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当前共找到 5620 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-29 |
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10316-8
PMID:42257753
|
综述 | 本文综述了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的综合框架，重点探讨宿主与肠道微生物互作的机制、多组学进展及酶工程策略 | 将昆虫宿主生理与肠道微生物组整合为生物降解平台，提出多步骤降解机制并强调从相关性数据向酶工程验证的转化 | 现有数据多为相关性分析，缺乏对特定酶功能的直接实验验证，且真实生物降解程度与部分转化之间的界限尚未明确 | 总结昆虫-微生物组系统在塑料降解中的机制，并指导开发基于酶的可持续塑料废物管理策略 | 昆虫幼虫及其肠道微生物组，重点涉及聚乙烯和聚丙烯等聚烯烃塑料 | 生物降解 | NA | 多组学分析 | NA | 组学数据（如宏基因组、宏转录组等） | NA | 酶工程 | 昆虫幼虫 | NA | 环境 |
| 62 | 2026-08-29 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文利用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜，定量研究了钙离子在无蛋白质条件下介导巨型单层囊泡融合的机制，揭示了其融合效率对膜组成和机械张力的敏感性 | 首次在细胞尺寸的巨型单层囊泡上直接定量钙离子介导的膜融合，并同时测量脂质混合、内容物混合和融合结果，克服了以往实验中囊泡尺寸的不一致性 | 研究仅限于无蛋白质的合成膜系统，可能无法完全反映生理条件下的融合过程；另外，融合效率对膜组成高度敏感，参数空间狭窄 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下驱动细胞尺寸膜融合的机制，并提供设计规则以应用于合成生物学和膜重构研究 | 巨型单层囊泡和大型单层囊泡 | 生物物理学 | 不适用 | 共聚焦显微镜、微流控捕获平台 | 不适用 | 图像 | 数百个单个囊泡 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学 |
| 63 | 2026-08-29 |
Synthetic budding morphogenesis by optogenetic receptor tyrosine kinase signaling
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715459
PMID:41959406
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研究论文 | 本研究通过光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET，实现对肾脏类器官出芽形态发生的定向调控，并展示了其在构建合成替换肾脏方面的潜力。 | 首次实现通过光遗传学方法，以蓝光介导的聚类方式非配体依赖性地激活RET信号，从而控制肾脏类器官的出芽方向，为上皮类器官设计提供了新的合成生物学策略。 | 摘要中未提及具体局限性，如体内应用挑战、长期稳定性或信号通路干扰等。 | 开发一种通过光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET信号的方法，以实现肾脏类器官的可控出芽形态发生，并促进合成肾脏的构建。 | 小鼠胚胎肾脏、人类干细胞来源的肾脏类器官以及表达optoRET的上皮细胞。 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 光遗传学 | NA | 图像 | 小鼠胚胎肾脏、人类干细胞来源的肾脏类器官（具体数量未提及） | 光遗传学 | 人类干细胞来源的肾脏类器官、小鼠胚胎肾脏 | 光遗传学RET受体（optoRET）介导的信号通路 | 医学 |
| 64 | 2026-08-29 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
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研究论文 | 本文讨论了基于重组酶的基因控制策略，用于减轻合成生物系统中资源竞争导致的模块间干扰。 | 提出重组酶介导的启动子翻转策略，设计了集成负反馈和前馈的控制器，以实现更平衡的资源分配和减少串扰。 | 未提及具体限制。 | 开发重组酶基控制策略，以提高基因电路的模块性、鲁棒性和可预测性。 | 基因模块和重组酶控制器。 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | NA | NA | 重组酶 | NA | 负反馈控制器、前馈控制器、重组酶介导的启动子翻转 | 工业生物技术 |
| 65 | 2026-08-29 |
Coupled Perturbations of Gene Circuit Dynamics by Resource Competition and Growth Dilution
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_19
PMID:42420739
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研究论文 | 本文介绍了一种在E. coli中构建和表征抑制性基因级联的实验流程，以研究资源竞争和生长稀释对基因电路动力学的耦合影响 | 首次系统解析资源竞争和生长介导稀释对基因电路行为的耦合效应，而非单独考虑每个因素 | 未提供具体的实验结果或数据，仅描述实验方案，且可能局限于E. coli系统 | 研究共享细胞资源和生长过程如何塑造基因电路行为，指导合成生物学中多个上下文依赖效应的研究 | 大肠杆菌中的抑制性基因级联 | 合成生物学 | NA | 荧光测定法 | NA | 荧光数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 66 | 2026-08-29 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346164
PMID:42566484
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研究论文 | 本文提出了SEGUID v2，扩展了原始SEGUID校验和以支持环形、线性、单链和双链生物序列 | SEGUID v2通过引入方向不变性和旋转不变性，解决了原始SEGUID无法处理环形DNA和双链DNA的问题，并采用Base64url编码以提高在文件名和URL中的兼容性 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发一种适用于各种类型DNA和RNA序列的校验和算法，以增强序列数据的完整性和注释检索效率 | DNA和RNA序列，包括线性、环形、单链和双链形式 | 生物信息学 | NA | 校验和算法（SHA-1哈希） | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 67 | 2026-08-29 |
Recombinant humanized type VII collagen for skin repair and regeneration: prospects for reconstructing the dermal-epidermal junction
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1912442
PMID:42656479
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综述 | 本文综述了重组人源化VII型胶原蛋白在皮肤修复与再生中的应用前景，重点探讨其在重建真皮-表皮连接中的作用 | 首次系统总结rhCol VII相较于传统I型和III型胶原材料的潜在优势，包括安全性、可规模化生产和针对DEJ的结构功能靶向性 | 尚需解决材料开发和临床转化中的挑战，如生产工艺优化和长期安全性评估 | 为基于rhCol VII的皮肤修复材料进一步研究提供参考，推动其在慢性伤口、美容术后屏障损伤和组织工程皮肤中的应用 | VII型胶原蛋白及其重组人源化形式（rhCol VII） | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 重组蛋白表达技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 68 | 2026-08-29 |
A review of glycosylation diversity and biosynthetic advances of steroidal saponins in Paris polyphylla var. yunnanensis
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1905483
PMID:42657317
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综述 | 系统总结了云南重楼中甾体皂苷的糖基化多样性和生物合成途径的研究进展，并探讨了利用异源生物合成提高其产量的策略。 | 整合多组学技术和合成生物学的最新进展，重点分析了甾体皂苷的糖基化模式及其对结构多样性的贡献。 | 未提及具体实验验证，仅基于已有文献进行总结。 | 阐明云南重楼中甾体皂苷的结构多样性和糖基化模式，并系统总结其生物合成途径，为可持续利用提供理论基础。 | 云南重楼中的甾体皂苷及其生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多组学技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | NA | NA | 甾体皂苷生物合成途径 | 医药 |
| 69 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
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研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo进行多基因构建体组装的实验方案 | 提供了一套标准化的MoClo系统组装多基因构建体的详细步骤，包括定义构建体结构、识别基本部件和载体，以及遵循标准规则进行单锅组装 | 未明确提及 | 介绍MoClo系统用于多基因构建体组装的方法，以促进合成生物学研究 | 多基因构建体及其组成部件和载体 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆，类型IIS酶DNA组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 多基因构建体 | 生物研究, 合成生物学 |
| 70 | 2026-08-29 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 本文介绍了一个软件工具，用于创建基于SBOL标准的构建计划表示，以模拟Type IIS介导的Golden Gate组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个将Golden Gate组装构建计划标准化为SBOL表示的软件工具，支持模拟Type IIS介导的组装反应，并实现机器可读的元数据存储 | 未在摘要中明确提及局限性 | 实现Golden Gate组装构建计划的标准化表示，以促进合成生物学中的信息交流和自动化 | Golden Gate组装标准（如MoClo、Phytobricks、Loop）和SBOL表示 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 文本和元数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | Golden Gate组装反应 | 工业生物技术 |
| 71 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文提供了克隆MoClo标准部件（level 0模块）的详细实验方案，包括引物设计、PCR扩增和Golden Gate克隆步骤 | 给出了用于MoClo系统的level 0模块克隆的标准化规程，特别涵盖了大片段部件的中间-1级克隆策略 | 未提及 | 为合成生物学研究者提供可复现的MoClo标准部件克隆方法 | MoClo标准部件（level 0模块）及其亚部件 | 合成生物学 | NA | PCR, Golden Gate克隆, DNA测序 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 多基因构建体 | 工业生物技术 |
| 72 | 2026-08-29 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种利用声学分配器自动化和小型化Golden Gate DNA组装反应的方法，将反应体积从传统的10-25 μL减少到1 μL | 首次将声学液体处理技术应用于Golden Gate克隆反应的小型化，实现了无吸头、高通量、低成本的DNA组装自动化 | 摘要未提及具体局限性 | 开发并验证一种自动化、小型化的Golden Gate DNA组装反应协议，以减少试剂消耗和塑料废物 | Golden Gate克隆反应及其DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、声学液体处理 | NA | 实验数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | DNA组装反应（模块化克隆） | 工业生物技术 |
| 73 | 2026-08-29 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重纳米孔扩增子测序验证Golden Gate组装结果的方法，称为DuBA.flow工作流程。 | 提出了一种结合双条形码扩增子测序与纳米孔平台的DuBA.flow流程，实现了从单菌落到最终测序报告的全流程序列验证，适用于高组合复杂性的文库组装。 | 摘要未提及具体局限性。 | 提供一种详细、易操作的协议，用于对Golden Gate组装结果进行高效的序列验证，特别是在使用部分文库导致高组合复杂性的情况下。 | Golden Gate组装产物，包括转录单元和多基因构建体。 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | 测序数据 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元和多基因构建体的组装 | 工业生物技术 |
| 74 | 2026-08-29 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源Python包，用于在OpenTrons OT-2实验室机器人上自动化Golden Gate组装，并升级其功能以支持模块化克隆载体、突变文库和索引质粒文库的构建。 | 通过开源机器人自动化Golden Gate组装，提升了错误率、资源消耗和培训要求，适用于复杂DNA构建和组合文库，且成本低、易用。 | 未提及 | 提供低成本的自动化解决方案，以简化合成生物学中的Golden Gate克隆和文库构建。 | 自动化Golden Gate组装流程及升级能力 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 实验数据 | 未提及 | Golden Gate Assembly | NA | 模块化克隆载体、突变文库和索引质粒文库 | 工业生物技术 |
| 75 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装技术的高效构建大肠杆菌合成小RNA表达质粒的方法，并提供了相关协议和设计工具G-GArden | 提出了一种基于Golden Gate组装的质粒系列和快速构建合成小RNA表达质粒的协议，并开发了G-GArden工具用于辅助设计寡核苷酸和悬突以实现无痕组装 | 文中未提及具体局限性 | 开发快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，应用于合成生物学领域 | 大肠杆菌中的合成小RNA表达质粒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 质粒序列和寡核苷酸序列 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 合成小RNA表达质粒 | 工业生物技术 |
| 76 | 2026-08-29 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种基于模块化Golden Gate组装的无克隆工作流程，用于快速生成线性DNA模板，以实现细胞-free转录和翻译系统的快速原型测试 | 提出了一种结合Golden Gate组装和PCR扩增的无克隆工作流程，能够在体外快速生成由多个基因部件组成的线性DNA模板，避免耗时的细胞转化和克隆步骤，实现一天内完成大量新组装构建体的测试 | 本文未明确提及局限性，但可能受限于线性DNA模板在细胞-free系统中的稳定性和组装效率 | 开发一种快速、模块化的方法，用于细胞-free原型测试遗传调控元件和电路，加速合成生物学的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传调控元件和电路，包括启动子、核糖体结合位点、编码序列和终止子等基因部件 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、PCR扩增、细胞-free转录和翻译（TXTL） | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate Assembly | NA | 转录单元由启动子、RBS、编码序列和终止子组成 | 工业生物技术 |
| 77 | 2026-08-29 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 该文章描述了在莱茵衣藻中使用金门克隆和模块化克隆方法标准化组装基因元件，构建转基因表达盒的步骤 | 将模块化克隆（MoClo）工作流应用于莱茵衣藻，实现了基于金门组装的层级化、句法驱动的基因元件组装 | 标题和摘要中未提及研究的局限性 | 建立适用于莱茵衣藻的标准化转基因表达盒组装流程 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | 金门克隆、模块化克隆 | NA | DNA序列 | NA | 金门组装 | 莱茵衣藻 | 转基因表达盒 | 工业生物技术 |
| 78 | 2026-08-29 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出SEGUID v2，扩展原始SEGUID校验和算法以支持环状、线状、单链和双链生物序列，确保数据完整性和快速查找。 | SEGUID v2引入了方向和旋转不变性，支持双链、环状及错配DNA/RNA序列，并使用Base64url编码以适应文件名和URL，克服了原版对拓扑结构的限制。 | 摘要未提及其他序列类型如RNA修饰或特殊结构的处理细节，也未提及性能评估或对比研究。 | 扩展SEGUID校验和算法，以处理环状和双链DNA等更多序列类型，提高数据验证和注释关联的效率。 | DNA和RNA序列，包括环形质粒等。 | 生物信息学、合成生物学 | NA | SHA-1哈希 | NA | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、数据管理 |
| 79 | 2026-08-29 |
Functional Nanopores Enabled with DNA
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202303103
PMID:37186432
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综述 | 本文综述了利用DNA链功能化现有纳米孔以及通过DNA纳米技术创建新型DNA纳米孔的研究进展 | 通过DNA功能化扩展纳米孔的结构和功能库，并创建全新类别的DNA纳米孔 | 摘要中未提及具体局限性 | 概述功能性DNA纳米孔领域的发展，并展望新应用 | DNA纳米孔及其功能化方法 | 纳米技术、合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | DNA纳米孔结构 | 生物传感、单分子检测、核酸测序 |
| 80 | 2026-08-28 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Sep, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类并总结芽孢杆菌属（Bacillus spp.）产生的次生代谢产物，涵盖其化学多样性、作用机制、结构-功能关系及实际应用中的挑战与机遇 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次生代谢产物，并整合了作用机制、结构-功能关系及基因组挖掘和合成生物学等新兴策略 | 未提供具体实验数据，且对代谢产物异质性、毒性等问题仅作定性讨论 | 为芽孢杆菌代谢产物的理性选择和应用提供框架，重点在农业、食品和医学领域 | 芽孢杆菌属的次生代谢产物，如脂肽、多肽、大环内酯、有机酸、聚酮和角鲨烯 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学辅助去重复化、合成生物学 | NA | 文本和综述性资料 | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 医学 |