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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-11 |
A reversible genetic NOR gate in plants using translational repression
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.004
PMID:41058342
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研究论文 | 本文介绍了一种在烟草植物中实现的可逆遗传NOR逻辑门电路,利用Cas6翻译抑制系统,以雌二醇和乙醇为输入,GFP表达为输出 | 采用Cas6翻译抑制系统实现可逆遗传逻辑电路,设计方法类似电子电路中的PMOS传输门逻辑,简化了复杂逻辑电路的设计 | NA | 开发一种在植物中实现可逆遗传逻辑电路的方法,降低合成生物学应用门槛 | 烟草植物 | 合成生物学 | NA | Cas6翻译抑制系统 | 数学建模 | 实验数据 | NA | Cas6 | 烟草植物 | 布尔NOR逻辑门,使用雌二醇和乙醇作为输入,GFP表达作为输出 | 农业 |
| 62 | 2026-01-11 |
A review on squalene production by engineered yeasts: Current advances and perspectives
2025-Dec-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108792
PMID:41475586
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综述 | 本文综述了利用工程化酵母生产角鲨烯的当前进展与前景 | 首次对工程化酵母生产角鲨烯的研究进行了全面系统的总结,并探讨了新兴酵母菌种的潜力及未来可能应用的技术 | NA | 总结和探讨利用合成生物学策略通过工程化酵母生产角鲨烯的方法与前景 | 工程化酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 63 | 2026-01-11 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能与分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制,并通过异源表达策略验证其功能 | 研究主要在拟南芥异源系统中进行,尚未在小麦本物种中完全验证;分子调控网络细节需进一步解析 | 探究非编码RNA调控植物耐冷性的分子机制,为作物分子模块育种提供理论基础 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)及转基因拟南芥 | 植物分子生物学 | 非疾病研究(植物非生物胁迫) | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS与MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥株系(具体数量未明确说明) | 转基因技术 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | NA | 农业 |
| 64 | 2026-01-10 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸,并展示了其在体外转录中的生物技术应用 | 开发了一种通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物谱受限的限制,实现了对多种核苷酸的同时高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用潜力 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 65 | 2026-01-10 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan-08, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构,并基于此结构指导了FNT家族蛋白的工程化改造,使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构,阐明了其底物选择性的分子机制,并成功通过定点突变将细菌FNT家族蛋白改造为具有碳酸氢盐转运功能的通道 | NA | 通过结构生物学和蛋白质工程手段,改造FNT家族蛋白以增强其碳酸氢盐转运能力,为提升光合作用效率提供合成生物学工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长实验 | NA | 结构数据、功能实验数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道的工程化改造 | 农业 |
| 66 | 2026-01-10 |
Advances in natural product discovery: strategies, technologies, and insights
2026-Jan-07, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00556-1
PMID:41495363
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综述 | 本文综述了天然产物发现领域的最新进展,包括策略、技术和见解 | 整合了生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包和优化的微生物培养等突破性技术,克服了20世纪90年代和2000年代的研究瓶颈 | 讨论了当前理性天然产物发现的局限性 | 提供天然产物发现的更新、简明路线图 | 天然产物及其类似物 | NA | 代谢紊乱、癌症耐药性、传染病 | 生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包、高通量去重复工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具包 | 微生物 | 生物合成基因簇的精确调控和优化 | 医药 |
| 67 | 2026-01-10 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jan-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
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综述 | 本文综述了合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇方面的路线图,探讨了当前面临的挑战和未来策略 | 提出了利用非经典底盘(如植物相关蓝细菌和丝状真菌)增强P450相容性,并整合无细胞系统、合成微生物群落、混合化学酶法合成和机器学习等前沿工具的实用框架 | 紫杉醇的异源生物合成仍受限于途径复杂性、P450表达差和代谢通量效率低等关键瓶颈 | 通过合成生物学方法实现紫杉醇等天然产物的可持续生产 | 紫杉醇(植物源抗癌药物)及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、异源生物合成、细胞游离系统、混合化学酶法合成、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 紫杉醇生物合成途径的重建与优化 | 医药 |
