本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-29 |
Mycogenic Nanomaterials: What Fungal Nanoparticles Promise and What Still Holds Them Back
2026-May-16, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12050366
PMID:42187848
|
综述 | 采用“承诺与障碍”框架综合评述真菌纳米技术在生物合成机制、真菌生物多样性、纳米材料组合、生物医学应用、环境和农业利用及工业可扩展性方面的前景与挑战 | 首次采用结构化“承诺与障碍”框架跨越六个相互关联的主题支柱,同步绘制机理前沿、生物多样性空白和转化障碍 | 机理知识差距、非模式真菌有限遗传工具包及缺乏标准化协议仍阻碍进展,且临床验证、长期毒性数据、制造可重复性和监管清晰度方面存在关键缺陷 | 批判性审视真菌纳米技术在多个领域的巨大前景与持续障碍,并提出分层路线图推动从实验室成果到实际应用的转化 | 真菌纳米粒子(纳米材料) | NA | NA | 多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、基因组挖掘、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 生物医学、环境、农业、食品包装 |
| 182 | 2026-05-29 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-May-13, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
|
综述 | 综述从合成生物学和材料科学角度总结了细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 从合成生物学与材料科学交叉视角系统总结了多孔框架材料细胞封装技术 | NA | 探讨利用框架材料工程化合成细胞和增强细胞功能的前景与挑战 | 多孔框架材料(MOF、COF、HOF)与细胞的复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞治疗,生物催化,生物传感,二氧化碳减排 |
| 183 | 2026-05-29 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-May-13, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
|
研究论文 | 测量生长停滞条件下合成抑制曲线,揭示遗传电路工程的设计挑战 | 首次系统量化生长停滞对基因NOT门抑制曲线的影响,发现未抑制表达水平降低超过100倍是主要挑战 | 仅针对单一基因电路类型(NOT门),未探索其他电路类型或更复杂环境 | 研究生长停滞对工程化遗传电路性能的影响 | 大肠杆菌中基因NOT门文库 | 合成生物学 | NA | 单细胞分辨率测量 | NA | 基因表达数据 | 基因NOT门文库 | NA | 大肠杆菌 | 遗传NOT门 | 工业生物技术 |
| 184 | 2026-05-29 |
Expanding the Microbial Genomic Landscape and Biotechnological Applications of CRISPR-Cas Systems
2026-May-08, Biology
DOI:10.3390/biology15100748
PMID:42187710
|
综述 | 该文章综述了CRISPR-Cas系统的多样性、在微生物中的基因组景观及其前沿生物技术应用 | 系统性地总结了通过计算挖掘微生物基因组和宏基因组发现的新型CRISPR效应物,包括独特性质、不同PAM需求及RNA靶向能力等,并讨论了其扩展分子生物学工具库的潜力 | 未明确提及具体研究限制,但可推断类1系统的递送挑战和伦理生物安全问题仍需解决 | 全面概述CRISPR-Cas系统的多样性、微生物基因组分布及生物技术应用,并强调其在合成生物学、治疗、诊断、环境修复和农业中的变革潜力 | 细菌和古菌中的CRISPR-Cas系统 | 机器学习和数字病理学以外的领域,更偏向合成生物学与生物技术,因此选择NA | NA | 计算微生物基因组挖掘、宏基因组分析 | NA | 基因组和宏基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | 细菌, 古菌 | 碱基编辑、先导编辑、基因敲入/敲除、活细胞DNA/RNA成像 | 合成生物学, 治疗, 诊断, 环境修复, 农业 |
| 185 | 2026-05-29 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labeling and functional imaging
2026-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03056-3
PMID:42020773
|
研究论文 | 开发了一种覆盖整个可见光谱的抗原稳定荧光纳米抗体合成工具包,用于多色标记和功能成像 | 首次将20多种荧光蛋白和生物传感器工程化到8种纳米抗体中,建立了一种可泛化设计的抗原稳定荧光纳米抗体平台,实现无背景可视化、多色检测和选择性靶向 | NA | 开发一种合成生物学驱动的抗原稳定荧光纳米抗体平台,用于精确研究蛋白质动态、细胞过程和复杂生物系统 | 抗原稳定荧光纳米抗体 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白工程, 生物传感器工程 | NA | 图像 | 小鼠脑组织样本和斑马鱼胚胎样本 | NA | 小鼠, 斑马鱼 | 抗原稳定荧光纳米抗体 | 医学, 基础生物学 |
| 186 | 2026-05-29 |
Marine Polysaccharides Modulating the Gut Microbiota-Immune Axis in Digestive Tract Tumors: An Update
2026-Apr-23, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md24050148
PMID:42188283
|
综述 | 系统综述了海洋多糖通过调节肠道菌群-免疫轴影响消化道肿瘤的最新研究进展 | 从多糖结构、菌群调节、免疫激活、肿瘤抑制和递送优化的逻辑框架出发,系统阐述了海洋多糖对肠道菌群-免疫轴的调控作用及机制,并整合多组学、合成生物学和纳米递送策略提出未来研究方向 | 海洋多糖的结构-活性关系仍不明确,口服生物利用度较低 | 总结海洋多糖调节消化道肿瘤中肠道菌群-免疫轴的研究,并促进其临床转化 | 海洋多糖(来自藻类、动物和微生物来源) | 机器学习 | 消化道肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 187 | 2026-05-29 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
|
研究论文 | 提出一种通过逆转录和同源重组实现RNA模板化基因组多样性生成的进化假说 | 首次系统提出基于RNA模板的逆转录与同源重组相结合可定向基因组多样性生成,并整合多种已知生物机制(如多样性生成逆转录元件、转座子、端粒酶及体细胞超突变)形成统一假说 | 目前为假说阶段,缺乏直接实验证据支持DGbyRT在自然界的实际发生频率及调控机制 | 提出并论证通过逆转录同源重组实现RNA模板化基因组多样性生成的进化机制 | 基因组多样性生成机制,涉及逆转录酶、逆转录元件、假基因、重复序列等 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | AutoDiMe | NA | NA | 进化生物学, 治疗创新 |
| 188 | 2026-05-29 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
|
研究论文 | 描述了一种利用高通量培养平台对毕赤酵母菌株进行静态碳代谢流分析的方法 | 提出高通量平台用于大规模工程菌株的代谢流特征分析,加速菌株工程循环 | NA | 实现高通量的13C代谢流分析,以表征工程菌株的细胞内代谢反应速率 | 毕赤酵母(Komagataella phaffii)菌株 | 代谢工程 | NA | 13C代谢流分析 | NA | 代谢通量数据 | 一组工程菌株 | NA | 毕赤酵母(Komagataella phaffii) | NA | 工业生物技术 |
| 189 | 2026-05-29 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
|
综述 | 本文综述了盘基网柄菌生命周期中多药转运蛋白的功能与进化保守性 | 首次系统整合盘基网柄菌中多药耐药蛋白的遗传组成,结合RNAseq与转录组共表达数据,揭示其在趋化、合作和细胞分化中的未探索角色 | 多药转运蛋白在该生物中的实验表征研究稀疏,功能验证数据有限 | 探讨多药转运蛋白在盘基网柄菌生命周期中的进化保守角色及在合成生物学、药物研究和微生物生理学中的应用潜力 | 盘基网柄菌的多药转运蛋白家族(ABC、MFS、MATE、SMR/DMT、RND、AbgT、PACE) | 微生物学 | NA | RNA-seq、转录组学共表达分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学、合成生物学、药学 |
| 190 | 2026-05-29 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-02-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
|
研究论文 | 提出在生长反馈下通过添加抑制性调控节点增强双稳态电路稳定性的策略 | 首次提出通过引入一个抑制性调控边缘来使双稳态电路对生长反馈去敏感化的简单控制策略 | 仅进行了仿真和体外实验,缺乏在复杂生物系统中的体内验证 | 研究如何通过额外抑制性调控增强基因电路在生长反馈下的鲁棒性 | 受生长反馈影响的双稳态基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | 双稳态电路模型 | NA | NA | NA | NA | 双稳态电路(含抑制性调控边缘) | 合成生物学 |
| 191 | 2026-05-29 |
Recent advances in synthetic biology of cyanobacteria for improved chemicals production
2020-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2020.1837458
PMID:33124500
|
综述 | 总结蓝藻合成生物学在提高化学品生产方面最新进展 | 综述了蓝藻合成生物学工具箱的最新应用和进展 | 由于生物产品产量低,大规模应用仍是技术挑战 | 推动蓝藻生物技术中新型工具的应用和未来展望 | 蓝藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 工业生物技术 |
| 192 | 2026-05-28 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
|
综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的新兴概念 | 系统阐述了RNA相比DNA在构建细胞骨架模拟物中的独特优势,包括共转录折叠能力、复杂三级相互作用及与细胞机器对接的功能 | 体内稳定性和高效递送等重大挑战尚未解决 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础性理解 | RNA折纸纳米管 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 人工细胞骨架(微管和肌动蛋白丝模拟结构) | 纳米技术、合成生物学、医学 |
| 193 | 2026-05-28 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
|
综述 | 探讨人工智能和机械建模在表征天然产物生物合成途径中的应用 | 全面分析2020至2025年间人工智能与机械建模在预测生物合成途径和酶-底物相互作用中的最新进展,并讨论整合这些策略以加速天然产物发现、工程和应用的未来方向 | 该领域仍面临复杂基因型-表型关系带来的挑战,且整合不同计算方法存在技术障碍 | 揭示天然产物生物合成途径以加速药物发现、生物技术和合成生物学应用 | 天然产物及其生物合成途径相关数据库、AI方法及机械模拟 | 机器学 | NA | AI, 机械建模 | NA | 文本(数据库) | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 194 | 2026-05-28 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
|
综述 | 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 | 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 | 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 | 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 | L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | 代谢通路 | 食品, 医药, 化工 |
| 195 | 2026-05-28 |
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11673-025-10533-5
PMID:42201630
|
研究论文 | 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 | 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 | 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 | 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 | 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 | 生物伦理学 | NA | NA | NA | 案例研究 | 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2026-05-28 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-May-26, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
|
综述 | 综述了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,涵盖关键酶、转录调控、合成生物学及人工智能应用 | 系统整合组学技术、合成生物学工具与人工智能在OPT生物合成中的应用前景,强调从经验试错向预测优化的范式转变 | 静态综述,未提供实验验证数据或定量比较不同策略的优劣 | 总结OPT生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的研究进展,实现可持续高效生产 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径相关基因和调控元件 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 组学技术, 基因组编辑, 异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 微生物, 植物 | 合成生物电路、代谢途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 197 | 2026-05-28 |
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13876-0
PMID:42189293
|
综述 | 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对的研究进展及其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 | 系统总结了酵母毒素-免疫因子对的分子机制、克隆和研究方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的开发前景 | 目前对多数免疫因子的保护机制了解尚少,限制了实际应用 | 推动对酵母毒素-免疫因子对的分子理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 | 酵母中的染色体外毒素-免疫因子对(包括dsRNA真菌病毒卫星和DNA病毒样元件) | 合成生物学 | NA | 基因克隆、分子生物学研究、工程改造 | NA | 文本 | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 毒素-免疫因子对(如毒素分泌系统、自我保护回路) | 食品防腐剂, 医药, 生物技术, 合成生物学 |
| 198 | 2026-05-28 |
Microbial production of xanthohumol driven by synthetic biology approaches
2026-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05037-2
PMID:42189397
|
综述 | 本文总结了通过合成生物学方法实现黄腐酚微生物生产的生物策略,并评估了其技术经济可行性 | 提出了利用微生物合成生物学实现黄腐酚可持续大规模生产的创新路径,并首次进行了技术经济可行性评估 | 仍需进一步努力实现黄腐酚的合成生物学生产 | 发展黄腐酚的商业化规模生物生产策略 | 黄腐酚 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化妆品、医药、营养保健品、食品 |
| 199 | 2026-05-28 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-May-26, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
|
评论文章 | 探讨在Genesis Mission时代,从设计-构建-测试-学习循环转向AI驱动的数字孪生技术以加速生物制造工艺放大的前景与挑战 | 提出将合成生物学与AI生态系统整合,并开发共享的AI就绪生物系统数据库和混合数字细胞模型来克服工业放大中的不确定性 | 研究仍处于概念阶段,缺乏具体的实验验证和实际应用案例 | 促进生物制造工艺放大的多尺度优化和数字孪生发展 | 微生物菌株在工业生物反应器中的性能 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 机器学习, 大语言模型 | 迁移学习, 强化学习, 贝叶斯优化 | 文献数据, 实时数据 | NA | NA | 微生物 | 混合数字细胞模型 | 工业生物技术 |
| 200 | 2026-05-28 |
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03034-6
PMID:42192394
|
综述 | 系统综述QS皂苷的异源生物合成进展,重点探讨利用微生物细胞工厂生产QS-21等化合物的合成生物学策略 | 全面梳理了最具有前景的QS皂苷QS-21的作用机制和应用,并深入探索了微生物合成QS皂苷的合成生物学策略,同时针对当前研究挑战提出了靶向应对策略 | 未具体说明,但综述性质决定了其受限于已有文献的覆盖范围和数据可用性 | 为促进QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 | QS皂苷(特别是QS-21)及其生物合成途径和异源生产策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、异源生物合成 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂(具体种类未指明) | QS皂苷的生物合成途径(包括QS-21的代谢通路设计) | 医学、疫苗学、食品、化妆品、洗涤剂 |