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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-03-29 |
De novo chemoenzymatic construction of lipid membranes
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.013
PMID:41895902
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研究论文 | 本文提出了一种化学酶促策略,在水溶液中从头构建磷脂和膜 | 开发了一种模块化方法,通过天然化学连接将脂肪酸合成与磷脂组装结合,实现无预存双层的膜构建 | NA | 为自下而上的合成生物学和生命起源研究提供从头构建膜的平台 | 磷脂和膜 | 合成生物学 | NA | 化学酶促合成,天然化学连接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生命起源研究 |
| 1002 | 2026-03-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种基于细胞自由表达系统封装的方法,在巨型单层囊泡中重构细菌谷氨酸受体通道 | 提出了一种新方法,通过封装和孵育细胞自由表达反应,成功在合成细胞模型中重构膜蛋白,并探索了信号肽替换对蛋白共翻译易位的影响 | NA | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 细胞自由表达系统、共翻译易位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1003 | 2026-03-29 |
Drivers of metabolic diversification: how dynamic genomic neighbourhoods generate new biosynthetic pathways in the Brassicaceae
2020-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.16338
PMID:31769874
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研究论文 | 本研究通过分析十字花科植物基因组,探讨了基因组动态邻域如何通过基因重排驱动三萜类生物合成途径的多样化进化 | 揭示了植物基因组通过动态基因组邻域重组核心酶基因库来产生新生物合成途径的进化机制,为植物代谢多样化提供了基因组学解释 | 研究仅基于13个已测序的十字花科基因组,功能验证仅针对三个代表性基因簇,可能未涵盖该家族的全部代谢多样性 | 探究植物新生物合成途径的进化机制,特别是三萜类代谢途径的多样化过程 | 十字花科植物的三萜类生物合成基因簇及其基因组邻域 | 植物基因组学与代谢工程 | NA | 基因组测序、系统发育分析、功能验证 | NA | 基因组序列数据 | 13个已测序的十字花科植物基因组,包含163个OSC基因 | NA | 十字花科植物 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 1004 | 2026-03-29 |
Consensus architecture of promoters and transcription units in Escherichia coli: design principles for synthetic biology
2017-Mar-28, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c6mb00789a
PMID:28256660
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研究论文 | 本文通过分析大肠杆菌K-12 MG1655中的实验描述和预测遗传元件,定义了转录单元的全面架构组织,以揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 提出了大肠杆菌启动子和转录单元的共识架构,为合成生物学提供了设计原则 | NA | 揭示自然基因组设计并指导合成遗传程序的构建 | 大肠杆菌K-12 MG1655中的遗传元件和转录单元 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 遗传信息数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 转录单元架构设计 | 工业生物技术 |
| 1005 | 2026-03-28 |
Advances in Biomolecular Condensates: From Disease Therapy to Synthetic Biology
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500931
PMID:41889100
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚体的最新突破、技术挑战和未来方向,重点关注其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 将生物分子凝聚体作为创新靶点,用于新药研发、疾病治疗、生物反应器构建和智能生物材料开发,为不可成药靶点提供新的干预策略 | NA | 探讨生物分子凝聚体在生物医学和工程生物学中的应用潜力 | 生物分子凝聚体(BMCs),包括蛋白质和核酸等生物分子 | 合成生物学 | NA | 液体-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 1006 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1007 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 1008 | 2026-03-28 |
The secret life of RNA and lipids
2025-12, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
|
综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用,包括其化学基础及其对合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学的影响 | 综述了RNA与脂质相互作用的新兴领域,提出了利用这些相互作用设计合成系统中RNA传感器和调控元件的可能性 | NA | 探索RNA与脂质相互作用,以推动合成生物学、RNA治疗和细胞调控研究 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和调控元件 | 医学, 工业生物技术 |
| 1009 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
|
研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包,扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化,具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包,以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 1010 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
|
研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略,用于区分近似的DNA和RNA序列,以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略,通过谨慎交换密码子实现,对酵母生理影响最小,并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印,结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型,水印策略对Gpm1基因有轻微影响,且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略,以区分合成与天然基因副本,支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的13个糖利用途径基因,包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株,涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径,通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 1011 | 2026-03-25 |
[Biomanufacturing driven by engineered organisms (2026)]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260153
