合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1461	2024-08-14	Biofunctional coacervate-based artificial protocells with membrane-like and cytoplasm-like structures for the treatment of persistent hyperuricemia 2024-01, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2023.11.030 PMID:37992873	研究论文	本文研究了基于生物功能化凝聚层滴的人工原细胞，用于治疗持续性高尿酸血症	开发了具有生理稳定性的聚赖氨酸-多核苷酸复合凝聚层滴，并通过PEG化磷脂膜改善其生物相容性，形成具有膜样和细胞质样结构的人工原细胞	NA	研究人工原细胞在治疗持续性高尿酸血症中的应用	人工原细胞的制备及其在降尿酸和预防肾脏损伤中的效果	生物技术	高尿酸血症	凝聚层滴技术	NA	生物分子	小鼠模型
1462	2024-08-14	Towards a Yersinia pestis lipid A recreated in an Escherichia coli scaffold genome 2024, Access microbiology DOI:10.1099/acmi.0.000723.v3 PMID:39130741	研究论文	本文利用CRISPR/Cas9重组技术将脂多糖A生物合成基因插入到表达脂多糖IV亚单位的菌株基因组中	成功插入三个基因并通过RT-PCR验证其表达，但通过MALDI-TOF质谱分析发现脂多糖A结构未在背景中重现	尽管基因表达，但脂多糖A结构未能在背景中重现	探索在Escherichia coli基因组中重现Yersinia pestis脂多糖A的可能性	脂多糖A生物合成基因及其在Escherichia coli中的表达	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9重组技术，MALDI-TOF质谱分析	NA	基因组	一个菌株
1463	2024-08-14	Step-by-step design of proteins for small molecule interaction: A review on recent milestones 2021-08, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.4098 PMID:33934427	综述	本文综述了蛋白质设计领域中针对小分子相互作用的最新进展，详细介绍了从活性结合位点的构思到支架设计、序列优化及定制蛋白质的实验表达的每一步骤	近期计算技术在硬件和软件方面的进步为高通量筛选和新型折叠及功能改进的详细设计铺平了道路	NA	开发定制的蛋白质和多肽以满足特定应用需求	蛋白质设计	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1464	2024-08-14	Two-Phase Synthesis of Taxol 2020-06-10, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.0c03592 PMID:32406238	研究论文	本文介绍了一种基于萜类合成生物机制的互补发散合成方法，用于合成紫杉醇	提出了一种新的合成紫杉醇的方法，该方法模仿了萜类合成的生物机制	NA	探索紫杉醇的新合成途径	紫杉醇的合成方法	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
1465	2024-08-13	AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network 2024-Sep-10, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004 PMID:39009230	研究论文	本文提出了一种名为AFP的新方法，通过将原子组追踪融入反应化学计量学，利用混合整数线性规划（MILP）来寻找代谢途径	AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学，构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径，并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物	NA	旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径	代谢途径的自动发现方法	代谢工程	NA	混合整数线性规划（MILP）	MILP模型	代谢途径数据	NA
1466	2024-08-13	A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes 2024-Sep-10, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007 PMID:39004405	研究论文	本文介绍了一种新的合成生物学表达系统，用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成	该系统允许将生物合成基因簇（BGCs）重构为单顺反子转录单元，并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒	NA	开发一种新的合成生物学系统，用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成	链霉菌中的生物合成基因簇（BGCs）	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	基因序列	涉及两种已知的生物合成基因簇，用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成
1467	2024-08-13	Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches 2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13152171 PMID:39124289	研究论文	本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展	利用合成生物学和机器学习技术，通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径	甾体内酯的生物合成途径复杂，是提高生产的主要障碍	提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求	茄科植物中的甾体内酯类化合物	合成生物学	NA	CRISPR	机器学习	生物过程数据	NA
1468	2024-08-13	Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems 2024-Aug, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493 PMID:38971129	综述	本文综述了利用微生物系统进行可持续生物化学合成的策略	结合系统生物学和合成生物学，以及将人工智能与代谢工程整合，以精确和数据驱动的方式设计生物合成途径	讨论了当前的限制并提出了优化生物系统的策略	开发可持续替代品以替代化石燃料和化学品，并推动绿色生物技术的发展	微生物系统的生物合成能力	生物技术	NA	代谢工程	人工智能	数据	NA
1469	2024-08-13	Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines 2024-Aug, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494 PMID:38936328	研究论文	本文探讨了非核糖体肽装配线上反应性氨基酸侧链的生物合成及其招募机制	本文揭示了多种反应性氨基酸在非核糖体肽中的生物合成途径及其在药物开发中的应用潜力	NA	研究反应性氨基酸在非核糖体肽合成中的作用及其在制药领域的应用	反应性氨基酸及其在非核糖体肽中的生物合成和功能	生物化学	NA	蛋白质工程	NA	NA	NA
1470	2024-08-13	Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling 2024-Aug, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151 PMID:38823314	综述	本文探讨了如何利用系统生物学和单细胞测序技术来识别协调植物生长和发育的候选基因	结合系统生物学和单细胞测序技术，以及合成生物学方法来测试假设和定义基因型-表型关系	识别候选基因仍然是一个挑战，由于复杂的基因网络和通路以及多效性现象	探索如何通过工程化植物激素信号来协调植物生长、发育和环境响应	植物生长和发育的候选基因及其在特定时间和组织背景下的功能	NA	NA	单细胞测序	NA	基因序列	NA
1471	2024-08-13	AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors 2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules29153512 PMID:39124917	综述	本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用	探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力，并提出了针对该领域挑战的创新解决方案	NA	探索人工智能在合成生物学中的应用，以推动学术研究和生物技术的实际应用	生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控	合成生物学	NA	机器学习、深度学习	AI算法	生物数据	NA
1472	2024-08-13	Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells 2021-06-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-021-24103-x PMID:34172734	研究论文	本文通过基因工程改造大肠杆菌，使其过量表达光驱动的向内质子泵，并将其封装在人工细胞大小的隔室中，利用光暗循环实现pH值的可逆调节，进而触发DNA结构与隔室边缘的附着	本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合，利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制	NA	实现光转化为质子梯度，用于驱动合成细胞系统的动作	大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构	合成生物学	NA	基因工程	NA	生物分子	NA
1473	2024-08-13	Refactoring biosynthetic gene clusters for heterologous production of microbial natural products 2021-06, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2020.12.011 PMID:33476936	综述	本文综述了微生物天然产物异源生产的最新进展，重点介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主	介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主，为微生物天然产物的发现、产量优化和组合生物合成研究提供了新的合成生物学方法	NA	总结微生物天然产物异源生产的最新进展	微生物天然产物及其生物合成基因簇	合成生物学	NA	BGC重构技术	NA	NA	NA
1474	2024-08-12	Functional modification of gut bacteria for disease diagnosis and treatment 2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.medj.2024.06.003 PMID:38964334	研究论文	本文讨论了通过功能性修饰肠道细菌用于疾病诊断和治疗的方法，包括包装材料、生物医学应用及未来发展	利用合成生物学和光遗传学技术改进细菌的定殖和控制释放，将肠道细菌转化为药物化学合成的细胞工厂	口服使用肠道细菌治疗受限于胃液的高酸性和免疫系统对外来细菌的攻击	探索通过功能性修饰肠道细菌以实现疾病诊断和治疗的新方法	肠道细菌及其在疾病治疗中的应用	NA	NA	合成生物学、光遗传学	NA	NA	NA
1475	2024-08-12	LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling 2024-Aug-09, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-01915-z PMID:39117617	研究论文	本研究通过CRISPR激活筛选识别能够增强CD8 T细胞干细胞样行为的转录调节因子，发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号传导促进CD8+ T细胞的干细胞特性及肿瘤排斥	首次发现LMO4通过结合JAK1并增强STAT3信号传导，促进CD8 T细胞的干细胞样特性，从而增强肿瘤免疫治疗效果	研究主要集中在体外和动物模型中，尚未在临床试验中验证LMO4的疗效	探索增强CD8 T细胞干细胞样行为的新策略，以提高基于T细胞的免疫治疗效果	CD8+ T细胞的干细胞样行为及肿瘤免疫治疗	免疫学	肿瘤	CRISPR/Cas9	NA	细胞	涉及多种细胞培养和小鼠肿瘤模型
1476	2024-08-12	Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization 2024-Aug-08, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51043-z PMID:39117632	研究论文	本文报道了一种基于热响应性水两相系统（TR-ATPS）的双级分隔方法，该系统由聚（N-异丙基丙烯酰胺）（PNIPAM）和葡聚糖（DEX）组成	TR-ATPS能够通过温度变化实现生物分子的时空富集，加速生物化学反应效率	NA	探索在合成系统中实现类似生物细胞内外的环境响应性分隔	热响应性水两相系统及其在生物分子存储和酶空间分布编程中的应用	生物化学工程	NA	水两相系统（ATPS）	NA	溶液	NA
1477	2024-08-12	Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology 2024-Aug, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176 PMID:39079313	综述	本文综述了酵母合成生物学在人类G蛋白偶联受体生物学和药理学领域的最新进展	介绍了酵母合成生物学在GPCR研究中的新概念和技术突破	NA	探讨GPCR在医学和生物技术中的应用	G蛋白偶联受体及其在细胞过程中的作用	生物技术	NA	合成生物学	NA	NA	NA
1478	2024-08-12	Plant synthetic biology as a tool to help eliminate hidden hunger 2024-Aug, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103168 PMID:38964080	综述	本文综述了利用合成生物学技术提高植物营养成分以对抗因缺乏负担得起的健康食品而导致的隐性饥饿的最新生物技术方法	介绍了在植物中生产通常在动物性饮食中发现的化合物，如维生素D或Omega-3脂肪酸的最新进展	NA	探讨利用合成生物学技术改善植物营养成分，以解决因食品不足导致的隐性饥饿问题	植物营养成分的改善，特别是维生素、矿物质和其他代谢物的增加	合成生物学	营养不良相关疾病	合成生物学	NA	NA	NA
1479	2024-08-12	Engineering plant-microbe communication for plant nutrient use efficiency 2024-Aug, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103150 PMID:38810302	研究论文	研究通过工程化植物与微生物之间的交流，提高植物对养分的利用效率	利用植物工程和合成生物技术，开发能够通过根分泌物选择性富集有益微生物的植物，以及能够改善植物养分可用性和吸收的微生物	NA	通过工程化植物与微生物的交流，优化植物对养分的利用效率	植物与根际微生物的交流	NA	NA	植物工程和合成生物技术	NA	NA	NA
1480	2024-08-12	CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution 2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae398 PMID:39120645	研究论文	本文介绍了一种名为CAPE的深度学习框架，该框架采用混沌注意力网络用于启动子进化，旨在预测启动子强度并指导其定向进化	CAPE模型通过综合提取启动子内的进化信息，并使用改进的DenseNet和Transformer结构处理整体信息，实现了对原核生物启动子强度预测的最新成果	NA	预测启动子强度并指导其定向进化，以降低传统启动子工程中的实验成本	原核生物启动子	机器学习	NA	深度学习	DenseNet, Transformer	启动子序列信息	NA