合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 2361 - 2380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2024-08-07 |
Optimization-based synthesis of stochastic biocircuits with statistical specifications
2018-01, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0709
PMID:29321266
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研究论文 | 本文提出了一种计算框架，用于系统地指定内在噪声水平，并基于统计规范设计高度异质性的生物电路 | 使用描述性统计作为随机生物电路的直观规范语言，并开发了一种基于优化的计算工具，探索满足设计要求的参数配置 | NA | 增强随机生物电路的设计过程 | 随机生物电路的设计和优化 | 合成生物学 | NA | 优化方法 | 凸优化程序 | 统计数据 | NA |
| 2362 | 2024-08-07 |
Synthetic enhancer design by in silico compensatory evolution reveals flexibility and constraint in cis-regulation
2017-Nov-29, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-017-0485-2
PMID:29187214
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研究论文 | 本文通过计算机模拟补偿进化设计合成增强子，揭示了顺式调控中的灵活性和约束 | 利用功能模型和计算机模拟补偿进化生成与自然增强子相似度不同的合成even-skipped stripe 2增强子，展示了增强子功能的多样性和复杂性 | 文章指出，尽管基因调控模型解释了大部分stripe 2增强子的功能，但表达偏离预测的情况表明可能存在未描述的因子调节表达 | 测试已知转录因子和它们之间的相互作用在多大程度上解释了果蝇even-skipped stripe 2增强子的活性 | 果蝇even-skipped stripe 2增强子的合成设计及其功能 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟补偿进化 | 功能模型 | 序列数据 | 40个序列 |
| 2363 | 2024-08-07 |
Parallel DNA Synthesis on Poly(ethylene terephthalate)
2017-10-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201700321
PMID:28763573
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研究论文 | 本文描述了在氨基化处理的聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）薄片上直接制造DNA阵列的方法 | 使用氨基处理暴露PET薄片上的羟基，这些羟基可用于耦合磷酰胺和启动阵列合成，无需进一步的功能化步骤 | NA | 开发一种灵活且坚固的基质，以提高寡核苷酸合成的通量 | 在PET薄片上直接制造DNA阵列 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 2364 | 2024-08-07 |
Identification of Novel Growth Regulators in Plant Populations Expressing Random Peptides
2017-Oct, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.17.00577
PMID:28807931
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研究论文 | 本文描述了一种结合化学基因组学和合成生物学的方法，通过在大量植物群体中表达随机合成的小肽，筛选出影响植物生长、发育和代谢的新型生长调节因子 | 该研究首次在大量植物群体中合成并筛选出影响植物生物学多个方面的随机小肽，为农业领域引入新一代生长调节剂、除草剂或防御化合物提供了新工具 | 目前研究主要集中在筛选和描述新型小肽对植物生物学的影响，尚未深入探讨这些小肽如何整合到生物化学过程中 | 旨在通过化学基因组学方法识别影响植物生长、发育和代谢的新型小分子 | 在大量植物群体中表达的随机合成小肽 | 合成生物学 | NA | 化学基因组学 | NA | 肽序列 | 超过2000株植物 |
| 2365 | 2024-08-07 |
Block V RTX Domain of Adenylate Cyclase from Bordetella pertussis: A Conformationally Dynamic Scaffold for Protein Engineering Applications
2017-09-17, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins9090289
PMID:28926974
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综述 | 本文综述了来自百日咳博德特菌的腺苷酸环化酶的Block V RTX肽域在钙结合时可逆折叠成β-卷曲二级结构，并探讨了其构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质被用作切换机制，以介导不同的蛋白质功能和蛋白质-蛋白质相互作用 | NA | 探讨RTX肽域的构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质及其在蛋白质工程中的应用 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2366 | 2024-08-07 |
Bacterial cell-free expression technology to in vitro systems engineering and optimization
2017-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2017.07.004
PMID:29062966
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研究论文 | 本文介绍了细菌无细胞表达技术在体外系统工程和优化中的应用 | 本文提出了机器学习实验来优化无细胞蛋白合成系统的蛋白产量，并介绍了使用脂质体作为动态容器合成最小细胞的实验 | NA | 探索无细胞表达系统在生物工程项目中的应用，如无细胞代谢工程、实验的进化设计及合成最小细胞构建 | 无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | 机器学习 | 蛋白 | NA |
| 2367 | 2024-08-07 |
Enzymatic N- and C-Protection in Cyanobactin RiPP Natural Products
2017-03-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6b12872
PMID:28195477
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研究论文 | 本文利用一种新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的自由N端和C端，通过结合其他模块化生物合成酶，实现了天然产物aeruginosamide B的完全合成和线性蓝细菌肽天然产物的生物合成 | 使用新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的N端和C端，并结合其他生物合成酶进行天然产物的合成 | NA | 探索和定义肽天然产物生物合成的酶机制 | 蓝细菌肽天然产物及其生物合成机制 | 生物化学 | NA | 生物合成酶 | NA | 肽 | NA |
| 2368 | 2024-08-07 |
Availability: A Metric for Nucleic Acid Strand Displacement Systems
2017-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00231
PMID:26875531
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研究论文 | 本文介绍了一种用于量化核酸链置换系统中泄漏影响的指标——可用性和相互可用性 | 提出了可用性和相互可用性的概念，用于分析网络并减少泄漏 | 需要进一步验证这些概念在实际合成生物学应用中的效果 | 量化核酸链置换系统中二级结构对泄漏的影响 | 核酸链置换系统中的泄漏问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2369 | 2024-08-07 |
Enzyme engineering: A synthetic biology approach for more effective library generation and automated high-throughput screening
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0171741
PMID:28178357
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，利用Golden Gate策略进行酶工程改造，生成更有效的生物催化剂库并进行自动化高通量筛选 | 本文展示了Golden Gate策略在酶工程中的优势应用，通过定向进化快速生成多样化的生物催化剂库 | NA | 开发一种有效的合成生物学方法，用于生成和筛选生物催化剂库 | Candida antarctica lipase A (Cal-A) 的酶工程改造 | 合成生物学 | NA | Golden Gate策略 | NA | DNA片段 | 三个不同的Candida antarctica lipase A基因片段 |
| 2370 | 2024-08-07 |
Challenges and Advances for Genetic Engineering of Non-model Bacteria and Uses in Consolidated Bioprocessing
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.02060
PMID:29123506
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综述 | 本文综述了非模式细菌遗传工程的挑战与进展，以及在整合生物加工中的应用 | 近年来，合成生物学、分子遗传工具开发、组学数据技术应用和计算工具的发展为非模式宿主的系统开发提供了前所未有的进展 | 非模式微生物的遗传操作仍然具有挑战性，因为生物体特定的细微差别阻碍了通用的分子遗传工具和可翻译的细胞内生化途径及调控机制的知识 | 探讨非模式微生物遗传工程的挑战与进展，以及在整合生物加工中的应用 | 非模式微生物的遗传工程及其在生物加工中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 基因组规模代谢模型 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2371 | 2024-08-07 |
Novel directions in molecular systems design: The case of light-transducing synthetic cells
2017, Communicative & integrative biology
DOI:10.1080/19420889.2017.1365993
PMID:29260799
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comments | 本文评论了在构建光自养合成细胞方面的首个里程碑，展示了其合成生物学背景、未来步骤及可能实现该成就的实验方法 | 文章介绍了光自养合成细胞的研究进展，特别是光合反应中心在巨型脂质囊泡中的重建 | NA | 研究旨在构建能够从可用能源中产生自身生化能量的光自养合成细胞 | 光自养合成细胞及其在脂质囊泡中的光合反应中心重建 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2372 | 2024-08-07 |
Introduction to provocative questions in left-right asymmetry
2016-12-19, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2015.0399
PMID:27821529
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研究论文 | 本文探讨了左右不对称现象的多个重要方面，涵盖细胞层面、生理学、遗传学、解剖学和进化生物学等多个领域 | 揭示了先前未被发现的多样性不对称机制，包括可能构成更普遍不对称发展基础的古老手性元素 | NA | 探讨左右不对称现象的机制及其在生物医学、发育、进化和合成生物学中的深远影响 | 从单细胞到无脊椎动物再到人类发育障碍的多种模型系统 | 发育生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2373 | 2024-08-07 |
Recent development on synthetic biological devices treating bladder cancer
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.08.001
PMID:29062946
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综述 | 本文综述了合成生物学在膀胱癌治疗领域的最新进展 | 利用合成生物学工具，包括DNA、RNA和蛋白质生物部件，探索癌症研究中的多种问题，如机制阐明、诊断工具创新和治疗新方法的发明 | NA | 推动肿瘤合成生物学的基础研究成果向临床应用转化 | 合成生物学在膀胱癌治疗中的应用 | 生物技术 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2374 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in China, UK and US
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.10.002
PMID:29062945
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2375 | 2024-08-07 |
The Saccharomyces cerevisiae pheromone-response is a metabolically active stationary phase for bio-production
2016-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.meteno.2016.05.001
PMID:29468120
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研究论文 | 研究了酵母菌的交配素反应作为生物生产代谢活跃静止期的潜力 | 首次探讨了交配素反应作为生物生产阶段的适宜性，并展示了其独特的代谢活性 | NA | 探索酵母菌交配素反应作为生物生产阶段的适宜性 | 酵母菌的交配素反应及其代谢特性 | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析 | NA | 代谢物通量数据 | NA |
| 2376 | 2024-08-07 |
The cellular Ising model: a framework for phase transitions in multicellular environments
2016-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.1092
PMID:27307510
|
research paper | 本文基于Ising模型引入了一种基因调控网络，该网络能在多细胞环境中诱导相变，从而协调细胞群体的行为 | 设计了由所谓的切换开关与两个群体感应模块Las和Lux接口组成的构建块，展示了信号分子跨细胞膜运输速率变化时，细胞群体从个体切换表型到全局集体表型组织的自发对称性破缺 | NA | 探索多细胞系统中的相变现象及其在合成生物学领域的应用 | 基因调控网络在多细胞环境中的相变行为 | synthetic biology | NA | NA | Ising model | NA | NA |
| 2377 | 2024-08-07 |
Kernel Architecture of the Genetic Circuitry of the Arabidopsis Circadian System
2016-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1004748
PMID:26828650
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研究论文 | 本文通过机制模拟研究了拟南芥昼夜节律系统的遗传电路核心结构，揭示了其核心反馈环路及其对昼夜节律分子特征的贡献 | 首次揭示了拟南芥昼夜节律系统中至少一半的调控交互作用对于表达野生型植物中观察到的昼夜节律分子特征是必不可少的，并提出了一个核心结构的概念 | NA | 探讨拟南芥昼夜节律系统中基因调控交互作用的重要性及其对昼夜节律维持的影响 | 拟南芥昼夜节律系统的遗传电路核心结构 | 生物学 | NA | 机制模拟 | NA | 分子特征 | NA |
| 2378 | 2024-08-07 |
Environmental Factors Modulating the Stability and Enzymatic Activity of the Petrotoga mobilis Esterase (PmEst)
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0158146
PMID:27351338
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研究论文 | 本研究通过计算机辅助识别和重组生产来自极端嗜热菌Petrotoga mobilis的酯酶PmEst，并使用同步辐射圆二色谱和荧光光谱技术进行生物化学、生物信息学和结构表征，以关联PmEst的稳定性和对不同底物的水解活性 | PmEst在有机溶剂中表现出增强的酶稳定性，这可能使其在合成生物学中具有新的应用 | NA | 研究Petrotoga mobilis酯酶PmEst的稳定性和酶活性，并探索其在工业过程中的应用潜力 | Petrotoga mobilis酯酶PmEst的稳定性和酶活性 | 生物技术 | NA | 同步辐射圆二色谱（SRCD）和荧光光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
| 2379 | 2024-08-07 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种在巨型单层脂质囊泡（GUVs）中重建细菌谷氨酸受体（GluR0）的方法，通过将无细胞表达系统封装并孵育在合成细胞内 | 本文创新性地利用无细胞表达系统，通过替换GluR0的N端信号肽为蛋白紫红质信号肽，成功实现了GluR0在混合GUVs膜中的共翻译转运 | 该方法目前仅限于模型膜蛋白GluR0的重建，未来需要验证其在其他膜蛋白重建中的适用性 | 旨在开发一种在合成细胞中重建膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体（GluR0）及其在合成细胞膜中的重建 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA |
| 2380 | 2024-08-07 |
Sugarcane breeding: a fantastic past and promising future driven by technology and methods
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1375934
PMID:38525140
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review | 本文从技术和方法的角度回顾了甘蔗育种的主要历史，指出了当前的状况和挑战，并对智能育种的前景进行了合理展望 | 本文提出了利用现代生物技术（如全基因组选择、转基因、基因编辑和合成生物学）和信息技术（如遥感和深度学习）来实现甘蔗育种的跨越式发展 | 由于遗传基础狭窄、品种退化严重、缺乏突破性品种以及育种周期长和基因聚合概率低等问题，甘蔗育种面临挑战 | 探讨如何利用新技术和方法推动甘蔗育种的发展，以应对未来世界人口爆炸、可耕种土地减少和各种生物及非生物胁迫的威胁 | 甘蔗育种 | NA | NA | 全基因组选择、转基因、基因编辑、合成生物学、遥感、深度学习 | NA | NA | NA |