合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-12-06	Genetic manipulation and tools in myxobacteria for the exploitation of secondary metabolism 2023-Jun, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2023.100075 PMID:39629250	综述	本文综述了黏细菌基因操作工具及其在次级代谢产物开发中的应用	强调了构建黏细菌底盘用于合成生物学研究和未开发次级代谢产物利用的必要性和紧迫性	黏细菌的独特社会性是其操作的主要限制因素	综述黏细菌基因操作的进展，特别是次级代谢产物的开发	黏细菌及其次级代谢产物	NA	NA	基因操作技术	NA	NA	NA
142	2024-12-06	Applications of toxin-antitoxin systems in synthetic biology 2023-Jun, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2023.100069 PMID:39629251	综述	本文综述了毒素-抗毒素系统的最新分类及其在合成生物学中的应用	本文介绍了毒素-抗毒素系统在合成生物学中的新应用	NA	探讨毒素-抗毒素系统在合成生物学中的潜在应用	毒素-抗毒素系统及其在合成生物学中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
143	2024-12-06	Next-generation synthetic biology approaches for the accelerated discovery of microbial natural products 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100060 PMID:39628520	综述	本文综述了下一代合成生物学方法在加速微生物天然产物发现中的最新进展和趋势	强调了大规模激活沉默的生物合成基因簇、直接克隆或重构感兴趣的生物合成基因簇以进行异源表达，以及合成生物信息学天然产物方法在快速获取生物活性非核糖体肽中的应用	NA	探讨下一代合成生物学方法在加速微生物天然产物发现中的应用	微生物天然产物及其衍生物的生物合成基因簇	合成生物学	NA	合成生物学	NA	基因组数据	NA
144	2024-12-06	Natural and engineered cyclodipeptides: Biosynthesis, chemical diversity, and engineering strategies for diversification and high-yield bioproduction 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100067 PMID:39628525	综述	本文综述了天然和工程化环二肽的生物合成、化学多样性及其工程策略，以实现多样化和高效生物生产	探讨了通过未发现的NRPS和CDPS基因簇以及工程化方法进一步扩展环二肽化学空间的可能性	目前环二肽天然生物合成的产量较低，需要克服	总结NRPS和CDPS介导的环二肽生物合成知识，探讨工程化方法以增加化学多样性及提高产量	环二肽的生物合成、化学多样性及工程化策略	生物工程	NA	合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
145	2024-12-06	Sustainable biosynthesis of valuable diterpenes in microbes 2023-Mar, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100058 PMID:39628524	综述	本文综述了二萜类化合物的生物合成及其在微生物中的可持续生产	本文介绍了利用合成生物学和代谢工程技术在微生物中高效生产高价值二萜类化合物的新进展	NA	总结近期发现的二萜类化合物及其相关酶和生物合成途径，特别是微生物直接从廉价碳源合成高价值二萜类化合物的方法	二萜类化合物及其生物合成途径	NA	NA	DNA测序和合成、组学分析、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
146	2024-12-06	Recent developments in the identification and biosynthesis of antitumor drugs derived from microorganisms 2022-Dec, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100047 PMID:39628704	综述	本文综述了从微生物中提取的抗癌药物的最新发展，包括其识别和生物合成	讨论了基因编辑技术和合成生物学工具在识别新基因簇、扩展天然产物和阐明生物合成途径中的应用	NA	总结微生物来源的抗癌化合物在生物合成方面的最新进展	微生物中的次级代谢产物及其衍生的抗癌药物	NA	NA	基因编辑技术，合成生物学工具	NA	NA	NA
147	2024-12-06	Engineered bacteria as drug delivery vehicles: Principles and prospects 2022-Sep, Engineering microbiology DOI:10.1016/j.engmic.2022.100034 PMID:39629029	综述	本文综述了利用合成生物学技术改造细菌作为药物递送载体的发展现状	探讨了合成生物学策略在改造细菌作为药物载体中的应用，包括工程细菌的靶向实现方法、遗传回路的设计方案以及治疗化合物的释放途径	NA	探讨工程细菌作为药物递送载体的原理和前景	工程细菌作为药物递送载体	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
148	2024-12-05	Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy 2024-Dec-04, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1 DOI:10.1002/adhm.202403704 PMID:39629555	研究论文	开发了一种用于炎症性肠病治疗的智能工程益生菌胶囊递送系统	设计了一种新的粘液包裹微球凝胶递送系统，能够有效保护工程细菌在胃中的存活并显著提高其在肠道的粘附性	NA	开发一种有效的工程细菌递送系统，用于治疗炎症性肠病	工程益生菌及其递送系统	生物工程	炎症性肠病	合成生物学技术	NA	NA	NA
149	2024-12-05	Session commentaries: synthetic and constructive biology 2024-Oct, Biophysical reviews IF:4.9Q1 DOI:10.1007/s12551-024-01219-0 PMID:39618793	评论	本文是对2024年IUPAB会议中关于合成生物学和构建生物学领域的五位研究者演讲的评论	NA	NA	探讨通过构建体外系统来学习生物学知识	体外合成生物学系统	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
150	2024-12-05	Cofactor recycling strategies for secondary metabolite production in cell-free protein expression systems 2024-Oct, Biophysical reviews IF:4.9Q1 DOI:10.1007/s12551-024-01234-1 PMID:39618802	研究论文	本文探讨了在无细胞蛋白表达系统中再生辅因子以促进次级代谢产物生产的策略	提出了在无细胞蛋白合成系统中再生辅因子的策略，以实现复杂代谢产物的连续生产	NA	旨在克服无细胞蛋白合成系统中辅因子再生效率低下的问题，以促进次级代谢产物的生产	无细胞蛋白合成系统中的辅因子再生策略	合成生物学	NA	无细胞蛋白合成	NA	NA	NA
151	2024-12-02	Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids 2024-Nov-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02599-4 PMID:39609835	研究论文	通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素	通过基因重设计和异源转化，显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量	在较高光照强度下，bkt品系的生长速度较慢	开发可持续的生产生物分子的过程，利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性	Nannochloropsis oceanica	NA	NA	基因工程	NA	NA	NA
152	2024-12-02	Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity 2024-Nov-29, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adp6775 PMID:39612335	研究论文	本文通过计算方法重新设计了一种非核糖体肽合成酶（NRPS）样羧酸还原酶的“守门员”腺苷化域，显著提高了其催化效率和底物特异性	通过近似机制的几何标准和Rosetta能量评分，成功重新设计了NRPS样酶的腺苷化域，显著提高了催化效率和底物特异性	NA	通过计算方法重新设计NRPS样酶的腺苷化域，以提高其催化效率和底物特异性	非核糖体肽合成酶（NRPS）样羧酸还原酶的腺苷化域	合成生物学	NA	计算设计	NA	NA	涉及CAR3突变体ACA-1和ACA-4，以及G418K
153	2024-12-02	A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells 2024-Nov-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54502-9 PMID:39609378	研究论文	介绍了一种包含6144个合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中筛选短合成启动子	开发了一种大规模并行报告基因分析文库，能够精确检测和放大转录活性，适用于多种细胞系和刺激响应	NA	开发一种工具，用于在哺乳动物细胞中筛选和分析合成启动子的转录活性	合成启动子及其在不同细胞系和刺激响应中的功能	合成生物学	NA	大规模并行报告基因分析	NA	转录活性数据	6144个合成启动子，适用于多种细胞系和刺激响应
154	2024-12-01	An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins 2024-Nov-30, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02598-5 PMID:39614317	研究论文	本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY，通过突变提高其稳定性和产量，适用于多种蛋白质和肽的工程化任务	通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基，成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体，适用于生物正交应用	NA	开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体，用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰	Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变，以及其在肽和蛋白质工程中的应用	生物技术	NA	蛋白质工程	NA	蛋白质和肽	肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein
155	2024-12-01	Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division 2024-Nov-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54807-9 PMID:39614082	研究论文	本文展示了在巨型单层脂质体（GUVs）中重组肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统的结合，实现了肌动蛋白环的自组织赤道组装和脂质体的变形	通过结合肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统，实现了肌动蛋白环在脂质体中的自组织定位和变形，展示了不同生物功能机制在体外结合的可能性	NA	工程化合成细胞的自分裂最小模块	肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在巨型单层脂质体（GUVs）中的重组	合成生物学	NA	肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统的重组	NA	NA	NA
156	2024-12-01	Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages 2024-Nov-27, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae966 PMID:39460615	研究论文	本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型，用于识别细菌中的可逆启动子（invertons），并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式	首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子，并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用	NA	研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式	细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	基因组和宏基因组数据	分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组，识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子
157	2024-12-01	Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control 2024-Nov-27, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae980 PMID:39526390	研究论文	本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件（synTCE），并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成，用于多路信号处理和细胞控制	引入了一种新的合成翻译耦合元件（synTCE），并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用	NA	开发定制化的生物系统功能，增强核糖调节器的计算能力和应用性	合成翻译耦合元件（synTCE）及其在生物系统中的应用	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
158	2024-12-01	Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases 2024-Nov-27, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005 PMID:39613152	研究论文	本文通过共表达细胞器间连接蛋白和脂酶，提高了工程化酿酒酵母中脂肪酸的积累	开发了一种新的工程策略，通过调控脂滴相关因子和脂酶，显著提高了酿酒酵母中脂肪酸的产量	NA	提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力	酿酒酵母中的脂肪酸积累	合成生物学	NA	基因工程	NA	NA	NA
159	2024-12-01	New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase 2024-Nov-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53762-9 PMID:39592584	研究论文	本文开发了一种新的自然界不存在的新途径，通过工程化的B12依赖性酰基-CoA变位酶实现CO2依赖的乙酰-CoA同化	本文首次提出了一种新的自然界不存在的新途径，称为Lcm模块，该模块直接连接乙酰-CoA和丙酮酸，并且能够固定CO2而不是释放它	本文主要在体外证明了Lcm模块的功能，尚未在体内环境中进行全面验证	开发一种新的CO2依赖的乙酰-CoA同化途径，以提高生物量产量并减少碳损失	乙酰-CoA和丙酮酸的代谢途径	代谢工程	NA	定向超突变和适应性进化	NA	NA	NA
160	2024-12-01	Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications 2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antibiotics13111095 PMID:39596788	综述	本文综述了肉桂醛（TCA）的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用	本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用，并介绍了其在化妆品中的应用	NA	综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用	肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用	NA	NA	代谢工程和合成生物学	NA	NA	NA