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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-03-10 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-Mar-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 本文开发了一种名为MNGE的通用基因组工程方法,用于在多种细菌中实现多拷贝、高度随机的代谢基因或途径整合 | 基于多靶向整合酶系统开发了不依赖宿主、仅需核心TT二核苷酸即可实现多拷贝随机整合的通用基因组工程技术 | NA | 开发适用于多种细菌的通用基因组工程技术,以高效生产高价值化合物 | 革兰氏阳性菌(链霉菌和糖多孢菌)与革兰氏阴性菌(伯克霍尔德菌和色杆菌) | 合成生物学 | NA | 多靶向整合酶系统 | NA | NA | 涉及4种细菌属(链霉菌、糖多孢菌、伯克霍尔德菌、色杆菌)及3种生物合成基因簇(41kb、106kb、66kb) | 多靶向整合酶系统 | Streptomyces albus, Burkholderia gladioli, Saccharopolyspora, Chromobacterium | 代谢途径整合(杀菌剂UK-2、聚醚抗生素盐霉素、G信号抑制剂FR900359的生物合成基因簇) | 工业生物技术 |
| 262 | 2026-03-10 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Mar-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
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综述 | 本文全面分析与综述了基于群体感应的细菌与真菌间的跨界通讯,并探讨了其工程化应用前景 | 首次系统性地总结和对比了细菌与真菌间基于群体感应的自然相互作用模式与合成生物学工程策略,为模块化调控微生物群落提供了蓝图 | NA | 阐明细菌与真菌间基于群体感应的通讯机制,并探索其工程化调控策略与应用 | 细菌与真菌间的跨界通讯系统及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、定向进化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 群体感应系统、生物膜共组装、代谢互补 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 263 | 2026-03-10 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026-Mar-04, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
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综述 | 本文系统评述了用于琥珀酸生物制造的微生物细胞工厂的工程化策略,包括底盘选择、代谢途径设计、合成生物学工具应用及下游分离工艺创新 | 提供了整合系统生物学、代谢建模与过程工程的多学科视角,为高效微生物细胞工厂设计及琥珀酸商业化生产提出战略框架 | NA | 推动生物基琥珀酸的商业化生产,替代石油化工路线 | 用于琥珀酸生产的微生物平台(细菌和酵母) | 合成生物学 | NA | 系统生物学、代谢建模、过程工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | 天然及异源生物合成途径的理性设计 | 工业生物技术 |
| 264 | 2026-03-10 |
Synthetic bioengineered macrophages for immune cell functions in infectious disease cellular therapy
2026-Mar, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70254
PMID:41420534
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学方法改造巨噬细胞以治疗皮肤利什曼病的新策略 | 首次将可诱导TET-ON基因回路与AI设计的免疫调节肽结合,通过纳米凝胶递送系统实现巨噬细胞功能的精准重编程 | 研究主要针对皮肤利什曼病模型,尚未验证在其他感染或炎症疾病中的普适性 | 开发针对皮肤利什曼病的靶向可控免疫细胞疗法 | 巨噬细胞及其在感染免疫中的功能调控 | 合成生物学 | 皮肤利什曼病 | 基因回路工程、AI肽设计、分子动力学模拟、纳米凝胶递送 | NA | NA | NA | TET-ON基因回路 | 巨噬细胞 | 可诱导表达免疫调节肽PepA的基因回路,用于促进IL-12产生和寄生虫清除 | 医学 |
| 265 | 2026-03-10 |
Polyphenols as Modulators of Macrophage Polarization: Mechanisms and Therapeutic Potential in Chronic Inflammatory Diseases
2026-Mar, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.70181
PMID:41582068
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综述 | 本文综述了天然多酚通过调控关键信号通路(如NF-κB、JAK/STAT等)影响巨噬细胞极化(M1/M2表型),及其在慢性炎症性疾病中的治疗潜力 | 系统阐述了多酚通过调控信号通路对巨噬细胞极化的双重调节作用(促M2抗炎与促M1抗癌),并提出了利用纳米技术、合成生物学和人工智能等创新方法克服多酚生物利用度低等局限性的新策略 | 多酚存在生物利用度低和毒性较低的问题,现有研究仍需进一步克服这些应用障碍 | 探讨天然多酚作为免疫调节剂,通过影响巨噬细胞极化来治疗慢性炎症性疾病的机制与潜力 | 天然多酚类化合物及其对巨噬细胞极化的调节作用 | NA | 慢性炎症性疾病(包括动脉粥样硬化、代谢性疾病、神经退行性疾病等) | 文献综述(基于Web of Science和PubMed数据库检索) | NA | 文本(已发表文献) | NA | NA | NA | NA | 医学(慢性炎症性疾病治疗、癌症免疫治疗) |
| 266 | 2026-03-10 |
Engineering Immune Cell to Counteract Aging and Aging-Associated Diseases
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521776
PMID:41603194
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综述 | 本文综述了工程化免疫细胞在对抗衰老及衰老相关疾病中的应用,探讨了其机制、挑战与未来发展方向 | 首次系统性地阐述了CAR工程化免疫细胞在非癌症衰老相关疾病治疗中的潜力,并提出了结合纳米技术、合成生物学和人工智能的跨学科策略 | 目标特异性有限、免疫抑制微环境、细胞来源和功能变异性等关键挑战尚未完全解决 | 探索免疫细胞疗法在抗衰老和延长健康寿命中的治疗潜力 | 衰老过程、衰老相关疾病、工程化免疫细胞(如CAR-T细胞) | 合成生物学 | 老年疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 免疫细胞(如T细胞) | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 267 | 2026-03-10 |
Programming Next-Generation Synthetic Biosensors by Genetic Circuit Design
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524172
PMID:41655251
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综述 | 本文综述了基于遗传电路设计的下一代合成生物传感器的最新进展,包括其传感机制、设计及应用 | 分析了调整剂量-响应曲线特性的方法,并探讨了与材料科学、电子工程和人工智能的协作以扩展应用空间 | NA | 总结遗传电路驱动的合成生物传感器的设计原则、工具和工程策略,以促进其实验室到现场应用的过渡 | 合成生物传感器 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 环境监测、疾病诊断、食品安全控制、生物生产优化 |
| 268 | 2026-03-10 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架,用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 结合了结构感知的TASEP模拟与机器学习抛光模型,无需表达数据或基因组背景,在多种细胞类型中实现高保真预测 | NA | 开发一种工具,用于从RNA序列预测核糖体位置分布,以支持合成生物学中的mRNA序列理性设计 | mRNA序列及其对应的核糖体位置分布 | 机器学习 | NA | 核糖体分析(Ribo-seq)、RNA-seq | 混合框架(结构感知TASEP与抛光模型) | 序列数据 | 多种细胞类型(iPSC、HEK293、LCL、RPE-1) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 269 | 2026-03-10 |
Geneticability of Live-Cell Site-Specific Synthesis of Quantum Dots
2026-Feb-02, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202519974
PMID:41414644
|
研究论文 | 本文提出了一种在活体哺乳动物细胞内实现功能无机纳米材料分子级空间精确合成的遗传可编程方法 | 通过基因编码富含半胱氨酸的蛋白质标签1DFS,并调控其细胞内固有代谢途径,实现了有机与无机分子在活细胞特定蛋白质位点的精确协同生长量子点,为蛋白质提供独特荧光功能 | NA | 开发一种遗传可编程平台,用于在活体细胞特定分子位点精确合成无机纳米材料,以增强生物体的精确操纵、监测和功能 | 活体哺乳动物细胞、病毒核蛋白(NP)、量子点(QD) | 合成生物学 | NA | 基因编码、代谢途径调控 | NA | NA | NA | 基因编码 | 哺乳动物细胞 | 通过1DFS蛋白质标签介导的有机-无机分子协同生长量子点的合成路径 | 医学、工业生物技术 |
| 270 | 2026-03-10 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因回路映射到仿生电子架构的计算框架,并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因回路作为高效计算模型,为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了一个平台,实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用,特别是针对对数数据转换器的设计 | 合成基因回路与仿生电子架构 | 合成生物学与电子工程交叉领域 | NA | 合成基因回路设计、对数编码技术 | 计算框架、对数模数转换器(ADC)模型 | 电流模式信号 | NA | 合成基因回路 | NA | 合成基因回路作为高效计算模型 | 能源、电子 |
| 271 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法,通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端,用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段(如gRNA和表位标签)组装效率低的问题,能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术,以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段,特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR,DNA组装,磷酸硫酯修饰,T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE(DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease) | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 272 | 2026-03-09 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在组织稳态中的核心作用,重点探讨其表型转换对细胞外基质结构的重塑及其作为治疗靶点的潜力 | 整合多组学分析、合成生物学和AI辅助生物材料,开发能动态调控巨噬细胞功能的‘智能’疗法 | 在实现时空精准调控和平衡促修复与促纤维化结果方面仍面临挑战 | 深入理解巨噬细胞生物学,探索其在疾病治疗中的转化潜力 | 巨噬细胞的发育起源、表型异质性及其在细胞外基质重塑、免疫监视和器官稳态中的作用 | NA | NA | 多组学分析、合成生物学、AI辅助生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 273 | 2026-03-09 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
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综述 | 本文综述了人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径关键调控基因的生物技术研究进展,包括基因发现、功能表征及前沿技术应用 | 聚焦于利用基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿技术,重新编程代谢通量以增强人参皂苷等代谢物生产,并整合组学策略与系统生物学模型 | NA | 阐明和操纵人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径的关键基因,以开发具有改善生物活性化合物谱的优良人参品种 | 人参(Panax ginseng)及其次级代谢产物,特别是苯丙烷类途径的黄酮类和多酚,以及萜类途径的人参皂苷 | NA | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学策略、系统生物学模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参(Panax ginseng) | 代谢途径工程,特别是苯丙烷类和萜类生物合成途径 | 医药 |
| 274 | 2026-03-09 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成进展,重点介绍了计算机辅助工程在提高产量和工业应用中的作用 | 结合生物信息学与合成生物学方法,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 探讨岩藻糖基化寡糖的微生物合成策略及其计算机辅助生产的潜力 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 工程微生物菌株 | 代谢途径工程,包括提高岩藻糖基转移酶活性和供应GDP-岩藻糖前体 | 医药、食品 |
| 275 | 2026-03-09 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化益生菌和微生物系统作为自调节活体疗法中的应用,以应对代谢性疾病 | 利用合成生物学策略开发工程化微生物作为可持续、自适应的活体疗法,整合精准治疗与生物基生产 | NA | 评估合成生物学如何使工程化益生菌和微生物系统成为代谢性疾病的自我调节活体疗法 | 代谢性疾病(如2型糖尿病、肥胖、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎) | NA | 代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 微生物系统 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢通路 | 医学 |
| 276 | 2026-03-09 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程方法重新推动生物脱硫技术发展的最新进展,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌野生型性能、调控机制、系统生物学和基因工程的最新进展,以及革兰氏阴性菌平台中操纵子重构和底盘设计与工艺限制的融合 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法克服传统加氢脱硫技术对持久性有机硫化合物处理不足的问题 | 中馏分燃料中的持久性有机硫化合物及其生物脱硫途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操纵子重构、底盘设计、染色体整合 | 红球菌、假单胞菌 | 4S脱硫途径、调控逻辑(硫源抑制、遗传调控因子)、操纵子架构(基因顺序、翻译调控) | 能源、工业生物技术 |
| 277 | 2026-03-09 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造微生物以将C2原料转化为高价值化学品和材料的最新进展 | 重点介绍了非天然和计算设计的途径、合成生物学与人工智能驱动的设计整合,以及构建下一代电气化和数字化引导的C2生物精炼厂 | NA | 总结并推动基于C2原料的生物制造技术,以支持低碳化学生产 | 微生物(如大肠杆菌、假单胞菌属、光合宿主)及其代谢途径 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块、C1-to-C2平台策略 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 278 | 2026-03-09 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 本文综述了沙棘生物活性成分的作用机制、合成生物学在提升其功能成分产量中的应用,以及基于纳米技术的精准递送系统,旨在推动沙棘在未来食品系统中的大规模应用 | 整合了合成生物学(如CRISPR/Cas9介导的代谢工程)与纳米技术递送系统,为提升沙棘生物活性成分的产量、功能性和生物利用度提供了创新框架 | NA | 探讨沙棘作为功能性食品的开发潜力,并推动其在未来食品系统中的大规模应用 | 沙棘(Hippophae rhamnoides)及其生物活性成分(类黄酮、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖) | NA | NA | CRISPR/Cas9介导的代谢工程、精准发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 279 | 2026-03-09 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
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综述 | 本文综述了利用甲醇作为一碳原料生产生物燃料的工程微生物研究进展 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制,并探讨了代谢通路重构、区室化和适应性进化等工程策略以提升甲醇利用和耐受性 | NA | 推动可持续甲醇生物制造的发展 | 天然和合成甲基营养菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 甲基营养菌 | 代谢通路重构 | 能源 |
| 280 | 2026-03-09 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物工程将细胞编程为生物传感器,以在复杂环境中转换环境信息为可检测信号的最新进展 | 整合生物分子设计、微生物组工程和合成生物学的新兴技术,开发了基于电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出的生物传感器,并利用宏基因组数据挖掘和蛋白质开关设计加速传感组件多样化 | 现有生物传感器在土壤、沉积物和废水等难以成像环境中的应用仍存在严重限制,且需要负责任的发展和现代化监管框架 | 探索和开发微生物作为生物传感器,用于在复杂环境中监测和转换环境信息 | 微生物细胞和群落,特别是未驯化的微生物,作为生物传感器的底盘 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序、宏基因组数据挖掘 | NA | 环境理化信息、生化信号 | NA | 生物分子设计、微生物组工程、合成生物学 | 微生物细胞和群落 | 生物传感器,包括转录调节器和变构蛋白质开关,用于直接调节报告输出 | 环境 |