合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5089 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-04 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
|
综述 | 本文综述了褪黑素在植物应对单一和复合非生物胁迫中的组学响应机制，旨在推动气候智能型农业发展 | 首次整合褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学和微生物组学等多层组学中的调控作用，并强调综合多组学方法在解析复杂调控网络中的潜力 | 未详细讨论褪黑素在田间条件下的实际应用效果及成本效益 | 总结褪黑素通过多层组学响应调控植物对多种非生物胁迫的适应机制，并探索将其转化为农业应用策略的途径 | 植物对单一和复合非生物胁迫的响应机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 2 | 2026-06-04 |
Recent advances and challenges in the biomanufacturing of L-homoserine as a versatile C4 platform chemical
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108880
PMID:41921584
|
综述 | 回顾L-高丝氨酸作为C4平台化学品的生物制造最新进展与挑战 | 系统概述了集成代谢工程策略，突出L-高丝氨酸在合成高值衍生物中的多功能性 | 缺乏涵盖集成代谢工程策略的系统综述 | 总结高效L-高丝氨酸细胞工厂的构建进展及其在高值衍生物生物合成中的应用 | 大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌作为底盘细胞的L-高丝氨酸细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | L-高丝氨酸生物合成途径，下游衍生物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-04 |
Semi-rational engineering of terminal deoxynucleotidyl transferase for high-efficiency enzymatic de novo DNA synthesis
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.009
PMID:41938127
|
研究论文 | 通过半理性工程改造末端脱氧核苷酸转移酶（TdT），实现了高效、可扩展的酶促DNA从头合成 | 通过UniProt数据库挖掘发现BtTdT并对其功能进行特性表征，结合AlphaFold3预测结构进行结构域截短和理性突变，获得显著提升3'-ONH-dNTP掺入活性的五重突变体M5 | 论文未说明该方法在长链DNA合成中的实际保真度和序列长度限制，也缺乏与现有磷酰胺酯方法的全面对比 | 开发高效、环保的酶促DNA合成技术，实现工业级DNA制造 | 末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）及其突变体 | 生物技术 | NA | 酶促DNA合成, NGS（间接通过数据库挖掘）, 计算机模拟（AlphaFold3） | AlphaFold3 | 序列数据（蛋白质序列） | 多种突变体评估（具体样本量未明确报告） | NA | NA | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-06-04 |
Dynamic, autonomous gene expression system for self-adaptation and self-regulation in microbial production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108889
PMID:41942052
|
综述 | 本文总结微生物细胞工厂中用于自适应与自调节的动态、自主基因表达系统的最新进展 | 系统梳理了单细胞和群体层面的动态调控策略，并强调反馈与前馈控制架构在实现稳定性、响应性和预测性适应中的机制 | 综述未涉及具体实验验证或定量比较，未详细讨论实际应用中的可扩展性和鲁棒性问题 | 推动整合系统生物学、合成生物学和控制理论，加速构建能在波动生物加工条件下自主优化性能的下一代细胞工厂 | 微生物细胞工厂中的动态基因调控系统，包括单细胞和群体水平策略 | 微生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂（如大肠杆菌、酵母等，文中未明确列举具体宿主） | 动态电路，包括代谢物响应系统、细胞负担响应系统、群体感应响应系统和pH响应系统，整合感知、反馈和控制模块 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-06-04 |
Synthetic biology development of microbial strains for liquid biofuel production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108891
PMID:41950978
|
综述 | 综述了利用合成生物学开发液体生物燃料生产微生物菌株的最新进展 | 从底盘菌株选择、合成生物学工具开发和代谢调控工具三个角度系统总结了合成生物学在菌株工程中的应用进展，并通过重要生物燃料的菌株开发案例展示了其巨大潜力 | 未提及当前合成生物学方法在工业化应用中面临的具体挑战或局限性 | 总结合成生物学在开发液体生物燃料生产菌株方面的最新进展，为生物燃料技术发展提供参考 | 液体生物燃料生产菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 能源 |
| 6 | 2026-06-04 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
|
综述 | 综述细菌结合在合成生物学中的应用，探讨如何利用接合机制递送遗传回路和代谢途径 | 将细菌结合与多种合成生物学策略整合，拓展了其在微生物底盘识别、菌群监测、生物修复和选择性杀伤等领域的应用 | NA | 总结细菌结合与合成生物学交叉领域的最新进展，并为利用接合转移的研究人员提供实用指南 | 细菌结合系统及其在多种微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌结合 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | 遗传回路、代谢途径 | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 7 | 2026-06-04 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
|
综述 | 该综述系统评估了将CRISPR-Cas基因组编辑应用于非模式生物面临的挑战和机遇，并提出了实现可持续生物技术的路线图 | 提出了一个系统性的框架，从宿主特异性障碍、技术解决方案到实际应用，全面剖析了非模式生物基因组编辑的关键问题，并重点介绍了无DSB的CRISPR变体技术 | 由于非模式生物种类繁多且研究基础薄弱，文中提出的许多解决方案仍然处于概念验证或实验室阶段，距大规模实际应用还有距离 | 推动CRISPR-Cas技术在非模式生物中的广泛应用，以实现可持续生物技术发展 | 非模式生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 碱基编辑, 先导编辑, CRISPR相关转座酶, 重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 非模式生物 | 无DSB的基因编辑模块（碱基编辑、先导编辑、CAST、重组酶辅助工程） | 农业, 工业生物技术, 环境修复, 能源 |
| 8 | 2026-06-04 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
|
综述 | 系统综述了四种细菌源递送系统的工程策略与应用潜力 | 首次系统比较活体生物治疗产品、细菌分泌系统、胞外收缩注射系统和细菌外膜囊泡四大平台的递送机制与工程灵活性 | 未深入讨论临床转化中的安全性评价和规模化生产挑战 | 探索基于细菌及其衍生物的精准药物递送工程策略 | 四种细菌衍生递送系统：活体生物治疗产品、细菌分泌系统、胞外收缩注射系统、细菌外膜囊泡 | NA | NA | 基因回路工程、蛋白质分泌系统改造、纳米囊泡工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 遗传回路、分子注射器、纳米注射器、纳米载体 | 医药 |
| 9 | 2026-06-04 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
|
综述 | 系统性评述基于GPCR的酵母生物传感器的模块化工程策略及其实际应用进展 | 通过模块化框架（传感、转导、输出）系统解析工程策略，并强调AI与合成生物学整合以实现下一代可预测可编程生物传感器设计 | 未提及具体性能限制数据或对比不同工程策略的量化效果 | 综述基于GPCR的酵母生物传感器工程化改造方法及其应用拓展 | GPCR信号通路与酵母遗传系统的结合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母 | GPCR信号转导通路（传感模块：GPCR，转导模块：酵母信号网络，输出模块：报告基因） | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 10 | 2026-06-04 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
|
综述 | 综述了AI驱动的多组学与表型组学整合在系统性作物工程中的应用，提出边缘到云闭环框架 | 提出从被动预测到主动设计的转变，利用生成式AI和基础模型加速设计-构建-测试-学习循环，并规划了弥补计算与实际差距的路线图 | 未提供具体实验验证或定量评估框架性能 | 通过AI整合多组学、表型组学和合成生物学，实现作物改良的系统性预测工程 | 作物品种和其基因型-环境-管理交互系统 | 机器学习 | NA | 多组学测序、表型组学、合成生物学 | Transformer架构、图神经网络、生成式AI模型、基础模型 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等多组学数据及实时表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物 | 基因电路设计（用于抗逆蛋白和基因回路） | 农业 |
| 11 | 2026-06-04 |
Filamentous fungal synthetic biology: Current applications and ongoing developments
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108912
PMID:42069191
|
综述 | 综述丝状真菌合成生物学在当前应用与未来发展 | 探讨丝状真菌在食品、医药、材料科学和生物修复等领域的新兴应用，并结合基因测序和计算技术促进合成生物学标准化 | 指出研究领域中的挑战和研究空白，如标准化语言创新不足 | 促进丝状真菌合成生物学在多种工程和应用领域的理解与标准化 | 丝状真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | NA | 食品, 医药, 材料科学, 生物修复 |
| 12 | 2026-06-04 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产及临床转化的工业化路径 | 从产量、可扩展性、成本效益、监管可行性与纯化策略兼容性综合角度，提出了酵母和转基因水稻两种主导生产平台的范式转变 | 克服生产扩大的经济挑战、确保产品一致性仍是实现其潜力的关键 | 分析重组人血清白蛋白的产业化路径及其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 重组人血清白蛋白的工业化生产和临床转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 毕赤酵母, 转基因水稻 | NA | 医疗, 药物递送, 先进疗法 |
| 13 | 2026-06-04 |
Probiotics: From natural to artificial
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108916
PMID:42092720
|
综述 | 系统总结了从天然益生菌到人工益生菌的转变，涵盖开发高性能人工益生菌的核心技术及其应用和挑战 | 从天然筛选转向理性设计与构建人工益生菌，重点介绍了人工智能、高通量筛选、定向进化、基因编辑等前沿技术在该领域的整合应用 | 生物安全性评估、监管政策、体内适应性、剂量调节方面存在挑战 | 为下一代人工益生菌的研究、临床转化和工业应用提供理论路线图 | 天然益生菌与人工益生菌 | NA | NA | 多组学、诱变育种、合成生物学、人工智能、高通量筛选、定向进化、基因工程、无缝基因编辑、原位工程 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学、环境 |
| 14 | 2026-06-04 |
Astaxanthin biomanufacturing under hierarchical constraints: Integrating synthetic biology and artificial intelligence for scalable production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108915
PMID:42105954
|
综述 | 提出一种分层约束管理框架，整合合成生物学与人工智能，实现虾青素可规模化生产 | 将虾青素生物合成重新定义为分层约束管理问题，提出分层对齐的AI辅助框架，使AI在分子、途径和系统三个层面分别发挥不同作用，将计算抽象与生物层级显式对齐 | 该框架为概念性方案，缺乏具体的实验验证和定量评估 | 解决虾青素规模化生物制造中由于生物复杂性导致的生产瓶颈 | 虾青素生物合成途径及其分层约束系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型、图学习模型、卷积神经网络、多模态学习、大语言模型 | 蛋白质语言模型、图神经网络、卷积神经网络、多模态学习模型、大语言模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | 虾青素生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-06-04 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
|
综述 | 系统回顾非食物生物质原料通过生物转化实现循环经济的挑战、技术与策略 | 首次整合原料特性、生物转化路径与废物升级策略的机制关联，并系统评估合成生物学与多组学驱动的先进微生物发酵平台 | 未对具体技术进行定量比较，且综述范围主要聚焦在技术层面，缺乏对经济性实际案例的深入分析 | 阐明非食物原料特性与生物转化路径及废物升级策略的机制联系，为优化工艺和商业化部署提供战略指导 | 非食物生物质原料（如木质纤维素、有机废弃物等）及其生物转化技术 | 工业生物技术 | NA | 厌氧消化、堆肥、微生物发酵、合成生物学、多组学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | 生物合成路径 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 16 | 2026-06-04 |
Toward predictable and programmable genetic circuits in plants
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108924
PMID:42140530
|
综述 | 探讨植物基因电路可预测性和可编程性的挑战与进展，提出定量工程框架 | 系统梳理了影响植物电路行为的基因组、表观遗传、发育、空间和环境因素，并提出了超越定性开关的定量传感、信息处理和模型指导设计策略 | 植物电路仍主要依赖经验优化，定量预测面临基因组背景、发育进程和环境变异等多重挑战 | 实现植物基因电路的可预测行为，推动合成生物学从模型系统向作物和田间环境扩展 | 植物基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物（包括模型植物和作物） | 定量传感、信息处理、模型指导设计的基因电路 | 农业 |
