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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2025-10-05 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 通过分析延迟悖论细胞群体控制电路的双稳态切换和振荡行为,提出实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制(初始细胞密度驱动和博来霉素诱导细胞死亡时间延迟驱动),并提出通过调节初始细胞密度和博来霉素浓度的稳健控制策略 | NA | 实现合成悖论控制电路的稳健群体控制 | 延迟悖论细胞群体控制电路 | 合成生物学 | NA | 动态分析、双稳态分析、Hopf分岔分析 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 细胞群体 | 悖论控制电路、双稳态开关、群体控制电路 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 1042 | 2025-10-05 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
|
研究论文 | 本研究通过生物催化聚合诱导自组装技术制备人工细胞囊泡,并系统优化其尺寸分布与后组装加载性能 | 首次系统研究生物催化PISA囊泡的尺寸均一化方法,并成功实现电穿孔技术对预成型囊泡的大分子加载 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡用于合成生物学应用 | 生物催化聚合诱导自组装形成的囊泡 | 合成生物学 | NA | 荧光相关光谱, 电穿孔, 蔗糖梯度离心 | NA | 光谱数据, 形态学数据 | NA | 生物催化聚合诱导自组装 | NA | 级联反应酶系统 | 合成生物学 |
| 1043 | 2025-10-05 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于透明质酸微凝胶的双功能平台,用于研究无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的相互作用 | 首次利用透明质酸微凝胶作为实验平台,实现了无细胞蛋白质合成与蛋白质原位积累的时空调控研究 | 仅展示了平台构建的初步步骤,尚未深入探索蛋白质释放动力学和实际应用场景 | 开发能够调控蛋白质合成和积累的细胞样平台 | 透明质酸微凝胶中的无细胞蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),蛋白质固定化技术 | NA | 蛋白质积累动力学数据 | NA | NA | NA | 蛋白质合成与积累调控平台 | 合成生物学,生物技术 |
| 1044 | 2025-10-05 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
|
研究论文 | 本研究展示了在巨型聚合物-脂质混合囊泡中原位聚合微管并观察不同网络形态的过程 | 首次在聚合物-脂质混合囊泡中实现微管原位聚合,并发现不同GTP浓度可产生不同的微管网络形态 | NA | 模拟活细胞动态细胞骨架,研究膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质混合囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合、微管组装 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1045 | 2025-10-05 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种结合机器人技术和机器学习的自动化方法,用于大规模生产治疗用合成细胞 | 首次将机器人液体处理系统与自动化组织解离乳化技术结合,使合成细胞产量提升30倍,生产时间减少一半,并采用基于AI的图像分析进行自动化质量评估 | 研究主要针对临床前应用,尚未在人体进行验证 | 开发可扩展的合成细胞自动化生产方法用于治疗应用 | 蛋白质生产型合成细胞 | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统、自动化组织解离乳化、AI图像分析 | 人工智能 | 图像数据 | 小鼠实验 | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 医学 |
| 1046 | 2025-10-05 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
|
研究论文 | 本研究开发了基于V-K型CRISPR相关转座酶(CAST)的系统,实现治疗性基因在人类细胞基因组中的可编程整合 | 首次将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组编辑,相比传统Cascade系统仅需单个Cas12k效应蛋白 | 脱靶事件虽罕见但可在特定基因组区域重复出现 | 开发更简化的CRISPR基因编辑工具用于治疗应用 | 人类细胞基因组 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 基因组数据 | 多种人类细胞类型 | CRISPR-Cas | 人类细胞 | 基因整合系统 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 1047 | 2025-10-05 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-May-15, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
|
综述 | 本文综述了利用微藻进行人工CO2封存技术的现状,重点探讨了CO2耐受物种筛选、培养优化、反应器设计及合成生物学应用 | 系统整合了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化策略,并引入合成生物学手段提升CO2溶解与生物固定效率 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有文献分析 | 优化微藻基碳封存技术以应对全球变暖挑战 | 微藻及其碳封存系统 | NA | NA | 合成生物学,生命周期评估,技术经济分析 | NA | 文献资料 | NA | NA | 微藻 | NA | 环境,能源 |
| 1048 | 2025-10-05 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于M13噬菌体的工程细菌DNA递送系统,用于研究细菌间的协同响应机制 | 利用M13噬菌体构建动态噬菌粒补充系统,首次实现工程细菌间DNA介导的信息传递和协同响应 | 未提及具体应用场景下的效率验证和安全性评估 | 开发工程细菌间DNA递送系统并研究细菌协同响应机制 | 工程细菌和M13噬菌体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体递送系统、基因电路模块化 | NA | NA | NA | M13噬菌体 | 工程细菌 | 动态噬菌粒补充系统、模块化基因电路 | 医学 |
| 1049 | 2025-10-05 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
|
研究论文 | 开发了一种能够持续再生全部20种氨酰-tRNA合成酶的重构系统,推动自合成人工系统的实现 | 首次实现了在重构系统中持续再生全部20种AARS,通过五项关键改进突破了翻译系统的自我再生难题 | 未提及在更复杂系统或体内环境中的应用验证 | 构建可自我复制的人工系统,推动合成生物学发展 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)及其再生系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构系统、序列优化、翻译系统优化、密码子优化 | NA | 实验数据 | 20种AARS蛋白的再生系统 | 体外重构系统 | 无细胞系统 | AARS再生系统,包含20种酶的协同表达和功能维持 | 合成生物学、基础研究 |
| 1050 | 2025-10-05 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
|
研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中引入人类m6Am甲基转移酶PCIF1,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现人类m6Am甲基转移酶PCIF1在酵母中能促进萜类化合物生物合成,并揭示其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径基因以及激活细胞壁完整性MAPK通路发挥作用 | NA | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1051 | 2025-10-05 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
|
综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造与人工智能、大模型等信息技术融合的发展方向和新兴技术方法 | NA | 为生物制造相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造相关的数据库、知识库和大语言模型 | 生物信息学 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能、大语言模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1052 | 2025-10-05 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
|
综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件智能设计方面的应用与进展 | 整合人工智能与合成生物学、高通量技术,开发更高效的核酸元件设计工具 | 生物系统复杂性高且缺乏高度量化的训练数据,限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨人工智能在生物制造中核酸元件设计优化的应用 | 生物制造中的核酸功能元件 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、高通量技术 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 启动子、核糖体结合位点、终止子及其组合设计 | 工业生物技术 |
| 1053 | 2025-10-05 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
|
综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 首次系统阐述AI技术如何通过分析高通量测序数据革新sgRNA设计,并拓展至CRISPR阵列注释和Cas蛋白修饰领域 | NA | 探讨人工智能技术在CRISPR-Cas系统优化中的应用价值 | CRISPR-Cas系统及其相关组件(sgRNA、Cas蛋白等) | 机器学习 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 1054 | 2025-10-05 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
|
综述 | 本文综述了机器学习在合成生物学元件和遗传电路设计中的应用现状与挑战 | 系统分析机器学习算法在合成生物学元件设计中的典型应用,并提出解决当前挑战的潜在方案 | NA | 探讨机器学习如何支持合成生物学元件和遗传电路的智能化设计 | 合成生物学元件(合成启动子、RNA调控元件、转录因子)和简单遗传电路 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 1055 | 2025-10-05 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
|
综述 | 系统介绍细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用,提出了高质量模型重建将为定量合成生物学提供计算支持 | NA | 为精确表征细胞生理代谢活动和绿色生物制造提供计算生物学工具 | 细胞生理代谢网络模型 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型(GEMs)、动力学模型、酶约束基因组尺度代谢模型(ecGEMs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1056 | 2025-10-05 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
|
综述 | 本文系统总结了计算模拟和人工智能辅助的转录因子生物传感器工程与优化研究进展 | 整合蛋白质结构预测、配体结合模拟和机器学习突变数据构建数学模型来预测调控蛋白响应 | NA | 促进新型生物传感器的开发与应用 | 转录因子生物传感器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 数学模型 | 突变数据 | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器 | 代谢工程, 合成生物学, 代谢物监测 |
| 1057 | 2025-10-05 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 系统总结发酵过程中在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展 | 整合实时传感数据与多尺度模型,提出基于智能感知和数字孪生的闭环控制系统新范式 | NA | 实现发酵过程的精确优化和高效放大 | 发酵过程的实时传感与智能控制 | 工业生物技术 | NA | 在线活细胞传感器、光谱分析、废气分析 | 人工神经网络、支持向量机 | 实时传感器数据、多尺度模型数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1058 | 2025-10-05 |
DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf242
PMID:40193705
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研究论文 | 本研究揭示了phi29 DNA包装马达对RNA/DNA杂交链和双链DNA包装效率差异的分子机制 | 首次发现RNA/DNA杂交链能避免通道门控机制,实现比双链DNA更高效的包装 | 通道门控的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究病毒DNA包装马达对不同核酸链类型的包装机制差异 | phi29噬菌体DNA包装马达系统 | 结构生物学 | NA | 单通道电生理学、蔗糖梯度超速离心、单孔电导测定 | NA | 电生理数据、离心分离数据 | NA | NA | phi29噬菌体 | NA | 基因/RNAi递送、基因治疗、合成生物学、纳米技术、单颗粒传感 |
| 1059 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构,实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合,实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象,尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
| 1060 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli
2022-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33255-3
PMID:36123371
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研究论文 | 本研究通过设计人工生物合成途径,在大肠杆菌中实现了植物源性止血物质三七素的全合成 | 采用逆向生物合成方法设计非天然生物合成途径,通过引入28个同义稀有密码子显著提高了三七素合酶的溶解度 | NA | 实现三七素的异源生物合成 | 三七素及其前体L-2,3-二氨基丙酸和草酰辅酶A | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成、代谢工程、密码子优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 三七素生物合成途径,包括前体合成模块和产物合成模块 | 医药 |