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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-09 |
Insights into the Fucoidan and Mannitol Biosynthetic Pathways in the Brown Seaweed Padina Tetrastromatica Based on Draft Genome and Transcriptome Analysis
2026-Jun-04, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10649-8
PMID:42240916
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研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析揭示了褐藻Padina tetrastromatica中岩藻多糖和甘露醇生物合成途径 | 首次对P. tetrastromatica进行互补基因组和转录组组装,鉴定了参与岩藻多糖和甘露醇生物合成的关键酶编码基因,为褐藻功能性糖类代谢提供了分子框架 | 基因组覆盖度不足20%,限制了完整基因组的获取 | 阐明褐藻中岩藻多糖和甘露醇的生物合成分子机制,为未来代谢工程和合成生物学应用奠定基础 | 褐藻Padina tetrastromatica | 生物信息学 | NA | NGS, 转录组测序, 基因组组装 | NA | 基因组序列, 转录本序列 | 单个褐藻样本(Padina tetrastromatica) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 102 | 2026-06-09 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Jun, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 探讨生物刺激素与组学驱动创新在提升植物非生物胁迫适应性中的作用 | 整合生物刺激素技术、小RNA、肽和激素作为新兴分子调节因子,以及AI驱动的早期预警系统,为合理设计生物刺激素提供路线图 | 未明确讨论生物刺激素在实际应用中的规模化挑战或潜在生态影响 | 阐明生物刺激素增强植物非生物胁迫耐受性的机制,并构建气候适应性农业的路线图 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等胁迫的响应 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物刺激素代谢途径设计 | 农业 |
| 103 | 2026-06-09 |
A yeast-based platform for etoposide production via yatein bioconversion
2026-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2026.e00280
PMID:42255528
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研究论文 | 建立基于酵母的依托泊苷生产平台,通过亚铁素生物转化实现可持续生产 | 首次在酵母中重构完整的亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源途径,结合途径重构、基因拷贝数优化和辅酶匹配性改造,并成功将生物生产与下游半合成转化衔接 | 依赖植物资源提供前体亚铁素,且酵母生产效率和规模化仍需进一步优化 | 开发依托泊苷中间体的可持续生物制造路径,替代传统植物提取方法 | 酿酒酵母细胞工厂、鬼臼类植物中的亚铁素前体 | 合成生物学 | 固体肿瘤、血液恶性肿瘤 | 途径重构、基因拷贝数优化、辅酶匹配性改造、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源代谢途径 | 医药 |
| 104 | 2026-06-08 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Jun-06, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
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综述 | 探讨利用自然界中其他生物操控植物代谢和发展的机制,为植物合成生物学提供新型工程策略 | 超越传统基因工程,从细菌、真菌和昆虫等生物操控植物代谢的自然机制中获取灵感,拓展植物工程的边界 | 未提及具体实验验证或技术局限性 | 通过研究自然界中生物操控植物的机制,为新型植物代谢工程方法提供思路 | 植物代谢系统及自然界的操控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 代谢通路操控 | 农业, 工业生物技术 |
| 105 | 2026-06-08 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jun-06, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 本文综述了人体微生物组作为新型生物活性天然产物来源的研究进展,涵盖其结构、生物活性及生物合成见解 | 系统总结了人体微生物组在不同解剖部位产生的天然产物多样性及其与宿主共进化关系,并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学方法,加速了生物合成基因簇和代谢物的发现 | 未明确提及具体研究限制,但综述性质决定了可能缺乏对特定代谢物深入的实验验证 | 概述人体微生物组来源的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性,并讨论其药物开发与人类健康的应用潜力 | 人体微生物组(包括肠道、口腔、皮肤、阴道等部位的微生物)及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 单细胞基因组学, 合成生物学, 整合组学 | NA | NA | NA | NA | 人体微生物组(肠道、口腔、皮肤、阴道等) | NA | 医学, 药物开发 |
| 106 | 2026-06-08 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
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研究论文 | 描述了一种基于合成Notch的受体(SNIPR),能检测PD-L1并触发巨噬细胞的可编程吞噬程序 | 将PD-L1从治疗终点靶点重新定义为可编程输入信号,实现了配体响应式巨噬细胞行为控制 | 目前仅在体外验证了THP-1来源巨噬细胞对SKOV-3卵巢癌细胞的吞噬增强效应 | 设计合成受体实现巨噬细胞对免疫调节配体的感知和条件性激活 | PD-L1配体及THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成Notch受体工程 | NA | NA | 体外细胞实验,涉及SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1巨噬细胞 | 合成生物学受体工程 | 人类细胞(THP-1单核细胞) | PD-L1感应合成Notch受体(SNIPR)电路,调控荧光报告基因或CV1-Fc效应器表达 | 医学 |
| 107 | 2026-06-08 |
A deep learning multi-attention Bi-GRU framework for kcat prediction with segmentation-based insights
2026-Jun-01, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110915
PMID:42250496
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研究论文 | 提出一种基于深度学习多注意力机制的双向门控循环单元框架KcatNeuroCortex,用于预测酶的催化效率kcat值 | 通过分割策略捕捉局部功能基序,并结合多注意力机制整合长程相互作用,实现可解释性和预测精度的提升,相比DLKcat将R²提高57% | 未明确提及模型的泛化能力验证或对极端序列条件的测试 | 开发可解释且准确的酶催化效率预测工具,支持代谢工程和合成生物学研究 | 酶的催化效率预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 双向门控循环单元(Bi-GRU)结合多注意力机制 | 酶序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 代谢工程, 合成生物学 |
| 108 | 2026-06-07 |
Microbial innovations for climate-resilient agriculture: mechanisms, applications, and emerging technologies
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05031-8
PMID:42250135
|
综述 | 综述微生物创新技术在气候适应型农业中的应用机制、进展及新兴技术 | 系统整合微生物组工程、合成生物学与人工智能工具,提出精准农业微生物干预策略 | 微生物技术因技术、生态和社会经济障碍尚未大规模推广,实际应用效果受环境异质性影响 | 探讨微生物解决方案在气候适应型农业中的潜力及规模化路径 | 土壤微生物、植物微生物组、微生物菌剂(包括菌根真菌、生物肥料、生物农药) | 机器学习 | NA | 宏基因组学、微生物组工程、合成生物学 | 机器学习 | 文本 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | 土壤微生物、植物微生物组 | 微生物传感器、代谢途径工程 | 农业 |
| 109 | 2026-06-07 |
Automated, modular assembly of reconstituted cell-free systems from in vitro-produced components
2026-Jun-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.002
PMID:42248716
|
研究论文 | 开发了一种基于体外生产组分的模块化无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX,通过自动化液体处理实现快速组装 | 首次实现将34种翻译因子和分裂T7 RNA聚合酶分别体外合成并自动化组装成无细胞系统,大幅降低成本并提高产量 | 目前仅测试了有限数量的翻译因子和RNA聚合酶组合,系统对复杂蛋白表达的支持能力仍需验证 | 构建一种低成本、可定制且可扩展的无细胞蛋白合成平台,以推动合成生物学应用 | 无细胞蛋白合成系统i-POPFLEX及其组成因子 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白合成、自动化液体处理 | NA | 蛋白产量数据、成本分析数据 | 无具体样本数量,涉及34种翻译因子和T7 RNA聚合酶的体外合成与组装 | 自动化液体处理系统 | 大肠杆菌(用于体外合成组分) | 无细胞蛋白表达系统(模块化组装) | 生物制造、合成生物学 |
| 110 | 2026-06-07 |
Programmable Nucleic Acid Sensing in Human Cells Using Circularizable ssDNA
2026-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73990-5
PMID:42248894
|
研究论文 | 开发了一种名为SONAR的平台,利用可环化的单链DNA传感器在人类细胞中检测目标DNA和RNA序列,并触发可控的基因表达 | 首次利用可环化单链DNA结合细胞连接酶实现核酸传感与基因表达调控的通用平台 | 未提及具体限制 | 开发一种可编程的核酸传感技术,实现活细胞中核酸信号检测和基因表达调控 | 人类细胞中的外源和内源核酸(DNA和RNA) | 合成生物学 | NA | SONAR、反义寡核苷酸(ASO)、逆转录、环化单链DNA | NA | NA | 未提及具体样本数量 | NA | 人类细胞 | 核酸传感-基因表达回路(通过环化ssDNA传感器检测核酸并驱动基因表达) | 医学、诊断、治疗、合成生物学 |
| 111 | 2026-06-07 |
Synthetic Biology for Next-Generation Lactic Acid Bacteria: Engineering the Future of Food
2026-Jun-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00333
PMID:42183823
|
综述 | 回顾乳酸菌在食品工业中的传统应用与当前限制,重点介绍合成生物学驱动的基因编辑、代谢工程和基因回路等策略,以精确设计和扩展乳酸菌功能 | 系统阐述了利用合成生物学工具(如基因编辑、定向进化)优化乳酸菌基因表达效率和代谢通路的创新方法,并展望其在个性化食品开发中的应用前景 | 当前乳酸菌菌株仍面临质粒不稳定、基因表达效率低和代谢通量调控复杂等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨如何通过合成生物学策略改进乳酸菌以推动下一代发酵食品发展 | 乳酸菌 | NA | NA | 基因编辑、代谢工程、合成基因回路、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 乳酸菌 | 代谢通路、基因回路 | 食品 |
| 112 | 2026-06-06 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过自下而上的方法阐明胚胎发育的一般原理和因果机制 | 强调合成系统虽简化但能测试发育潜力极限、厘清因果关系并为预测模型提供依据 | 未明确讨论合成系统与自然系统的差异及简化带来的潜在偏差 | 理解多细胞组织如何从细胞间相互作用中涌现 | 合成生物学重建的发育过程(干细胞与合成生物学重建的类胚胎系统) | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因工程、成像技术、计算建模 | NA | NA | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学、发育生物学研究 |
| 113 | 2026-06-06 |
Living buildings with living electronics: towards biologically intelligent biohybrids
2026-Jun-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.015
PMID:42242980
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观点文章 | 探讨将电活性生物膜作为生物智能组件融入建筑,实现从实验室原型到集成架构的转型 | 提出将电活性生物膜编程为生物晶体管和逻辑处理器等生物智能组件,而非简单生物催化剂,实现建筑功能化 | 未明确提及局限,可能涉及从实验室原型到实际建筑集成的技术挑战和规模化问题 | 规划电活性生物膜混合生物-人工系统从实验室原型向分布式资源回收集成架构的转型路线 | 电活性生物膜及其在建筑中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 电活性生物膜 | 生物晶体管、逻辑处理器 | 建筑、环境、工业生物技术 |
| 114 | 2026-06-06 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Jun, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在遗传编码中同时引入多种非规范氨基酸的研究进展 | 介绍了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子库实现多种非规范氨基酸同时编码的突破性技术,特别是哺乳动物系统中稀有密码子重新编码与终止密码子抑制的整合实现了五种不同非规范氨基酸的遗传编码 | 未明确阐述当前技术的局限性 | 总结在遗传编码中同时编码多种不同非规范氨基酸的变革性进展 | 多种非规范氨基酸及其遗传编码系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码, 非规范氨基酸(ncAA)引入, 密码子重新编码, 终止密码子抑制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医药, 合成生物学 |
| 115 | 2026-06-06 |
Antimicrobial discovery from underexplored environments: unlocking specialized metabolism
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102745
PMID:41880737
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综述 | 探讨从未充分探索环境中发现抗生素的新策略,重点介绍先进培养技术、多组学、合成生物学和人工智能如何解锁隐秘的微生物代谢途径以应对抗生素耐药性危机 | 整合生态学、组学、合成生物学和人工智能等新兴方向,覆盖从稀有微生物群落到古菌及古代蛋白质组挖掘的跨维度创新方法 | 未具体讨论这些新策略在实际应用中的可扩展性、成本效益及潜在生态环境影响 | 总结和推进从新环境中发现抗生素的研究方向,填补抗生素发现创新缺口 | 常规土壤微生物以外的未被充分探索的微生物资源(稀有分类群、古菌、未培养微生物、古代蛋白质组) | 机器学习 | 抗微生物耐药性相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 116 | 2026-06-05 |
Emergent bioengineering
2026-Jun-03, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
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研究论文 | 探讨利用合成生物学改造生态系统功能特征以增强其韧性的新兴生物工程方法 | 提出从经典工程向新兴工程的范式转变,强调适应性、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计基础 | 生物安全和控制方面的进展主要集中在细胞尺度,生态系统层面的干预持续性和功能维持尚未解决 | 评估合成生物学在应对全球气候变化和生物多样性丧失中的潜力,并讨论从可控干预到生态功能持久性的转变挑战 | 现有生态系统及其中微生物群落的功能特征 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 117 | 2026-06-05 |
Programmable, multiplexed and orthogonal gene control in bacteria with attenuated Cas13d systems
2026-Jun-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03160-x
PMID:42230991
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研究论文 | 提出一种通过蛋白质工程策略生成减毒Cas13d变体的方法,实现细菌中可编程、多重且正交的基因调控 | 通过定向截短Cas13d柔性区域生成具有可调RNase活性的减毒变体,引入CRISPR RNA间隔区5'端近端错配实现翻译抑制、多顺反子mRNA降解和IF3融合翻译级CRISPR激活的功能切换 | 未详细说明该策略在其他细菌宿主中的通用性及长期稳定性评估 | 开发适用于细菌的RNA调控工具包,实现可编程、多重和正交的基因控制 | 大肠杆菌中的基因调控及番茄红素生物合成优化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas13d、蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas13d | 大肠杆菌 | 基于减毒Cas13d的RNA调控回路,包括翻译抑制、多顺反子mRNA降解和IF3融合翻译级CRISPR激活 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 118 | 2026-06-05 |
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Jun, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 对植物光呼吸旁路的设计与工程化进行综述,分为三种主要类型并分析其机制和应用 | 首次将光呼吸旁路系统性地分为碳释放型、碳中性和碳正性三类,并强调通过重编程乙醇酸代谢提高光合效率的潜力 | 未提供具体的实验数据或定量比较各种旁路的实际效率,且主要基于模型植物和作物,实际应用效果需进一步验证 | 总结当前抑制C3植物光呼吸的遗传策略,指导未来光呼吸旁路的优化与合理设计 | C3植物中的光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光呼吸旁路(包括碳释放型、碳中性型和碳正性型) | 农业 |
| 119 | 2026-06-05 |
Nanomedicine carrier-based combined antitumor strategy integrating phototherapy and immunotherapy
2026-Jun, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2026.2671715
PMID:42153947
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综述 | 系统分析纳米载体介导的光疗与免疫疗法联合抗肿瘤策略的原理、机制及最新进展 | 总结了纳米载体在时空协同递送、刺激响应释放以及将“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤方面的创新应用,并探讨了多响应纳米平台、仿生设计和克服缺氧策略等新兴趋势 | 临床转化仍面临制造可扩展性、人类肿瘤异质性和最佳治疗排序等挑战 | 分析纳米载体如何实现光疗与免疫疗法的精准时空协同递送,以增强抗肿瘤免疫反应 | 纳米药物载体、光治疗剂、免疫检查点抑制剂、原位疫苗、免疫调节剂及过继细胞疗法(包括CAR-T细胞) | 纳米医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 120 | 2026-06-04 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-03, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
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综述 | 回顾了蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌合成生物学的研究进展,并指出了限制可预测遗传工程的主要障碍以及未来优先发展方向 | 首次系统总结蘑菇生物学特有的工程约束(如复杂有性周期、异核体特性及转化过程中的菌株不稳定性),并深入分析了基因表达瓶颈(如启动子和终止子表征不足、基因组浓缩导致基因整合困难、内含子和特定序列基序的影响),同时提出了未来优先发展方向包括遗传部件跨物种评估、更先进基因编辑策略、高通量筛选方法及建立统一模型系统 | 未详细讨论具体实验案例或应用效果,主要基于已有文献综述和推理 | 推动蘑菇形成菌纲真菌合成生物学发展,使其成为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9等基因编辑策略 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 机械真菌生物学研究 |