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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-10-13 |
Molecular point-of-care: technological evolution, clinical applications, and future perspectives
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1908277
PMID:42857429
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综述 | 系统综述了分子即时检测(POCT)平台的技术演进、临床应用及未来展望 | 系统整合了等温核酸扩增技术(LAMP、RPA、RCA)与CRISPR/Cas识别系统,并结合微流控芯片和智能手机数字平台,实现全自动化sample-in answer-out诊断能力 | 多重检测中的交叉干扰、酶在冷链外稳定性不足、核心组件成本高昂、缺乏定制化监管框架 | 总结分子POCT平台的技术演进,探讨其在多领域的临床转化应用与未来发展方向 | 分子即时检测(POCT)平台及其相关技术 | 数字病理学 | 传染病, 肿瘤, 心血管疾病, 代谢性疾病 | LAMP, RPA, RCA, CRISPR-Cas | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 62 | 2026-10-13 |
Design Principles for Perfect Adaptation in Biological Networks with Nonlinear Dynamics
2024-07-03, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01318-9
PMID:38958824
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研究论文 | 该论文提出了一个基于非线性系统理论的框架,用于识别生物网络中对外部扰动实现完美适应的设计原则。 | 提出了基于非线性系统理论的框架,不依赖于特定的速率动力学知识,仅需最小假设;推导出完美适应的数学条件,并证明只有两类网络架构(非相干前馈和带缓冲节点的负反馈环)能提供局部适应;提出了揭示全局适应设计原则的通用算法。 | 未考虑下游连接对适应性的影响,某些非相干前馈网络在下游连接存在时无法提供适应;研究基于理论推导和模拟,缺乏实验验证。 | 识别生物网络中对外部扰动实现完美适应的设计原则。 | 生物网络的结构与适应特性。 | 系统生物学、合成生物学 | NA | 非线性系统理论、数学建模、模拟研究 | 非线性动力学模型 | NA | NA | NA | NA | 非相干前馈(IFF)结构、带缓冲节点的负反馈环(NFB) | 医学、工业生物技术 |
| 63 | 2026-10-13 |
Recent advances in construction and regulation of yeast cell factories
2022-Feb-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-022-03241-4
PMID:35174424
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综述 | 本文综述了过去五年中酵母细胞工厂构建与调控的研究进展,重点关注植物天然产物的生产 | 系统总结了不同酵母底盘(如酿酒酵母、解脂耶氏酵母和毕赤酵母)及新兴基因组编辑工具的应用,并强调了亚细胞通路定位、动态调控和转运蛋白工程等代谢调控策略,同时涵盖了基于C1的化学生物生产 | 未明确提及具体限制,但作为综述,可能缺乏原始实验数据且依赖已发表研究 | 总结酵母工程在生产植物天然产物方面的进展,并讨论现有挑战和未来前景 | 酵母细胞工厂,包括酿酒酵母、解脂耶氏酵母和毕赤酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑工具 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 毕赤酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 64 | 2026-10-13 |
Antibiotic residues in environment: antimicrobial resistance development, ecological risks, and bioremediation
2022-Jan, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-021-17374-w
PMID:34773239
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综述 | 本文综述了抗生素在环境中的残留问题,包括抗微生物耐药性的产生、生态风险以及生物修复方法 | 从分子和合成生物学角度提出了工程化微生物-代谢物生物器件以及开发具有理想特性的新型菌株来修复抗生素残留的新思路 | 未提供具体的实验数据或验证结果,仅对现有方法进行总结与展望 | 总结抗生素对环境的影响、耐药性产生机制以及不同的生物修复方法 | 环境中的抗生素残留、抗生素抗性基因和抗性细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 65 | 2026-10-13 |
Acoustically triggered mechanotherapy using genetically encoded gas vesicles
2021-12, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-021-00971-8
PMID:34580468
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研究论文 | 该研究利用基因编码的气体囊泡在超声触发下产生惯性空化效应,实现体内特定位置的机械治疗 | 首次利用基因编码的气体囊泡作为超声触发惯性空化的介质,实现远程控制的细胞杀伤和组织破坏,并可用于工程化细胞按需裂解释放分子载荷 | 目前仅在肿瘤归巢益生菌治疗的小鼠模型中验证,尚未在人体中测试,长期安全性和免疫原性未知 | 开发一种利用超声和基因编码气体囊泡在体内特定位置产生机械效应的方法,用于精准的机械治疗 | 基因编码的气体囊泡、工程化细胞、小鼠肿瘤模型 | 合成生物学 | 癌症 | 超声诱导惯性空化、基因工程 | NA | NA | 小鼠肿瘤模型(具体数量未提供) | 合成生物学 | 哺乳动物细胞、小鼠 | NA | 医学 |
| 66 | 2026-10-13 |
