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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-28 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Feb-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在模拟无膜细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA序列可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建多刺激响应的人工DNA凝聚物,并展望了与光遗传学、单分子技术和机器学习辅助序列设计结合的智能多组分系统 | 时空控制有限、易受核酸酶降解、存在免疫原性,这些挑战需解决以推进其在活体系统中的转化应用 | 概述DNA凝聚物的构建策略及其生物应用,并讨论未来发展方向 | DNA凝聚物及其在合成生物学和精准医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚、环境调控(如DNA浓度、离子强度、pH、温度) | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟无膜细胞器、可编程生化微环境 | 医学、合成生物学 |
| 62 | 2026-02-28 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学相结合,利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构,并突出其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战,但未在摘要中具体说明 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 63 | 2026-02-28 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Feb-25, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了微生物代谢工程在将C2原料转化为高价值化学品和材料方面的最新进展 | 强调了合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型和人工智能驱动设计的整合,以构建下一代、电气化和数字引导的C2生物精炼厂 | NA | 探索微生物代谢工程在C2原料增值化中的应用 | 微生物,包括大肠杆菌、假单胞菌属和光合宿主,以及C2原料 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 64 | 2026-02-28 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路,通过整合多个RAS传感器来选择性靶向RAS驱动的癌症细胞,表达治疗性蛋白 | 结合多个RAS传感器以提高癌症选择性,实现前所未有的突变RAS细胞特异性输出蛋白表达 | NA | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS驱动的癌症细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 整合多个RAS传感器的合成基因电路,用于选择性表达治疗性蛋白 | 医学 |
| 65 | 2026-02-28 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-Feb-23, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
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研究论文 | 本研究开发了一种结合生物正交化学与合成生物学工程改造的细菌外膜囊泡(OMV)平台,用于增强乳腺癌的光热免疫治疗 | 通过合成生物学改造细菌使其自主产生富含IL-2的OMV,并整合生物正交靶向(N3/DBCO系统)与光热治疗(ICG),实现了程序化免疫调节与肿瘤特异性递送的多功能协同 | 未明确说明临床前研究的动物模型具体类型及长期安全性评估数据 | 克服传统OMV在肿瘤免疫治疗中载药能力有限、肿瘤蓄积不足和快速清除的障碍 | 乳腺癌肿瘤模型 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成生物学改造、电穿孔封装、代谢糖工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(具体菌种未指明) | 通过基因工程使亲本细菌持续表达白细胞介素-2(mIL2)并富集于外膜囊泡 | 医学 |
| 66 | 2026-02-28 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026-Feb-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖在微生物合成中的最新进展,重点关注计算机辅助工程在提升合成效率和营养功能方面的应用 | 结合生物信息学方法与合成生物学策略,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产,并应用理性设计和虚拟筛选优化岩藻糖基转移酶选择 | NA | 探讨微生物合成岩藻糖基化寡糖的替代方法,以克服天然提取和化学合成的成本与规模限制 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物菌株 | NA | 医药、食品 |
| 67 | 2026-02-28 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Feb-20, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于原位检测肿瘤来源DNA(特别是KRAS突变)的最新进展、策略与应用前景 | 将基因工程细菌与CRISPR-Cas工具结合,利用细菌的自然感受态和水平基因转移能力,实现对肿瘤突变DNA的特异性识别与报告输出,开创了肿瘤DNA活体检测的新诊断范式 | 存在生物安全性、定植效率以及检测灵敏度限制等挑战 | 开发基于工程细菌的肿瘤DNA生物传感器,用于癌症的精准诊断与个性化治疗 | 肿瘤来源的DNA(特别是驱动癌症的KRAS突变) | 合成生物学 | 结直肠癌、胃肠道癌及其他实体瘤 | CRISPR-Cas工具、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 用于特异性检测突变DNA序列的生物传感器电路,包含选择性靶向、整合突变序列及产生可观察报告输出的遗传回路 | 医学 |
| 68 | 2026-02-28 |
