生物学和响应性材料修饰,实现急性肺损伤的协同治疗 | 首次将细胞因子免疫调节与微环境响应性抗氧化功能结合于单一益生菌平台,并通过合成生物学与材料工程的协同设计提升治疗效果 | 尚缺乏长期安全性评估及在人源模型中的验证 | 开发一种针对急性肺损伤的工程益生菌治疗策略,实现靶向递送、免疫调节和氧化应激缓解 | 急性肺损伤小鼠模型及人肺相关细胞 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学、材料表面修饰、代谢组学 | NA | 代谢组学数据 | LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白细胞介素-4的基因回路,及ROS响应性表面修饰 | 医学 |
| 32 | 2026-06-20 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
|
综述 | 综述了转录因子作为第三代核心传感元件,用于开发低成本、现场快速检测食品污染物的技术 | 提出了近端诱变策略,并将转录因子工程与人工智能辅助分析相结合,以识别和表征性能关键功能位点 | 指出了食品安检诊断中仍存在的挑战和机遇 | 总结转录因子在生物传感器中作为识别模块的应用,推动其向食品安全监测的实际应用发展 | 转录因子及其与DNA结合位点的协同优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 转录因子生物传感器 | 食品 |
| 33 | 2026-06-19 |
Microscopic Fungi as Sources of Natural UV-Protective Compounds
2026-Jun-18, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-05005-x
PMID:42310121
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综述 | 综述2014年至2025年间关于微观真菌作为天然紫外线防护化合物来源的研究,涵盖黑色素、类菌孢素氨基酸等代谢物及其光保护、抗氧化和抗炎特性 | 系统揭示了微观真菌中多种代谢物(如黑色素、MAAs、类胡萝卜素等)的紫外线防护潜力,并整合了合成生物学、纳米递送系统等先进技术,强调真菌在开发多功能环保防晒产品中的未充分利用价值 | 产量优化、配方稳定性和法规验证方面仍存在挑战 | 探索微观真菌作为可持续、生物相容性紫外线防护化合物的天然来源,以替代合成防晒剂 | 微观真菌及其代谢产物(黑色素、类菌孢素氨基酸、类胡萝卜素、醌类、呫吨酮类、生物碱等) | 微生物学, 生物技术 | NA | 提取, 发酵, 合成生物学, 纳米颗粒递送系统 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 极端真菌, 工程酵母 | NA | 医药, 化妆品 |
| 34 | 2026-06-19 |
Bacterial Laccase: Recent Advances in Production, Engineering Strategies, and Diagnostic Applications
2026-Jun-18, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70272
PMID:42312546
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综述 | 综述了细菌漆酶在近十年内的生产技术、工程策略及诊断应用方面的研究进展 | 系统分析了合成生物学如何克服异源表达的历史限制,并探讨了定向进化、理性设计、翻译后修饰及计算建模增强漆酶催化性能的方法 | NA | 评估细菌漆酶从实验室研究向实际生物催化剂转化的进展,并指出剩余挑战和未来研究方向 | 细菌漆酶 | NA | NA | 定向进化,理性设计,翻译后修饰,计算建模 | NA | NA | 超过120篇同行评审论文 | 合成生物学,异源表达 | 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌 | NA | 环境监测,工业加工,医学诊断 |
| 35 | 2026-06-19 |
From agri-food wastes to high-value products: research progress, technological innovation, and challenges in the resource recycling of Chinese Baijiu by-products
2026-Jun-14, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135149
PMID:42289255
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综述 | 系统分析中国白酒副产物的化学成分、风味化合物谱和微生物资源,并讨论多样化利用途径的研究进展 | 以中国白酒副产物为典型案例,深入分析了资源化利用面临的挑战和未来发展方向 | 发展常受限于关键反应效率低、过程放大困难、单一生产模式导致资源浪费等因素 | 探讨如何高效利用蒸馏酒生产过程中产生的大量有机废弃物,推动绿色低碳经济和资源循环 | 中国白酒生产副产物(包括化学成分、风味化合物和微生物资源) | NA | NA | 合成生物学、热化学技术 | NA | 化学组成数据、风味化合物数据、微生物数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 农业, 环境 |
| 36 | 2026-06-19 |
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Jun-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102489
PMID:42288134
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研究论文 | 首次在圆红冬孢酵母中开发并优化了游离型质粒系统,并应用于基因表达、代谢工程和CRISPR基因组编辑 | 首次建立圆红冬孢酵母的游离型质粒系统,并开发Cre-loxP介导的体内再环化策略提高转化效率,以及实现无缝基因组编辑 | 未明确讨论系统中可能存在的长期稳定性和大规模应用的限制 | 开发一种功能性的游离型质粒系统以加速圆红冬孢酵母的代谢工程和合成生物学研究 | 圆红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR、Cre-loxP | Rhodotorula toruloides | 游离型质粒系统、CRISPR系统 | 工业生物技术 |
| 37 | 2026-06-19 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Jun-13, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了微生物生产S-腺苷甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展,重点介绍了系统代谢工程和合成生物学策略 | 系统总结了提高SAM生物合成、利用和循环的工程策略,并特别强调了SAM在阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等衍生物合成中的作用 | 未明确说明具体局限性,但指出了当前依赖化学合成的问题以及未来可持续生产的挑战 | 推动SAM及SAM依赖性高价值化合物的高效可持续微生物生产 | 微生物生产S-腺苷甲硫氨酸及其高价值衍生物,包括阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸 | 系统代谢工程与合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | 微生物 | NA | 生命科学、工业生物技术 |
| 38 | 2026-06-19 |
Bacteria as anticancer agents: bioactive metabolites, engineered platforms, and translational mechanisms
2026-Jun-12, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovag050
PMID:42240519
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综述 | 本文综述了细菌作为抗癌剂的潜力,包括其产生的生物活性代谢物、工程化平台及转化机制 | 系统总结了细菌来源的多种生物活性代谢物及其抗癌机制,并结合宏基因组学、基因组挖掘和合成生物学技术,突出了工程化细菌平台在肿瘤靶向治疗中的创新应用 | 尽管具有前景,但细菌衍生物在毒性、产量、选择性和临床转化方面仍存在挑战 | 探讨细菌衍生物在抗癌治疗中的现状与未来发展方向 | 细菌及其产生的生物活性代谢物和相关工程化平台 | NA | 癌症 | 宏基因组学, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌(放线菌、芽孢杆菌、假单胞菌、海洋来源菌等) | 工程化细菌平台(选择性定植肿瘤、递送治疗分子、激活前药疗法) | 医学 |
| 39 | 2026-06-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jun-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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观点评述 | 提出纳米流体学作为推动自下而上无细胞分子系统合成生物学发展的变革性平台 | 首次系统阐述纳米流体学如何利用纳米限域效应和精准质量传输,实现分子构建块的功能整合与时空结构主动组装 | 未涵盖纳米流体系统实际应用的实验验证及规模化生产的潜在挑战 | 探索纳米流体学在自下而上无细胞分子系统合成生物学中的核心作用与未来方向 | 自下而上构建的无细胞分子系统及纳米流体器件 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装与时空结构 | 合成生物学 |
| 40 | 2026-06-10 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-Jun-08, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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综述 | 综述微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解,提出解决塑料污染问题的框架 | 整合微生物分类学、酶学解聚与多组学功能分析,提出连接微生物特性与塑料降解四阶段的系统框架,并讨论生物强化策略与转化瓶颈 | 降解度量指标的变异性和可比性不足,实验室结果向实际应用的转化受限 | 弥合实验室发现与实用生物降解策略之间的差距,推动微生物塑料修复研究 | 塑料降解微生物及其降解机制 | 微生物学、环境科学 | NA | 多组学分析、酶工程、基因修饰 | NA | 综述数据 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程, 合成微生物群落设计 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |