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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-19 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质科学中如何形成一个自我强化的循环,将结构预测、功能注释和从头设计紧密结合 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质,特别是单域球状蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,冷冻电镜与AI集成 | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI模型 | 3D坐标,序列数据,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 2 | 2026-04-19 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 本文提出了一种名为“通过逆转录酶生成多样性”的互补机制,用于解释基因组多样化的新途径 | 提出DGbyRT机制,通过逆转录和同源重组整合RNA到基因组,偏向转录组已有区域,改变序列探索的统计分布 | NA | 探讨基因组多样化的进化机制,特别是基于RNA模板的逆转录和重组过程 | 细胞或外源RNA、逆转录酶、同源重组过程、转录的假基因和重复序列 | NA | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-04-19 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入工程肝组织在体内生长的新策略,以解决工程组织植入物尺寸限制的临床转化问题 | 首次将合成生物学与组织工程结合,实现植入后按需诱导工程肝组织在体内扩增,通过YAP和生长因子信号轴控制肝细胞增殖 | 研究仍处于概念验证阶段,长期安全性和临床适用性需进一步验证 | 开发一种通过合成生物学触发工程组织在体内生长的方法,以克服治疗规模组织植入物的尺寸限制 | 工程肝组织和人肝细胞 | 合成生物学 | 肝病 | 合成生物学工具、组织工程、信号通路调控 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学工具 | 人类肝细胞 | 通过YAP和生长因子信号轴控制的增殖通路,实现按需组织扩增 | 医学 |
| 4 | 2026-04-19 |
Microfluidic platforms for precision delivery of therapeutic cells in regenerative and personalized medicine
2026-Apr-02, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115865
PMID:41935637
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综述 | 本文综述了微流控技术在再生与个性化医学中用于治疗性细胞精准递送的最新进展 | 强调了微流控平台如何通过精确操控流体、生物材料和细胞,改善细胞活力、定位精度和植入持久性,并结合CRISPR基因编辑与合成生物学开发“智能”治疗细胞 | 仍面临监管标准化、大规模生产和临床工作流程整合的挑战 | 推动精准再生医学的发展,解决治疗性细胞临床转化中的递送难题 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、工程化细胞构建体、CAR-T细胞等治疗性细胞 | NA | NA | 微流控技术、软光刻、热塑性塑料加工、3D打印、水凝胶集成、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-04-19 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2026-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学方法生成温度敏感等位基因,以支持不育昆虫技术中的雄性专用品系开发 | 提出了结合CRISPR/Cas基因编辑、理性蛋白质设计以及温度诱导N-降解子或温度敏感内含肽等新兴合成生物学策略,创建非转基因的温度敏感等位基因,以简化雄性专用品系的生成 | 在雄性决定基因座或染色体上整合和表达基因尚未可靠建立,需要额外策略将温度敏感表型与雌性发育联系起来 | 开发用于不育昆虫技术的温度敏感等位基因,以增强雄性专用释放的效率 | 不育昆虫技术中的遗传性别品系,特别是温度敏感致死突变 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑、理性蛋白质设计、温度诱导N-降解子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(SIT目标物种) | 温度敏感等位基因设计,用于条件性控制导致雌性致死或性别转换的蛋白质 | 农业 |
| 6 | 2026-04-19 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
|
综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展,从基础生物学到合成生物制造 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7,建立了叶绿素降解与生育酚合成的直接联系,并探讨了合成生物学方法生产天然维生素E的新范式 | NA | 探索维生素E的化学组成、功能、生物合成途径及生产策略 | 维生素E及其生物活性分子 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 7 | 2026-04-19 |
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-Apr, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500586
PMID:41999168
|
概念报告 | 本文提出了“元细胞”这一新概念,用于定义一类具有动态功能、环境响应性和可编程行为的工程化活细胞-外壳系统 | 首次提出“元细胞”概念,并定义了其三个核心功能特征:可重构性、可负载性和运动性,为单细胞纳米封装领域建立了统一的概念框架 | 这是一篇概念性报告,尚未提供具体的实验验证或技术实现细节 | 为单细胞纳米封装技术建立统一的概念框架,推动其在先进疗法、微型机器人和交互式生物混合系统等领域的应用 | 单细胞纳米封装形成的细胞-外壳结构(元细胞) | 合成生物学 | NA | 单细胞纳米封装 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | NA | 医学, 微型机器人, 生物混合系统 |
| 8 | 2026-04-19 |
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Feb-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物光呼吸旁路,以克服光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 | 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调通过重编程乙醇酸代谢生产高价值代谢物的策略 | NA | 克服C3植物光呼吸的碳损失限制,提高光合效率 | 植物光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 光呼吸旁路,包括叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路 | 农业 |
| 9 | 2026-04-19 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
|
综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 | 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法,将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合,以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计,特别是以LacI为例的转录因子调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 | 热力学框架模型 | 序列数据、实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-04-18 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
|
综述 | 本文综述了基于核苷酸编辑酶的高性能生物成像与生物传感技术,涵盖其催化原理、应用模块及未来发展方向 | 将核苷酸编辑酶重新编程为可编程执行器,用于生物传感和生物成像,实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容性 | NA | 探讨核苷酸编辑酶在生物传感和生物成像中的应用潜力 | 核苷酸编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶)及其驱动的生物传感和生物成像系统 | NA | NA | 核苷酸编辑酶技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断、治疗监测、合成生物学 |
| 11 | 2026-04-18 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
|
研究论文 | 本文介绍了Rhodo-Box,一个用于促进Rhodobacter sphaeroides代谢工程的合成生物学工具箱 | 开发了Rhodo-Box工具箱,通过扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,为Rhodobacter sphaeroides提供了标准化的遗传元件和半自动化克隆方法 | NA | 促进Rhodobacter sphaeroides作为可持续生物制造底盘微生物的代谢工程应用 | Rhodobacter sphaeroides,一种紫色非硫α-变形菌 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆,半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts,Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和转录终止子在内的遗传元件集合 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-18 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST(真空与超声辅助瞬时转化)的新方法,用于提高多种单子叶和双子叶植物幼苗中的瞬时基因表达效率 | VAST方法通过结合真空渗透和超声预处理,显著提高了基因表达效率,并扩展了适用植物种类范围 | NA | 开发一种更高效、通用的瞬时基因表达方法,以促进植物功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等关键作物物种 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | VAST | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 13 | 2026-04-18 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为蛋白质表达底盘生物的基本生物学特性、工程化改造、合成生物学工具及其在蛋白质表达中的应用与前景 | 聚焦于Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究与应用成果,这是先前综述中关注较少的方面 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,突出其优势和应用前景,并指出该领域的挑战和未来方向 | Vibrio natriegens菌株及其作为蛋白质表达底盘生物的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、基因组注释、代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-04-18 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 本文综述了麦角硫因的多功能角色、微生物生产瓶颈,以及合成生物学和代谢工程策略在提高其产量方面的最新进展 | 总结了麦角硫因生物合成和降解途径中关键酶的发现与鉴定,以及通过代谢工程策略实现的高效异源生产,包括化学酶催化级联路线达到的最高产量 | NA | 探讨麦角硫因的生产方法、生物合成途径及在食品、化妆品和制药行业的应用 | 麦角硫因(一种天然抗氧化化合物) | 合成生物学 | NA | 代谢组学、合成生物学、化学酶催化 | NA | NA | NA | NA | 非天然宿主菌株(例如大肠杆菌和酵母) | 麦角硫因生物合成和降解途径 | 食品、化妆品、制药 |
| 15 | 2026-04-18 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK软件套件,用于核酸结构、设备和系统的分析与设计 | NUPACK 4引入了增强的物理模型(如共轴和悬垂堆叠子系综)、显著的速度提升(20-120倍)、大规模复合物处理能力(如30,000 nt)、混合材料支持以及多样化的序列约束设计 | NA | 开发用于核酸纳米技术、分子编程和合成生物学领域的计算工具 | 核酸结构、设备和系统 | 计算生物学 | NA | 计算分析 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联和结构工程,包括假结可能性 | 医学, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-04-18 |
Engineering Microbial Particles for Next-Generation Biomedical Platforms
2026-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202600012
PMID:41995096
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综述 | 本文系统综述了微生物衍生颗粒(MDPs)的类别、生物合成途径、理化特性及其在生物医学领域的应用,并探讨了其未来发展方向 | 系统整合了MDPs作为生物启发纳米材料的多样化类别、生物工程调控方法及其在药物递送、疫苗设计等领域的应用,并展望了合成生物学与材料科学结合开发下一代智能生物平台的前景 | NA | 综述微生物衍生颗粒(MDPs)的生物学特性、工程化方法及其在生物医学平台中的应用 | 微生物衍生颗粒(MDPs),包括细胞外囊泡、外膜囊泡、包涵体、多糖颗粒和病毒样颗粒 | NA | NA | 组学分析、先进成像技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 17 | 2026-04-18 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Apr-16, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
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综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,影响高级组装、水合作用和共价连接,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 通过蛋白质组学揭示低丰度PTMs,并利用合成生物学和生物正交化学实现修饰的程序化安装,以调控物理化学性质,为下一代蛋白质基材料的预测性设计提供基础 | NA | 理解并利用丝蛋白的翻译后修饰,以促进化学生物学与材料科学交叉领域的蛋白质基材料设计 | 丝蛋白及其翻译后修饰,包括羟基化、糖基化、磷酸化和共价交联 | NA | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学 |
| 18 | 2026-04-18 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学途径、系统工程策略及绿色增值前景 | 将棉酚的互变异构与反应热点关联为可处理目标,整合微生物与混合培养途径,并将活性酶分类为四个模块,提出结合分析学、命运追踪、分级生物测定和毒代动力学的产品解析验证方法 | 现有解毒方法常资源密集,可能损害蛋白质质量,且主要依赖整体棉酚减少而非产品解析证据,无法确认解毒效果 | 开发棉酚的生物解毒策略,以实现棉籽副产品的绿色增值和风险降低 | 棉酚及其解毒产物 | 合成生物学 | NA | 酶工程、多酶级联设计、AI辅助酶/途径挖掘、合成生物学架构 | NA | NA | NA | NA | 微生物、混合培养系统 | 功能基团修饰、芳香环裂解、溶解度增强共轭、自由基介导环化等模块化合成生物学途径 | 农业、工业生物技术 |
| 19 | 2026-04-18 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-04-18 |
Duckweeds: from fundamental biology to a sustainable plant chassis for biotechnology
2026-Apr-16, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00110-1
PMID:41989705
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综述 | 本文综述了浮萍作为可持续生物技术平台的潜力,包括其独特生物学特性、遗传工具开发以及在分子农业中的应用进展 | 提出浮萍作为下一代植物底盘生物,整合了其简化表观基因组促进转基因表达、高效CRISPR-Cas9编辑系统等最新突破 | 需要建立整合组学数据库、通用遗传工具包和可扩展培养技术才能实现从概念验证到工业应用的转化 | 评估浮萍作为可持续生物技术平台的潜力和发展方向 | 浮萍(Lemnaceae)及其作为生物技术底盘的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9编辑、遗传转化、代谢工程 | NA | 基因组数据、组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 浮萍(Lemnaceae) | 代谢途径工程、治疗蛋白生产系统 | 工业生物技术、医药、农业、环境 |