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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-03-19 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文通过单分子力谱技术结合微流控增强光阱和粗粒度模拟,研究了toehold介导的链置换过程的单分子动力学 | 首次在单分子水平上实时观察TMSD过程,实现了微秒和纳米级分辨率,并揭示了序列效应在链置换中的重要性 | NA | 探究toehold介导的链置换在单分子层面的动力学特性 | DNA和RNA链的toehold介导链置换过程 | NA | NA | 单分子力谱、微流控增强光阱、粗粒度模拟 | NA | 力谱数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 核酸纳米技术、合成生物学 |
| 1062 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
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综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术,探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制,并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物(包括古菌、细菌和真核生物)及其酶(极端酶) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑,基因组尺度代谢模型,比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术,环境 |
| 1063 | 2026-03-18 |
A protein-fragment complementation assay to quantify synthetic protein scaffold efficiency
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag003
PMID:41836103
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研究论文 | 本研究开发了一种基于二氢叶酸还原酶蛋白质片段互补分析(DHFR PCA)的方法,用于量化合成蛋白质支架在酵母中的效率 | 首次将DHFR PCA应用于酵母中蛋白质支架效率的定量研究,并识别了影响支架效率的关键因素,如PBD-肽相互作用强度和结合可用性 | 研究主要聚焦于酵母模型,可能不直接适用于其他生物系统,且支架表征依赖于生长速率耦合,可能受其他因素影响 | 探索和量化合成蛋白质支架在酵母中的效率,以优化支架设计工具 | 肽结合域(PBD)和肽的相互作用、支架架构和表达水平 | 合成生物学 | NA | 蛋白质片段互补分析(DHFR PCA) | NA | 生长速率数据 | NA | 蛋白质支架设计 | 酵母 | 蛋白质支架,用于诱导酶的空间接近性 | 工业生物技术 |
| 1064 | 2026-03-18 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文回顾了人类合成生物学领域在可编程基因调控系统方面的最新进展,重点介绍了多层级基因表达控制工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | 强调了高通量人类合成生物学方法的发展,实现了在DNA、RNA和蛋白质水平上的模块化调控,并展示了合成基因程序在操纵细胞行为和提供信息方面的创新应用 | NA | 探讨人类合成生物学中可编程基因调控系统的开发与应用,以控制细胞表型和功能 | 人类细胞中的合成基因系统和调控工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |
| 1065 | 2026-03-18 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法,用于纯化具有天然转录后修饰的tRNA,以增强无细胞翻译系统的性能 | 提出了一种灵活的方法,能高产高纯地生成修饰tRNA,解决了RNA生物化学中长期存在的挑战,并首次提供了关键tRNA的完整修饰谱 | NA | 开发一种纯化方法,以生产保留天然转录后修饰的tRNA,用于改进无细胞翻译系统和遗传密码扩展 | tRNA(转移RNA),特别是来自大肠杆菌和酿酒酵母的tRNA,以及工程化tRNA变体 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、细胞无翻译反应 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 1066 | 2026-03-17 |
Stability and Reactivity of Alternative Nucleobases in Concentrated Sulfuric Acid
2026-Mar-03, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31050845
PMID:41828832
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研究论文 | 本研究评估了14种商业可得的替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,以探索其在该溶剂中形成DNA类似聚合物的潜力 | 首次系统研究了替代核碱基在浓硫酸中的稳定性,并识别出多个稳定且可溶的候选碱基,为在极端酸性环境中设计遗传类似聚合物提供了新方向 | 研究仅限于实验室条件下的短期稳定性评估,未验证这些碱基在浓硫酸中实际形成聚合物或进行碱基配对的能力 | 探索在浓硫酸等极端酸性溶剂中稳定存在的替代核碱基,以支持DNA类似聚合物的设计 | 14种商业可得的替代核碱基 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱(H和C NMR) | NA | 光谱数据 | 14种化合物,在98%和81%浓硫酸中孵育3周 | NA | NA | NA | 天体生物学、行星科学、合成生物学 |
| 1067 | 2026-03-17 |
Application of Enzyme Engineering and Synthetic Biology for Modulated Transformation of Fructooligosaccharides (FOSs) to Elucidate the Catalytic Mechanism of Fructofuranosidases
2026-Mar-03, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15050843
PMID:41829116
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研究论文 | 本研究通过酶工程和合成生物学方法改造果呋喃糖苷酶,以提高果寡糖的转化效率并阐明其催化机制 | 构建了突变酶142P-242K,将果寡糖转化效率从29%提升至52%,并揭示了催化口袋修饰和底物亲和力变化是提高产量的主要因素 | 活性位点的疏水性和强氢键阻碍了从GF2合成nystose (GF3) | 提高果寡糖的酶法生产效率和阐明果呋喃糖苷酶的催化机制 | 果呋喃糖苷酶突变体142P-242K及其催化产物果寡糖 | 合成生物学 | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 制药 |
| 1068 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
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综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用,并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识,并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 1069 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 1070 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
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综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 1071 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 1072 | 2026-03-16 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-09-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
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研究论文 | 本文介绍了一种按需纳升输送平台,通过电激活微滴组装实现实时控制和选择性内容融合 | 该平台创新性地整合了电传感、触发式液滴合并和被动分选于单一连续流中,利用基于阻抗的内容检测选择性识别目标液滴并启动电聚结融合 | NA | 开发一种高精度、可编程的纳升输送平台,用于提高生化检测的吞吐量和特异性 | 微滴液滴及其内容物,应用于细菌筛选等场景 | NA | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学偏转 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、单细胞分析 |
| 1073 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 1074 | 2026-03-15 |
NNTox: Gene Ontology-Based Protein Toxicity Prediction Using Neural Network
2019-11-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-54405-6
PMID:31784686
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因本体(GO)的神经网络模型NNTox,用于预测蛋白质毒性,并分析了GO术语与蛋白质毒性之间的关系 | 将通用的蛋白质功能预测方法扩展应用于毒性预测,开发了基于神经网络的模型NNTox,能够预测蛋白质的毒性可能性及具体毒性类型 | 现有方法过于特定,限制了其应用范围;模型依赖于预测的GO术语,可能受预测准确性影响 | 预测蛋白质毒性,以减少合成生物学中潜在危害风险 | 蛋白质序列及其毒性 | 生物信息学 | NA | 神经网络 | 神经网络 | 蛋白质序列和GO术语 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1075 | 2026-03-15 |
The rise of bottom-up synthetic biology and cell-free biology
2019-05-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/ab1bed
PMID:31018188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1076 | 2026-03-15 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
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综述 | 本文从实验/技术和理论两个角度探讨上皮-间质转化(EMT),综述其在胚胎发育、伤口愈合和转移等生理背景下的调控网络,并介绍相关数学模型和新兴合成生物学技术 | 结合实验与理论视角,强调网络基序(如耦合反馈环)在生成上皮与间质状态间中间杂交态中的作用,并提出通过驱动网络动态向期望吸引子(如上皮细胞状态)来控制表型结果的新兴方法 | NA | 理解EMT调控网络,以开发控制细胞表型结果的方法,特别是在癌症治疗策略中 | 上皮-间质转化(EMT)的调控网络及其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 合成生物学 | 癌症 | NA | 数学模型 | NA | NA | 合成生物学技术 | 细胞 | 网络基序如耦合反馈环 | 医学 |
| 1077 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
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综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物,影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架,将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来,并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物(如植物化学物质、多糖、复方草药)、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1078 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |
| 1079 | 2026-03-14 |
Overcoming hydrophobicity-driven aggregation: An integrated expression strategy enables high-yield soluble production of recalcitrant starch synthases in Escherichia coli
2026-Mar-10, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106917
PMID:41819303
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研究论文 | 本研究开发了一种整合表达策略,用于提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量 | 结合结构分析、MBP融合标签、优化诱导条件和密码子优化,系统性解决了疏水性酶的可溶性表达难题,并验证了该策略对多种不同来源淀粉合成酶的普适性 | 研究主要针对原核表达系统,未在真核宿主中验证;酶活性提升的具体分子机制有待进一步阐明 | 提高疏水性淀粉合成酶在大肠杆菌中的可溶性表达产量,以支持无细胞化学酶法淀粉合成 | 嗜热绿菌门细菌的淀粉合成酶(CtSS)及其他四种植物来源的淀粉生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质异源表达、结构分析、MBP融合标签技术、密码子优化 | NA | 蛋白质序列与结构数据、酶活性数据 | 5种淀粉合成酶(CtSS、GmPGM、ZmAGP、OsSS、MeSS) | MBP融合表达系统 | 大肠杆菌 | 淀粉生物合成途径的异源表达优化 | 工业生物技术 |
| 1080 | 2026-03-14 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIRF的合成翻译调控平台,通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序,实现了在大肠杆菌中可调控的翻译 | 开发了蛋白质诱导的核糖体移码平台,将适配体-蛋白质相互作用与-1移码基序结合,实现了可编程的翻译调控,突破了传统移码设计的严格序列和结构限制 | 观察到可测量的基础移码水平,未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发可编程的翻译调控工具,用于遗传电路设计和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的翻译调控机制和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导的核糖体移码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 生物传感、生物治疗 |