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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2301 | 2024-08-07 |
Are Antisense Proteins in Prokaryotes Functional?
2020, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2020.00187
PMID:32923454
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研究论文 | 本文探讨了原核生物中反义蛋白的功能性问题 | 研究揭示了大量新发现的蛋白质对生物体有用,并提出了这些蛋白质应被添加到基因组注释中,以及预测它们的方法应标准化 | 确定这些蛋白质产品的功能部分仍需进一步研究,包括分子相互作用的研究和详细的进化分析 | 旨在揭示大量新型蛋白质,这些蛋白质具有极其多样化的潜在实际应用 | 原核生物中的反义蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2302 | 2024-08-07 |
Emerging Cellular Therapies for Cancer
2019-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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研究论文 | 本文探讨了基因工程改造的T细胞作为新型抗癌药物的潜力及其在癌症治疗中的应用 | 介绍了合成生物学方法在细胞工程中的应用,为免疫细胞编程提供了更广泛的工具集 | NA | 探索基因工程T细胞在癌症治疗中的应用及其潜在的扩展领域 | 基因工程T细胞及其在癌症、传染病、器官移植和自身免疫疾病中的应用 | NA | 癌症 | 基因编辑 | NA | NA | NA |
2303 | 2024-08-07 |
Bioengineering Strategies for Protein-Based Nanoparticles
2018-Jul-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070370
PMID:30041491
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综述 | 本文综述了基于蛋白质的纳米颗粒(PNPs)在生物工程和生物偶联方面的最新进展,以及如何利用合成生物学概念来开发和增强PNPs的固有特性并赋予其新功能 | PNPs具有独特的自组装、高稳定性、生物相容性和可生物降解性,以及可通过化学或遗传策略操纵的外部组件和包封特性 | NA | 探讨基于蛋白质的纳米颗粒在药物递送、疫苗开发和生物催化等领域的应用潜力 | 基于蛋白质的纳米颗粒及其在纳米生物技术中的应用 | 生物工程 | NA | 生物偶联 | NA | NA | NA |
2304 | 2024-08-07 |
Applications of Yeast Synthetic Biology Geared towards the Production of Biopharmaceuticals
2018-Jul-06, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070340
PMID:29986380
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综述 | 本文综述了合成生物学在酵母异源生物合成生物制药中的应用,并展示了酵母细胞工厂的潜力和能力 | 近年来,合成生物学和天然代谢途径的阐明推动了这一领域的新发展 | NA | 探讨合成生物学在酵母生物制药生产中的应用及其未来趋势 | 酵母作为生物制药的生产平台 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2305 | 2024-08-07 |
Noise control for molecular computing
2018-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0199
PMID:29997258
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研究论文 | 本文开发了一种算法,用于在保持确定性动力学的同时,在基于质量作用动力学的反应网络中引入可控的状态依赖性噪声。 | 该算法能够在不改变确定性动力学的情况下,引入可控的噪声,从而在生物化学网络设计中起到重要作用。 | NA | 旨在开发一种方法,用于在生物化学网络设计中控制内在噪声。 | 生物化学反应网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2306 | 2024-08-07 |
Heterologous Production of Flavour and Aroma Compounds in Saccharomyces cerevisiae
2018-Jun-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070326
PMID:29958445
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review | 本文综述了利用酵母作为微生物细胞工厂生产风味和香气化合物的方法 | 利用合成生物学领域的进展,通过异源途径在酵母中生产通常稀有且昂贵的植物源化学品 | NA | 探讨酵母作为生产风味和香气化合物的可持续高效方法 | 风味和香气化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2307 | 2024-08-07 |
Boosting Secondary Metabolite Production and Discovery through the Engineering of Novel Microbial Biosensors
2018, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2018/7021826
PMID:30079350
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研究论文 | 本文介绍了通过工程化新型微生物生物传感器来促进细菌中次级代谢产物生产和发现的最新进展 | 开发了新型合成生物学方法,用于提高次级代谢产物的生产率和在异源宿主中挖掘及重建新的生物合成基因簇 | 讨论了当前开发方法的潜力和局限性,并指出了该领域可能的新方向 | 旨在通过工程化微生物生物传感器和合成启动子及表达系统,构建微生物细胞工厂以生产次级代谢产物 | 细菌中的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因簇 | NA |
2308 | 2024-08-07 |
Auxotrophy to Xeno-DNA: an exploration of combinatorial mechanisms for a high-fidelity biosafety system for synthetic biology applications
2018, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-018-0105-8
PMID:30123321
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中用于提高生物安全性的多种组合机制,包括从营养缺陷型到最小基因组的方法 | 提出了使用Xeno-DNA和非经典氨基酸等方法来消除构建细胞的遗传信息,以及基于Xeno-DNA的无细胞系统的最终生物安全系统 | NA | 研究并改进合成生物学中的生物安全系统,特别是在iGEM竞赛的背景下 | 合成生物学中的生物安全系统,包括营养缺陷型、毒素-抗毒素系统、无细胞系统等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2309 | 2024-08-07 |
De novo design of modular peptide-binding proteins by superhelical matching
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05909-9
PMID:37020023
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研究论文 | 本文介绍了一种通过超螺旋匹配设计模块化肽结合蛋白的新方法 | 利用几何哈希技术识别与双齿氢键兼容的蛋白骨架和肽对接排列,并通过优化蛋白序列以实现折叠和肽结合 | NA | 设计具有序列特异性的肽结合蛋白,以应用于蛋白质组学和合成生物学 | 模块化肽结合蛋白及其与肽的相互作用 | 蛋白质工程 | NA | 几何哈希技术 | NA | 蛋白质结构 | 设计了六种不同的三肽重复序列结合蛋白 |
2310 | 2024-08-07 |
The interplay of spatial organization and biochemistry in building blocks of cellular signalling pathways
2020-05, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0251
PMID:32453980
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研究论文 | 本文探讨了空间组织与生化途径之间的相互作用,重点关注了共价修饰循环和双组分系统等基本构建模块 | 分析了不同类型的空间组织对修饰动力学的影响,以及空间组织与化学反应之间的相互作用 | NA | 理解空间组织在生化途径中的作用,并为合成生物学中的途径空间组织工程提供见解 | 共价修饰循环和双组分系统等生化途径的基本构建模块 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2311 | 2024-08-07 |
Structural organization of biocatalytic systems: the next dimension of synthetic metabolism
2019-Nov-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190015
PMID:33523157
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综述 | 本文综述了体外合成代谢网络(SIVMNs)的结构组织及其在提高效率和生产力方面的重要性 | 探讨了如何通过结构组织优化合成代谢网络,以减少有害副反应、有效利用可再生能源并提高生产力 | NA | 探讨如何进一步发展体外合成代谢网络,通过结构组织优化其性能 | 体外合成代谢网络(SIVMNs)及其反应的结构组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2312 | 2024-08-07 |
Physicochemical considerations for bottom-up synthetic biology
2019-11-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190017
PMID:33523159
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综述 | 文章综述了从分子组件构建合成细胞的挑战性研究领域,特别是生物系统在合成囊泡中限制的影响 | NA | NA | 探讨构建合成细胞所需的物理化学考虑 | 合成细胞的内部pH、离子强度、大分子拥挤、氧化还原状态及代谢能量守恒 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2313 | 2024-08-07 |
Modeling population dynamics in a microbial consortium under control of a synthetic pheromone-mediated communication system
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800107
PMID:32625018
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一个由两种菌株组成的模型共生体,其中接收菌株的生长和荧光标记蛋白EGFP的表达受发射菌株产生的α-因子信息素浓度控制,并开发了一个定量的实验和理论框架来描述模型共生体中的种群动态 | 本文开发了一个定量的实验和理论框架,用于描述受合成信息素介导的通信系统控制的微生物共生体中的种群动态 | NA | 研究如何通过合成生物学方法控制微生物共生体的行为,以应用于复杂的生物转化过程 | 由两种菌株组成的模型共生体,其中一种菌株产生α-因子信息素,另一种菌株受信息素浓度控制生长和表达荧光标记蛋白EGFP | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | 数学模型 | 生物数据 | 两种菌株的共生体在不同培养条件下的实验数据 |
2314 | 2024-08-07 |
Recent advances in natural products exploitation in Streptomyces via synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800137
PMID:32625022
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综述 | 本文综述了利用合成生物学在链霉菌中开发天然产物的新进展 | 合成生物学作为一种新的生物工程平台,被用于发现新的生物活性化合物并扩大生物活性天然产物的多样性和生产 | NA | 探讨合成生物学在天然产物开发中的应用 | 链霉菌中的天然产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
2315 | 2024-08-07 |
Lignin valorization meets synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800133
PMID:32625023
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综述 | 本文综述了合成生物技术在木质素转化中的应用,特别是生产高价值产品如芳香化学品、环裂解化学品和生物活性物质 | 合成生物技术为木质素的高值化利用提供了新的潜在策略,包括优化木质素降解酶、构建新型人工转化途径和改进模型微生物底盘 | NA | 探讨合成生物技术在木质素转化中的应用,以实现木质素的高值化利用 | 木质素及其转化产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
2316 | 2024-08-07 |
Advances in bio-based production of dicarboxylic acids longer than C4
2018-Sep, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800023
PMID:32624947
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综述 | 本文综述了利用生物方法特别是合成生物学技术生产C4以上直链二羧酸的最新进展 | 设计并验证了多种生产二羧酸的路径,包括C5至C15范围的二羧酸,并通过工程化微生物宿主和优化生物催化元件的性质来提高目标二羧酸的代谢通量 | 讨论了相关路径的当前优势和局限性,并提出了合成路径设计和优化以实现二羧酸超量生产的展望 | 探讨生物基生产化学品的方法,特别是二羧酸的生产 | C4以上直链二羧酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2317 | 2024-08-07 |
Developing a Multidisciplinary Approach for Engineering Stem Cell Organoids
2020-Jul, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-019-02391-1
PMID:31659603
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研究论文 | 本文探讨了多学科方法在干细胞衍生类器官开发中的应用 | 文章介绍了干细胞生物学、合成生物学、生物工程和生物技术领域的最新进展,特别是干细胞衍生类器官的开发 | 文中指出类器官研究在可重复性和规模化方面仍面临挑战 | 旨在通过多学科方法优化类器官的形成条件,以促进其在疾病模型、药物发现和再生医学中的应用 | 研究对象包括干细胞、细胞外基质以及生物化学和生物物理信号 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
2318 | 2024-08-07 |
Functional replacement of isoprenoid pathways in Rhodobacter sphaeroides
2020-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13562
PMID:32207882
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研究论文 | 本研究在工业相关细菌 Rhodobacter sphaeroides 中,通过合成生物学和代谢工程技术,成功替换了内源性的 2-C-甲基-D-赤藓糖醇 4-磷酸(MEP)途径,引入了一种正交代谢途径,即来自相关细菌的异源甲羟戊酸(MVA)途径,以提高倍半萜的生产效率 | 通过替换内源性代谢途径为异源途径,实现了在 Rhodobacter sphaeroides 中倍半萜生产效率的提升 | NA | 探索在细胞工厂中引入代谢旁路以提高生产效率的可能性 | Rhodobacter sphaeroides 细菌中的代谢途径替换 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | 代谢途径分析 | NA |
2319 | 2024-08-07 |
Rapid prototyping of microbial production strains for the biomanufacture of potential materials monomers
2020-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2020.04.008
PMID:32335188
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研究论文 | 本文评估了一种生物制造流水线的能力,该流水线能够快速原型化微生物细胞工厂,用于生产化学多样性的工业相关材料构建块 | 通过结合160个遗传部件构建115条独特的生物合成途径,实现了17种潜在材料单体和关键中间体的生产 | NA | 探索通过微生物菌株工程高效生产化学品的方法,并评估其在可持续材料生产中的潜力 | 微生物生产菌株和生物制造流水线的能力 | 合成生物学 | NA | 微生物菌株工程 | NA | 遗传部件 | 160个遗传部件,115条独特的生物合成途径 |
2320 | 2024-08-07 |
sgRNA-PSM: Predict sgRNAs On-Target Activity Based on Position-Specific Mismatch
2020-Jun-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.01.029
PMID:32199128
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研究论文 | 本文提出了一种名为sgRNA-PSM的新方法,用于预测sgRNA在CRISPR-Cas9系统中的靶向活性,通过捕捉长程序列信息和进化信息来减少特征向量的维度,避免过拟合风险 | 提出了两种新方法sgRNA-PSM和sgRNA-ExPSM,通过捕捉长程序列信息和进化信息来提高sgRNA靶向活性预测的准确性 | 目前的方法存在一定的局限性,需要新的计算预测方法来改进 | 开发新的计算方法来预测sgRNA的靶向活性,以支持理论研究和实际应用 | sgRNA的靶向活性 | 生物信息学 | NA | CRISPR-Cas9系统 | NA | 序列数据 | 基准数据集包含11个人类基因和6个老鼠基因,以及一个独立数据集 |