| 68 | 2026-01-10 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Jan-05, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
|
综述 | 本文提出并详细阐述了'生命是程序集合'的理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 提出'生命是程序集合'这一跨学科理论框架,将生命现象系统性地解释为多种程序的集合与协同运作 | 面临意识难题(hard problem of consciousness)的挑战以及相关的伦理争议 | 探讨生命的本质,构建一个理解生命现象的跨学科理论范式 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等层面) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 69 | 2026-01-10 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
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研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型癌症免疫治疗策略 | 将合成生物学与营养学、癌症免疫治疗相结合,开发可口服的工程化益生菌平台,实现局部递送免疫调节剂并降低全身毒性 | 存在定植效率和生物安全性方面的挑战,需要进一步优化可控遗传回路 | 开发低毒性、可口服的免疫治疗平台,增强检查点抑制剂疗效并减少副作用 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂(可溶性CD80、PD-L1纳米抗体、IL-2)、肿瘤微环境 | 合成生物学 | 肺癌 | 基因工程、可控遗传回路设计 | NA | 临床前实验数据、临床荟萃分析、I期临床试验数据 | 临床前小鼠模型、NSCLC患者I期试验 | 合成生物学工具(未具体说明) | 食源性益生菌(具体菌种未说明) | 分泌型免疫调节剂递送系统(可溶性CD80、PD-L1纳米抗体、IL-2生产回路) | 医药 |
| 70 | 2026-01-10 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文探讨了工程化乳酸菌表达肿瘤杀伤细胞因子作为新型生物治疗策略,用于治疗实体瘤 | 利用工程化乳酸菌局部表达细胞因子,结合微生物安全性和精准免疫激活,避免了全身性细胞因子治疗的严重毒性 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且工程菌的生物安全性和长期控制需进一步优化 | 开发一种低毒性、局部作用的抗肿瘤生物治疗方法,以替代传统全身性细胞因子治疗 | 工程化乳酸菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15、TRAIL) | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具(如诱导型启动子、生物安全杀死开关) | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学工具 | 乳酸菌 | 设计表达肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15、TRAIL)的合成生物电路 | 医学 |
| 71 | 2026-01-10 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
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综述 | 本文探讨了绿色药物发现如何利用生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能实现可持续制药转型 | 整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,推动制药行业向可持续方向转型 | 面临生物勘探伦理、资源保护及公平利益分享等挑战 | 探索绿色制药在减少环境危害同时促进药物创新的潜力 | 植物、微生物和海洋生物等生物多样性资源 | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体提取 | 人工智能、机器学习 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医药 |
| 72 | 2026-01-10 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2025-Dec-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台 | 建立了理解不同空间控制原理的框架,并展望了面向合成生物学和细胞工程的多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限 | 通过生物分子区室化实现生物催化过程的代谢通量调控 | 空间工程平台,包括支架化区室(脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室)和无支架组装体(无膜细胞器和凝聚层) | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化 | NA | NA | NA | DNA折纸, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 哺乳动物细胞 | 代谢通路, 生物传感器 | 工业生物技术, 医药 |
| 73 | 2026-01-10 |
Development and application of synthetic biology tools for improved production of human breast milk components
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.002
PMID:41497495
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综述 | 本文综述了合成生物学工具在提高人乳成分微生物发酵生产效率和构建细胞工厂方面的应用 | 系统总结了合成生物学工具在优化人乳成分生产中的潜在应用,并探讨了相关细胞工厂构建的挑战与机遇 | NA | 提高人乳成分的微生物发酵生产效率,以降低生产成本、简化制造过程并减少环境污染 | 人乳成分及其在微生物细胞工厂中的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 生物传感器, 代谢途径 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 74 | 2026-01-10 |
