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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2025-04-08 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行了重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统快速高效地表达了难以通过传统宿主细胞方法表达的FGFR3-TACC3融合蛋白,并验证了其功能性 | 目前尚未获得任何全长RTK的高分辨率结构,且该方法在其他难表达膜蛋白上的适用性有待验证 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶(RTKs)难以表达和提取的问题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白质 | 特定产量为300 µg/mL裂解液 |
162 | 2025-04-07 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发并应用了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统,用于研究细菌间的协同响应机制 | 利用M13噬菌体开发了一种新型的工程菌DNA传递系统,能够实现细菌间的DNA信息传递和协同响应 | 未提及在实际疾病治疗中的应用效果和潜在安全性问题 | 研究细菌间的信息传递机制,为多细菌联合调控提供基础 | 工程菌和M13噬菌体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递系统 | NA | DNA | 未明确提及具体样本数量 |
163 | 2025-04-07 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Apr-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
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review | 讨论生物打印和合成生物学在工程化功能性内分泌胰腺构建体中的最新进展 | 融合合成生物学、细胞工程与生物打印技术,为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 探索利用生物打印和合成生物学技术开发功能性内分泌胰腺构建体,以治疗糖尿病 | 内分泌胰腺构建体 | 合成生物学 | 糖尿病 | 生物打印、合成生物学、细胞工程 | NA | NA | NA |
164 | 2025-04-07 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文综述了利用多组学策略和人工智能技术发现植物生物合成途径的最新进展 | 提出了一种结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程,并探讨了AI驱动的途径发现方法 | 未提及具体实施案例或验证结果 | 促进可持续生物经济发展,通过合成生物学获取复杂天然产物 | 植物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、代谢组学) | AI驱动方法 | 多组学数据 | NA |
165 | 2025-04-07 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-Mar-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
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研究论文 | 本文通过理性设计末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)的引物识别位点,实现了RNA引物的高效延伸 | 通过工程化TdT的引物识别位点,将RNA延伸活性从20%提升至90%以上,并开发了两种可行的微量microRNA检测方法 | 未提及具体样本量或实验验证的广泛性 | 改进RNA引物的延伸效率,简化RNA序列分析流程 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及RNA引物 | 合成生物学 | NA | 酶工程、RNA延伸技术 | NA | NA | NA |
166 | 2025-04-07 |
Towards the computational design of protein post-translational regulation
2015-Jun-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2015.04.056
PMID:25956846
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review | 本文综述了蛋白质翻译后修饰(PTMs)在细胞调控中的作用及其计算方法设计的最新进展 | 探讨了利用合成生物学方法设计蛋白质翻译后修饰调控的新机遇 | 尚未深入探讨具体设计方法的实验验证和应用限制 | 推动合成生物学在蛋白质翻译后修饰调控领域的应用 | 蛋白质翻译后修饰(PTMs)及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA | NA |
167 | 2025-04-06 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母,显著促进了萜类化合物的生物合成 | 首次发现PCIF1能显著提升酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的产量,并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径来发挥作用 | 研究仅针对酿酒酵母中的萜类化合物生物合成,未在其他微生物或产物中进行验证 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母中萜类化合物的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程酵母菌株 |
168 | 2025-04-06 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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research paper | 该研究通过工程化生物传感器优化酵母中蛋白质的高通量分泌 | 利用酵母G蛋白偶联受体生物传感器测量与目标蛋白质共分泌的肽标签浓度,实现分泌效率的高通量筛选 | NA | 优化异源蛋白质表达策略中的分泌效率 | 酵母中的蛋白质分泌系统 | 合成生物学 | NA | Combinatorial Golden Gate克隆 | NA | NA | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 |
169 | 2025-04-06 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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研究论文 | 利用合成生物学在稻米中表达固氮酶生物合成途径,并克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 通过多基因载体转化和转基因稻米间的有性杂交,成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入稻米,并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基,获得了具有Fe蛋白活性和抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在稻米细胞质中不稳定,仍需进一步优化以提高其稳定性 | 减少化学氮肥的使用,通过工程化手段在谷物中实现固氮 | 稻米 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、有性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 两个F杂交稻米品系L12-13和L8-17 |
170 | 2025-04-06 |
Microbial production of hyaluronic acid: The current advances, engineering strategies and trends
2025-Mar-26, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.03.015
PMID:40154620
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综述 | 本文综述了透明质酸(HA)的微生物生产方法,包括工程菌株的使用、代谢工程策略、工业规模生产及影响分子量的关键因素 | 探讨了利用基因和代谢工程以及合成生物学的最新进展解决透明质酸生产中分子量、粘度和副产物形成的挑战 | 需要进一步研究开发更高效、抗污染且能利用低成本底物的工程菌株 | 推进透明质酸的工业化生产并扩展其应用 | 透明质酸(HA)的微生物生产 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、基因和代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
171 | 2025-04-06 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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review | 本文综述了合成脂质生物学这一新兴领域,探讨了脂质和生物膜的构建、操纵及分析方法 | 提出了‘合成脂质生物学’这一新概念,整合了化学、生物学、物理学和工程学等多学科方法研究脂质和生物膜 | 该领域尚处于起步阶段,许多技术和方法仍需进一步发展和验证 | 构建更清晰的脂质和生物膜特性、行为及功能描述 | 脂质和生物膜 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA |
172 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
173 | 2025-04-05 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 研究开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)的重构系统,为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法(序列优化、翻译系统组成优化、特定AARS替换、翻译抑制消除及DNA浓度平衡),实现了20种AARS的可持续再生 | 研究未涉及该重构系统在更复杂环境中的应用效果 | 推动自复制人工系统的实现 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS) | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
174 | 2025-04-05 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Apr-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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综述 | 本文探讨了丝状真菌中基因调控网络(GRN)操作的分子工具包,重点关注转录重连和启动子工程 | 利用对光和温度等物理线索响应的顺式元件,实现了前所未有的时空精确基因表达控制,并展示了转录重连如何增强纤维素酶生产和揭示复杂电路的设计原则 | 主要关注丝状真菌,对其他真菌种类的应用潜力讨论较少 | 探索丝状真菌中基因调控网络的操纵潜力,特别是在代谢工程和基础研究中的应用 | 丝状真菌,特别是以Neurospora crassa为模型 | 合成生物学 | NA | 转录重连,启动子工程 | NA | NA | NA |
175 | 2025-04-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素降解的前沿生物策略、木质素分解酶、代谢途径以及降解菌株或菌群,并批判性地评估了其潜在机制 | 强调了利用数字系统和合成生物学等创新方法来释放木质素衍生原材料的商业潜力,以及人工智能驱动技术在克服当前挑战和推动木质素增值广泛采用中的前景 | 木质素的复杂组成和抗分解性仍然是其定向增值的主要障碍 | 探索木质素增值和利用木质素基原材料进行生物制造的潜力 | 木质素及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、人工智能驱动技术 | NA | NA | NA |
176 | 2025-04-05 |
TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites
2025-Mar-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf102
PMID:40131780
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研究论文 | 介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC,用于快速、低成本、高通量地检测转基因植物的T-DNA整合位点 | 开发了基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位新方法TTLOC,相比现有技术更快速、成本更低且通量更高 | 未明确提及方法的局限性 | 开发一种快速、低成本、高通量的T-DNA整合位点检测方法,以促进转基因植物的鉴定和作物育种 | 转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦 | 植物合成生物学 | NA | Tn5转座酶介导的基因组DNA片段化,NGS测序 | NA | 基因组测序数据 | 65个转基因拟南芥株系和多个其他作物转基因株系 |
177 | 2025-04-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 研究DNA纳米结构与脂质膜之间的相互作用,探讨纳米尺度立体效应对其影响 | 首次揭示了DNA纳米结构锚定物的立体环境及局部纳米级双层形态对膜相互作用的影响,并展示了通过非脂化DNA区域实现50和200纳米囊泡尺寸区分的创新方法 | 研究仅针对四种特定立体环境下的DNA纳米结构,可能无法涵盖所有可能的相互作用情况 | 探索DNA纳米结构与脂质膜相互作用的机制,为合成生物学和生物传感应用提供理论基础 | 具有四种不同立体环境膜锚定物的3D DNA纳米结构与不同尺寸膜囊泡的相互作用 | DNA纳米技术 | NA | 3D DNA纳米结构构建技术 | NA | 实验观测数据 | 不同尺寸的膜囊泡(特别展示了50nm和200nm囊泡的区分) |
178 | 2025-04-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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research paper | 该研究介绍了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)的新型合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关的T细胞表型 | 提出了一种具有可调生物化学和生物物理特性的软合成细胞技术,作为人工抗原呈递细胞(aAPCs),用于体外T细胞扩增,并揭示了横向配体移动性在T细胞激活中的关键作用 | 研究主要基于体外实验,未涉及体内验证 | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术,以改善免疫治疗效果 | T细胞,特别是IL-4/IL-10分泌的调节性CD8 T细胞和Her2/CD3双特异性T细胞接合剂介导的T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 |
179 | 2025-04-04 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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review | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在合成生物学和再生医学中的潜在应用 | 综述了多种原始细胞模型的构建方法及其组装成功能化原始组织的化学和物理策略,强调了原始组织在细胞间通讯和集体行为方面的独特性质 | NA | 探索原始细胞网络工程在原始组织发展中的应用 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚体和乳液滴)及其组装成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
180 | 2025-04-04 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-Mar-21, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该论文探讨了通过合成生物学方法生产新型和已灭绝天然产物的途径 | 利用基因敲除和基因交换技术,成功分离出多种新型代谢产物,并优化了生产菌株以提高特定代谢物的产量和稳定性 | 研究主要集中在细菌和真菌的代谢途径,可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径,以生产新型和改良的代谢产物 | 细菌和真菌的代谢途径及其产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | 多种细菌和真菌菌株 |