Research progress and applications of reverse genetics systems for infectious bronchitis virus
2026-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106312
PMID:41447763
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综述 | 本文系统回顾了传染性支气管炎病毒反向遗传学系统的发展、应用与挑战,并展望了未来整合CRISPR/Cas9等技术的方向 | 全面梳理了多种反向遗传学平台(如痘病毒支持系统、体外连接转录等)在IBV研究中的应用,并探讨了其作为多病原疫苗载体的潜力 | 存在技术障碍、安全考虑和知识缺口,具体限制未在摘要中详细说明 | 研究传染性支气管炎病毒的反向遗传学技术,以推动病原研究、疫苗设计和抗病毒靶点发现 | 传染性支气管炎病毒 | NA | NA | 反向遗传学,包括痘病毒支持系统、体外连接转录、靶向RNA重组、细菌人工染色体克隆、转化相关重组、环状聚合酶延伸反应 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 医学(疫苗开发、抗病毒研究) |
| 69 | 2026-02-28 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 本研究开发了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酿酒酵母的周质空间展示遗传编码的蛋白质调节剂,以筛选和研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性,实现了功能优先的筛选 | 虽然已用G蛋白偶联受体进行了验证,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标 | 开发一种用于筛选和研究遗传编码蛋白质调节剂的合成生物学平台 | 肽、蛋白质和纳米抗体在酿酒酵母周质空间的展示及其对膜蛋白功能的调控 | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 周质展示平台,包含优化的分泌信号和展示支架,用于配体保留和信号传导 | 医学、工业生物技术 |
| 70 | 2026-02-28 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用,从机制解析到临床转化的最新进展 | 系统性地将阴道微生物群失调与宫颈癌治疗耐药性联系起来,并提出了基于微生物组的干预策略,包括合成生物学驱动的精准微生物组疗法 | NA | 探讨微生物组如何驱动宫颈癌治疗耐药性,并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程细菌 | NA | 医学 |
| 71 | 2026-02-28 |
[Biosynthesis and functions of human milk oligosaccharides]
2025-Oct-17, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250490
PMID:41755593
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综述 | 本文综述了人乳寡糖的生理功能、应用潜力及其生物合成技术,重点探讨了通过合成生物学方法提高产量的策略 | 聚焦于利用合成生物学技术和代谢工程,通过选择不同底盘细胞来显著提高人乳寡糖的产量,为食品和制药行业新产品开发提供新机遇 | NA | 总结人乳寡糖的生理功能、应用潜力及生物合成技术,推动其在食品和制药领域的规模化生产 | 人乳寡糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 底盘细胞(具体类型未指定) | NA | 食品,制药 |
| 72 | 2026-02-28 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 本研究开发了一种基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE,用于链霉菌的高效、精确基因编辑 | 首次在链霉菌中建立了基于ISDra2 TnpB的基因组编辑平台,其效应蛋白大小仅为Cas9的三分之一,并开发了单碱基编辑和多重编辑系统,通过AI辅助蛋白质工程将编辑效率提升至近100% | NA | 开发适用于链霉菌的高效、精确基因组编辑工具 | 链霉菌(Streptomyces) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、TnpB辅助基因组编辑、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-Cas, TnpB | 链霉菌(Streptomyces) | 基因组编辑平台、单碱基编辑系统(C·G-to-T·A)、多重编辑系统 | 工业生物技术 |
| 73 | 2026-02-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调控基因表达的潜力,特别是在ALOX5基因中的应用 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应来优化核糖开关功能,并开发了能够切换5-LO野生型与缺失外显子13的异构体表达的新型核糖开关剪接概念 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型 | 研究合成核糖开关在调控哺乳动物细胞中基因表达和异构体切换的潜力与优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控、核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | 使用HEK293细胞系 | 合成核糖开关、基因编辑 | 哺乳动物细胞(HEK293) | 四环素核糖开关控制的盒式外显子系统,用于调控选择性剪接和异构体切换 | 医学、合成生物学 |
