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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1441 | 2024-08-20 |
Artificial Self-assembling Nanocompartment for Organizing Metabolic Pathways in Yeast
2021-12-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00045
PMID:34591448
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研究论文 | 本文介绍了一种用于在酵母中组织代谢途径的人工自组装纳米隔室,利用病毒样颗粒(MPyV VLPs)进行内部分隔 | 首次在酵母中展示了能够参与代谢途径的人工生物催化隔室,并确立了MPyV平台作为酵母工程的有前景的合成生物学工具 | NA | 开发一种新的工具用于在酵母中组织代谢途径,以提高特定代谢产物的产量 | 酵母细胞中的代谢途径和特定酶的活性 | 合成生物学 | NA | 病毒样颗粒(MPyV VLPs) | NA | 生物分子 | NA |
1442 | 2024-08-20 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏蛋白信号复合体在人工光照调节下的作用及其在开发气候智能型作物中的应用 | 探讨了人工光照对植物生长、产量和次级代谢物产生的影响,以及在藻类中提高生物修复效率的应用 | NA | 旨在探讨光敏蛋白信号复合体和基于人工光照的 photobiotechnological 方法在开发气候智能型作物中的应用 | 光敏蛋白(PHOT)及其在植物中的功能,以及人工光照对作物和藻类的影响 | NA | NA | 基因靶向和合成生物学方法 | NA | NA | NA |
1443 | 2024-08-19 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2021
2021-Oct-22, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2021-0026
PMID:34674411
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综述 | 本文介绍了2021年系统与合成生物学中COMBINE标准的最新规范 | 提供了四个标准的更新版本:Synthetic Biology Open Language Visual Version 2.3、Synthetic Biology Open Language Visual Version 3.0、Simulation Experiment Description Markup Language Level 1 Version 4和OMEX Metadata specification Version 1.2 | NA | 更新和介绍系统与合成生物学中的标准规范 | 系统与合成生物学中的COMBINE标准 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
1444 | 2024-08-19 |
Molecular engineering of nonmetallic biosensors for CEST MRI
2015-May-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/cb500923v
PMID:25730583
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研究论文 | 本文探讨了利用分子工程和合成生物学开发非金属生物传感器用于化学交换饱和转移(CEST)磁共振成像(MRI)的新方法 | 引入了一种新的化学交换饱和转移(CEST)对比机制,使得可以合理设计非金属生物传感器用于MRI | NA | 开发新的非金属生物传感器,用于监测复杂的生物过程并通过非侵入性成像技术进行MRI | 非金属生物传感器的设计与优化 | 生物技术 | NA | 化学交换饱和转移(CEST)MRI | NA | 生物分子 | NA |
1445 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性,这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落(SMCs)作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户,为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战,主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA |
1446 | 2024-08-17 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
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研究论文 | 研究在PURE无细胞转录-翻译系统中蛋白质自再生的极限 | 成功将非核糖体PURE蛋白质浓度降低至97.3%,并提高了蛋白质合成效率 | 原文未明确提及 | 重现生命系统的自我再生功能,以创造合成细胞 | PURE无细胞转录-翻译系统中的蛋白质自再生 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录-翻译系统 | NA | 蛋白质 | 涉及36种非核糖体蛋白质 |
1447 | 2024-08-17 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
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综述 | 本文综述了工程化活体材料(ELMs)的制备方法及其在医疗、环境保护和制造领域的应用潜力 | ELMs结合了合成生物学与材料科学,具有自愈、自复制和环境适应性等独特“活体”特性 | 需要进一步的研究和技术进步以提高ELMs的安全性、功能性和实际应用性 | 探讨ELMs在近年来的变革性影响,特别是在医疗保健和环境保护领域 | 工程化活体材料(ELMs)及其制备方法和应用 | 材料科学 | NA | 3D生物打印、静电纺丝 | NA | NA | NA |
1448 | 2024-08-17 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
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research paper | 介绍了一种名为ShuffleAnalyzer的综合性工具,用于可视化DNA重排过程 | ShuffleAnalyzer提供直接的图形输出,使得分析过程更加用户友好且高效 | NA | 开发一种工具以提高DNA重排分析的效率和可视化 | DNA重排过程及其在合成生物学中的应用 | synthetic biology | NA | DNA shuffling | NA | DNA序列 | NA |
1449 | 2024-08-17 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究探讨了外源性氨基酸tRNA合成酶(aaRS)和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响,并利用这些效应在Escherichia coli中设计了一种新型生物逻辑门。 | 本研究发现了外源性aaRS/tRNA对细胞内腺苷三磷酸的高消耗率在高温下引起的温度敏感性,并利用这一特性构建了一种新型生物AND门。 | 本研究主要集中在DH10β Δ中F1RP/F2P双杂交系统的转化细胞,可能需要进一步研究在其他系统和条件下的适用性。 | 探索外源性aaRS/tRNA对基因表达的影响,并开发新型生物逻辑门。 | 外源性氨基酸tRNA合成酶和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响。 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
1450 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶(CYP80G6和CYP80Q5),它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物,揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外,还鉴定了两种CYP719C酶(CYP719C3和CYP719C4),它们催化形成甲基二氧桥,这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性,我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径,实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用,并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径,为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征,并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA |
1451 | 2024-08-17 |
Editorial: Plant chassis for synthetic biology and its application in biomanufacturing
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1460378
PMID:39148620
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1452 | 2024-08-16 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本文展示了将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 利用合成生物学技术,将工程化细菌作为活体分析工具,具有更广泛的生物标志物检测范围和先进的处理及感应/响应功能 | NA | 探索将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中,用于实时监测生物标志物 | 工程化细菌、皮肤纹身、生物标志物监测 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | RNA温度计 | 荧光读数 | NA |
1453 | 2024-08-16 |
Genome Engineering for Next-Generation Cellular Immunotherapies
2023-12-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.2c00340
PMID:35930700
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研究论文 | 本文探讨了通过基因组工程技术改进下一代细胞免疫疗法的策略 | 利用CRISPR-Cas系统和合成生物学方法,开发具有更高效力和精细模块控制的细胞疗法,并提供同种异体疗法开发的工具包 | 目前尚未提及具体限制 | 克服现有细胞免疫疗法中的挑战,如抗原逃逸、肿瘤微环境中的免疫抑制、毒性和靶向非肿瘤效应 | CAR-T、TCR-T、NK细胞疗法及其他免疫细胞类型 | 基因组学 | 癌症 | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因数据 | 未具体说明样本数量 |
1454 | 2024-08-16 |
Plant Metabolic Gene Clusters: Evolution, Organization, and Their Applications in Synthetic Biology
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.697318
PMID:34490002
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综述 | 本文综述了植物代谢基因簇的进化、组织结构及其在合成生物学中的应用 | 探讨了基因簇通过基因重复和新功能化进化而来的机制,并强调了其在代谢工程和合成生物学策略中的重要性 | NA | 总结基因簇的进化,讨论其在特化代谢物生物合成中的组织和重要性,并强调其在未来代谢工程或合成生物学策略中的应用 | 植物代谢基因簇及其在特化代谢物生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇 | 超过20个基因簇 |
1455 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析,鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子,并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时,通过基因组数据和蛋白质组分析,识别了534个操纵子,并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域,用于识别核糖体结合位点(RBSs)。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,包括启动子元件和核糖体结合位点,为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析,荧光报告系统 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | 48个天然启动子,534个操纵子,15个基因间区域 |
1456 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调,并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子,参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外,还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 |
1457 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌,用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块,实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成,克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血,特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA |
1458 | 2024-08-14 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化条件性gRNA的dCas9调节器,用于精确控制内源基因表达 | 本研究首次实现了基于多输入逻辑处理的条件性gRNA,能够高效调节内源代谢过程 | NA | 开发一种新的方法来精确控制CRISPR-Cas系统,以调节内源基因表达 | Escherichia coli中的内源代谢基因和细胞骨架基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 涉及Escherichia coli中的多个基因,包括lacZ, malT, poxB, ftsZ和mreB |
1459 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
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综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术,深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术,蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA |
1460 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |