合成生物学相关文章
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当前共找到 167 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
|
研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台，用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略，并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵，以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%，可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置，实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |
| 102 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
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综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势，从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂，推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验，尤其是儿科研究；监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战，探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究，包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病，复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 103 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
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研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台，通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计，将弱适配体（如茶碱或四环素适配体）的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍，实现超过一个数量级的改进，并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性，可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台，扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路，增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 104 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关，实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关，通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性，并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性，且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关，用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关，包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术，通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增，通过多序列检测显著减少假阳性，并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及，但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器，适用于即时检测场景 | 核酸序列（DNA和RNA）的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 106 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性，并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节，仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 107 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，显著提升其催化活性，并构建了最小功能化突变体s149FvPolX，拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化，缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶，克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 108 | 2026-06-14 |
Exploiting conformational changes in a caffeine aptamer to engineer synthetic RNA devices
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag584
PMID:42273912
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研究论文 | 通过选择咖啡因结合适体并工程改造为合成RNA装置，克服了传统筛选方法在构象转换适体上的局限性 | 采用RNA Capture-SELEX和体内筛选选择了咖啡因结合适体，并通过新型光流控筛选和直接嫁接方法，实现了该适体在核糖开关、核酶和荧光适体传感器中的模块化整合 | 在哺乳动物细胞中，核酶筛选仍面临通量和序列-功能挑战 | 拓展构象转换适体的可用性，推动RNA装置在合成生物学中的应用 | 咖啡因结合适体及其在RNA装置中的模块化整合 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 体内筛选, 光流控筛选 | NA | RNA序列 | 多个咖啡因结合适体候选分子 | NA | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞 | 核糖开关, 核酶, 荧光iSpinach适体传感器 | 合成生物学, 分子传感, 细胞调控 |
| 109 | 2026-06-14 |
Deep Learning-Guided Reverse Translation Enhances Soluble Expression of Recombinant Proteins in Escherichia coli
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27115131
PMID:42278656
|
研究论文 | 开发了一个结合同义密码子生成模型和基因表达水平预测模型的深度学习框架，用于提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达 | 提出了一种核心回避密码子优化策略，通过深度学习引导的反向翻译显著提升异源蛋白的可溶性表达 | NA | 设计DNA序列以保证高可溶性表达，并理解DNA序列与蛋白质表达之间的关系 | α-葡聚糖磷酸化酶和异淀粉酶两种工业酶 | 机器学习 | NA | 深度学习、基因表达预测 | SCG模型、GELP模型 | 基因组数据、基因表达数据 | 两种酶各进行多次实验（αGP 3次，IA 4次） | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 110 | 2026-06-13 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Jun-10, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
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综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器用于生物催化的研究进展 | 提出了利用自组装多酶系统（细菌区室和生物凝聚体）作为新一代生物催化剂，促进可持续有机合成与合成生物学的交叉融合 | 仅概述了现有研究，未提供实验数据或定量比较不同系统的性能 | 探索工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用潜力 | 工程化细菌区室和生物凝聚体等自组装多酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器 | 可持续化学, 有机合成 |
| 111 | 2026-06-13 |
Recent developments in intein-mediated protein splicing and their applications in bioengineering
2026-Jun-09, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
|
综述 | 综述内含子介导的蛋白质剪接最新进展及其在生物工程中的应用 | 系统总结了内含子在结构多样性、催化机制和可控性方面的工程化改进，以及条件型内含子在合成生物学中的新兴应用，并指出了计算设计、高通量筛选和人工智能整合的未来方向 | 仍存在剪接不完全、外显子兼容性问题以及上下文依赖效率等限制其广泛应用的挑战 | 全面概述内含子生物学、分类和机制，并讨论其在生物技术和生物医学中的应用进展、挑战与未来机遇 | 内含子及其工程化变体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 内含子工程改造 | NA | 条件型内含子、蛋白质剪接系统 | 生物技术、生物医学 |
| 112 | 2026-06-13 |
Small but Mighty: The Surprising Metabolic Range of a Bacterial Microcompartment
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.05.730297
PMID:42282558
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中异源表达丙二醇利用操纵子，研究细菌微区室的代谢多功能性，并展示其在底物利用和生物技术中的应用潜力 | 首次证实异源表达的Pdu细菌微区室具有底物杂泛性，可处理C2至C5的二醇和三醇，并通过酶工程将底物范围扩展至1,2-戊二醇，为塑料回收和高价值化合物合成提供新途径 | 氧气抑制1,2-丙二醇利用，虽在微氧条件下缓解，但可能限制某些需氧应用；目前主要在模式菌株大肠杆菌中验证，其他宿主适用性未评估 | 研究细菌微区室的代谢多功能性及其在合成生物学中的调控潜力 | 大肠杆菌中异源表达的Pdu细菌微区室 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 分子动力学模拟，染色体整合，同源重组，诱变 | NA | 代谢数据，分子动力学模拟数据 | 单个大肠杆菌工程菌株及多种底物测试 | CRISPR-Cas9，同源重组 | 大肠杆菌 | Pdu细菌微区室代谢模块 | 工业生物技术，塑料回收 |
| 113 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合，提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束，引入嵌入式物理信息神经网络方法，无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设，机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |
| 114 | 2026-06-13 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 综述细胞色素P450酶催化二酮哌嗪生物碱结构多样化的研究进展 | 强调P450酶除羟基化外的催化多样性，包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化，并探讨工程化P450变体在可持续生物合成中的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同P450变体的催化效率 | 总结P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用，并探索合成生物学驱动的创新策略 | 细胞色素P450酶及其催化的二酮哌嗪生物碱 | 合成生物学 | NA | P450酶催化、工程化P450变体 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | 二酮哌嗪生物合成途径 | 药物发现 |
| 115 | 2026-06-11 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-Jun-10, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
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综述 | 探讨基于核酸（特别是DNA纳米孔）构建的合成跨膜纳米孔的最新进展 | 系统总结了DNA纳米孔从亚纳米离子通道到可定制大分子通道的多样化架构，并突出RNA折纸技术用于基因编码纳米孔的独特潜力 | 未具体说明，但综述性质决定其可能缺乏实验验证和定量比较 | 评述核酸基纳米孔的设计原理、膜锚定方法、脂质重排影响及功能动态调控 | 核酸纳米孔（DNA纳米孔及RNA折纸纳米孔） | 分子生物学 | 未涉及 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 单分子传感, 细胞操纵 |
| 116 | 2026-06-11 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的概念及其潜在应用 | 提出将RNA折纸作为可编程支架用于构建仿生细胞骨架网络，利用RNA的共转录折叠、三级相互作用及与细胞机器交互等独特优势 | 体内稳定性和有效递送仍是主要挑战 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础理解并启发未来发展 | RNA折纸纳米管及其在人工细胞骨架中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 纳米管结构，模仿微管和肌动蛋白丝 | 纳米技术, 合成生物学, 医学 |
| 117 | 2026-06-11 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 综述通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展的研究进展 | 系统总结了通过代谢工程在细胞内合成非标准氨基酸以克服传统依赖外源添加限制的创新策略 | 未具体提及局限性，但可推断当前方法可能面临代谢途径效率、宿主兼容性等挑战 | 探讨代谢工程与遗传密码扩展结合在合成生物学中的应用前景 | 遗传密码扩展技术及非标准氨基酸的生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基础研究、应用研究 |
| 118 | 2026-06-11 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 综述利用细菌分泌系统改造共生或益生大肠杆菌，设计活体治疗药物以定向递送治疗蛋白 | 系统比较了不同细菌分泌系统（包括源自病原体的系统）用于工程菌递送治疗性蛋白的优缺点，并以炎症性肠病为例展示了合成生物学在解决治疗递送挑战中的应用 | 未提及具体实验验证或临床转化中的数据，可能停留在概念综述层面 | 探讨通过工程化细菌分泌系统实现治疗蛋白定向递送，克服传统给药方式的系统性副作用 | 共生和益生大肠杆菌及其改造的分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 分泌系统（如源自病原体的分泌装置）与转录调控通路 | 医学 |
| 119 | 2026-06-10 |
Microalgae-Based Semiartificial Photosynthesis: Strategies, Applications, and Future Prospects
2026-Jun-09, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c01166
PMID:42203637
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综述 | 综述微藻基半人工光合作用系统的策略、应用与未来前景 | 通过将活体藻细胞与工程化非生物组件结合，无需体外重建光合作用，系统性地优化光子利用、电子传递、二氧化碳浓度和环境鲁棒性 | 生物-非生物界面的能量耦合、缺乏标准化性能指标、长期稳定性不足以及纳米材料的可持续性问题 | 探讨微藻基半人工光合系统在太阳能燃料生产、生物制造、环境修复和生物混合微机器人等领域的应用及未来发展方向 | 微藻光合作用与半人工光合系统 | 数字生物学 | NA | 半人工光合作用 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 120 | 2026-06-10 |
The impact of fertilization on the health of paddy soil: pathways and prospects for fertility regulation based on microbial communities
2026-Jun-09, Crop health
DOI:10.1007/s44297-026-00078-3
PMID:42262665
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综述 | 本文综述了施肥对水稻土健康的影响，并从微生物群落角度探讨了培育肥力的途径与前景 | 揭示了水稻土厌氧环境下有机质周转缓慢及土壤有机碳稳定的独特机制，并提出了基于合成生物学、材料工程和数据驱动智能决策系统的未来研究方向 | 缺乏对施肥阈值与微生物群落动态关系的定量分析，且未涵盖不同水稻种植系统的实证数据 | 探讨施肥对水稻土肥力和微生物群落的影响，以及通过微生物介导的碳固存机制实现智能绿色高产水稻种植的途径 | 水稻土中的微生物群落及土壤有机碳动态 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学， 材料工程， 智能决策系统 | 水稻 | NA | 农业， 环境 |