本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-03 |
Light-controlled synthetic communication networks via paired connexon nanopores
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66621-y
PMID:41274894
|
研究论文 | 本文通过工程化连接蛋白通道,在脂质体合成细胞中构建了光控合成通信网络 | 利用正交连接蛋白(连接蛋白43和连接蛋白32)设计UV和近红外响应通道,实现合成细胞间正交信号分子传输 | NA | 模拟生物细胞间通信网络,构建合成细胞通信系统 | 脂质体合成细胞和工程化连接蛋白通道 | 合成生物学 | NA | 连接蛋白工程、脂质体组装 | NA | NA | NA | 连接蛋白工程 | 脂质体合成细胞 | 光控合成通信网络,基于连接蛋白通道的正交信号传输 | 合成生物学、生物工程 |
| 142 | 2026-01-03 |
Extremophile-Derived Bioactives in Cosmeceuticals: Bridging Nutraceuticals and Skincare for Holistic Wellness
2025-Nov-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15121787
PMID:41465727
|
综述 | 本文综述了极端微生物来源的生物活性物质在药妆品和营养化妆品中的应用,探讨了其通过局部和系统途径改善皮肤健康的潜力 | 将极端微生物来源的独特化合物(如极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸)整合到药妆品中,并系统阐述了其局部外用与口服营养补充相结合的全方位护肤策略 | NA | 分析极端微生物来源的生物活性物质在护肤领域的应用潜力及其生产策略 | 极端微生物及其产生的生物活性化合物(极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸等) | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色提取 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 极端微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 143 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触(MLCs)的方法,以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能,特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触(MLCs) | 医学 |
| 144 | 2026-01-03 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
|
综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良潜在工具的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的生物技术策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物中的microRNA及其人工调控工具 | NA | NA | 人工miRNA设计、靶标模拟物技术、短串联靶标模拟物 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 利用miRNA生物合成途径编程合成回路 | 农业 |
| 145 | 2026-01-02 |
Bioelectrochemical energy conversion and wastewater treatment in microbial fuel cells: a review of progress, limitations, and future developments
2025-Dec-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133903
PMID:41475609
|
综述 | 本文综述了微生物燃料电池(MFC)在生物电化学能量转换和废水处理方面的最新进展、局限性及未来发展 | 系统总结了合成生物学和微生物工程在增强生物膜稳定性、改善胞外电子传递方面的最新进展,以及纳米结构电极相较于传统碳电极在提升电流输出方面的优势 | 材料成本高、电极污染、长期稳定性有限以及规模化问题阻碍了工业部署 | 探讨MFC技术在环境可持续性和可再生能源生成框架下的应用前景 | 微生物燃料电池(MFC) | NA | NA | 生物电化学能量转换 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源 |
| 146 | 2026-01-02 |
Synthetic biology for sustainable food colourant production: Innovations and opportunities
2025-Dec-24, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147749
PMID:41475255
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学技术可持续生产天然食品着色剂的创新方法与机遇 | 提出通过整合AI辅助生物设计、系统生物学和菌株工程工作流等多学科平台,并建立创新的经济与法律机制,以加速可持续天然食品着色剂的产业化 | NA | 探讨利用合成生物学解决天然食品着色剂供应限制、促进可持续生产的途径 | 天然食品着色剂及其生产方法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、精准发酵、AI辅助设计、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂、植物品种 | 颜色富集植物品种、高产微生物细胞工厂 | 食品、工业生物技术 |
| 147 | 2026-01-02 |
Computational design of allulose-responsive biosensor toolbox for auto-inducible protein expression and CRISPRi mediated dynamic metabolic regulation
2025-Dec-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67669-6
PMID:41430049
|
研究论文 | 本文通过计算设计开发了一种基于转录因子的阿洛酮糖响应生物传感器工具箱,用于自动诱导蛋白表达和CRISPRi介导的动态代谢调控 | 成功实现了结构引导的计算设计,优化了PsiR的阿洛酮糖响应性,灵敏度提高20倍,并构建了检测范围广泛的PAB盒,同时验证了其在增强LacI-IPTG生物传感器灵敏度中的普适性 | NA | 开发阿洛酮糖触发的调控电路,用于生物技术应用中的动态代谢调控和蛋白表达 | 转录因子PsiR、阿洛酮糖响应生物传感器、CRISPR干扰电路 | 合成生物学 | NA | 结构引导计算设计、CRISPRi | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 阿洛酮糖触发的CRISPR干扰电路、自动诱导蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 148 | 2026-01-02 |
Advances in functional genomics of major rice pests and pathogens and their molecular interactions with the host: A comprehensive review
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148965
PMID:41232877
|
综述 | 本文全面综述了主要水稻病虫害的功能基因组学研究进展及其与宿主的分子互作机制 | 系统总结了水稻免疫的新机制,如效应子触发的自噬降解和环状RNA衍生的防御肽,并提出了整合人工智能、合成生物学和纳米技术的未来研究方向 | 田间应用面临效应子变异、信号串扰理解不完整以及抗性与发育权衡等挑战,许多抗性位点在感病背景下被抑制 | 阐明水稻病虫害的功能基因组学及其与宿主的分子互作机制,以促进可持续作物生产 | 水稻病虫害(害虫和病原体)及其与水稻宿主的分子互作 | 植物功能基因组学 | 水稻病虫害 | 功能基因组学、多组学方法、CRISPR编辑 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | NA | CRISPR | 水稻 | NA | 农业 |
| 149 | 2026-01-02 |
Advances in microbial biofuel production by metabolic and enzyme engineering, synthetic biology, metagenomics, and genome editing applications
2025-Nov-17, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20240002
PMID:41217051
|
综述 | 本文综述了利用微生物通过代谢与酶工程、合成生物学、宏基因组学和基因组编辑技术生产生物燃料的不同方法 | 整合了多种先进分子技术(如宏基因组学、合成生物学和CRISPR-Cas基因组编辑)在生物燃料生产中的应用,强调了从未发现的微生物群落中获取新型酶和构建高效工程微生物系统的创新策略 | NA | 探讨微生物在生物燃料生产中的潜力,并概述相关技术进展 | 微生物及其酶系统,以及植物生物质作为原料 | NA | NA | 代谢工程、酶工程、合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物细胞 | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 150 | 2026-01-02 |
Matrine and Its Derivatives: Multi-Pathway Regulation in Cancer Therapy
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S563211
PMID:41467103
|
综述 | 本文综述了苦参碱及其衍生物通过多通路调控在癌症治疗中的作用、挑战及未来发展方向 | 系统阐述了第三代衍生物(如MT-26, YF-18)通过靶向双重抑制和激活NLRP3/caspase-1细胞焦亡通路,在胰腺癌和肝癌模型中实现60-78%的抑瘤率,并克服化疗耐药性 | 临床转化面临生物利用度低、脱靶毒性(如通过激活导致的肝毒性)以及肿瘤异质性驱动的耐药机制(如介导的铁死亡逃逸)等挑战,且迄今为止尚无针对苦参碱或其衍生物在癌症治疗中的I/II期临床试验注册 | 探讨苦参碱及其衍生物作为多靶点天然生物碱在癌症治疗中的协同抗肿瘤效应及其转化前景 | 苦参碱及其衍生物 | NA | 癌症 | 多组学(空间代谢组学、单细胞表观药物组学)、合成生物学、器官芯片技术 | NA | NA | NA | DNA折纸纳米机器人、磁性引导微/纳米游泳器、AI辅助晶体筛选 | NA | NA | 医学 |
| 151 | 2026-01-01 |
Trends in Customizable Single-Cell Protein Production Enabled by Synthetic Biology: Carbon-Negative Biomanufacturing and Engineered Functionalities
2025-Dec-31, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08537
PMID:41330641
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何推动可定制单细胞蛋白生产的趋势,包括碳负生物制造和工程化功能的发展 | 探讨了从糖类到废物衍生流和C1化合物的底物演变,以及通过合成生物学实现营养定制和感官属性编程的新兴策略 | NA | 分析合成生物学在解决单细胞蛋白生产可持续性、效率和可扩展性挑战中的应用 | 单细胞蛋白生产价值链,包括底物、菌株开发、发酵过程和营养定制 | 合成生物学 | NA | 模型驱动代谢工程、数字精准控制发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 优化蛋白质生物合成的代谢途径 | 农业, 食品 |
| 152 | 2026-01-01 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
|
综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、机制见解以及用于可扩展生产的生物技术进展 | 整合了临床研究、机制洞察和生物技术生产方法,强调了微生物平台在工业规模生物合成中的前景,并探讨了生物技术与文化背景的融合 | 未提及具体临床研究的样本量限制或生物技术方法的经济成本详细分析 | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力和可扩展生产方法 | 裸盖菇素及其生物合成 | 生物技术 | 心理健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 153 | 2026-01-01 |
Neutral theory of cooperative dynamics
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515423122
PMID:41417606
|
研究论文 | 本文提出了一种基于随机中性理论的合作物种模型,探讨了合作互动在生态系统中的作用 | 模型在经典中性理论基础上引入物种间合作复制的假设,揭示了低迁移率下物种丰度分布的双峰模式及核心合作物种的作用 | NA | 研究合作物种的随机中性理论,以理解合作互动对生物多样性和生态系统稳定性的影响 | 合作物种的动力学行为,包括物种丰度分布、多样性和停留时间 | 生态学 | NA | 随机中性理论建模 | 中性理论模型 | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 微生物组研究、合成生物学、生命起源 |
| 154 | 2026-01-01 |
Deep learning-based investigation of chloroplast translation regulatory sequences
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1698951
PMID:41459449
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合CNN、LSTM、Attention和Residual架构的混合深度学习模型,用于分类和分析植物与藻类叶绿体翻译调控序列,特别是5'非翻译区序列及SD基序的存在与否 | 首次应用深度学习模型分析叶绿体翻译调控序列,并提出了在藻类质体工程中引入异源前导序列的两种潜在策略 | 模型性能虽强,但存在一小部分植物和藻类序列表现出跨组模式,可能影响分类准确性 | 研究叶绿体翻译调控序列的架构,以促进合成生物学和基因工程的发展 | 植物和藻类的叶绿体5'非翻译区序列,包括含与不含SD基序的序列 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, Attention, Residual | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 |
| 155 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、在疾病中的作用以及靶向极化的治疗策略 | 超越了传统的M1/M2二分法,强调了极化状态的连续性和动态性,并系统阐述了信号通路、代谢重编程和表观遗传机制之间的互作网络 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 阐明巨噬细胞极化的分子机制及其在疾病中的作用,并探讨靶向极化的治疗策略 | 巨噬细胞(包括组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源的巨噬细胞)及其极化状态 | 免疫学 | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 156 | 2025-12-31 |
Molecular engineering and in-silico biotechnological innovations for microbial degradation of persistent pesticides
2026-Feb, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106833
PMID:41461407
|
综述 | 本文综述了利用分子工程和生物技术创新促进微生物降解持久性农药的最新进展 | 整合了下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学和AI驱动的代谢工程等多种前沿技术,并强调从实验室到田间应用的转化潜力 | NA | 推动微生物降解持久性农药,实现可持续的农药管理和环境修复 | 持久性农药、降解微生物、相关基因与酶途径 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学、AI驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | NA | 环境、农业 |
| 157 | 2025-12-31 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
|
综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统以增强CAR免疫疗法在实体瘤治疗中的应用,旨在解决制造可扩展性、肿瘤靶向特异性和抗原异质性等挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原生产、scFv表达、共刺激结构域递送以及肿瘤微环境调节,并利用CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的关键障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,通过合成生物学方法解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并弥合临床前进展与临床实施之间的差距 | 工程化益生菌株(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas | NA | NA | 389项同行评议研究(2015-2025年) | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 158 | 2025-12-31 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2025-Dec-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
|
综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了几何深度学习在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势,强调了其在提升可解释性和泛化能力方面的作用,并提出了将可解释人工智能与基于结构的验证相结合的统一概念框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头蛋白质设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据(空间、拓扑、物理化学特征) | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 159 | 2025-12-31 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽(bundlemer)作为模块化构建单元,用于构建复杂的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无痕纯化,并整合SpyTag和sortase识别基序,实现了正交反应性连接和精确组装 | NA | 开发模块化生物合成平台,用于构建具有精确结构和功能的蛋白质纳米材料 | 重组表达的束状肽及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | 蛋白质序列、结构图像 | NA | SpyCatcher-SpyTag连接、sortase介导连接 | NA | 模块化束状肽作为构建单元,通过正交连接化学组装成纤维结构和多层纳米笼结构 | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 160 | 2025-12-31 |
Real-Time Monitoring of Microbial Metabolic Dynamics through a Carbon Dot-Functionalized Whole-Cell Electrochemical Biosensor
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18617
PMID:41395934
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于碳点功能化全细胞电化学生物传感器的平台,用于实时监测微生物代谢动态 | 通过将碳点工程化微生物与先进循环伏安法相结合,利用量子增强电荷传输机制实现电化学信号近20倍放大,并采用模块化生物架构设计,可跨多种微生物系统无缝适配 | NA | 开发实时监测微生物代谢动态的新型生物传感平台 | 微生物代谢网络及其动态变化 | NA | NA | 碳点工程化、循环伏安法、电化学生物传感 | NA | 电化学信号、代谢物数据 | NA | 碳点功能化、合成生物学 | 微生物(具体种类未指定) | 全细胞生物传感器、模块化生物架构 | 工业生物技术、临床诊断、生物过程优化 |