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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-16 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
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综述 | 综述了用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 整合了化学全合成、生物正交化学、活细胞成像等多种跨学科方法,为脂质功能研究和治疗创新提供新路径 | 仅总结现有方法,未提出新的实验设计或突破性技术 | 探索甘油磷脂在细胞中的复杂功能及代谢机制 | 甘油磷脂及其类似物 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 62 | 2026-06-16 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases driving triterpene scaffold diversification for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 本研究通过染色体级别基因组组装和功能分析,揭示了川楝中氧化角鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成三萜骨架多样化的分子机制 | 首次发现川楝中OSC基因家族通过新功能化产生11种不同三萜骨架,并鉴定出4个关键氨基酸残基替换足以切换产物特异性,揭示了正向选择驱动代谢创新的分子基础 | 研究主要基于瞬时表达和系统发育分析,尚需更全面的体内功能验证和晶体结构解析,且替代途径的生理意义仍需进一步阐明 | 阐明植物中三萜骨架多样化的适应性进化分子机制 | 川楝(Melia toosendan)中的氧化角鲨烯环化酶基因家族 | 生物信息学 | NA | 染色体级别基因组组装, NGS, 瞬时表达 | NA | 基因组序列, 代谢物谱 | 1个川楝品种的基因组和14个OSC基因 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 合成生物学,农业(植物源杀虫剂) |
| 63 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
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研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 64 | 2026-06-16 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Jun-15, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了利用自然遗传变异改善光合作用的策略,以支持下一代作物育种 | 整合自然遗传变异与合成生物学和光合遗传工程的互补方法,提出优化光合作用以提升作物产量和抗逆性的战略框架 | 未详细讨论具体田间验证结果和长期环境适应性挑战 | 探索通过自然变异和现代生物技术优化光合作用,提升作物产量潜力和气候适应性的策略 | 作物光合性状的自然遗传变异及其分子调控机制 | 农业生物技术 | NA | 光合遗传工程、合成生物学 | NA | 综述文献数据 | NA | 合成生物学 | 作物 | 光合代谢通路优化 | 农业 |
| 65 | 2026-06-16 |
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76102
PMID:42294635
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研究论文 | 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 | 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 | 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 | 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 | 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 | 合成生物学 | NA | 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 | NA | 转录组数据 | NA | 热激活基因扩增系统、基因沉默 | Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 | 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 | 工业生物技术, 医药 |
| 66 | 2026-06-16 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Jun-14, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
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综述 | 探讨将开菲尔中乳酸菌转化为工程活生物治疗药物,用于结直肠癌的靶向瘤内免疫治疗 | 提出从发酵到药物的流程,利用合成生物学改造开菲尔乳酸菌,使其能够靶向肿瘤缺氧区域并原位释放纳米抗体和细胞因子,将冷肿瘤转化为热肿瘤以增强免疫治疗 | 面临生物遏制、生产和监管等转化挑战 | 开发工程化活生物治疗药物用于结直肠癌的靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳酸菌菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 乳酸菌(开菲尔来源) | 靶向肿瘤缺氧区域的生物传感器及纳米抗体和细胞因子释放电路 | 医学 |
| 67 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
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研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台,用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略,并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵,以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%,可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置,实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |
| 68 | 2026-06-16 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Jun-13, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 基于CiteSpace的文献计量分析,系统回顾了2000至2024年间植物生理活性物质研究的全球趋势与热点 | 首次通过定量可视化分析揭示了植物生理活性物质研究从基础分离到机制研究、功能性食品及纳米递送系统的阶段性转变,并识别了新兴热点如植物免疫调控、肠道微生物互作和分子动力学模拟 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能遗漏其他语种或非索引文献,且分析周期截至2024年,后续研究趋势未覆盖 | 系统梳理植物生理活性物质研究的全球趋势、热点演变及未来方向,指导跨学科合作与可持续开发利用 | 植物来源的生理活性物质(如植物化合物、抗氧化剂等) | 文献计量学 | NA | 文献计量分析,CiteSpace可视化 | NA | 文献数据(文本) | 8096篇文献(2000-2024年Web of Science核心合集) | NA | NA | NA | 医学,农业,工业生物技术,功能性食品 |
| 69 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
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综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 70 | 2026-06-16 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Jun-11, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究利用计算生物学方法鉴定并表征了源自蟑螂肠道的戊糖片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在戊糖片球菌中鉴定出通过水平基因转移获得且独立存在的bphC基因同源物,并通过分子对接和动力学模拟验证其功能潜力,同时发现其基因组中含有IS30家族插入序列,为合成生物学改造提供了机会 | 该菌株缺乏独立的PCB矿化能力,且预测的PPBPHCIII酶与功能验证的1EIR复合物相比结合亲和力较弱,主要是因为氢键形成较少 | 鉴定和表征戊糖片球菌中潜在的联苯降解能力,以开发用于PCB解毒的益生菌饲料添加剂 | 蟑螂肠道来源的戊糖片球菌QS-GN03_1菌株及其潜在联苯降解基因 | 机器学习 | NA | 全基因组测序,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组序列,蛋白质结构数据 | 一个戊糖片球菌菌株 | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 戊糖片球菌 | Bph操纵子整合电路 | 农业,环境,食品 |
| 71 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
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研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 72 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关,实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关,通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性,并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性,且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关,用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关,包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 73 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术,通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增,通过多序列检测显著减少假阳性,并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及,但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器,适用于即时检测场景 | 核酸序列(DNA和RNA)的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 74 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性,并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节,仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 75 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,显著提升其催化活性,并构建了最小功能化突变体s149FvPolX,拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化,缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶,克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 76 | 2026-06-14 |
Exploiting conformational changes in a caffeine aptamer to engineer synthetic RNA devices
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag584
PMID:42273912
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研究论文 | 通过选择咖啡因结合适体并工程改造为合成RNA装置,克服了传统筛选方法在构象转换适体上的局限性 | 采用RNA Capture-SELEX和体内筛选选择了咖啡因结合适体,并通过新型光流控筛选和直接嫁接方法,实现了该适体在核糖开关、核酶和荧光适体传感器中的模块化整合 | 在哺乳动物细胞中,核酶筛选仍面临通量和序列-功能挑战 | 拓展构象转换适体的可用性,推动RNA装置在合成生物学中的应用 | 咖啡因结合适体及其在RNA装置中的模块化整合 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 体内筛选, 光流控筛选 | NA | RNA序列 | 多个咖啡因结合适体候选分子 | NA | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞 | 核糖开关, 核酶, 荧光iSpinach适体传感器 | 合成生物学, 分子传感, 细胞调控 |
| 77 | 2026-06-14 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
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研究论文 | 开发了一个结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型的深度学习框架,用于提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心回避密码子优化策略,通过深度学习引导的反向翻译显著提升异源蛋白的可溶性表达 | NA | 设计DNA序列以保证高可溶性表达,并理解DNA序列与蛋白质表达之间的关系 | α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶两种工业酶 | 机器学习 | NA | 深度学习、基因表达预测 | SCG模型、GELP模型 | 基因组数据、基因表达数据 | 两种酶各进行多次实验(αGP 3次,IA 4次) | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 78 | 2026-06-13 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Jun-10, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
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综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器用于生物催化的研究进展 | 提出了利用自组装多酶系统(细菌区室和生物凝聚体)作为新一代生物催化剂,促进可持续有机合成与合成生物学的交叉融合 | 仅概述了现有研究,未提供实验数据或定量比较不同系统的性能 | 探索工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用潜力 | 工程化细菌区室和生物凝聚体等自组装多酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器 | 可持续化学, 有机合成 |
| 79 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进,以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用,并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制,并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 80 | 2026-06-13 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
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研究论文 | 通过工程化改造酿酒酵母的过氧化物酶体辅因子系统,实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化过氧化物酶体的辅因子平衡,结合细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略,显著提高α-葎草烯产量 | 未提及在大规模发酵或工业环境下的稳定性和成本效益 | 在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个工程化酵母菌株(LM07, LM27等) | NA | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径靶向过氧化物酶体,过氧化物酶体辅因子系统(乙酰辅酶A供应、NADH可用性、CoA代谢循环),细胞质-过氧化物酶体双区室工程 | 工业生物技术 |