合成生物学相关文章
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当前共找到 5089 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-04 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
|
综述 | 本篇综述深入探讨了基于无细胞系统的生物传感器的设计与功能，涵盖遗传回路构建、信号输出策略及多种设备格式，并讨论其应用与局限性 | 强调无细胞系统在合成生物学中作为快速、模块化和可定制生物传感器的优势，并探索人工智能辅助设计、分子优化及先进材料集成等工程解决方案 | 当前局限性包括保质期短、灵敏度有限和规模化困难 | 综述无细胞生物传感器的设计、功能、应用及未来发展方向 | 无细胞系统及其在生物传感器中的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因回路，信号输出策略 | 医疗, 环境科学, 农业, 食品质量保障 |
| 62 | 2026-06-04 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 探讨无细胞系统与自动化和机器人技术的融合如何改变生物技术与生物工程领域 | 详细分析了自动化无细胞系统的设计、功能和局限性，并强调微流控设备、液体处理机器人和集成分析平台等技术的结合 | 面临标准化、开发更稳定经济的无细胞提取物以及整合人工智能和机器学习用于实验设计和过程优化的挑战 | 研究利用自动化机器人平台实现无细胞蛋白质合成及其他可编程无细胞生物机制的快速应用，以促进高通量筛选、合成生物学电路快速原型化、按需生物制造和即时诊断 | 无细胞系统、自动化平台和机器人技术 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、微流控技术、液体处理机器人 | NA | NA | NA | 微流控设备、液体处理机器人、集成分析平台 | NA | NA | 工业生物技术、医学 |
| 63 | 2026-06-04 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
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综述 | 探讨利用无细胞系统进行生物分子高通量筛选的原理、平台与应用 | 强调了无细胞系统在合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程中的变革性影响，并整合了微流控、自动化及机器学习等前沿技术 | 高试剂成本和有限的翻译后修饰仍是挑战 | 综述无细胞系统在生物分子高通量筛选中的应用，推动下一代生物分子筛选和治疗开发 | 无细胞系统（如大肠杆菌、麦胚、兔网织红细胞及PURE系统）及高通量平台（如微孔板、液滴微流控、纸质设备） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、高通量筛选、微流控、质谱、数字PCR | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 麦胚, 兔网织红细胞 | NA | 医学, 药物发现, 诊断, 蛋白质工程 |
| 64 | 2026-06-04 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的开发历程、现状及未来发展方向 | 详细阐述了无细胞系统从最初的大肠杆菌提取物发展到涵盖多种生物来源的综合平台，并指出其在快速高效合成蛋白质、增强化学抗性和简化标记等方面的独特优势 | 存在成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定等挑战 | 介绍无细胞转录翻译系统的开发进展及其在合成生物学和生物制药中的应用潜力 | 无细胞转录翻译系统（TXTL） | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核细胞 | NA | 合成生物学, 生物制药 |
| 65 | 2026-06-04 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
|
综述 | 探讨人工智能与无细胞系统的整合，涵盖最新进展、工业应用及未来方向 | 系统阐述了人工智能（包括机器学习、深度学习和生成模型）在优化无细胞系统中的应用，如通过深度学习发现抗菌肽、通过主动学习将蛋白质产量提高34倍 | 面临数据需求、模型可迁移性和可扩展性等挑战 | 探索人工智能与无细胞系统的融合，推动合成生物学的发展 | 无细胞系统中的蛋白质合成和代谢等生物过程 | 机器学习 | NA | 无细胞系统 | 深度學習, 生成模型, 贝叶斯优化, 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 制药, 诊断 |
| 66 | 2026-06-04 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 综述蛋白质工程在医学、食品和环境等领域的最新进展，重点关注人类疾病治疗和生物医学科学 | 系统总结了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成就，涵盖进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程应用的当前挑战和伦理考量 | 回顾蛋白质工程的最新发展，强调其在人类疾病特别是癌症治疗中的变革潜力 | 蛋白质工程相关技术及其在治疗性蛋白质、抗体工程、酶合成中的应用 | 蛋白质工程 | 癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas、高通量数据 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学、食品、环境、工业生物技术 |
| 67 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
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综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 68 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
|
综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 69 | 2026-06-04 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
|
研究论文 | 提出DNABERT2-CAMP混合模型用于大肠杆菌启动子识别，结合Transformer全局编码与CNN局部特征提取 | 首次将预训练DNABERT-2 Transformer与CNN-Attention-Mean Pooling模块结合，同时建模长程基因组依赖和局部基序特征 | 仅限于大肠杆菌σ70启动子识别，未验证其他物种或启动子类型 | 开发高精度可解释的大肠杆菌启动子识别方法 | 大肠杆菌K-12菌株的启动子序列 | 机器学习 | NA | DNABERT-2、CNN、Transformer | 混合Transformer-CNN模型 | DNA序列 | 8720条81bp序列（平衡数据集） | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 70 | 2026-06-04 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
|
综述 | 探讨瘤内微生物群通过炎症和免疫机制重塑肺癌微环境，并展望基于合成生物学的工程菌和纳米抗生素在免疫治疗中的应用 | 首次系统阐述瘤内微生物群在肺癌微环境中通过分泌代谢物、激活信号通路、招募免疫抑制细胞及上调免疫检查点分子表达来主动诱导慢性炎症并促进肿瘤进展，并评估了基于合成生物学的工程菌和靶向纳米抗生素重塑免疫微环境的潜力 | 肺组织低生物量导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响，且常忽视真菌和病毒等非细菌成分在肿瘤生态系统中的协同作用 | 阐明瘤内微生物群影响肺癌细胞和肿瘤微环境的机制，并探索其临床转化潜力 | 瘤内微生物群及其在肺癌微环境中的作用 | 微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序, 多组学技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 71 | 2026-06-03 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Jun-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
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综述 | 系统总结了液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略，并探讨了人工智能与深度学习如何推动该领域的理性设计 | 首次将人工智能和深度学习应用于内在无序区数据库构建和数据驱动的合成IDR理性设计，建立了定量序列-相行为关系，推动经验设计向预测性工程框架转变 | 冷凝物的老化和与宿主细胞环境的兼容性仍是关键挑战 | 为合成生物学和代谢工程领域提供液-液相分离的集成理论框架和前瞻性视角，以开发下一代稳定、可编程的基于LLPS的微生物细胞工厂平台 | 液-液相分离形成的人工冷凝物及其在代谢通道、基因表达控制和复杂可编程细胞功能模块中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 液-液相分离, 人工智能, 深度学习 | 深度学习 | 内在无序区序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工冷凝物（代谢通道、基因表达控制、可编程细胞功能模块） | 工业生物技术 |
| 72 | 2026-06-03 |
Nanomedicine carrier-based combined antitumor strategy integrating phototherapy and immunotherapy
2026-Jun, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2026.2671715
PMID:42153947
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综述 | 系统分析纳米载体介导的光疗与免疫疗法联合抗肿瘤策略的原理、机制及最新进展 | 提出纳米载体可精准时空协调光疗诱导的免疫原性细胞死亡与免疫检查点抑制剂、原位疫苗等免疫疗法的协同递送 | 临床转化面临制造可扩展性、人类肿瘤异质性和最佳治疗排序等挑战 | 探讨纳米载体介导的光疗-免疫联合疗法在实体瘤治疗中的应用潜力 | 纳米药物载体、光疗药物、免疫调节剂、肿瘤微环境 | 纳米医学 | 癌症 | 光疗, 免疫疗法, 纳米载体递送 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 73 | 2026-06-03 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白预测方法FSM，以提升识别率 | 创新性地融合特征协同模型与GO纯中心性，构建纯PPI网络并设计新中心性度量GPC，有效降低PPI数据噪声并增强特征关系整合 | 方法依赖GO注释和基因表达数据质量，可能在不同物种或数据稀疏场景下性能受限 | 提高必需蛋白预测的准确率，推动合成生物学和疾病治疗发展 | 酵母数据集中的必需蛋白 | 机器学习 | NA | 基因表达分析、GO注释分析 | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学、医学 |
| 74 | 2026-06-03 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-May-31, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
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综述 | 本文讨论了如何将酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错整合为一个连续自动化工作流程，以解决当前基因构建中碎片化问题 | 提出通过理解合成、组装与保真度控制之间的依赖关系来实现真正集成的工作流程，并强调酶促DNA合成作为水性过程为整合提供新机遇 | 未提供具体的实验验证或定量比较，仅基于文献分析和理论推理 | 探索将酶促DNA合成、碎片组装和MutS纠错集成到一个自动化流程中，以提高基因构建的保真度、通量和可扩展性 | 基因构建管道中的步骤：寡核苷酸合成、片段组装和纠错 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS纠错、层次化组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学 |
| 75 | 2026-06-03 |
Microalgae-Based Semiartificial Photosynthesis: Strategies, Applications, and Future Prospects
2026-May-27, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c01166
PMID:42203637
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综述 | 综述了微藻基半人工光合系统的策略、应用与未来前景 | 首次系统综述了将活体微藻细胞与工程非生物组分结合的半人工光合系统，以解决光谱不匹配、电子传输效率低和CO₂扩散限制等问题 | 存在生物-非生物界面能量耦合不足、缺乏标准化性能指标、长期稳定性和纳米材料可持续性等关键挑战 | 探讨微藻基半人工光合系统的生物学基础、光学增强、电子转移调控、CO₂浓缩和压力缓解策略，以及其在太阳能燃料、生物制造、环境修复和生物混合微型机器人中的应用 | 微藻及其与非生物材料结合的半人工光合系统 | 机器学习和数字病理学不适用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 半人工光合系统，结合光能捕获、电子传输调控和CO₂浓缩模块 | 能源、环境、生物制造 |
| 76 | 2026-06-03 |
Bottom-Up Synthetic Biology for Artificial Cell Design: From Scaffold Materials to Functional Integration
2026-May-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2604.04021
PMID:42225276
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综述 | 综述自下而上合成生物学在人工细胞设计方面的最新进展，涵盖五种主要支架材料和四种功能类别，并讨论应用领域和技术局限性 | 重点介绍凝聚物基和混合分层区室两种新兴支架材料，系统总结四种核心功能类别（级联代谢、蛋白质合成、分裂和能量产生）的整合方法 | 模块兼容性、操作稳定性和调控挑战等关键技术局限性制约人工细胞的实际应用 | 综述自下而上人工细胞设计的研究进展和应用前景 | 人工细胞及其非生命分子组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 级联代谢通路、蛋白质合成回路、分裂机制、能量产生系统 | 工业生物催化, 治疗性蛋白递送, 生物传感, 生命起源研究 |
| 77 | 2026-06-03 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
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综述 | 综述了基于核酸构建的跨膜纳米孔的最新进展，重点介绍DNA纳米孔的设计原理、架构及应用 | 系统总结了DNA纳米孔作为可编程跨膜通道的理性设计方法及其在合成生物学中的新兴应用，特别强调了RNA折纸技术用于创建基因编码纳米孔的独特潜力 | 未明确提及具体局限性，但可推断现有核酸纳米孔在膜锚定效率、离子传导动态调控等方面仍存在挑战 | 探讨基于核酸的合成跨膜纳米孔的设计、特性及其在单分子传感和合成生物学中的应用前景 | 核酸纳米孔（特别是DNA纳米孔）及其与脂质膜的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA折纸、RNA折纸 | NA | NA | NA | DNA折纸、RNA折纸 | NA | 跨膜纳米孔、核酸纳米通道 | 医疗、合成生物学 |
| 78 | 2026-06-03 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 该论文通过文献计量学方法分析1994至2024年间植物基因工程的全球趋势和合作网络 | 首次系统揭示中美双核国际合作结构及“一带一路”倡议对技术传播的影响，并划分技术生命周期的三个阶段 | NA | 系统分析植物基因工程领域全球研究趋势与合作网络动态 | 1994-2024年间全球植物基因工程相关文献 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas9, RNA干扰, 农杆菌介导转化 | NA | 文本 | 1994-2024年全球文献数据 | CRISPR-Cas9, RNA干扰, 农杆菌介导转化 | 烟草 | NA | 农业 |
| 79 | 2026-06-03 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-May, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
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研究论文 | 开发了一种基于吩嗪的模块化系统，实现电子设备与工程细菌之间的双向氧化还原通讯 | 利用可商业获得的电极结合吩嗪修饰，建立模块化通讯通道框架，实现电子与生物域间的比例控制和双向信号传导 | NA | 构建电子设备与生物系统之间的无缝通讯桥梁 | 工程细菌群体与商用电子电极 | 合成生物学 | NA | 电化学传感、吩嗪生物合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 吩嗪基氧化还原通讯回路，包括电信号编码、生物信号传输、双域信号接收及可控噪声模块 | 环境监测, 适应性生物制造, 响应式生物医学设备 |
| 80 | 2026-06-03 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 构建了一种合成基因电路，将生化信号转换为电信号，用于电化学生物传感 | 首次将间接电子传递基因电路与响应性基因电路耦合，使非典型电活性细菌实现信号转化，用于单细胞水平一氧化氮检测 | 未提及 | 开发基于合成生物学的下一代电活性微生物电化学生物传感器 | 大肠杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路、电化学检测 | NA | NA | NA | 合成基因电路 | 大肠杆菌 | 一氧化氮响应模块与苯二胺-1-羧酸合成模块耦合的集成基因电路 | 生物传感、医学 |