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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
262 | 2025-03-23 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 本文通过结合理性蛋白质设计、多位点定向诱变和定向进化技术,成功改变了雌激素受体α的配体偏好,使其对乳腺癌治疗药物他莫昔芬产生响应 | 开发了一种名为TERRA的雌激素受体变体,该变体失去了对雌激素的响应性,转而被他莫昔芬激活,这一特性在哺乳动物细胞和小鼠中得以保持 | 未明确提及具体局限性 | 改变雌激素受体α的配体偏好,以扩展哺乳动物合成生物学工具箱 | 雌激素受体α | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多位点定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA |
263 | 2025-03-23 |
Between Centralization and Fragmentation: The Past, Present, and Future of Phage Collections
2024-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1089/phage.2023.0043
PMID:40114810
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综述 | 本文回顾了噬菌体收集的历史和现状,探讨了集中化治疗相关噬菌体收集的挑战和潜力 | 提出了创建可持续、互联和公平的噬菌体银行基础设施的必要性,并考虑了合成生物学和人工智能可能带来的范式转变 | 未提供具体的解决方案或实施细节,仅进行了概述和反思 | 探讨噬菌体收集的集中化和标准化问题,以应对当前知识碎片化和缺乏协调的挑战 | 噬菌体收集和噬菌体银行基础设施 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
264 | 2025-03-22 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MultiCRISPR-EGA的图形用户界面工具,该工具使用精英遗传算法(EGA)来设计优化的单启动子驱动的多路CRISPR引导RNA(gRNA)阵列 | MultiCRISPR-EGA工具通过使用精英遗传算法(EGA)优化多路gRNA阵列设计,显著提高了CRISPR干扰(CRISPRi)应用的效率和特异性 | 工具的性能仅在计算实验中进行了验证,尚未在实际生物实验中进行广泛测试 | 优化多路CRISPR引导RNA(gRNA)阵列设计,以提高基因组编辑的效率和成本效益 | 多路CRISPR引导RNA(gRNA)阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | 精英遗传算法(EGA) | 基因目标数据 | NA |
265 | 2025-03-22 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 本文开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关(ON-核糖开关),用于创建多步基因调控级联 | 首次在真核细胞无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联,并成功开发了高效的蛋白质响应性ON-核糖开关 | 初始设计的两种ON-核糖开关效率较低,且多步级联的切换效率受限于其中最差的一步 | 构建真核细胞无细胞系统中的复杂基因调控级联 | 蛋白质响应性ON-核糖开关及其在基因调控级联中的应用 | 合成生物学 | NA | 核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
266 | 2025-03-22 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了CRISPR基因工具包在提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能方面的应用 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的最新进展,包括基因编辑、转录调控和酶调节 | 未具体提及研究的局限性 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
267 | 2025-03-22 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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综述 | 本文综述了合成生物学策略在高效生产天然色素及其非天然衍生物方面的最新进展 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量和多样化生产非天然衍生物的策略 | 天然色素在市场上的商业化仍面临稳定性差、颜色谱有限和产量低等挑战 | 探索利用合成生物学方法高效生产天然色素及其非天然衍生物 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
268 | 2025-03-22 |
Semiautomated Production of Cell-Free Biosensors
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00703
PMID:40073441
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研究论文 | 本文探讨了使用液体处理机器人技术制造无细胞生物传感器的反应,比较了手动和半自动反应组装方法 | 使用液体处理机器人技术进行无细胞生物传感器的半自动化生产,提高了生产效率和一致性 | 研究仅针对两种无细胞基因表达检测系统进行了测试,未涵盖所有可能的生物传感器类型 | 提高无细胞生物传感器的生产效率和质量控制 | 无细胞生物传感器的制造过程 | 合成生物学 | NA | 液体处理机器人技术 | NA | NA | 384孔板的氟化物感应无细胞生物传感器 |
269 | 2025-03-22 |
Biosynthesis and metabolic engineering of natural sweeteners
2025-Mar-18, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01864-y
PMID:40100508
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综述 | 本文综述了天然甜味剂的生物合成途径及相关酶,并重点介绍了利用合成生物学方法通过微生物细胞工厂生产这些甜味剂的研究 | 总结了多种天然甜味剂的生物合成途径,并探讨了利用合成生物学技术进行微生物生产的进展 | 未提及具体实验数据或生产规模,主要为基础性综述 | 探讨天然甜味剂的生物合成途径及其微生物生产方法 | 天然甜味剂,如罗汉果苷、甜菊糖苷、甘草酸等 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
270 | 2025-03-22 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-Mar-18, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 本文通过定向进化技术增强羟化酶XcP4H的活性,用于在工程化益生菌中高效生产5-HTP,以治疗抑郁症 | 使用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化,显著提高了5-HTP的产量,并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 解决5-HTP的药代动力学问题,开发一种基于益生菌的活体治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程化益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动力学模拟、基因编辑 | NA | NA | 小鼠模型 |
271 | 2025-03-21 |
Modulating ion channels with nanobodies
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005
PMID:40103710
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综述 | 本文综述了纳米抗体在离子通道研究和调控中的应用进展 | 纳米抗体因其小尺寸、高特异性和识别难以接近的表位的能力,为离子通道的结构-功能关系研究提供了新的机会,并有望克服传统药物的脱靶效应和毒性问题 | NA | 探讨纳米抗体在离子通道研究和治疗中的潜力 | 离子通道 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体技术 | NA | NA | NA |
272 | 2025-03-21 |
Recent advances in biological synthesis of food additive succinate
2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2472636
PMID:40107767
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综述 | 本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展,重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用 | 本文通过先进的合成生物学技术,强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力,并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向 | 尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力,但仍需提高成本效益和竞争力,同时考虑环境问题 | 提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益,同时考虑环境问题 | 琥珀酸 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略,包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导 | NA | NA | NA |
273 | 2025-03-21 |
Microalgae in health care and functional foods: β-glucan applications, innovations in drug delivery and synthetic biology
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1557298
PMID:40103595
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综述 | 本文综述了微藻在医疗保健和功能性食品中的应用,特别是β-葡聚糖的治疗潜力、药物递送创新和合成生物学应用 | 强调了微藻在免疫调节和抗癌治疗中的潜力,以及合成生物学和生物工艺工程在提高微藻治疗和营养价值方面的创新应用 | 需要进一步研究和开发以解决可扩展性、法规一致性和消费者接受度问题 | 探讨微藻在医疗保健和功能性食品中的应用潜力 | 微藻及其衍生的生物活性化合物,如β-葡聚糖 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学、生物工艺工程 | NA | NA | NA |
274 | 2025-03-21 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
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研究论文 | 本文通过结构基础的工程改造,将一种倍半萜环化酶转化为α-红没药醇合酶,展示了其作为合成生物学应用平台的潜力 | 通过突变活性位点轮廓,重新设计EIZS以生成倍半萜醇产物,而非倍半萜烃产物,扩展了EIZS作为设计环化酶平台的潜力 | 突变后的酶在生成α-红没药醇时的保真度仅为65%至74%,表明仍有改进空间 | 研究目的是通过结构基础的工程改造,将EIZS转化为α-红没药醇合酶,以扩展其在合成生物学中的应用 | 研究对象是EIZS酶及其突变体,特别是F95S-F198S双突变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化表征 | NA | 晶体结构数据、生化数据 | NA |
275 | 2025-03-21 |
Small RNAs Turn Over a New Leaf as Morphogens
2017-11-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.10.025
PMID:29112845
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研究论文 | 本文探讨了移动小RNA梯度通过基于阈值的读取机制创建基因表达尖锐边界的可能性 | 通过操纵参与叶片上下模式的小RNA和一种新颖的合成生物学方法,支持了这一假设 | NA | 研究小RNA梯度在基因表达边界形成中的作用 | 叶片模式形成中的小RNA | 发育生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
276 | 2025-03-20 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析,探讨了Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术,深入解析了Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,并验证了tonb基因在该机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s的碱性抗性机制,未涉及其他极端环境的耐受性 | 研究Halomonas alkalicola CICC 11012s对碱性胁迫的响应分子机制,以促进其在工业污染控制和合成生物学底盘细胞中的应用 | Halomonas alkalicola CICC 11012s及其突变体 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 蛋白质组数据、代谢组数据 | 野生型和突变体Halomonas alkalicola CICC 11012s |
277 | 2025-03-20 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jan-13, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路,该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入 | 开发了一种新型的无细胞生物传感器信号放大电路PSR,通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收,显著提高了生物传感器的灵敏度 | 未提及具体的局限性 | 扩展无细胞生物传感器的功能,提高其检测小分子的灵敏度 | 无细胞系统中的基因表达和传感 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR) | NA | 核酸 | NA |
278 | 2025-03-20 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐(HExxH)结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能 | 首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合,并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能 | NA | 研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能 | 包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶 | 酶学 | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | NA |
279 | 2025-03-20 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体,用于控制染色体基因的表达 | 通过添加诱导型和组成型启动子,增强了mini-Tn插入载体的功能,实现了染色体上基因的差异转录控制 | 研究主要针对革兰氏阴性菌,未涉及其他类型细菌或真核生物 | 开发一种更灵活的染色体基因表达控制系统,以替代质粒在基因互补中的应用 | K-12菌株MG1655的染色体 | 合成生物学 | NA | 染色体整合技术 | NA | NA | NA |
280 | 2025-03-19 |
Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006
PMID:40092160
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研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具,用于非模式微生物Erwinia persicina的基因操作 | 成功应用CRISPR-Cas9系统于Erwinia persicina,通过优化gRNA设计和单质粒系统实现高效基因组编辑,并展示了其在合成生物学中的应用潜力 | 研究主要针对Erwinia persicina,未涉及其他非模式微生物的适用性验证 | 开发适用于非模式微生物Erwinia persicina的基因组编辑工具 | Erwinia persicina细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | NA |