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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-26 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述了转录因子作为第三代核心传感元件在开发低成本、现场快速检测食品污染物技术中的应用 | 提出了近端诱变策略并整合人工智能辅助分析来优化转录因子及其DNA结合位点 | 仍面临优化和实际应用挑战,具体局限性未详细说明 | 总结转录因子在食品安全监测中的传感应用及其工程化进展 | 转录因子及其用于检测食品中小分子和重金属离子的传感器平台 | 机器学习(与合成生物学交叉) | NA | 转录因子工程, 人工辅助分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物系统 | 生物传感器 | 食品安全 |
| 62 | 2026-06-26 |
Bioengineered bacteria in cancer immunotherapy: mechanistic advances, therapeutic strategies and clinical potential
2026-Jun-24, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05030-1
PMID:42340392
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综述 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的机制进展、治疗策略和临床潜力 | 系统地总结了合成生物学、基因工程和物理化学修饰手段设计可编程细菌系统的最新进展,并阐述了化学、物理和生物修饰细菌与多种疗法的多模态协同效应 | 免疫清除、遗传稳定性、毒性风险和肿瘤微环境异质性限制了临床转化 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的进展,为下一代持久个性化活体治疗设计提供见解 | 工程化细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因工程、物理化学修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 细菌 | 群体感应电路、缺氧响应启动子、毒性减退、配体-受体靶向 | 医学 |
| 63 | 2026-06-26 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-06-23, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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review | 综述了微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解 | 整合了微生物分类学、酶解聚和多组学功能分析,提出了连接微生物特性与塑料降解四个关键阶段的框架,并批判性评估了降解指标的稳健性和可比性 | 现有研究碎片化,降解效率、机制和实际应用报告不一致,聚合物特性、实验条件和评估方法的变异性严重阻碍了跨研究比较和实验室向实际应用的转化 | 梳理微生物降解塑料的最新进展,弥合实验室发现与实际生物降解策略之间的差距 | 塑料降解微生物及相关酶 | NA | NA | 多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成微生物联合体 | 环境 |
| 64 | 2026-06-26 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-06-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种可扩展的基于RNA的逻辑和多层细胞编程平台RATEX | 通过整合翻译到转录的转换器与合成RNA调控因子,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,能够利用大型翻译调控因子库和核糖体介导的环境输入感知,实现多输入逻辑处理与信号放大 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍然具有挑战性 | 开发可扩展的遗传电路以实现活细胞中的复杂功能 | RNA调控因子和核糖体介导的传感机制 | 合成生物学 | NA | RNA调控 | NA | NA | NA | RATEX平台 | 活细胞 | 逻辑门(6输入OR逻辑门、混合3输入逻辑门、3输入AND门),信号放大级联 | 合成生物学, 生物技术 |
| 65 | 2026-06-26 |
The Gut Microbiome Dependency Continuum in Drug Discovery: A Unified Pharmacology Framework Linking Clinical Drugs, Natural Products, and Engineered Microbial Therapeutics
2026-Jun-10, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15020043
PMID:42346015
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综述 | 提出肠道微生物组依赖性连续谱框架,整合临床药物、天然产物和工程微生物疗法,揭示微生物组在药理学中的关键作用 | 首次提出四层肠道微生物组依赖性连续谱框架,将微生物组从被动调节剂重新定义为可编程治疗平台,系统整合药物发现中的微生物组依赖性层次 | NA | 构建统一药理学框架,阐述肠道微生物组在药物发现和治疗功能中不同深度依赖性,推动微生物组感知的药物发现和精准工程微生物疗法开发 | 肠道微生物组及其与药物的相互作用(包括粪便微生物移植、微生态制剂、代谢调节药物、天然产物和工程微生物疗法) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 肠道微生物组 | 可编程微生物系统、工程益生菌、微生物组响应药物递送系统、合成微生物群落 | 医学 |
| 66 | 2026-06-26 |
Advances in UDP-Glycosyltransferases from Medicinal Plants: Discovery, Catalytic Mechanism, Engineering and Biosynthetic Application
2026-Jun-10, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060402
PMID:42346382
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综述 | 系统总结了药用植物UDP-糖基转移酶的最新全球研究进展,涵盖发现、催化机制、工程改造及生物合成应用 | 首次系统整合多组学、人工智能辅助基因挖掘与蛋白质工程优化策略,构建了包括体外多酶级联、微生物细胞工厂和植物悬浮细胞培养的全谱生物制造体系框架 | 工业化放大、监管合规和临床转化是核心挑战 | 为药用植物UDP-糖基转移酶的工程应用提供完整技术框架,支持稀有天然治疗性糖苷的绿色规模化生产 | 药用植物UDP-糖基转移酶 | 机器学习 | NA | 多组学, 人工智能, 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物悬浮细胞 | 体外多酶级联、微生物细胞工厂、植物悬浮细胞培养系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 67 | 2026-06-26 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
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综述 | 提出药效微动力学(PMD)框架,用于量化活体药物载体的剂量、暴露与控制 | 首次将药代动力学/药效学(PK/PD)框架扩展到活体药物系统,定义了功能暴露积分、定植效率等新指标,并整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理 | 框架尚处于理论阶段,需大量实验验证;边界条件(如非复制型微生物干预)下经典PK/PD仍适用,PMD的适用范围存在局限 | 建立定量递送科学体系,重新定义活体治疗药物的暴露与控制 | 活体药物载体(如益生菌、工程微生物治疗剂、活体生物治疗产品) | 机器学习 | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 68 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 69 | 2026-06-24 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用,重点关注生物屏障和递送系统的进展 | 系统总结了基于纳米颗粒、外泌体和细胞载体的递送平台如何克服脑肿瘤免疫治疗中细胞因子面临的生物屏障、半衰期短和毒性等挑战 | 缺乏具体的临床试验数据支持,多数讨论仍基于体外和动物模型结果,临床转化前景尚不明确 | 研究常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力和递送策略 | 常见γ链细胞因子(如IL-2、IL-7、IL-15等)以及脑肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 70 | 2026-06-23 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-Jun-22, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
