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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-12 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
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研究论文 | 本研究从本塞姆氏烟草中鉴定内生组成型启动子,并定量表征其转录活性,为植物合成生物学提供CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统鉴定了本塞姆氏烟草的内源组成型启动子库,通过GFP和双荧光素酶报告系统定量测定其转录强度,并在多个异源物种中验证了启动子活性的跨物种保守性 | 启动子在单子叶植物(如玉米)中的活性显著降低,跨物种应用的通用性有限 | 为植物合成生物学提供具有定量定义转录强度的内源组成型启动子,作为CaMV 35S启动子的替代方案 | 本塞姆氏烟草的内源组成型启动子 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因分析、双荧光素酶报告系统、原生质体瞬时表达 | NA | 基因表达数据 | 多个候选启动子,在拟南芥、白菜、辣椒、玉米等物种的原生质体中测试 | NA | 本塞姆氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 42 | 2026-07-12 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
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研究论文 | 该论文报道了下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2,通过删除毒力和非必需基因增强生物安全性,同时保持快速生长和蛋白质表达,并整合多种合成生物学功能用于先进生物制造 | AMAX2在保持高生长速率和蛋白质产量的基础上,通过基因删除显著提升生物安全性,并集成可诱导系统、tRNA补充、基因组规模CRISPRi-seq必需基因鉴定、无DNA微细胞生产、表面展示和蛋白靶向分泌等多功能模块 | 论文未明确讨论AMAX2在长期培养中的遗传稳定性,以及与其他常用底盘(如大肠杆菌)在工业规模生产中的成本效益比较 | 开发一种兼具高性能、生物安全性和多功能性的可编程微生物底盘,用于先进生物制造和生物治疗开发 | 气单胞菌底盘AMAX2及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因删除, 质粒系统, 细胞表面展示, 蛋白质分泌系统 | NA | 基因组数据, 功能实验数据, 生物安全性数据 | 细胞和动物模型(具体数量未在摘要中提供) | CRISPRi-seq, 质粒工程 | 气单胞菌 | 可诱导表达系统, tRNASupplementation系统, SpyCatcher-SpyTag表面展示系统, VI型分泌系统介导的蛋白质转运 | 工业生物技术, 医学 |
| 43 | 2026-07-12 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
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研究论文 | 本研究揭示了肼基乙酸是细菌产生的硝胺——N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径,发现肼基乙酸是其关键前体,并验证了赖氨酸为硝基氮的来源,通过基因簇重建和同位素标记实验确认了合成路线 | 研究未完全阐明硝胺生物合成的全部步骤,且生物合成途径在工业生产中的可持续性尚需进一步开发 | 阐明细菌产生的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 链霉菌属细菌(Streptomyces)及N-硝基甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、生物信息学分析、基因簇重建 | NA | 同位素标记数据、蛋白质组学数据、晶体结构数据 | 使用多种同位素标记前体(L-赖氨酸、甘氨酸、肼基乙酸)进行培养实验,样本数量未明确说明 | NA | 链霉菌属细菌(Streptomyces) | N-硝基甘氨酸的生物合成途径,涉及肼基乙酸的生成及硝胺中间体 | 工业生物技术、能源(含能材料) |
| 44 | 2026-07-09 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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research paper | 本研究报道了通过共递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸(dsNHO)可显著提高莱茵衣藻的基因敲除效率 | 发现非同源寡核苷酸增强(NOE)现象,可将基因敲除效率提高高达100倍,并阐明其通过破坏细胞DSB感知通路将DNA修复从经典的NHEJ转向易错的MMEJ机制 | NOE效应受dsNHO长度、结构和化学修饰的显著影响,且具体机制仍需进一步验证 | 提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑, 非同源寡核苷酸增强(NOE) | NA | NA | 未明确样本数量 | CRISPR-Cas | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 45 | 2026-07-09 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Jun, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 批判性评估溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)的体内追踪策略,强调其临床转化和实施 | 整合了光学、核素、磁共振、超声/光声等多种模态成像及纳米技术、分子报告基因等先进工具,并引入合成生物学、AI、液体活检等新兴策略,提供了患者特异性追踪的规模化方案 | 病毒基因组容量限制、免疫介导清除以及信号穿透深度不足等挑战仍然存在 | 评估溶瘤呼肠孤病毒(尤其Pelareorep)的体内追踪技术,促进临床优化设计和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒(Pelareorep)及其在肿瘤治疗中的体内分布和疗效监测 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光学成像、核素成像、磁共振成像、超声/光声成像、纳米技术、分子报告基因、CRISPR、AI图像分析、液体活检 | NA | 图像 | NA | CRISPR回路、病毒条形码 | 人类细胞 | 合成生物学报告基因回路 | 医学 |
| 46 | 2026-07-09 |
Cotranslational Assembly of Oligomeric Proteins
2026-06, Annual review of biochemistry
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文综述了寡聚蛋白的共翻译组装机制,探讨其与合成、折叠和亚基组装的紧密耦合,以及其在人类疾病、进化意义和合成生物学中的潜力 | 颠覆了寡聚蛋白组装是翻译后随机碰撞的传统观点,系统阐述了共翻译组装作为一种根本不同机制在空间时间协调、层次化组装、结构多样性及进化功能中的创新性影响 | 未提供具体实验数据支持,且共翻译组装在不同蛋白系统中的普遍性和具体调控机制仍需进一步验证 | 阐述共翻译组装的分子机制、细胞需求及功能意义,并讨论其在人类疾病、进化以及合成生物学中的应用潜力 | 寡聚蛋白的共翻译组装过程及其涉及的亚基 | 合成生物学 | 人类疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 重组蛋白生产 |
| 47 | 2026-07-06 |
Riboregulation in bacteria: From simple switches to complex regulatory networks
2026-06-07, Postepy biochemii
DOI:10.18388/tkbrr231
PMID:42400427
|
综述 | 本文综述了细菌中核糖调控从简单开关到复杂调控网络的作用机制和应用 | 系统总结了核糖调控的多层网络特性,包括sRNA结合蛋白和RNA海绵的调控作用,并强调了Hfq-CLASH等现代方法在体内识别这些相互作用的应用 | 未提供具体实验数据或定量分析来支持所述机制 | 阐述细菌核糖调控在适应性中的关键作用及其在合成生物学和抗抗生素耐药性中的应用 | 细菌的核糖调控元件,包括核糖开关、温度传感器、反义RNA和sRNA网络 | 合成生物学 | NA | Hfq-CLASH | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 核糖调控网络,包括开关、传感器和调控回路 | 合成生物学, 医学 |
| 48 | 2026-07-04 |
Toward development of soil-derived Bacillus isolates as lung cancer cytotoxic agents
2026-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100074
PMID:42396176
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研究论文 | 探索土壤来源的芽孢杆菌分离物作为肺癌细胞毒性药物的潜力 | 通过结合环境微生物筛选、代谢物抗癌活性测试和数学模型构建,建立了一种从土壤细菌中发掘肺癌治疗用工程化微生物底盘和分子载体的平台 | 未明确说明,但隐含可能包括所需进一步体内验证及工程化改造的复杂性 | 开发土壤来源的芽孢杆菌分离物作为肺癌细胞毒性药物 | 从纽约曼哈顿公园土壤中收集和表征的芽孢杆菌分离物及其分泌代谢物 | 微生物组学、合成生物学、癌症治疗 | 肺癌 | 代谢物分析、共培养实验、数学模型 | 常微分方程模型 | 细胞生长数据、代谢物毒性数据 | 来自25个城市公园的土壤样本 | NA | 芽孢杆菌分离物 | NA | 医学 |
| 49 | 2026-07-04 |
Sulfolobales: Acidothermophilic archaea as models for biology and biotechnological applications
2026-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100262
PMID:42396182
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review | 综述了酸热古菌目Sulfolobales的生物学研究进展及其在生物技术中的应用 | 强调Sulfolobales作为古菌生物学、真核特征起源研究模型以及合成生物学平台的独特优势,并聚焦其专性异养菌在生物质降解中的应用 | 未涵盖所有Sulfolobales物种的详细代谢机制或大规模工业应用案例 | 总结Sulfolobales生物学研究进展并探讨其在生物技术中的应用潜力 | 酸热古菌目Sulfolobales | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | Sulfolobales | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 50 | 2026-07-02 |
Tumor-Mimic Artificial Cell Integrated With In Situ Synthetic Biology for Testing of Antitumor Drug Sensitivity
2026-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240134
PMID:42382689
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研究论文 | 通过结合细胞膜仿生技术和原位合成生物学,构建了一种用于评估多种抗肿瘤药物疗效的类肿瘤人工细胞 | 首次将人工细胞技术与原位合成生物学相结合,设计了一种核糖酶可在细胞内催化分子信标裂解产生荧光信号,直接指示药物疗效,并利用3D编码人工细胞分类细胞特异性特征 | 未明确提及,但可能涉及人工细胞与真实生物系统之间的差异以及临床转化的挑战 | 开发一种有效且低成本的人工细胞平台,用于抗肿瘤药物的敏感性测试和药效分析 | 类肿瘤人工细胞,携带药物抗性蛋白的细胞膜,以及3D编码人工细胞 | 合成生物学,生物医学工程 | 肿瘤 | 细胞膜仿生技术,原位合成生物学,荧光成像 | NA | 荧光信号,细胞特征数据 | NA | 人工细胞技术 | NA | 核糖酶催化分子信标裂解的合成生物回路 | 医学 |
| 51 | 2026-07-01 |
Spontaneous Non-Catalyzed Molecular Reactions and Interactions in the Human Body: Biomedical Implications
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524277
PMID:42183827
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综述 | 综述了人体内自发非催化分子反应与相互作用及其生物医学应用 | 系统总结生理条件下无酶介导的自发非催化反应,并探讨其在疾病诊断、药物递送和再生工程中的新兴机会 | 未提及具体实验验证或定量分析,可能缺乏对反应动力学和选择性的深入讨论 | 探讨非催化分子反应在生物医学中的潜在应用 | 人体内的小分子、蛋白质、细胞等组分间的非催化反应与相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 免疫工程 |
| 52 | 2026-07-01 |
Genome mining and phylogenomics reveal diverse biosynthetic gene clusters in desert Actinobacteria
2026-Jun, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001764
PMID:42376834
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研究论文 | 通过基因组挖掘和系统发育基因组学方法,研究从埃及西奈沙漠分离的放线菌中多样化的生物合成基因簇 | 首次系统分析西奈沙漠放线菌的基因组,发现多个与已知参考序列相似度低的未知生物合成基因簇,揭示其作为新型抗菌和抗肿瘤代谢物来源的潜力 | 仅为基因组分析,缺乏实验验证和化学表征 | 探索沙漠放线菌中新型生物活性化合物的生物合成潜力 | 从西奈沙漠分离的放线菌菌株 | 天然产物发现 | NA | 基因组测序, 系统发育基因组学, 基因组挖掘 | NA | 基因组序列 | 多个来自西奈沙漠的放线菌菌株 | NA | 放线菌 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 53 | 2026-06-30 |
Gnotobiology: from 19th-century global foundations to 21st-century omics - six decades of Czech contribution to microbiome research
2026-Jun-29, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01536-9
PMID:42371248
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综述 | 本文回顾了捷克六十年来的无菌生物学研究,从1962年启动项目到21世纪与组学技术结合,探讨了无菌动物模型在微生物组研究中的关键作用 | 首次系统梳理了捷克无菌生物学的发展历程及其对全球微生物组研究的贡献,特别是结合高-throughput测序和代谢组学等技术,将研究重点从微生物组编目转向宿主-微生物相互作用的机制解析 | 未提及 | 追溯捷克无菌生物学六十年发展,并探讨其与组学技术整合后对宿主-微生物相互作用研究的影响 | 无菌猪、大鼠、兔和小鼠等动物模型,以及人类代谢、免疫介导、肿瘤和神经精神疾病的模型 | 微生物组研究 | 免疫疾病、代谢疾病、肿瘤、神经精神疾病 | 高通量测序、代谢组学、组学技术 | NA | 微生物组数据、代谢组数据 | 未提及 | NA | 猪、大鼠、兔、小鼠 | NA | 医学、个性化医疗、合成生物学 |
| 54 | 2026-06-28 |
Enzyme fusion-based enhancement of ene-reductase activity for chiral α-substituted carboxylic acid production
2026-Jun-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153204
PMID:42349580
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研究论文 | 通过酶融合策略构建烯还原酶与醛脱氢酶的融合酶,提高手性α-取代羧酸的生物合成效率 | 首次采用刚性连结肽(EAAAK)₂将烯还原酶与醛脱氢酶进行正向融合,显著提升底物还原活性及级联催化的产率 | 仅针对一种底物和融合配置进行了验证,未探索不同连接肽和酶组合在其他底物合成中的普适性 | 优化多酶级联反应动力学不平衡,实现高效生物合成手性α-取代羧酸 | 烯还原酶与醛脱氢酶融合蛋白构建及其在α-甲基氢肉桂酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 融合蛋白构建、分子动力学模拟、动力学分析 | NA | 序列数据、动力学参数、模拟结果 | 未明确说明样本数量,但涉及多种融合酶变体及自由酶的比较 | 酶融合技术、连接肽设计 | 大肠杆菌 | 多酶级联反应(烯还原酶-醛脱氢酶融合) | 制药、农业 |
| 55 | 2026-06-28 |
Editorial for the Special Issue "Advances in Metabolic Engineering of Industrial Microorganisms"
2026-Jun-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061368
PMID:42354992
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社论 | 该社论总结了工业微生物代谢工程领域的最新进展,涵盖合成生物学、CRISPR基因组编辑、系统生物学和高通量组学技术的融合 | 强调了合成生物学与CRISPR技术的结合对代谢工程的变革性推动作用,但未提出具体创新点 | 作为社论,内容为概述性总结,缺乏具体研究细节和实验验证 | 回顾和展望工业微生物代谢工程领域的技术进展与应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑, 高通量组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢途径 | 工业生物技术 |