| 17 | 2026-06-04 |
Synthetic Biology for Next-Generation Lactic Acid Bacteria: Engineering the Future of Food
2026-Jun-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00333
PMID:42183823
|
综述 | 综述了合成生物学在下一代乳酸菌工程中的应用，旨在通过基因编辑、代谢工程和遗传回路设计来克服当前乳酸菌菌株的局限性，推动食品产业的未来发展 | 系统总结了合成生物学工具在乳酸菌精准设计和功能扩展中的应用，特别关注提高基因表达效率和利用定向进化优化外源基因，为个性化食品开发提供新视角 | 未提及具体实验验证或量化分析，主要基于现有文献的总结，缺乏对实际应用挑战的深入讨论 | 探讨合成生物学驱动策略以改造乳酸菌，解决其传统应用中面临的质粒不稳定、基因表达效率低和代谢通量调控复杂等限制，提升食品生产效率和产品多样性 | 乳酸菌 | NA | NA | 基因编辑、代谢工程、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 乳酸菌 | 遗传回路、逻辑门、代谢通路 | 食品工业 |
| 18 | 2026-06-04 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-03, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
|
综述 | 回顾了蘑菇形成菌纲（Agaricomycetes）真菌合成生物学的研究进展，并指出了限制可预测遗传工程的主要障碍以及未来优先发展方向 | 首次系统总结蘑菇生物学特有的工程约束（如复杂有性周期、异核体特性及转化过程中的菌株不稳定性），并深入分析了基因表达瓶颈（如启动子和终止子表征不足、基因组浓缩导致基因整合困难、内含子和特定序列基序的影响），同时提出了未来优先发展方向包括遗传部件跨物种评估、更先进基因编辑策略、高通量筛选方法及建立统一模型系统 | 未详细讨论具体实验案例或应用效果，主要基于已有文献综述和推理 | 推动蘑菇形成菌纲真菌合成生物学发展，使其成为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成菌纲（Agaricomycetes）真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9等基因编辑策略 | 蘑菇形成菌纲（Agaricomycetes）真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 机械真菌生物学研究 |
| 19 | 2026-06-04 |
Expanding the genetic toolset: Using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jun-02, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
|
研究论文 | 本研究展示了将核糖调控元件通过丝氨酸重组酶整合到工业相关微生物底盘中的方法 | 同时利用顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程两种合成生物学工具，实现多个宿主的通用基因组操作和精确基因表达 | 未明确说明局限性 | 扩展工业微生物在生物制造中的应用工具集 | 顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程在荧光报告系统中的功能 | 合成生物学 | NA | SAGE, 丝氨酸重组酶 | NA | 荧光强度数据 | 三种工业相关宿主：恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、嗜氢贪铜菌 | 丝氨酸重组酶, SAGE | 恶臭假单胞菌, 谷氨酸棒杆菌, 嗜氢贪铜菌 | 顺式抑制子调控元件与荧光报告基因的整合系统 | 工业生物技术, 生物制造 |
| 20 | 2026-06-04 |
Programmable, multiplexed and orthogonal gene control in bacteria with attenuated Cas13d systems
2026-Jun-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03160-x
PMID:42230991
|
研究论文 | 开发了一种基于弱化Cas13d系统的可编程、多路复用且正交的细菌基因控制方法 | 通过理性蛋白工程设计弱化Cas13d变体，结合CRISPR RNA间隔区5'端近端错配，实现可调RNase活性、降低细胞毒性，并支持翻译抑制、多顺反子mRNA降解和IF3融合介导的翻译水平CRISPR激活的功能切换 | 未提及长期稳定性或可能存在的脱靶效应 | 构建细菌中基于Cas13d的RNA调控工具，优化基因表达和代谢途径 | 大肠杆菌中的多顺反子mRNA、合成电路及番茄红素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas13d、蛋白工程 | NA | 生物学数据（生长密度、基因表达、代谢产物产量） | NA（未明确样本数量） | CRISPR-Cas13d | 大肠杆菌 | 翻译抑制、多顺反子mRNA降解、IF3融合翻译水平CRISPR激活的合成电路 | 工业生物技术 |