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综述 | 从合成生物学和材料科学角度综述细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 系统总结多孔框架材料封装细胞的合成策略,并整合细胞表面化学与活性评估方法 | 未深入讨论不同框架材料在长期稳定性与免疫原性方面的比较 | 探讨框架材料在合成细胞工程和增强细胞功能中的应用前景与挑战 | 细胞@MOF、细胞@COF、细胞@HOF复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多孔框架封装系统(MOF、COF、HOF) | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 71 | 2026-06-23 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 本研究通过异源生产平台在Streptomyces albidoflavus中生产植物生物刺激素pteridic acids F和H,并显著提高了产量 | 首次建立pteridic acids (PTA)的功能性异源生产平台,结合Cas12a辅助的精确靶向克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程,以及基因组规模代谢模型指导的培养基优化,实现超过20倍的产量提升 | 初始异源表达仅产生可检测的elaophylin而非PTA,且经过启动子工程后PTA产量仍低于定量限 | 建立Pteridic acids (PTA)的异源生产平台并优化产量,以开发植物生长促进剂应对非生物胁迫 | Pteridic acids F和H(植物生长促进聚酮化合物) | 合成生物学 | NA | Cas12a辅助精确靶向克隆(CAPTURE), CRISPR-Cas9, 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus J1074, NBC1270 | PTA生物合成基因簇异源表达系统,包括kasOp*启动子工程 | 农业, 生物技术 |
| 72 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统,以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略,但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展,以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 73 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用,重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具(如CRISPR-Cas系统)从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统(重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽),生物传感器(全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物) | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 74 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性,实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合,效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合,可能存在位置效应,且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术,用于作物改良和合成生物学 | 烟草(Nicotiana benthamiana)和水稻(Oryza sativa) | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织,具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草(Nicotiana benthamiana),水稻(Oryza sativa) | 位点特异性基因整合系统(含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫) | 农业, 合成生物学 |
| 75 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力,提出周质体腔(PPC)作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔(PPC)作为工程化细胞区室的萜类合成潜力,揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证,需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔(PPC)用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔(PPC)、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径(包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达) | 工业生物技术 |
| 76 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能,并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等) | 合成生物学应用(计算、生物传感、人类健康) |
| 77 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器,实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链,通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制,并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及,但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 78 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器,并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统,并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器,用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器,多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 79 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上,实现无需去垢剂的脂质体膜插入,解耦了蛋白质设计与脂质体设计,便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制,但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略,用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像(电子显微镜)、荧光信号(流式细胞术) | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体,具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 80 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略,包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果,主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法,突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |