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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
|
研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 2 | 2025-11-18 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
|
综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展,探讨未来食品生物制造的挑战与发展策略 | 首次针对Fusarium venenatum菌株的系统性综述,填补了该领域在合成生物学工具开发和底盘工程应用方面的综述空白 | NA | 为基于Fusarium venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | Fusarium venenatum | NA | 食品, 农业 |
| 3 | 2025-11-18 |
Advances in microbial biofuel production by metabolic and enzyme engineering, synthetic biology, metagenomics, and genome editing applications
2025-Nov-17, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20240002
PMID:41217051
|
综述 | 本文综述了利用微生物通过代谢工程、酶工程、合成生物学、宏基因组学和基因组编辑技术生产生物燃料的不同方法 | 整合了多种先进分子技术(宏基因组学、合成生物学、CRISPR-Cas基因组编辑)在微生物生物燃料生产中的应用 | 仅提供方法概述,缺乏具体实验数据和新发现 | 探讨微生物在生物燃料生产中的应用方法和进展 | 微生物及其酶系统 | NA | NA | 代谢工程、酶工程、合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物细胞 | 工程化生物系统 | 能源, 工业生物技术 |
| 4 | 2025-11-18 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来发展方向 | 利用合成生物学技术编程细菌使其能够选择性定植肿瘤微环境并局部递送治疗剂 | 需要克服肿瘤内异质性等挑战才能充分发挥其治疗潜力 | 探索工程化细菌在癌症治疗中的应用前景 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 沙门氏菌, 乳酸菌 | 生物传感器, 治疗剂递送系统, 免疫调节回路 | 医学 |
| 5 | 2025-11-18 |
Design of a Multienzyme Derived from Mouse Fatty Acid Synthase for the Compartmentalized Production of 2-Pyrone Polyketides
2025-Nov-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511726
PMID:41243670
|
研究论文 | 本研究设计了一种基于小鼠脂肪酸合酶的多酶系统,用于区室化生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 通过酮合酶结构域的两个氨基酸替换增强非天然底物合成能力,并利用SpyTag/SpyCatcher系统整合4-香豆酸连接酶加载模块 | NA | 开发区室化生物合成平台用于高效生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 小鼠脂肪酸合酶衍生的多酶系统及其催化的2-吡喃酮化合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、化学酶法合成 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | NA | 多酶区室化系统,包含改造的脂肪酸合酶和4-香豆酸连接酶加载模块 | 医药 |
| 6 | 2025-11-18 |
Harnessing CRISPR-Cas9 for Lactobacillus improvement in silage production: current knowledge and future perspectives
2025-Nov-15, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01282-x
PMID:41239469
|
综述 | 系统回顾CRISPR-Cas9基因编辑技术在乳酸杆菌改良及其在青贮饲料生产中应用的现状与前景 | 首次系统探讨如何利用CRISPR-Cas9技术定向优化乳酸杆菌特性以开发新一代青贮微生物接种剂 | 主要基于现有研究进展进行综述,缺乏实际工程化应用的详细验证数据 | 探讨合成生物学技术在青贮饲料乳酸杆菌改良中的应用潜力 | 乳酸杆菌及其在青贮发酵中的功能特性 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 7 | 2025-11-18 |
Plant-derived peptides: from identification to agronomic applications
2025-Nov-15, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.11.004
PMID:41243283
|
综述 | 本文综述植物源肽从鉴定到农艺应用的全链条发展,提出整合人工智能、纳米技术和合成生物学等新兴技术的解决方案 | 提出整合人工智能驱动的高通量肽发现、纳米技术增强环境韧性和合成生物学构建工业生物制造平台的协同技术框架 | 植物肽商业化面临多样性探索不足、生产成本高、生态风险评估不完整和应用场景未定义等限制 | 开发植物源肽作为生态友好型生物农药和生物刺激素替代化学农药 | 植物源肽及其在农业中的应用 | 农业生物技术 | NA | 人工智能、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 8 | 2025-11-18 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2025-Nov-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
|
综述 | 系统探讨血红蛋白的微生物合成策略、功能定制化修饰方法及其多领域应用前景 | 重点介绍利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰,以及整合帕累托最优和迭代生物工程框架等先进技术 | NA | 解决血红蛋白微生物合成的关键挑战并拓展其应用领域 | 血红蛋白及其突变体和衍生物 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 9 | 2025-11-18 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-Nov-08, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
|
综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症治疗中的应用与前景 | 系统总结了纳米技术平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体等)在实现细胞因子靶向递送、控制释放和增强抗肿瘤免疫方面的创新解决方案 | 仍面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性和制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送策略如何克服当前免疫疗法的局限性并提高胃肠道癌症治疗效果 | 胃肠道癌症(结直肠癌、胃癌、食道癌)及相关的细胞因子免疫疗法 | 纳米医学 | 胃肠道癌症 | 纳米技术递送平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶、智能纳米载体) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2025-11-18 |
Recent advances and perspectives in biosynthesis of paclitaxel: key enzymes and intermediates
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148049
PMID:41043740
|
综述 | 本文综述了紫杉醇生物合成的最新进展,重点关注关键酶和中间体的研究 | 强调合成生物学策略在紫杉醇关键中间体生物合成中的新兴趋势 | NA | 探索紫杉醇的可持续生产策略以满足市场需求 | 紫杉醇生物合成途径中的关键酶和中间体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、微生物发酵技术、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 11 | 2025-11-18 |
Innovative approaches in bioremediation: the role of halophilic microorganisms in mitigating hydrocarbons, toxic metals, and microplastics in hypersaline environments
2025-Aug-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02817-7
PMID:40804729
|
综述 | 本文综述了嗜盐微生物在高盐环境中修复碳氢化合物、有毒金属和微塑料污染的作用及生物技术应用 | 系统探讨了工程化嗜盐微生物在极端环境生物修复中的创新应用,结合基因编辑和合成生物学技术提升污染物降解效率 | 存在基因工程菌株优化难度大、生物安全性保障不足、微生物生态理解不深以及规模化应用成本较高等挑战 | 研究嗜盐微生物在高盐环境污染物生物修复中的应用潜力 | 嗜盐和耐盐微生物及其在高盐环境中的生物修复功能 | 环境生物技术 | NA | 基因编辑、重组DNA技术、组学方法 | NA | NA | NA | 基因编辑, 重组DNA | 嗜盐微生物 | 污染物降解代谢通路 | 环境 |
| 12 | 2025-11-18 |
Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
2023-05-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79815
PMID:37255080
|
研究论文 | 本研究通过粗粒度模型验证了资源分配策略可解释不同细菌菌株生长速率和生长产量的显著差异 | 建立了连接蛋白质组组成与生长表型的资源分配模型,揭示了高生长速率不一定伴随低生长产量的新机制 | 模型基于标准实验室条件,在复杂环境中的适用性有待验证 | 探究细菌菌株生长速率和产量差异的生物学机制 | 不同细菌菌株 | 系统生物学 | NA | 计算建模、表型数据库分析 | 粗粒度资源分配模型 | 生长表型数据、代谢通量数据 | 数百个已发表菌株表型数据 | NA | 细菌 | NA | 代谢工程、合成生物学 |
| 13 | 2025-11-17 |
Synthetic peptide vaccines targeting SVA elicit robust protective immune responses in swine
2025-Dec, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110763
PMID:41106188
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研究论文 | 本研究基于合成生物学原理设计合成针对塞内卡病毒A(SVA)的合成肽疫苗,并在猪体内验证其免疫保护效果 | 首次基于SVA衣壳蛋白VP2的B细胞中和表位和荨麻疹病毒F蛋白的辅助T细胞表位设计合成肽疫苗,并筛选出最佳佐剂组合 | 研究样本量有限,未进行大规模田间试验验证疫苗的长期保护效果 | 开发安全有效的塞内卡病毒A(SVA)合成肽疫苗 | 小鼠和猪的免疫反应及保护效果 | 合成生物学 | 猪水疱病 | 固相肽合成(SPPS) | NA | 免疫学数据 | 小鼠和猪的免疫实验样本 | NA | 小鼠,猪 | 基于B细胞中和表位和T细胞表位的合成肽设计 | 兽医学 |
| 14 | 2025-11-17 |
Advances in functional genomics of major rice pests and pathogens and their molecular interactions with the host: A comprehensive review
2025-Nov-11, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148965
PMID:41232877
|
综述 | 本文全面综述了水稻主要病虫害功能基因组学及其与宿主分子互作机制的研究进展 | 揭示了效应子触发自噬降解和环状RNA衍生防御肽等新型免疫机制,提出基于单倍型的抗性模块组装策略 | 田间应用面临效应子变异性、信号串扰理解不完整、抗性与发育权衡等挑战 | 解析水稻与病虫害的分子互作机制并开发可持续作物保护策略 | 水稻主要病虫害及其与宿主的分子互作 | 功能基因组学 | 水稻病虫害 | 多组学方法、CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | CRISPR | 水稻 | NA | 农业 |
| 15 | 2025-11-17 |
In Vivo and In Vitro Mechanisms of Equol Synthesis and Key Influencing Factors: A Critical Review
2025-Oct-31, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213449
PMID:41228520
|
综述 | 本文系统综述了雌马酚的体内外合成机制、关键影响因素及其潜在分子机制 | 重点探讨了基于合成生物学和基因编辑技术的雌马酚高效体外合成突破路径 | 传统合成技术存在效率低、副产物生成和环境问题等限制因素 | 阐明雌马酚的合成机制及影响因素,推动其高效合成技术发展 | 雌马酚(S-雌马酚和R-雌马酚)及其合成微生物 | 合成生物学 | 更年期症状、衰老、心血管疾病 | 合成生物学、基因编辑技术 | NA | NA | NA | 基因编辑 | 肠道细菌 | NA | 医药 |
| 16 | 2025-11-17 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
|
研究论文 | 本研究通过细胞内水凝胶化技术将非复制但代谢活跃的赛博格细胞方法扩展到病原细菌 | 将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株推广到病原细菌,创建了具有病原特性的赛博格病原体 | 仅研究了特定病原菌株,未涉及其他类型病原体 | 开发具有病原特性的非复制但代谢活跃的赛博格病原体用于生物医学应用 | 不同菌株的病原细菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 多种病原细菌菌株 | 细胞内水凝胶化 | 病原细菌 | 细胞内聚合物凝胶网络 | 医学 |
| 17 | 2025-11-16 |
Integrated base editing and microfluidics boost microbial lipid production from lignin
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133441
PMID:41045995
|
研究论文 | 本研究通过整合碱基编辑和微流控技术,开发了一种提升真菌利用木质素生产微生物油脂的方法 | 建立了铜诱导的MCM5-AID碱基编辑器实现全基因组C-to-T/G-to-A诱变,并结合微流控技术进行超高通量筛选 | NA | 提升微生物利用木质素生产油脂的能力 | 弯曲孢子菌Curvularia clavata J1 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑, 微流控技术, 转录组学, 基因组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | 碱基编辑 | 弯曲孢子菌 | 铜诱导的MCM5-AID碱基编辑系统 | 能源, 工业生物技术 |
| 18 | 2025-11-16 |
Efficient biosynthesis of retinal from Escherichia coli by metabolic engineering
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133501
PMID:41093029
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造大肠杆菌,实现了从生物资源高效合成视网膜的目标 | 采用系统与合成生物学方法构建高效视网膜生物合成细胞工厂,整合酶工程、翻译工程、膜工程和中心碳代谢重构等多层次工程策略 | 膜工程和NADPH再生的尝试未能提高视网膜产量 | 开发高效的视网膜生物合成方法 | 大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、酶工程、定向进化、RBS优化、膜工程 | NA | NA | 4-L生物反应器规模 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 甲羟戊酸途径代谢工程、中心碳代谢重构、β-胡萝卜素合成途径、视网膜生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 19 | 2025-11-16 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
|
研究论文 | 通过靶向染色质编辑揭示了模拟表观遗传记忆的存在 | 首次证明染色质修饰能够维持连续梯度基因表达水平,揭示模拟表观遗传记忆机制 | 未明确说明研究的细胞类型或实验规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态 | 染色质修饰和基因表达动态 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 表观遗传效应器、基因组报告系统 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |
| 20 | 2025-11-16 |
M3Site: multiclass multimodal learning for protein active site identification and classification
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf590
PMID:41222559
|
研究论文 | 提出一种多模态多类别学习框架M3Site,用于蛋白质活性位点的识别与分类 | 整合蛋白质序列嵌入、结构图表示和功能文本注释进行残基级多类别活性位点预测,采用功能感知交叉注意力模块和自适应加权融合机制 | NA | 开发更准确的蛋白质活性位点识别与分类方法 | 蛋白质活性位点 | 生物信息学 | NA | 蛋白质语言模型、等变图神经网络、生物医学语言模型 | 多模态深度学习框架 | 蛋白质序列、结构图、功能文本注释 | 25,883个蛋白质(来自UniProt和AlphaFold2) | NA | NA | NA | 药物设计、合成生物学 |