PMID:41873064
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综述 | 本文回顾了2025年合成生物学与生物制造在智能化集成、系统优化及多元化应用方面的显著进展,并展望了该领域的未来发展方向 | 人工智能从辅助工具演变为核心驱动力,推动研究范式从“经验驱动”向“数据和模型驱动”的根本转变;环境生物修复从功能菌株工程转向合成微生物群落的理性设计,标志着可预测、可控修复策略的新时代 | NA | 总结合成生物学与生物制造领域的最新进展,并展望其未来发展趋势 | 合成生物学与生物制造领域的技术、应用及发展趋势 | NA | NA | 人工智能、酶工程、蛋白质设计、细胞工厂构建、合成微生物群落设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 传统及新兴底盘宿主 | 细胞工厂、合成微生物群落、人工细胞 | 工业生物技术、环境、能源、医药 |
| 1012 | 2026-03-25 |
[Recent advances in the application value and biosynthesis of chiral reticuline]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250432
PMID:41873066
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综述 | 本文系统总结了手性网状碱作为苄基异喹啉生物碱核心骨架的应用价值、合成途径及最新研究进展 | 揭示了具有(-)-立体化学偏好的研究,为合成(-)-构型苄基异喹啉生物碱提供了新途径 | (-)-网状碱的生物合成仍受关键酶立体选择性的限制,需通过酶工程和途径重构等策略解决 | 为开发下一代高效、高选择性的苄基异喹啉生物碱提供理论支持和实践指导 | 手性网状碱及其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的应用 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 酶工程、途径重构 | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 1013 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析,总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角,系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素,并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |
| 1014 | 2026-03-25 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展,强调计算工具与合成生物学方法的整合 | 提出将计算建模(如同源建模、分子对接、分子动力学模拟)和深度学习策略与传统技术相结合,加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径,以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1015 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够高效整合大于50 kb的大片段DNA,并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶,Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台,包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学,药物发现 |
| 1016 | 2026-03-25 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库个体变异基因分型的自动化工作流程,利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包实现 | 开发了模块化、标准化的自动化工作流程,结合开源液体处理器和自定义软件,提高了基因分型的可靠性和可重复性 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制,需通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 为基因组工程和合成生物学中的高通量筛选提供自动化、可扩展的个体变异基因分型解决方案 | 转座子插入库中的个体克隆变异 | 合成生物学 | NA | 转座子插入、PCR分析、测序 | NA | 测序数据 | 46个变异体(其中40个成功鉴定) | OT-2液体处理器 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 1017 | 2026-03-25 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文报道了构建完全基于蛋白质的微三维打印机器人结构的过程,这些结构由最小化肌动球蛋白皮层涂层并驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建和驱动的三维机器人结构,结合了三维打印技术和肌动球蛋白主动涂层 | 需要生物材料专业知识,完成过程耗时15天,可能限制广泛采用 | 将生物分子活动组装和放大以在人造设备中执行工作,推动合成生物学应用 | 蛋白质基三维打印机器人结构、肌动球蛋白皮层 | 合成生物学 | NA | 三维打印、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 1018 | 2026-03-25 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
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研究论文 | 本文提出了一种通过利用原核生物作为现场组分、功能和结构构建块库来构建细菌源性原始细胞的协议 | 采用空间分离的细菌菌落捕获和处理策略,在单个凝聚微滴中生产膜结合、分子拥挤、组成、结构和功能复杂的合成细胞,并实现内源性重塑以获取多种原始细胞器 | 协议完成需约27天,且需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术的专业知识 | 构建具有高组织和功能复杂性的逼真合成细胞,以理解细胞过程和生命基础 | 细菌源性原始细胞 | 合成生物学 | NA | 微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物(细菌) | 膜结合、分子拥挤的合成细胞,包含空间分区核样DNA/组蛋白凝聚物、膜结合水泡、F-肌动蛋白原始细胞骨架网络和原始线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 1019 | 2026-03-25 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文综述了2014至2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦于针对蓝藻系统的合成生物学创新,以解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍,促进多样化蓝藻天然产物家族的生产 | NA | 扩大蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、生物信息学工具、组合生物合成、转录与翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus elongatus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇(BGCs)克隆、宿主工程 | 医药 |
| 1020 | 2026-03-25 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了过去十年中通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的酶,强调了其在合成生物学中设计功能性肽制剂的应用潜力 | 突出了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶,这些酶能超越二十种蛋白质氨基酸的限制,产生结构复杂多样的肽类,为合成生物学提供新工具 | NA | 探索核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)的翻译后修饰酶,以促进功能性肽制剂的理性设计和生产 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)及其翻译后修饰酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |