合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-04-02	Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications 2025-Mar-31, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400671 PMID:40162738	research paper	本研究开发了一种自动化方法，用于大规模生产具有治疗应用潜力的合成细胞（SCs），并通过机器学习和机器人技术优化了生产过程	结合机器人液体处理系统和自动化组织解离器，显著提高了合成细胞的生产效率和规模，同时利用AI图像分析实现了高质量、高通量的SC表征	研究主要聚焦于蛋白质表达的SCs，可能不适用于其他类型的合成细胞	开发自动化方法以提高合成细胞的生产效率和规模，用于治疗应用	合成细胞（SCs）	synthetic biology	NA	robotic liquid handling system, automated tissue dissociator, AI-based image analysis	AI-based image analysis	image	mice administered with large-scale luciferase-expressing SCs
202	2025-04-02	Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency 2025-01-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81235-y PMID:39779752	研究论文	本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率，探索了提高植物转化效率的新方法	发现根外植体具有显著的再生能力和转化适应性，并揭示了与高再生和转化效率相关的候选基因	研究仅针对杨树这一种生物能源作物，未涉及其他重要作物物种	提高植物转化效率，优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习循环	杨树的不同外植体（叶、茎、叶柄和根）	植物生物技术	NA	农杆菌介导的植物转化技术	NA	转录组数据	多种杨树外植体类型（叶、茎、叶柄和根）
203	2025-04-01	Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts 2025-Mar-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02692-2 PMID:40155940	综述	本文总结了特定异黄酮的药理特性、其生物合成途径以及在工程酵母中生产异黄酮的技术策略	利用合成生物学和先进的生物技术策略，实现生物活性异黄酮的环保生产	NA	探讨异黄酮及其前体的生物合成及其在食品、制药和化妆品工业中的应用	植物源性异黄酮及其前体	合成生物学	NA	工程酵母生物合成	NA	NA	NA
204	2025-04-01	Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly 2025-Mar-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58379-0 PMID:40148329	research paper	该研究展示了通过自组装系统实现分子逻辑计算向介观系统的扩展	首次展示了自组装系统（由环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂组成）能够执行逻辑操作，其中膜本身表现为一个Reset-Set Flip-Flop，并集成了7个以上的逻辑元件	人工分子基介观系统在逻辑操作方面的应用仍然非常罕见	探索分子逻辑计算在介观系统中的应用	自组装系统（环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂）	合成生物学	NA	自组装技术	NA	NA	NA
205	2025-04-01	Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis 2025-Mar-28, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs00981a PMID:40151987	综述	本文综述了蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在扩展酶催化功能方面的作用	揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和其生物合成途径，以及它们在酶催化中的新功能和应用	对辅因子生物合成和功能的机制理解仍显不足，传统诱变方法可能干扰辅因子组装	探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在酶催化、生物催化和生物技术中的应用	蛋白质衍生辅因子及其在酶催化中的作用	生物化学	NA	非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱学	NA	NA	NA
206	2025-04-01	CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation 2025-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07454-x PMID:40148310	综述	本文综述了CAR-T细胞疗法在血液肿瘤治疗中的显著效果及其面临的挑战，并介绍了跨学科创新技术以克服当前CAR-T细胞疗法的主要障碍	提出了基于合成生物学的ON/OFF开关、生物指导支架、纳米材料、溶瘤病毒、CRISPR筛选、肠道微生物群及其代谢物等跨学科策略，以设计下一代CAR-T细胞	未提及具体的临床试验数据或样本量，可能缺乏实证支持	克服当前CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中的主要障碍，设计下一代CAR-T细胞	CAR-T细胞疗法及其在肿瘤免疫治疗中的应用	肿瘤免疫治疗	血液肿瘤	合成生物学、CRISPR筛选、纳米材料、溶瘤病毒等	NA	NA	NA
207	2025-04-01	The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms 2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12030324 PMID:40150788	research paper	本文探讨了弗雷德里克·格里菲斯的转化实验的局限性及其在创造新型微生物中的潜力	揭示了经典转化实验在创造新型微生物中的局限性，并探讨了其潜在应用	转化实验依赖于非常相近的微生物，限制了其创造潜力	研究转化实验在合成生物学中的应用及其局限性	微生物的基因组转移和转化实验	合成生物学	NA	基因组转移	NA	NA	NA
208	2025-04-01	Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis 2025-01-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85266-x PMID:39775135	研究论文	通过比较分析猫须草不同组织的转录组，揭示了与黄酮类生物合成相关的差异表达基因	首次全面比较猫须草各组织中黄酮类化合物的合成机制，并鉴定出与根部黄酮积累相关的212个差异表达基因	研究仅关注转录组水平，未涉及蛋白质或代谢物水平的验证	探究猫须草各组织中黄酮类化合物的生物合成机制	猫须草的不同组织（根、茎、叶）	合成生物学	肾脏疾病	HPLC分析、转录组分析、qRT-PCR	NA	转录组数据	猫须草的根、茎、叶组织样本
209	2025-03-30	Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015 PMID:40151792	研究论文	本研究通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（GAS），以增强大肠杆菌中germacrene A的生产	结合分子对接和系统发育分析，对ScGAS进行关键残基诱变，显著提高了germacrene A的产量	研究依赖于大肠杆菌作为宿主，可能不适用于其他生产系统	提高germacrene A的产量，以满足β-榄香烯的临床需求	加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（ScGAS）	合成生物学	癌症	分子对接、系统发育分析、诱变	NA	NA	NA
210	2025-03-30	Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems 2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622 PMID:40117974	研究论文	本研究探讨了动物细胞与叶绿体的相互作用及其在体外细胞培养系统中的光诱导反应	揭示了人类宫颈癌HeLa细胞和小鼠巨噬细胞样J774.1细胞与叶绿体相互作用的三种不同模式，并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性	缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体-动物细胞相互作用	研究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应	人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞	合成生物学	宫颈癌	体外细胞培养	NA	细胞反应数据	HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞
211	2025-03-30	A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement 2025-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14561 PMID:39723813	研究论文	本研究探讨了一种来自甜薯卷叶病毒的SBG51 deltasatellite DNA序列，该序列在终止子下游时能显著增强基因表达	发现SBG51序列能显著增强基因表达，并鉴定出一个123 bp的AT富集序列及其中的'ATAAA'/'TTAAA'元件具有增强效应	未明确说明该技术在更广泛宿主中的适用性及长期稳定性	探索合成生物学中基因表达元件的新设计	SBG51 deltasatellite DNA序列及其衍生的AT富集序列	合成生物学	NA	基因表达分析	NA	基因表达数据	本氏烟草叶片和转基因拟南芥植物
212	2025-03-30	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用来自低等生物的一组酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源	NA	探讨通过异源合成生物学工具延缓衰老和年龄相关疾病的策略	来自低等生物的一组酶，包括氨基酸稳态调节剂、氧化还原电位调节剂等	合成生物学	老年病	NA	NA	NA	NA
213	2025-03-30	Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches 2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15030465 PMID:40141809	综述	本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）进行抗癌策略的最新进展及协同治疗方法	探讨了梭菌在癌症治疗中的直接肿瘤溶解、免疫调节及与现有癌症疗法的协同效应，并介绍了通过合成生物学进行的基因改造	尽管临床前和临床研究表明梭菌疗法与其他疗法结合具有潜力，但仍存在挑战	研究梭菌在癌症治疗中的应用及其与其他疗法的协同效应	厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）	癌症治疗	癌症	合成生物学、基因改造	NA	NA	NA
214	2025-03-30	Engineering Useful Microbial Species for Pharmaceutical Applications 2025-Mar-05, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030599 PMID:40142492	综述	本文综述了微生物工程在制药生物技术中的最新进展，包括基因工程、合成生物学和自适应进化在优化微生物菌株中的应用	整合了CRISPR-Cas系统、合成生物学方法以及AI和ML技术来优化微生物工程，加速新药开发	代谢途径的高效优化、可持续的工业规模生产以及满足国际监管要求仍是关键挑战	探讨微生物工程在制药领域的应用及其技术进展	微生物菌株及其在制药中的应用	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统、合成生物学、AI和ML	NA	NA	NA
215	2025-03-30	Where Biology Meets Engineering: Scaling Up Microbial Nutraceuticals to Bridge Nutrition, Therapeutics, and Global Impact 2025-Mar-02, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030566 PMID:40142459	综述	本文探讨了微生物平台在营养保健品生产中的变革性作用，强调了先进的发酵技术、合成生物学和代谢工程	微生物生物技术作为一种可持续替代方案，利用微生物细胞作为生物工厂，高效合成生物活性化合物	优化微生物菌株、确保产品质量和规模化生产仍面临挑战	探讨微生物平台在营养保健品生产中的应用及其全球健康影响	微生物细胞及其合成的生物活性化合物	生物技术	肥胖、糖尿病、心血管疾病、癌症	CRISPR/Cas9基因组编辑、适应性进化、生物反应器创新	NA	NA	NA
216	2025-03-30	Alien Chromosome Serves as a Novel Platform for Multiple Gene Expression in Kluyveromyces marxianus 2025-Feb-25, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13030509 PMID:40142402	研究论文	本研究探索了利用外来染色体R1作为克鲁维酵母中多基因稳定整合和表达的新平台	首次利用外来染色体R1作为多基因表达的稳定平台，并展示了其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力	目前对克鲁维酵母中调控元件和插入位点的了解有限	开发克鲁维酵母中多基因稳定表达的新方法	克鲁维酵母KS-R1菌株及其外来染色体R1	合成生物学	NA	基因删除、基因替换、异源基因表达	NA	基因表达数据	多个克鲁维酵母菌株及其基因改造变体
217	2025-03-30	Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis 2024-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01677-3 PMID:38977789	research paper	该研究利用邻近触发的蛋白质反式剪接技术，实现了从预制部件中时间分辨合成目标蛋白质，并应用于多种蛋白质的研究	开发了一种模块化的蛋白质反式剪接技术，能够时间分辨地合成目标蛋白质，并区分起始材料和产物的细胞定位和/或活性状态	NA	开发合成生物学工具以操纵细胞状态，并研究蛋白质的翻译后调控	多种蛋白质，包括激酶癌融合蛋白BCR-ABL和DNAJ-PKAc	合成生物学	癌症	邻近触发的蛋白质反式剪接技术	NA	蛋白质合成数据	NA
218	2025-03-30	Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer 2024-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01628-y PMID:38783133	研究论文	该研究展示了细胞外电子传递（EET）如何作为活细胞代谢与合成材料特性之间的可调桥梁，用于调控活体材料的转录	利用EET作为桥梁，通过遗传电路设计调控活体材料的机械性能，实现了对材料特性的程序化控制	NA	探索活体材料中遗传和代谢编程对材料特性的控制	Shewanella oneidensis菌株和合成聚合物网络	合成生物学	NA	细胞外电子传递（EET）	布尔逻辑门	NA	NA
219	2025-03-29	Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli 2025-Mar-26, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00835 PMID:40138712	research paper	该研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌EcN进行基因工程改造，成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件，同时实现了生物活性化合物的生物合成	首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术进行基因工程改造，并成功表达多种荧光报告基因和生物活性化合物	仅测试了两种大肠杆菌菌株，可能无法代表所有肠道菌株的特性	探索原生肠道大肠杆菌作为合成生物学平台的潜力	肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌EcN	合成生物学	NA	CRAGE技术	NA	基因表达数据	两种大肠杆菌菌株（EcAZ-1和EcN）
220	2025-03-29	Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L 2025-Mar-21, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818 PMID:40147328	研究论文	本研究通过整合代谢组和转录组分析，揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因	鉴定了6个CYP450候选基因，并验证了它们在齐墩果烷型三萜皂苷生物合成中的关键作用，特别是HhCYP716A409和HhCYP716S11在β-香树脂醇C-28位氧化中的作用，以及HhCYP72D57、HhCYP72A1140和HhCYP72A1141在齐墩果酸C-23位羟基化中的作用	研究仍处于初步阶段，对CYP450基因在五环三萜骨架修饰阶段的功能表征尚不深入	探究常春藤中齐墩果烷型皂苷生物合成的分子机制	常春藤（Hedera helix L）及其代谢产物	植物代谢工程	NA	转录组分析、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内验证	NA	转录组数据、代谢组数据	NA