| 74 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域,整合化学、生物学、物理学和工程学方法,以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架,强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解,类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜,揭示其性质、行为和功能,以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2026-02-27 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 本文介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件,用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个单一的可访问框架中,提供比基于结构的方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的综合平台,以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋(CCs)作为合成生物学中的模块化、可编程构建块以及治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络,用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 76 | 2026-02-27 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 本文通过多层宿主工程改造酿酒酵母,以增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译 | 提出了一种结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主工程策略,显著提升CrPV IRES活性 | NA | 增强非典型翻译系统中的IRES活性,以扩展合成生物学中的RNA调控工具 | 酿酒酵母和蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、宿主工程改造 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 内部核糖体进入位点介导的翻译系统 | 工业生物技术 |
| 77 | 2026-02-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK),一个基于Golden Gate的模块化克隆系统,适用于大肠杆菌,旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点,提供了更灵活的转录和翻译控制,并整合了Cello库的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化克隆系统,以优化遗传电路的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传电路和DNA组装工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路,包括启动子、绝缘核酶、核糖体结合位点和NOT门 | 生物技术 |
| 78 | 2026-02-27 |
Slowpoke: An Automated Golden Gate Cloning Workflow for Opentrons OT-2 and Flex
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00629
PMID:41642882
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Slowpoke的自动化Golden Gate克隆工作流程,专为Opentrons OT-2和Flex液体处理平台设计 | 开发了一个用户友好、灵活且开源的自动化Golden Gate克隆工作流程,并配有免费的图形用户界面,简化了协议生成过程 | 工作流程仍需用户干预菌落挑取和平板转移步骤 | 开发一个标准化、高通量且无错误的DNA组装自动化解决方案 | Golden Gate克隆工作流程的自动化 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | 使用MoClo酵母工具包和SubtiToolKit进行验证,涉及多个组装组合 | Golden Gate Assembly | 酵母, 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 79 | 2026-02-27 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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研究论文 | 本文采用合成生物学方法,探索如何利用最小遗传电路在单细胞系统中实现非关联性学习,包括习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 通过设计基于理论模型和已知调控元件的合成电路,首次在单细胞水平模拟了习惯化、敏感化及集中-分散学习效应,为实验验证提供了平台 | 研究基于模拟设计,尚未进行实验验证,且电路可能受限于结构和动力学约束,与神经学习系统存在差异 | 探索基础认知功能的遗传实现机制,以理解单细胞生物的学习行为及其进化优势 | 单细胞系统和非神经生物中的学习行为,如原生生物和黏菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,包括遗传电路设计和模拟 | NA | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 单细胞系统(如大肠杆菌或酵母) | 包含激活子、抑制子、荧光报告基因和群体感应分子的合成电路,用于实现习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 工业生物技术,医学 |
| 80 | 2026-02-27 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 本研究在解脂耶氏酵母中成功重建了植物来源的半纤维素(β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖)的生物合成途径,并实现了其O-乙酰化修饰 | 首次在酵母系统中同时合成植物来源的半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体,创造了自然界不存在的结构更复杂的乙酰化变体 | 未明确说明产量、规模化生产可行性及与天然植物半纤维素在高级结构上的完全一致性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中生产具有特定理化性质的植物源半纤维素多糖 | 半纤维素多糖(β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖)及其O-乙酰化衍生物 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达、寡糖质谱分析、组成分析、糖苷键分析 | NA | 质谱数据、化学分析数据 | NA | 基因表达(糖基转移酶、O-乙酰转移酶) | 解脂耶氏酵母 | 重建植物半纤维素生物合成途径(骨架合成与乙酰化修饰模块) | 生物材料、制药、工业生物技术 |