Recent advances in bacterial biosensing and bioremediation of cadmium pollution: a mini-review
2021-Dec-01, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-021-03198-w
PMID:34850291
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综述 | 本文综述了利用细菌进行镉污染生物传感和生物修复的各种方法 | 强调了将合成生物学和代谢工程整合到细菌生物传感器和生物吸附剂设计中的新趋势 | 现有细菌方法存在局限性,如检测灵敏度、修复效率及实际应用限制 | 总结细菌在环境镉污染生物传感和生物修复方面的最新进展 | 天然或基因工程细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 生物传感器,生物吸附剂 | 环境 |
| 67 | 2026-10-13 |
Traditional in vitro strategies for sustainable production of bioactive compounds and manipulation of metabolomic profile in medicinal, aromatic and ornamental plants
2021-Oct-30, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-021-03771-5
PMID:34718882
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综述 | 该综述总结了利用前体喂养、诱导子和培养基优化等传统体外策略来提高药用、芳香和观赏植物中生物活性化合物含量的研究进展 | 系统整合了传统体外策略(前体喂养、诱导子、培养基优化)并提出了结合机器学习算法优化这些策略组合以大规模生产药用生物活性化合物的新思路 | 传统策略仍存在规模化生产受限、对复杂代谢网络调控理解不足等问题,且机器学习在该领域的应用尚处于起步阶段 | 综述传统体外策略在可持续生产生物活性化合物和调控药用、芳香及观赏植物代谢组轮廓中的应用,为相关研究者提供见解 | 药用、芳香和观赏植物(MAOPs)的体外培养物(愈伤组织、器官发生培养物) | 植物生物技术 | NA | 体外培养、前体喂养、诱导子处理、培养基优化 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 药用、芳香和观赏植物 | NA | 医药, 食品, 化妆品, 工业生物技术 |
| 68 | 2026-10-13 |
Approaches in the photosynthetic production of sustainable fuels by cyanobacteria using tools of synthetic biology
2021-Oct-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-021-03157-5
PMID:34664124
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具改造蓝细菌以生产可持续燃料的最新进展与方法 | 系统总结了用于蓝细菌基因组编辑的合成生物学工具及其在多种生物燃料分子生产中的应用 | 仅对现有研究进行综述,未提供原始实验数据 | 探讨利用合成生物学方法改造蓝细菌实现可持续燃料的光合生产 | 蓝细菌,特别是集胞藻 PCC 6803 和聚球藻 PCC 7942 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、基因组编辑、遗传改造、转化技术 | NA | 文本 | NA | NA | 集胞藻 PCC 6803,聚球藻 PCC 7942 | 多基因单操纵子 | 能源,工业生物技术 |
| 69 | 2026-10-12 |
Integrated microdroplet workflow for high-throughput cell-free transcription in double emulsion picoreactors
2027-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.119231
PMID:42777282
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研究论文 | 本文提出了一种集成微流控工作流程,可在与水包油包水双乳液皮升级反应器中实现无细胞转录,并兼容商用流式细胞仪 | 核心创新在于集成设备将乳液再注入、电场介导的体外转录试剂步进注射以及下游双乳化相结合,减少了手动操作并在多步工作流程中保持液滴完整性,同时利用商用流式细胞仪替代定制液滴分选平台 | 本工作并未进行文库筛选,仅建立并验证了底层工作流程,尚未实际应用于调控序列的功能筛选 | 建立并验证一种可及的模块化平台,为无需专用光学分选仪器的调控序列功能筛选奠定基础 | 水包油包水双乳液皮升级反应器中的无细胞转录反应 | 合成生物学 | NA | 液滴微流控、等温滚环扩增、体外转录、Mango III适配体荧光生物传感 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 70 | 2026-10-12 |
Advances in biosynthesis and sensory property modulation of mogrosides
2026-Nov-30, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120509
PMID:42858992
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综述 | 本文综述了罗汉果甜苷的生物合成及感官特性调控的研究进展,涵盖其生理功能、生物合成突破、食品基质相互作用及扩大应用 | 系统整合了罗汉果甜苷在生理功能、生物合成、食品基质相互作用及应用方面的多学科最新进展,并强调了合成生物学和酶工程在高效微生物生产中的作用 | 天然可用性低和固有的感官缺陷尚未完全解决 | 综述罗汉果甜苷的生物合成和感官特性调控,以促进其可扩展生产及在食品市场中的应用 | 罗汉果甜苷 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | NA | 食品, 医药 |
| 71 | 2026-10-12 |
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.738993
PMID:42539253
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研究论文 | 本文介绍了一个名为“咖啡因大肠杆菌”的教育模块,该模块通过合成生物学实验教学,引导高中生探究基因工程菌株,用于测量液体中的咖啡因浓度 | 将合成生物学与探究式学习结合,开发了符合NGSS标准的五周教学模块,并通过工程化大肠杆菌作为咖啡因生物传感器,让学生在实践中学习基因工程和定量分析 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 将合成生物学和基因工程研究引入高中课堂,激发学生对科学研究的兴趣,并培养其动手实验和数据分析能力 | 高中生、教师以及工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学教育 | NA | 基因工程、生物测定 | NA | 实验数据 | 在8所德克萨斯州高中实施,涉及学生和教师,具体人数未提及 | NA | 大肠杆菌 | NA | 教育 |
| 72 | 2026-10-12 |
Artificial intelligence and synthetic biology in traditional Chinese medicine: revolutionizing public health applications
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1789960
PMID:42052276
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综述 | 本文综述了人工智能与合成生物学在中医药现代化中的协同作用,涵盖可持续生物合成、化合物预测、质量控制、网络药理学机制阐释及诊断可重复性提升 | 系统提出人工智能与合成生物学协同整合以推动中医药从经验实践向标准化、循证公共卫生干预转化的框架 | 未充分讨论人工智能可解释性不足、生物数据库有限以及跨学科协作机制尚不成熟等挑战 | 探讨人工智能与合成生物学如何协同克服中医药现代化障碍,实现可持续发展并保留其治疗价值 | 中医药(包括中药活性化合物、中医药临床评价体系、中医药诊断与治疗实践) | 机器学习 | NA | 生物信息学、机器学习、网络药理学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-10-12 |
Engineered bacteria and engineered probiotics for intestinal disease therapy: a bibliometric and knowledge mapping analysis
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1970221
PMID:42851468
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研究论文 | 该文通过文献计量学和知识图谱分析,表征了工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的研究格局、知识结构、研究热点和新兴趋势 | 首次采用文献计量学与知识图谱相结合的方法,系统揭示工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗领域从传统抗炎、黏膜免疫调节向底盘选择、增强定殖、自调控基因回路、益生菌基生物材料、缓释递送系统和抗肿瘤治疗转变的研究趋势 | 文献计量数据仅能反映研究主题分布与趋势,不能直接证明治疗性能;2026年数据为部分年度数据;未来仍需解决生物安全性、遗传稳定性、时空可控性、肠道定殖、递送效率和临床转化等问题 | 表征工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的研究格局、知识结构、研究热点和新兴趋势 | 2015年至2026年间发表的499篇工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的相关文献 | 机器学习 | 肠道疾病,炎症性肠病,结直肠癌 | 文献计量学分析,知识图谱分析,关键词共现分析,关键词爆发分析,共被引参考文献分析 | NA | 文本 | 499篇文献,来源于Web of Science Core Collection和Scopus数据库,发表于2015年至2026年 | NA | NA | 自调控基因回路,缓释递送系统,工程细菌介导的抗肿瘤治疗,环境感知与局部治疗递送系统 | 医学 |
| 74 | 2026-10-12 |
A pipeline for screening small molecule-enhanced protein stability in a bacterial orphan receptor
2025-11, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70330
PMID:41074865
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研究论文 | 本文表征了来自Candidatus Solibacter usitatus的孤儿PAS-HTH转录因子CU228,并建立了一个筛选小分子增强蛋白稳定性的流程 | 首次将CU228表征为通过小分子稳定化搜索新型配体的模型系统;结合生物信息学、结构分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差NMR等多种技术系统筛选配体 | 仅使用约760个化合物的片段库进行筛选,配体亲和力仅为微摩尔级别,尚未进行合成化学遗传学变体的实际设计与验证 | 建立筛选小分子增强孤儿PAS蛋白稳定性的分析流程,为设计单组分转录因子的合成化学遗传学变体奠定基础 | 来自Candidatus Solibacter usitatus的孤儿PAS-HTH转录因子CU228 | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 结构数据、光谱数据、NMR数据 | 约760个化合物的片段库 | NA | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 75 | 2026-10-12 |
Recent advancements in CRISPR/Cas technology for accelerated crop improvement
2022-Apr-23, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-022-03894-3
PMID:35460444
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas及其衍生基因编辑工具在作物遗传改良中的应用进展 | 系统总结了CRISPR/Cas及其仿制工具如碱基编辑、引物编辑、多重基因组编辑、染色体工程等先进生物技术在作物遗传改良中的应用,并讨论了基因驱动、组织特异性基因组编辑、dCas9介导的表观遗传修饰和转基因程序性自我消除等最新技术 | 未提及 | 综述CRISPR/Cas技术及其衍生工具在加速作物改良方面的最新进展,探讨其在作物遗传改良中的应用潜力和前景 | 作物植物 | 植物基因组编辑 | NA | CRISPR/Cas, 碱基编辑, 引物编辑, 多重基因组编辑, 染色体工程, 基因驱动, 组织特异性基因组编辑, dCas9介导的表观遗传修饰 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 76 | 2026-10-12 |
Microbial degradation and valorization of poly(ethylene terephthalate) (PET) monomers
2022-Apr-15, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-022-03270-z
PMID:35426614
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综述 | 本文综述了降解PET单体的微生物和代谢途径以及将TPA和EG生物转化为高附加值化合物的研究进展 | 聚焦于PET单体(EG和TPA)的微生物降解和代谢途径而非PET水解酶,并详细讨论了将TPA和EG生物转化为高附加值化合物的最新进展 | 未提及具体实验数据,主要基于文献综述,缺乏对现有微生物降解效率和经济可行性的系统评估 | 总结PET单体微生物降解和增值转化的研究现状,探讨利用合成生物学和代谢工程解决PET污染问题 | PET塑料、PET单体(乙二醇EG和对苯二甲酸TPA)、塑料降解微生物、微生物细胞工厂 | 合成生物学, 代谢工程, 环境生物技术 | NA | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 77 | 2026-10-12 |
Metagenomics Approaches in Discovery and Development of New Bioactive Compounds from Marine Actinomycetes
2020-Apr, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-019-01698-5
PMID:31069462
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综述 | 本文综述了宏基因组学在海洋放线菌新型生物活性化合物发现与开发中的应用,包括基于序列和功能的筛选方法、相关技术进展及面临的挑战 | 系统总结了宏基因组学结合先进扩增与筛选技术(如φ29 DNA聚合酶、新一代测序、Cosmids)及新型生物信息学工具(如自动化基因组挖掘、anti-SMASH)在克服传统方法局限方面的潜力 | 宏基因组学存在偏好性分类、高质量DNA样本不易获取、异源表达及宿主选择等局限 | 探讨宏基因组学方法在海洋放线菌生物活性化合物发现与开发中的应用与前景 | 海洋放线菌及其宏基因组 | NA | NA | 宏基因组学、新一代测序、φ29 DNA聚合酶扩增、Cosmids、生物信息学工具(自动化基因组挖掘、anti-SMASH) | NA | 序列数据、功能筛选数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 78 | 2026-10-12 |
CRISPR-associated nucleases: the Dawn of a new age of efficient crop improvement
2020-02, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-019-00181-y
PMID:31677059
|
综述 | 本文综述了CRISPR相关核酸酶的发展历史及其在多种植物基因组编辑中的应用,并介绍了新报道的核酸酶工具 | 系统总结了新报道的多种CRISPR相关核酸酶,并探讨其通过不同DNA序列改变形式编辑植物特定基因的潜力,以及与合成生物学整合的前景 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且主要基于已有研究进行归纳 | 总结CRISPR相关核酸酶在作物改良中的应用及新型核酸酶工具的发展 | 多种植物物种的基因组编辑 | 农业生物技术 | NA | CRISPR相关核酸酶基因组编辑 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 79 | 2026-10-12 |
An update and perspectives on the use of promoters in plant genetic engineering
2020, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:33097676
|
综述 | 本文综述了植物基因工程中启动子的使用进展与前景,重点讨论了不同类型启动子(如组成型、诱导型、组织特异性启动子)在转基因表达调控中的作用、优缺点及其在合成生物学和基因组编辑中的应用 | 系统更新了目前已报道的各类启动子的重要性、当前前景及优缺点,并探讨了其在合成生物学和基因组编辑中的影响,为开发营养和农艺改良的转基因作物提供指导 | 作为综述,缺乏原始实验数据,主要基于已有文献的归纳和总结,未提供新的实验验证 | 总结植物基因工程中启动子的重要性和应用前景,帮助研究人员更好地利用启动子开发营养和农艺改良的转基因作物 | 植物基因工程中使用的各类启动子及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 80 | 2026-10-12 |
Synthetic microbial consortia for biosynthesis and biodegradation: promises and challenges
2019-Oct, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10295-019-02211-4
PMID:31278525
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综述 | 本文综述了合成微生物菌群在生物合成和生物降解方面的前景与挑战 | 系统总结了合成微生物菌群在基础研究及工程应用中的潜力,并指出系统生物学与合成生物学工具有望填补微生物互作机制的知识空白 | 对微生物互作的分子机制理解不足,合成菌群的理性设计与优化仍面临挑战,其技术潜力尚未被充分开发 | 探讨合成微生物菌群在生物合成与生物降解领域的应用前景及面临的挑战 | 合成微生物菌群及环境微生物菌群中的互作关系 | 合成生物学 | NA | 系统生物学, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |