合成生物学相关文章
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当前共找到 5384 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-07-10 |
De novo peptide grafting to a self-assembling nanocapsule yields a hepatocyte growth factor receptor agonist
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103302
PMID:34805784
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研究论文 | 通过将抗MET肽药效团移植到自组装纳米胶囊的表面，生成了一种能激活肝细胞生长因子受体MET的新型生物制剂 | 首次将Lasso-grafting技术应用于自组装蛋白质纳米胶囊，通过多药效团展示诱导MET受体二聚化并激活信号通路 | 未明确讨论体内稳定性和免疫原性等潜在限制 | 开发一种基于合成生物学的胶囊型生物制剂，以激活信号受体 | 肝细胞生长因子受体MET及自组装纳米胶囊AaLS | 合成生物学 | NA | Lasso-grafting技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 通过Lasso-grafting将抗MET肽药效团植入lumazine synthase变体的环中，形成多药效团展示的纳米胶囊 | 医学 |
| 182 | 2026-07-09 |
Gene expression in synthetic biology: Going with the light
2026-Sep, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
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综述 | 本文综述了利用光诱导基因表达在合成生物学中的应用，重点探讨了光遗传学方法与基因回路设计的结合 | 系统总结了光敏启动子、光调节转录因子和光笼诱导剂等光诱导基因表达元件，并首次将光作为二进制输入函数与逻辑门设计相结合，阐明了光遗传学与合成生物学之间的关联 | 主要聚焦于原核生物，对真核系统仅作简要比较，可能限制了在高等生物中的应用推广 | 综述光诱导基因表达在合成生物学中的关键元件和逻辑门设计，促进光遗传学与合成生物学的融合 | 原核生物为主，兼与真核基因表达系统比较 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 光诱导基因表达回路, 逻辑门 | 生物技术, 医学 |
| 183 | 2026-07-09 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品中农药残留酶降解策略的最新进展，重点讨论工程化手段提升催化性能与应用转化 | 系统整合天然酶、纳米酶、多酶/杂化级联体系，并引入人工智能辅助设计与合成生物学新兴方法 | 实际食品基质中酶稳定性、可重复使用性及规模化应用存在障碍，监管不确定性尚未解决 | 探讨酶催化降解农药的工程化策略及其在食品体系中的实际应用潜力 | 农药残留物及相关酶类（天然酶、纳米酶、级联系统） | 机器学习 | NA | 生物催化、纳米技术、人工智能设计、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 人工智能辅助设计, 合成生物学工具 | NA | 多酶或杂化级联系统 | 食品, 农业 |
| 184 | 2026-07-09 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统回顾基因组规模代谢模型在萜类化合物生物合成中的进展 | 综述了GSMM在典型萜类生产微生物（包括模式和非模式微生物）中的应用，并讨论了多约束模型及机器学习与合成生物学整合等未来方向 | 主要关注四种微生物，可能未覆盖所有萜类生产宿主 | 为萜类细胞工厂的智能设计和高效构建提供理论参考 | 四种典型萜类生产微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、蓝细菌和另一种非模式微生物 | 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 蓝细菌 | 萜类生物合成途径 | 医学, 农业, 能源, 食品 |
| 185 | 2026-07-09 |
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Jul-07, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120464
PMID:42413334
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研究论文 | 通过构建多模块工程大肠杆菌，实现5种苯乙酮衍生物混合物的完全降解，避免不完全降解产生的中间体毒性 | 首次利用合成生物学方法将14个结构优化基因整合为4个分解代谢模块，构建了可完全降解5种苯乙酮衍生物及其混合物的工程菌株，并验证了其有效解毒能力和广泛底物范围 | 未详细评估工程菌株在复杂自然环境中的长期稳定性和生态影响，以及降解产物对土壤微生物群落的影响 | 解决微生物不完全降解苯乙酮衍生物产生有毒中间体积累的环境污染问题 | 5种苯乙酮衍生物（苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮）及其混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、同位素标记追踪、斑马鱼毒性测试 | NA | 降解动力学数据、同位素标记数据、毒性测试数据 | 5种苯乙酮衍生物，每种1 mM浓度，混合降解实验 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | 多模块分解代谢通路（4个模块，整合14个结构优化基因） | 环境修复 |
| 186 | 2026-07-09 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 该文章以临床转化视角审视细菌疗法，提出“精准活体治疗”新范式，并系统综述细菌表面工程策略以提高肿瘤可及性 | 首次提出“肿瘤可及性”概念，强调其在当前治疗应用中的关键瓶颈，并从临床转化角度借鉴抗体药物偶联物成功经验，提出从局部修饰设计转向系统性可及性整体考虑的新范式 | 未详细讨论细菌表面工程策略在人体临床试验中的实际效果及潜在安全性问题 | 探讨细菌疗法从实验室到临床转化的关键障碍，特别是肿瘤可及性不足的问题，并综述表面工程策略以推动精准活体治疗发展 | 细菌表面工程策略及其在肿瘤、炎症性疾病和代谢疾病中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌表面工程（包括共价偶联、细胞膜封装、生物素-链霉亲和素系统等） | 医学 |
| 187 | 2026-07-09 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 综述了黄曲霉在食品安全威胁与生物技术资源方面的双重角色，重点探讨其次级代谢多样性及调控机制 | 将黄曲霉重新定义为双用途生物体，既关注生物安全风险又突显其可开发的化学多样性，并系统概述了CRISPR等新兴生物技术策略在激活隐秘代谢产物方面的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同调控机制的效果，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 总结黄曲霉次级代谢组的知识，探索其生物技术潜力以促进制药和农业创新 | 黄曲霉的次级代谢产物，包括黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、黄曲霉震颤素及隐秘代谢产物 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达、合成生物学 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学平台 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇激活、异源表达途径 | 农业, 制药, 食品, 工业生物技术 |
| 188 | 2026-07-09 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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评论文章 | 本文回顾了合成酵母基因组计划（Sc2.0）的进展，该计划已构建所有16条酵母染色体的合成版本，并探讨了未来新染色体的潜力 | 通过设计-构建-测试-学习循环重新定义了对真核生物基因组的理解，并将酵母基因组视为动态可修改系统，而非静态蓝图；同时提出了正交于天然基因组的模块化合成染色体（新染色体）的概念 | 作为一篇短评，未深入讨论技术挑战或潜在局限性 | 庆祝《酵母》期刊40周年，概述酵母遗传学在Sc2.0项目及后续工作中的关键概念和技术进步 | 酿酒酵母及其合成染色体 | 合成生物学 | NA | 合成基因组组装, 设计-构建-测试-学习循环 | NA | 基因组序列 | 所有16条酵母染色体的合成版本 | NA | 酿酒酵母 | 新染色体 | NA |
| 189 | 2026-07-09 |
EL222-Based Optogenetic Gene Regulation in Methylotrophic Yeasts: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70025
PMID:42126106
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综述 | 综述了基于EL222的光遗传学基因调控在甲基营养酵母中的机制、应用和未来方向 | 聚焦EL222系统在毕赤酵母中的光控异源蛋白生产，及其在酿酒酵母合成生物学和代谢工程中的广泛应用，展示了光遗传学作为无化学诱导剂替代方案的潜力 | 文中未明确指出具体局限性，但可能包括光穿透深度、光敏蛋白稳定性或大规模发酵中的光传递效率等实际问题 | 总结酵母光遗传学领域的关键进展，特别是EL222系统在甲基营养酵母中实现光控基因调控，推动更安全、可控和节能的基因调控策略 | 甲基营养酵母如毕赤酵母，以及酿酒酵母 | 合成生物学 | 不适用 | 光遗传学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 毕赤酵母, 酿酒酵母 | 基于EL222的光控基因调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学, 代谢工程 |
| 190 | 2026-07-09 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
|
research paper | 本研究报道了通过共递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸（dsNHO）可显著提高莱茵衣藻的基因敲除效率 | 发现非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，可将基因敲除效率提高高达100倍，并阐明其通过破坏细胞DSB感知通路将DNA修复从经典的NHEJ转向易错的MMEJ机制 | NOE效应受dsNHO长度、结构和化学修饰的显著影响，且具体机制仍需进一步验证 | 提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑, 非同源寡核苷酸增强（NOE） | NA | NA | 未明确样本数量 | CRISPR-Cas | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 191 | 2026-07-09 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Jun, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 批判性评估溶瘤呼肠孤病毒（特别是Pelareorep）的体内追踪策略，强调其临床转化和实施 | 整合了光学、核素、磁共振、超声/光声等多种模态成像及纳米技术、分子报告基因等先进工具，并引入合成生物学、AI、液体活检等新兴策略，提供了患者特异性追踪的规模化方案 | 病毒基因组容量限制、免疫介导清除以及信号穿透深度不足等挑战仍然存在 | 评估溶瘤呼肠孤病毒（尤其Pelareorep）的体内追踪技术，促进临床优化设计和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒（Pelareorep）及其在肿瘤治疗中的体内分布和疗效监测 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光学成像、核素成像、磁共振成像、超声/光声成像、纳米技术、分子报告基因、CRISPR、AI图像分析、液体活检 | NA | 图像 | NA | CRISPR回路、病毒条形码 | 人类细胞 | 合成生物学报告基因回路 | 医学 |
| 192 | 2026-07-09 |
Cotranslational Assembly of Oligomeric Proteins
2026-06, Annual review of biochemistry
IF:12.1Q1
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综述 | 本文综述了寡聚蛋白的共翻译组装机制，探讨其与合成、折叠和亚基组装的紧密耦合，以及其在人类疾病、进化意义和合成生物学中的潜力 | 颠覆了寡聚蛋白组装是翻译后随机碰撞的传统观点，系统阐述了共翻译组装作为一种根本不同机制在空间时间协调、层次化组装、结构多样性及进化功能中的创新性影响 | 未提供具体实验数据支持，且共翻译组装在不同蛋白系统中的普遍性和具体调控机制仍需进一步验证 | 阐述共翻译组装的分子机制、细胞需求及功能意义，并讨论其在人类疾病、进化以及合成生物学中的应用潜力 | 寡聚蛋白的共翻译组装过程及其涉及的亚基 | 合成生物学 | 人类疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 重组蛋白生产 |
| 193 | 2026-07-09 |
Abiotic stress sensing in plants: Biochemical and biophysical basis
2026-May-14, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 本文综述了植物响应非生物胁迫的生化与生物物理基础感知机制 | 系统总结了温度、干旱、盐碱、洪涝和土壤压实等胁迫的代表性感知机制，并强调了Ca和活性氧作为中心整合因子的作用，同时指出了人工智能驱动建模、单细胞技术、合成生物学和基因组编辑等新兴方法的潜力 | 主要关注已知感知机制，对原初胁迫信号识别、空间组织及复合胁迫感知等未解问题仅作展望 | 阐明植物非生物胁迫感知的分子逻辑与机制 | 植物（未具体指定物种） | 机器学习和人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因组编辑 | 植物 | 生物传感器 | 农业, 环境 |
| 194 | 2026-07-09 |
Rare-codon-tuned fluorescent biosensor for high-throughput selection of Escherichia coli strain capable of L-arginine overproduction
2026-05-12, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-026-05154-w
PMID:42121024
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研究论文 | 开发一种稀有密码子调控的荧光生物传感器，用于高通量筛选能够过量生产L-精氨酸的大肠杆菌菌株 | 该传感器利用稀有密码子AGG编码的富含L-精氨酸肽模块与StayGold荧光蛋白融合，建立荧光强度与胞内L-精氨酸水平的严格关联，无需正交翻译系统即可在野生型菌株中应用 | 未具体说明局限性，但可能包括传感器对特定代谢物的特异性及长期稳定性待验证 | 开发高通量表型分析方法以加速菌株优化和生物制造 | 大肠杆菌ARG文库及其突变菌株 | 合成生物学 | NA | 紫外线诱变、荧光激活细胞分选、基因组分析 | NA | 基因组序列和荧光数据 | 大肠杆菌ARG文库（未指定具体数量），以及分离的菌株ARG-B10和B10 | NA | 大肠杆菌 | 稀有密码子依赖的荧光生物传感器，包含AGG稀有密码子富集的L-精氨酸肽模块与StayGold融合基因 | 工业生物技术 |
| 195 | 2026-07-09 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 综述了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型，以及通过Shokat系统和磷酸化蛋白质组学等工具解析有丝分裂阈值和减数分裂特异性的研究进展 | 结合化学生物学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学方法，系统阐述了Cdk1活性调控的定量与定性机制，并拓展到减数分裂的特异性调控 | 主要基于酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）的研究，对脊椎动物等更复杂体系的整合有限，且未涉及哺乳动物中的细节机制 | 阐明Cdk1活性调控的定量阈值与定性功能在细胞周期进程（有丝分裂和减数分裂）中的作用机制 | 酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）以及脊椎动物相关研究 | 细胞生物学 | NA | Shokat系统（类似物敏感性等位基因）、质谱分析、合成生物学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母、脊椎动物细胞 | NA | 基础生物学 |
| 196 | 2026-07-09 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 介绍一种合成基因回路，能够选择性靶向RAS驱动型癌症 | 通过组合多个RAS传感器构建基因回路，实现了前所未有的高选择性输出蛋白表达 | 暂无明确限制说明 | 开发一种高选择性的合成基因回路，用于靶向RAS突变驱动的癌症治疗 | RAS突变型癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成基因回路 | NA | RAS靶向基因回路，包含多个RAS传感器和一个输出蛋白表达模块 | 医学 |
| 197 | 2026-07-08 |
Exploring Neurological Disorder Therapeutics: The Progress and Future Prospects of Proteins and Peptides Derived from Blue Foods
2026-Jul-06, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 探讨蓝色食物来源的蛋白质和肽在神经疾病治疗中的进展与未来前景 | 综述了蓝色食物生物活性分子在神经保护中的多机制作用，并展望了纳米制剂、合成生物学和人工智能在肽发现中的新方法 | 临床转化面临提取标准化、生物利用度、批次差异、过敏原性和复杂监管要求等挑战 | 总结蓝色食物来源蛋白质和肽在神经疾病治疗中的研究进展，并评估其临床应用潜力 | 海洋鱼类、藻类和无脊椎动物等蓝色食物中的生物活性蛋白质和肽 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 198 | 2026-07-08 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 展示了一个能自我复制的53 kb人工模块基因组，该基因组编码所有26种大肠杆菌染色体复制系统蛋白，在体外实现自我复制 | 首次实现由遗传信息生成自我编码复制机制的染色体复制系统，构建了名为PRIMES的体外自我复制系统，支持超过28代递归自我复制 | NA | 构建能自主自我复制的人工细胞，实现自下而上的合成生物学目标 | 大肠杆菌染色体复制系统和人工模块基因组 | 合成生物学 | NA | Replication-Cycle Reaction (RCR) 系统、蛋白质合成系统 (PURE) | NA | NA | NA | NA | NA | 模块基因组 (RCR module-genome) | 合成生物学、人工细胞构建 |
| 199 | 2026-07-08 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 利用机器学习引导发现聚对苯二甲酸乙二醇酯结合模块，以增强耐用全细胞降解 | 提出机器学习辅助管道，结合隐马尔可夫模型同源性搜索和监督式PET水解酶机器学习模型（PETML），从天然蛋白质架构中发现了新型PET结合模块，并展示了其在全细胞催化降解PET中的优越性能 | 未明确说明局限性，但研究主要基于计算预测和体外实验，可能缺乏体内实际环境验证 | 开发可增强PET酶降解效率的结合模块，实现耐用全细胞催化系统 | PET结合模块候选物，特别是tCBM13-1，以及大肠杆菌表面展示系统 | 机器学习，合成生物学 | NA | 机器学习，分子对接，分子动力学模拟，表面展示 | 隐马尔可夫模型，PETML | 蛋白质序列数据，分子对接数据，实验测量数据 | 197个非冗余候选模块，重点研究tCBM13-1 | CRISPR-Cas9（可能用于展示系统建设） | Escherichia coli | 双锚定系统（OmpA和EhaA）用于表面共展示FAST-PETase和tCBM13-1 | 环境，工业生物技术 |
| 200 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术，实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用，实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成，并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数，以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法，显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性，但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术，用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |