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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2025-09-06 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
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研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统,用于非模式生物中的DNA片段组装 | 利用单链寡核苷酸桥接技术实现可重复使用DNA片段的组装,无需限制性内切酶 | NA | 扩展模块化克隆系统的应用范围至非模式生物 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装技术,寡核苷酸桥接组装 | NA | DNA序列数据 | 使用ST7-B作为测试案例,构建了多种启动子-终止子组合的载体 |
142 | 2025-09-06 |
Mapping variation in dual use risk assessments of synthetic biology projects
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1620678
PMID:40895722
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研究论文 | 本研究通过评估合成生物学项目的双重用途风险,揭示了专家和学生评审在风险认知和管理策略上的显著差异 | 首次对现实世界合成生物学项目进行双重用途风险评估的实证研究,揭示了评审者间存在显著判断差异 | 样本规模有限(18名专家和49名学生),仅评估了四个项目,可能影响结果的普适性 | 分析双重用途研究关切(DURC)风险评估的一致性和准确性,改进风险管理方法 | 合成生物学项目 | 生物安全 | NA | 修改版美国政府对生命科学双重用途研究监管政策的配套指南框架 | NA | 专家评审数据 | 18名经验丰富的DURC评审专家和49名合成生物学学生 |
143 | 2025-09-05 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
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研究论文 | 本研究开发并验证了基于CRISPR的靶向T-DNA整合技术(CRISTTIN),用于植物基因功能研究和转基因表达的精确调控 | 发现传统Cas9在CRISTTIN中的性能优于设计的Cas9-适配体融合核酸酶,并展示了该技术在多重基因编辑、报告基因整合和转录调控中的多样化应用 | NA | 开发植物基因组中靶向T-DNA整合的新方法,以克服随机整合的局限性 | 拟南芥和水稻 | 合成生物学 | NA | CRISPR, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA |
144 | 2025-09-05 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-04, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
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研究论文 | 开发了一种动态多相凝聚系统,模拟细胞区室化实现选择性分子分配 | pH响应性平台可根据极性分离酶促产物并具有增强的胶体稳定性 | NA | 构建用于催化、合成生物学和仿生化学系统的多相凝聚体系 | 颗粒和小分子 | 合成生物学 | NA | 多相凝聚技术 | NA | NA | NA |
145 | 2025-09-05 |
CELLM: Bridging Natural Language Processing and Synthetic Genetic Circuit Design with AI
2025-Sep-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00391
PMID:40905372
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研究论文 | 本研究开发了一个结合自然语言处理与合成生物学工具CELLO的集成系统,用于自动化设计和优化遗传电路 | 首次将大型语言模型(如DeepSeek-R1、Phi-4)与合成生物学设计工具CELLO集成,实现自然语言到功能性生物设计的直接转换 | NA | 通过AI技术降低遗传电路设计的复杂性,使非生物工程专家也能参与设计 | 遗传电路的设计与优化 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型(LLM)、LangChain框架、Cello v2.1软件 | DeepSeek-R1, Phi-4 | 文本 | NA |
146 | 2025-09-05 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-Sep-04, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文总结了拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs)在实现CRISPR/Cas系统可编程控制方面的策略、优势与挑战 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等明确拓扑结构,实现CRISPR活性的空间控制、可逆性和程序化激活 | NA | 提升CRISPR/Cas系统的时间与条件控制精度 | 拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统,化学响应连接器,刺激敏感基团 | NA | NA | NA |
147 | 2025-09-05 |
Intelligent Design of Escherichia coli Terminators by Coupling Prediction and Generation Models
2025-Sep-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00429
PMID:40905909
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研究论文 | 本研究通过结合预测模型和生成模型,实现了大肠杆菌终止子的智能设计 | 首次将序列特征和热力学特征结合用于终止子强度预测,并采用GAN生成终止子序列 | 预测模型性能仍有提升空间(R²=0.72),实验验证样本量有限(18个终止子) | 开发计算工具准确预测和生成大肠杆菌终止子序列 | 大肠杆菌内在终止子 | 合成生物学 | NA | 机器学习,生成对抗网络(GAN) | GAN,机器学习模型 | DNA序列数据 | 使用内在终止子训练数据,实验验证18个生成终止子 |
148 | 2025-09-05 |
Creating a designer cyanobacterial ecosystem for the sustainable production of biomass rich in sun-protecting compounds: mycosporine-like amino acids and scytonemin
2025-Sep-04, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04450-9
PMID:40906293
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综述 | 探讨通过合成生物学策略构建蓝藻生态系统以可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的研究 | 提出利用基因和代谢工程优化蓝藻菌株代谢途径的创新生物技术方法,以提高紫外线防护化合物的产量 | 蓝藻中有益代谢物浓度通常较低,使得工业化规模生产在经济上不可行 | 开发可持续生产富含紫外线防护化合物(如MAAs和scytonemin)的高质量蓝藻生物质 | 蓝藻及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA |
149 | 2025-09-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Sep-02, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
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综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖(EPS)在免疫调节中的关键作用及其作为活生物治疗剂的治疗潜力 | 系统阐述EPS通过特定结构基序与宿主模式识别受体相互作用实现精准免疫调控的创新机制,并提出工程化活生物治疗剂原位生产定制化EPS的新策略 | 存在结构功能认知缺口,特定结构基序与可预测免疫结果之间的关联性尚未明确,且可扩展、可重复的生产方法仍面临挑战 | 探讨肠道微生物胞外多糖的免疫调节功能及治疗应用开发 | 肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学技术、理性工程设计 | NA | 文献数据 | NA |
150 | 2025-09-05 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害生物防治中的作用、化学多样性及应用前景 | 系统探讨真菌挥发性化合物作为生物熏蒸剂的创新应用,并提出结合定向诱变、合成生物学和人工智能的未来研究方向 | NA | 研究采后病害的生物防治方法,特别关注真菌挥发性有机化合物的作用机制与应用 | 植物病原微生物、食品腐败微生物、真菌挥发性有机化合物 | NA | NA | 生物熏蒸、定向诱变、合成生物学、人工智能分析化学 | NA | 化学化合物数据 | NA |
151 | 2025-09-05 |
Identification and application of promoters and terminators for plant synthetic biology
2025-Sep-01, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2025.100273
PMID:40902856
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综述 | 本文综述了植物合成生物学中启动子和终止子的鉴定与应用进展 | 探讨了双向启动子在基因叠加中的应用及启动子-终止子组合平衡对转基因表达稳定性的重要性,并介绍了基于深度学习的启动子预测模型 | NA | 实现高效精确的基因调控 | 植物合成生物学中的生物部件(启动子和终止子) | 合成生物学 | NA | ATAC-Seq, STARR-Seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | NA |
152 | 2025-09-05 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-Jul-21, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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综述 | 本文综述紫杉烷生物合成途径解析、工程化及合成生物学策略,以可持续生产多样化紫杉烷衍生物 | 提出AI引导的CYP450定向进化、代谢区室化及CRISPRi-dCas9基因回路等创新策略,用于构建新型紫杉烷库 | 仅I型紫杉烷骨架生物合成途径接近完全解析,其他类型途径仍待阐明 | 解析多样化紫杉烷生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷二萜类天然产物(包括紫杉醇、多西他赛、卡巴他赛)及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | 酶工程、AI引导定向进化、CRISPRi-dCas9、代谢区室化 | NA | NA | 涉及近500种已报道紫杉烷化合物 |
153 | 2025-09-03 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 开发了一种基于人类蛋白酶的人源化细胞因子调控平台hDIRECT,用于控制细胞因子活性 | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交调控系统,避免免疫原性风险,并通过蛋白酶切割控制细胞因子活性 | NA | 创建安全可控的蛋白质分泌调控系统以支持细胞疗法 | 人类细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)和人源蛋白酶系统 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗 | 蛋白质工程、蛋白酶调控技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
154 | 2025-09-03 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 探讨植物-病毒-节肢动物媒介系统中内共生菌的作用及其在可持续病毒病管理中的潜力 | 提出利用基因工程改造内共生菌来调控三方互作关系,为植物病毒病防控提供创新策略 | NA | 分析内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫互作系统中的功能并探索其生物防治应用 | 植物、病毒、节肢动物媒介及内共生菌 | 植物病理学与生物防治 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA |
155 | 2025-09-03 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍一种名为DASH的新型基因堆叠系统,用于植物合成生物学,解决现有DNA组装方法的局限性 | 结合Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,实现大片段DNA的高效组装和后期修饰 | NA | 开发高容量且多功能的植物基因组装工具 | 植物合成生物学中的DNA构建体 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、PhiC31整合酶、FLP重组酶 | NA | DNA序列数据 | 一个116 kb的DNA构建体,包含35个转录单元 |
156 | 2025-09-03 |
Plant cytochrome P450 enzymes for bioactive metabolites biosynthesis, growth regulation, and stress adaptation
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf297
PMID:40623215
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综述 | 本文综述植物细胞色素P450酶在生物活性代谢物合成、生长调控和胁迫适应中的最新研究进展 | 聚焦2020-2025年间最新研究,系统总结CYP酶在植物关键生物活性化合物合成及生理功能中的重要作用 | 仅涵盖有限时间范围(2020-2025)的研究,且数据库中超过99.8%的CYP酶尚未完成功能表征 | 增强对植物CYP酶功能的理解,为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用提供基础 | 植物细胞色素P450酶(CYPs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | 数据库记录超过300,000个CYP酶(仅0.2%经过功能表征) |
157 | 2025-09-03 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-Aug-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文聚焦于合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 系统总结了针对蓝藻宿主操作难题的合成生物学创新方法,包括BGC克隆、组合生物合成和宿主工程等技术突破 | NA | 促进蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物生物合成基因簇 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、组合生物合成、转录调控、翻译调控 | NA | 基因组数据 | 涉及多种蓝藻宿主菌株(如 sp. PCC 6803, UTEX 2973, sp. PCC 7120) |
158 | 2025-09-03 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文全面回顾光合作用原理及其工程化策略与应用,探讨其在可持续技术中的潜力 | 系统整合纳米材料、微流体、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略以增强光合作用效率 | NA | 探讨光合作用工程化策略及其在能源与物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化设计 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助、微流体技术、合成生物学、光生物电化学系统(PBESs) | NA | NA | NA |
159 | 2025-09-03 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子与生化特征,探讨内共生体向细胞器演化的关键机制 | 整合自然内共生系统与人工工程化系统的比较研究,揭示内共生演化中的分子变化规律 | NA | 探讨光合内共生系统的演化机制及其对合成生物学的启示 | 线粒体、叶绿体等内共生起源的细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 比较基因组学、蛋白质导入/导出系统分析 | NA | 分子与生化数据 | NA |
160 | 2025-09-03 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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研究论文 | 本研究利用金属酚醛网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化,增强其结构稳定性和化学抗性 | 首次使用MPN实现凝聚体的可控膜化与解组装,并展示其氧化还原活性调控膜厚度与渗透性的能力 | NA | 开发稳定且功能化的原始细胞模型,抵御外部化学威胁 | 聚赖氨酸和三磷酸腺苷凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱 | NA | 化学分析数据 | NA |