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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-05-08 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
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研究论文 | 通过结合膨胀显微镜和光激活定位显微镜,在细菌中实现约3纳米空间分辨率的双色三维单分子定位,用于研究蛋白质-蛋白质相互作用 | 优化细菌中的膨胀显微镜方案实现4倍各向同性膨胀,最小化色差和信号串扰,通过高选择性斜入射照明提高单分子灵敏度 | NA | 发展一种有效方法,用于原核生物和高密度样品中分子组织的研究 | 参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 计算机视觉 | NA | 三维膨胀光激活定位显微镜 | NA | 图像 | 细菌细胞中的HisF和HisH蛋白质 | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 382 | 2026-05-08 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
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综述 | 全面探讨下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的应用,包括共抑制和共刺激通路、联合治疗策略及精准免疫肿瘤学框架 | 系统总结下一代免疫检查点(如LAG-3、TIM-3、TIGIT等共抑制分子和ICOS、OX40等共刺激分子)的机制与临床证据,并整合免疫代谢、先天免疫感应、细胞因子信号、维生素D和肠道菌群等TME调节策略,提出基于多组学、系统生物学和人工智能的精准免疫肿瘤学框架 | 治疗效益仍局限于部分患者,主要由于免疫逃逸、肿瘤异质性和肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 综述下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的进展、挑战和未来方向 | 下一代免疫检查点(共抑制和共刺激通路)、肿瘤微环境调节策略(免疫代谢、先天免疫、细胞因子、维生素D、肠道菌群)、临床试验数据 | NA | 多种恶性肿瘤 | 多组学分析、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 383 | 2026-05-08 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了用于基因组记录细胞事件的分子电路的发展策略 | 提出了构建能忠实将过去细胞状态编码到基因组DNA记录中的新传感模块和遗传电路架构的需求 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 探索构建用于基因组记录多种细胞事件的分子电路 | 基于CRISPR的基因组编辑技术和合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感模块和遗传电路架构 | NA |
| 384 | 2026-05-08 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-01-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究利用量子隧穿纳米间隙结和机器学习技术,对八种人工合成DNA碱基进行了电识别研究 | 首次将量子隧穿传输与机器学习结合用于人工DNA碱基的高精度电识别,实现了高达100%的碱基识别准确率 | 未提及实际生物样本中的验证或系统级应用限制 | 实现人工合成DNA碱基的快速精确电识别,推动遗传研究、DNA数据存储和合成生物学发展 | 八种人工合成DNA碱基(DNA和DNA碱基) | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 序列 | 八种人工合成DNA碱基数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 遗传学, DNA数据存储, 诊断 |
| 385 | 2026-05-08 |
Smartphone-controlled optogenetically engineered cells enable semiautomatic glucose homeostasis in diabetic mice
2017-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aal2298
PMID:28446682
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研究论文 | 该论文通过结合电子工程、软件工程和合成生物学,开发了一套智能手机辅助的半自动糖尿病治疗方案 | 首次将智能手机控制与光遗传工程细胞相结合,实现远红光响应的小鼠血糖稳态半自动调节 | 需要进一步验证该方法在人体中的安全性和有效性,且依赖无线设备和植入式水凝胶胶囊的稳定性 | 开发基于智能手机控制的半自动细胞治疗系统,用于糖尿病管理 | 糖尿病模型小鼠及工程化光遗传细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 糖尿病小鼠若干 | NA | 小鼠 | 远红光响应光遗传开关,控制人胰高血糖素样肽-1(shGLP-1)或小鼠胰岛素的产生 | 医学 |
| 386 | 2026-05-07 |
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100047
PMID:42088953
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综述 | 综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及应用前景 | 系统阐述了原花青素聚合的非酶促机制、MYB-bHLH-WD40核心转录复合物的调控作用,并指出了结构-活性关系的关键知识空白 | 未阐明聚合反应的细胞定位、聚合机制及精确的结构-活性关系 | 总结原花青素研究最新进展,明确未来研究方向 | 原花青素 | NA | NA | 基因编辑, 合成生物学, 纯化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 医疗, 食品, 动物营养 |
| 387 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
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research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因,构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具(未明确说明具体工具) | Aureobasidium melanogenum(出芽短梗霉) | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 388 | 2026-05-07 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-May-06, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
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研究论文 | 通过多组学分析和载体重设计优化双特异性抗体的表达 | 提出了整合序列级生物信息学和合成生物学诊断的方法,直接提高了复杂生物制品的可制造性,为解决隐蔽表达缺陷提供通用框架 | NA | 解决双特异性抗体在中国仓鼠卵巢细胞中表达效率低的问题 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 机器学习 | NA | RNA测序、剪接预测、密码子优化评估、基序筛选 | NA | 文本、序列数据 | 三种双特异性抗体候选物 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 389 | 2026-05-07 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-May-04, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
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综述 | 本文概述了遗传密码扩展技术在生理相关背景下研究疾病生物学的进展、挑战和新兴方法 | 将GCE定位为转化合成生物学平台,用于机制性解析疾病过程,强调其在越来越接近生理环境中的应用 | 该技术广泛实施的主要挑战仍待解决,但具体局限性文中未详细说明 | 利用遗传密码扩展技术解析疾病的分子机制 | 动态蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 390 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE,用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法,基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机(仅需核心TT二核苷酸)的基因整合,适用于革兰氏阳性和阴性菌,并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法,以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌,包括革兰氏阳性菌(链霉菌、糖多孢菌)和革兰氏阴性菌(伯克霍尔德菌、紫色杆菌) | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程,合成生物学,工业生物技术 |
| 391 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
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研究论文 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在人诱导多能干细胞中高效同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台,实现一周内同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合,并支持近无疤痕载荷整合和组件循环利用 | NA | 开发高效的双基因整合平台,加速干细胞中合成生物学的设计-构建-测试循环 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的神经元、运动神经元和内皮细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人诱导多能干细胞, 神经元, 运动神经元, 内皮细胞 | 四环素诱导型控制与格拉佐普瑞韦诱导型合成基因开关 | 医学, 生物技术 |
| 392 | 2026-05-07 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Apr-28, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过基因组修改和定点突变,在鸡沙门氏菌中生成不依赖诱导剂的AraC变体,实现pBAD启动子的组成型激活 | 首次在鸡沙门氏菌中通过L9K替换获得组成型激活的AraC变体,绕过了阿拉伯糖依赖的阻遏-激活转换机制 | 未在体内或大规模培养条件下验证系统的稳定性和通用性 | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统,用于微生物生物制造和合成生物学 | 鸡沙门氏菌(Salmonella Gallinarum) | 合成生物学 | NA | 定点突变,基因组编辑,绿色荧光蛋白表达分析,电泳分析,结构建模 | NA | 生长曲线,蛋白质表达水平,电泳数据 | NA | CRISPR-Cas9(用于基因组删除),定点突变 | 鸡沙门氏菌(Salmonella enterica serovar Gallinarum) | pBAD启动子驱动的组成型表达系统(通过L9K突变AraC实现) | 工业生物技术,合成生物学,治疗生物技术 |
| 393 | 2026-05-07 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
|
研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的差异性高尔基体O-糖基化 | 首次采用体外一锅合成生物学方法模拟癌症相关的糖基化通路差异,结合动力学和计算机反应动态模拟解析酶定位和底物特异性 | NA | 解析肿瘤相关MUC1异常糖基化的分子机制 | MUC1黏蛋白及其糖基化过程 | 合成生物学 | 肿瘤 | 体外一锅合成生物学方法,动力学模拟,计算机反应动态模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 394 | 2026-05-07 |
Improving governance in the age of synthetic biology, artificial intelligence, and diverging threats
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1705143
PMID:42088837
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研究论文 | 探讨合成生物学和人工智能时代如何改进治理以应对生物安全威胁 | 提出了一个包含四个相互关联组件的混合治理框架,并结合专家共识制定政策建议 | 依赖于少数专家的意见,可能无法涵盖所有视角 | 在合成生物学和人工智能时代改进治理,降低生物武器开发与扩散风险 | 生物威胁优先事项及治理框架 | NA | NA | Delphi过程 | NA | 定性数据 | 13位来自不同相关领域的专家 | 合成生物学 | NA | NA | 生物安全, 治理 |
| 395 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 提出STRAIGHT-IN Dual平台,实现人类诱导多能干细胞中双DNA载荷的等位基因特异性单拷贝整合,效率达100%且一周内完成 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA载荷,效率高达100%,且支持近无痕整合和组件循环利用 | 未提及长期稳定性和脱靶整合风险 | 开发高效精准的人类诱导多能干细胞基因工程平台 | 人类诱导多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 位点特异性整合、基因回路设计 | NA | NA | NA | STRAIGHT-IN平台、synZiFTR系统 | 人类诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统、四环素诱导系统 | 医学、再生医学 |
| 396 | 2026-05-06 |
L-xylulose, a new versatile rare sugar: recent biosynthetic advances and challenges
2026-Jul-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119125
PMID:42083189
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综述 | 综述了稀有糖L-木酮糖的生物合成最新进展,分析六种酶促途径并识别两条竞争性路线,同时探讨底盘细胞构建和工业发酵的核心瓶颈 | 提出AI驱动高产菌株筛选、关键酶催化优化和靶产物高效胞外转运/分泌三大突破策略,并主张合成生物学与智能制造融合是未来发展关键方向 | 未详细对比化学合成与生物合成的成本效益,且对六种酶促途径的工业化适用性缺乏定量评估 | 系统梳理L-木酮糖生物合成进展,识别核心瓶颈并展望突破策略以推动其在食品和医药工业的应用 | L-木酮糖及其生物合成途径中的酶和底盘细胞 | 合成生物学 | NA | AI导向的高通量筛选技术、关键酶催化优化技术、胞外转运工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品工业、制药工业、化学工业 |
| 397 | 2026-05-06 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了植物油脂体的多尺度工程框架,从多尺度结构到下一代食品系统提供路线图 | 整合物理场、界面工程和合成生物学等多学科策略,建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系,实现植物油脂体的可编程功能调控 | 技术转化面临规模化挑战以及技术经济和监管障碍 | 系统综述植物油脂体的多尺度工程方法,推动其从基础研究到工业应用 | 植物油脂体 | 合成生物学 | NA | 界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(种子) | NA | 食品 |
| 398 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
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研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架,用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA,并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架,能够高效构建大片段重复DNA序列,并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列(GVGVP)为模型,未测试其他类型重复序列的适用性;表征限于NEB 5-alpha细胞,未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列,并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽(ELP)质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒,并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构(通过dIII和HI消化及Gibson组装实现) | 生物技术、材料科学 |
| 399 | 2026-05-06 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-May-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的可扩展RNA平台,用于逻辑和多层细胞编程 | 整合了翻译到转录的转换器与合成RNA调节器,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,并利用天然核糖体介导的多种环境输入感知 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍是一个挑战 | 开发可扩展的遗传电路以实现细胞中的复杂功能 | RNA调节器和多输入逻辑门 | 合成生物学 | NA | RNA调控、基因电路设计 | 逻辑门(OR、AND) | RNA信号、代谢物信号 | NA | RATEX平台 | 活细胞(未具体说明) | 逻辑门(多输入OR和AND门)、信号放大和级联级联 | 合成生物学、生物技术 |
| 400 | 2026-05-06 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于8种反刍动物的2325个宏基因组样本,重建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录(CRMC),并揭示了维生素合成微生物的分布模式和途径偏好 | 构建了目前最大的反刍动物胃肠道微生物基因组目录(CRMC),包含约39,696个MAGs,图谱拼接率高达83.45%,首次系统性地揭示了反刍动物与人类在维生素合成途径和基因节点选择上的趋同演化规律 | 可能受限于样本来源的多样性及宏基因组组装的完整性,未具体分析不同宿主间维生素合成微生物的功能差异或环境因素的影响 | 系统阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在宿主间的分布模式 | 8种反刍动物(牛、羊等)的胃肠道宏基因组样本及维生素合成微生物 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、宏基因组组装基因组(MAG)重建、维生素合成通路分析 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本,来源于8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物(牛、羊等) | NA | 农业、医学 |