| 56 | 2026-06-28 |
Microbial α-L-Rhamnosidases: Regioselective Biocatalysts for Flavonoid Biotransformation and Nutraceutical Applications
2026-Jun-16, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48060625
PMID:42353629
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综述 | 本文概述了微生物α-L-鼠李糖苷酶在食品生物技术和营养保健品生产中的选择性催化作用 | 首次系统区分α-(1→2)和α-(1→6)连接底物,总结重组酶平台、固定化生物催化剂及宏基因组学、合成生物学和AI辅助蛋白质工程的新机遇 | 未提供实验数据验证,主要依赖文献综述,缺乏对工业应用经济性和规模化挑战的深入分析 | 总结微生物α-L-鼠李糖苷酶的来源、催化机制、底物特异性、结构功能关系及在功能食品和靶向营养保健品中的应用 | 微生物α-L-鼠李糖苷酶及其催化的类黄酮生物转化 | NA | NA | 重组酶平台、固定化生物催化剂、宏基因组学、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 食品, 营养保健品 |
| 57 | 2026-06-26 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
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综述 | 回顾了蘑菇形成型伞菌纲真菌合成生物学的研究进展,并概述了限制可预测基因工程的主要障碍 | 强调了蘑菇生物学特有的工程限制,包括复杂的有性周期、异核现象以及转化和生长过程中的菌株不稳定性,并提出了该领域优先发展方向 | 尚未全面解决基因表达瓶颈,如启动子和终止子表征不足、基因组致密性导致的基因整合挑战以及内含子和特定序列基序的影响 | 推动伞菌纲真菌作为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成型伞菌纲真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 伞菌纲真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 真菌生物学 |
| 58 | 2026-06-26 |
[Research progress in inducible expression regulation systems in photosynthetic cyanobacteria]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260030
PMID:42343792
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综述 | 综述了光合蓝细菌中诱导型表达调控系统的研究进展 | 系统比较了化学诱导系统和光遗传控制系统在多种蓝细菌菌株中的适用性及调控特性,并展望了通过合成生物学构建新型诱导表达系统、模块化调控电路和环境响应表达系统的未来趋势 | 未提供实验数据验证各系统性能差异的定量比较 | 总结并分析蓝细菌中诱导型基因表达调控系统的研究现状,为构建更高效、可控且环境友好的基因表达调控系统提供参考 | 光合蓝细菌中的诱导型表达调控系统,包括化学诱导系统和光遗传控制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 光合蓝细菌 | 诱导型表达系统、光遗传控制系统、模块化调控电路、环境响应表达系统 | 绿色生物制造 |
| 59 | 2026-06-26 |
[Advances in genome editing technologies in Komagataella phaffii and their applications in biomanufacturing]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250908
PMID:42343789
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综述 | 系统总结了Komagataella phaffii中基因组编辑技术的发展历程及其在生物制造中的应用 | 全面梳理了从传统重组方法到下一代精确编辑工具的演变,重点介绍了CRISPR/Cas系统的最新进展、优化策略和工程实践 | 未明确提及具体局限性,但指出了提高编辑效率、快速组装复杂代谢途径和加速工业转化等方面的挑战与机遇 | 为Komagataella phaffii的理性工程改造及其在合成生物学和生物制造中的广泛应用提供参考 | Komagataella phaffii | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas,基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术,生物制造 |
| 60 | 2026-06-26 |
[Neo-chemical industry: a new perspective for understanding biomanufacturing industry]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260154
PMID:42343785
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评论文章 | 引入‘新化工’视角重新理解生物制造产业,分析其工业化挑战与战略路径 | 将生物制造重新定义为合成生物学驱动的化工产业范式重构,构建了涵盖原料、工艺和技术的三维分析框架 | 基于单一案例(l-丙氨酸厌氧发酵)进行理论推导,缺乏对不同类型生物制造过程的系统验证 | 澄清生物制造产业性质,提供理解其本质和价值的直观框架 | 生物制造产业及其工业化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 材料 |