Construction of microbial systems for polyethylene terephthalate degradation
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.013
PMID:41497499
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综述 | 本文综述了用于聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解的微生物系统的构建研究现状 | NA | NA | 探讨PET塑料微生物降解的研究现状与未来发展潜力 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料 | 合成生物学 | NA | 微生物降解、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 75 | 2026-01-10 |
[Research advances in biosynthetic pathways of monoterpenes]
2025-Oct, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文系统梳理了单萜类化合物的已知生物合成途径,重点分析了各阶段调控酶的催化原理与特性,并讨论了单萜异源生产的影响因素 | 通过整合测序技术与合成生物学研究,为单萜生产提供绿色、高效、可持续的生物合成替代方案,并系统分析途径中的关键酶及其作用机制 | NA | 为更好地理解单萜生物合成途径的进化奠定基础,并为利用微生物高效生产高价值活性单萜化合物提供方向 | 单萜类化合物的生物合成途径及其调控酶 | 合成生物学 | NA | 测序技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 单萜生物合成途径 | 食品,化妆品,医药 |
| 76 | 2026-01-10 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的多目标优化方法,用于设计和优化基于变构转录因子的无细胞生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 提出了一种结合机器学习、定向标记和无细胞基因表达的多目标优化框架,可同时优化生物传感器的灵敏度和选择性,克服了传统定向进化的局限性 | NA | 开发用于饮用水铅检测的高性能无细胞生物传感器 | 基于变构转录因子PbrR的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 机器学习、无细胞基因表达、定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据、配对数据集 | NA | NA | 无细胞系统 | 基于变构转录因子的生物传感器 | 环境监测 |
| 77 | 2026-01-10 |
Cnidarian toxins: omics approaches and recombinant proteins
2025, The journal of venomous animals and toxins including tropical diseases
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了利用组学技术和重组蛋白方法研究刺胞动物毒素的最新进展、局限性与未来前景 | 整合了组学技术、重组表达系统、合成生物学及人工智能计算工具在刺胞动物毒素研究中的协同应用,并展望了其在生物活性化合物开发中的潜力 | 复杂毒素的功能验证与生产仍具挑战性,尤其是需要复杂折叠或翻译后修饰的毒素;细胞游离蛋白合成系统等新技术的工业可扩展性仍有限 | 探索刺胞动物毒素的分子多样性、药理潜力及其作为生物活性化合物的来源 | 刺胞动物(如水母、海葵等)产生的毒素 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、重组蛋白表达、细胞游离蛋白合成系统 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 78 | 2026-01-09 |
Integrating synthetic biology and process engineering for enhanced isobutanol biosynthesis yield and sustainability
2026-Jan-08, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02720-8
PMID:41501833
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综述 | 本文综述了异丁醇生物合成的最新进展,并从生物学和工程学角度探讨了提高产量的策略 | 整合合成生物学与过程工程,以提升异丁醇生物合成的产量和可持续性,强调酶途径优化、代谢工程和细胞工程的多学科方法 | 异丁醇的细胞毒性和挥发性导致生产过程中的损失,且酶和代谢途径的修改仍需进一步优化以提高效率和产量 | 提高异丁醇作为生物燃料和平台化学品的生物合成产量和可持续性 | 异丁醇生物合成过程,包括酶途径、代谢工程、细胞工程和发酵技术 | NA | NA | 代谢工程、细胞工程、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 能源、医药、精细化学品、工业生物技术、环境 |
| 79 | 2026-01-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 强调了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测方面的突破性进展 | 讨论了数据质量要求、模型可解释性以及AI工具普及化等关键挑战 | 探索人工智能如何推动细胞生物学的基础研究和治疗应用 | 细胞生物学中的复杂生物数据,如细胞图像、转录组学和蛋白质相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 80 | 2026-01-09 |
Rapid evolution of a highly efficient RNA polymerase by homologous recombination
2026-Jan-07, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02124-7
PMID:41501182
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研究论文 | 本文通过同源重组和定向进化,将高选择性DNA聚合酶转化为具有高效RNA合成活性的非天然同源物 | 利用单细胞液滴微流体选择策略,在短进化路径中成功开发出C28聚合酶,该酶能以约3 nt/s的速率合成高保真度RNA,并接受多种修饰RNA类似物 | 未明确提及具体限制,但可能涉及工程聚合酶在复杂生物环境中的稳定性和应用范围 | 将DNA聚合酶重编程为高效RNA合成酶,以推动生物技术和医学应用 | DNA聚合酶家族及其非天然同源物C28 | 合成生物学 | NA | 同源重组、定向进化、单细胞液滴微流体选择、PCR | NA | NA | NA | 同源重组 | NA | NA | 生物技术, 医学 |