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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-10-04 |
Symbiotic interactions of plant microbiota in alleviating stress: a review
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1892395
PMID:42825194
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综述 | 本文综述了植物微生物组通过共生互作缓解生物与非生物胁迫的机制，并探讨了多组学、合成生物学和纳米技术等新兴手段在理解和工程化有益植物-微生物互作中的应用 | 系统整合了多组学整合、合成微生物群落、工程化群体感应回路、全息生物体水平分析以及纳米颗粒介导的根际微生物组调控等新兴方法，用于理解和工程化有益的植物-微生物互作 | 有益微生物在田间条件下定殖能力差，且对植物-微生物互利共生复杂机制的理解尚不完整 | 总结植物在生物与非生物胁迫下的适应策略，阐明微生物共生在缓解胁迫中的作用，并展望理解和工程化有益植物-微生物互作的新兴方法 | 植物微生物组、有益微生物、植物-微生物共生互作 | 农业科学, 合成生物学, 微生物组学 | NA | 多组学整合, 合成生物学, 纳米技术, 群体感应回路工程 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 工程化群体感应回路, 合成微生物群落 | 农业, 环境 |
| 142 | 2026-10-04 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
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综述 | 本文探讨了从地球化学到生物化学的转变，提出了通过将LUCA代谢的反应规则映射到前生命反应来连接非生物化学与早期生命的建模框架 | 提出从LUCA代谢映射反应规则到前生命反应的新思路，并构建整合热力学、行星条件和关键反应物可用性的综合建模框架，利用生成模型探索代谢起源 | 目前仅为理论框架和假设，缺乏实验验证，前生命反应与LUCA代谢之间的直接证据尚不充分 | 探索代谢的化学起源，揭示从早期地球化学到LUCA复杂代谢能力的演化路径 | LUCA的代谢网络、前生命化学反应体系 | 机器学习 | NA | NA | 生成模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 143 | 2026-10-04 |
Combining in silico evolution and nonlinear dimensionality reduction to redesign responses of signaling networks
2017-Jan-13, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/13/6/066015
PMID:28085678
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研究论文 | 结合计算机模拟进化与非线性降维方法，重新设计固定拓扑信号网络的响应，并表征不同输入-输出关系下的动力学参数集合 | 将计算机模拟进化算法与非线性降维相结合，用于设计固定拓扑信号网络的响应，并约束生物参数范围 | 研究仅基于计算模拟，未进行实验验证 | 理性设计信号网络的输入-输出关系，并表征不同响应下的动力学参数集合 | T细胞受体（TCR）信号网络及含有正负反馈的网络 | 机器学习 | NA | 计算机模拟进化 | 进化算法 | 数值数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 144 | 2026-10-03 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Oct, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究鉴定了香青兰中五种UDP-糖基转移酶，阐明了其糖基化机制，并通过工程化大肠杆菌实现了生物活性黄酮糖苷的体内生产 | 首次系统鉴定了香青兰中参与黄酮糖苷生物合成的五种UGT，发现DmUGT1具有宽泛的底物杂泛性，并鉴定了决定糖供体特异性的关键氨基酸Ser127和Tyr373，同时通过增强UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖供应实现了目标糖苷的高效生产 | 尚未完全解析所有UGT的晶体结构，体内生产产量仍有提升空间，未对其他潜在UGT进行功能验证 | 系统阐明香青兰中黄酮糖基化机制，挖掘参与生物活性黄酮糖苷生物合成的候选基因，并建立合成生物学生产方法 | 香青兰（Dracocephalum moldavica）中的UDP-糖基转移酶及黄酮糖苷化合物 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 基因克隆与表达、同源建模、定点突变、代谢工程、合成生物学 | 同源建模 | 序列、质谱、酶活数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 增强UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖胞内供应的质粒与UGT表达质粒共表达系统 | 医药 |
| 145 | 2026-10-03 |
Synthetic biology unlocks programmable control of complex plant glycan metabolism
2026-Oct-01, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102978
PMID:42822192
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综述 | 该文章综述了合成生物学工具如何实现对植物复杂糖代谢的可编程控制，重点关注细胞壁生物合成和代谢物糖基化途径 | 系统性地将新兴的可编程工具（包括合成、组织特异性和诱导型启动子设计，RNA、蛋白质和通路水平的调控开关，以及基于CRISPR的系统）应用于植物糖代谢工程，并提出了从静态修饰向自我调节的精确代谢控制转变的新范式 | 文章为综述性质，未提供原始实验数据验证所提出的可编程控制策略在植物糖代谢工程中的实际效果 | 探讨合成生物学工具在植物复杂糖代谢（细胞壁生物合成和代谢物糖基化）中的可编程控制应用潜力，并分析如何克服相关工程障碍 | 植物细胞壁生物合成途径和代谢物糖基化途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR、RNA调控、启动子工程、诱导型表达系统 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 组织特异性启动子、诱导型启动子、RNA调控开关、蛋白质调控开关、通路水平调控开关 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 146 | 2026-10-03 |
Establishment of a genome editing system and expression of heterologous proteins in the nonconventional yeast Pichia kudriavzevii
2026-Sep-29, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70104
PMID:42819547
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研究论文 | 本文建立了库德里阿兹威毕赤酵母的高效CRISPR/Cas9基因组编辑系统，并实现了分泌型mCherry和人IgG1 Fc片段在不同位点的表达 | 在二倍体非常规酵母库德里阿兹威毕赤酵母中建立了高效的无标记CRISPR/Cas9基因组编辑系统，编辑效率高达88%，并能常规生成纯合突变体；同时结合位点感知表达策略实现了异源蛋白的分泌表达 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 建立库德里阿兹威毕赤酵母的基因组编辑系统并实现异源蛋白表达，将其打造为可编程的生产宿主 | 库德里阿兹威毕赤酵母（Pichia kudriavzevii） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 库德里阿兹威毕赤酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 147 | 2026-10-03 |
Firewalled synthetic commensal blocks horizontal gene transfer in the gut
2026-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.17.752456
PMID:42779942
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研究论文 | 该研究通过基因组设计和实验室进化，创建了一种高适应性的基因防火墙共生菌，能够在小鼠肠道中稳定定植并阻止水平基因转移 | 通过直接改变TCA和TCG丝氨酸密码子的氨基酸身份，无需未分配中间体，建立了稳定数千代的遗传防火墙，并利用实验室进化鉴定适应性突变，理性重设计基因组以提高适应性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体或复杂环境社区中验证；长期进化可能产生未知适应性突变 | 开发高适应性的基因防火墙共生菌，以防止合成遗传信息通过水平基因转移扩散，并用于安全活体治疗 | 基因工程共生菌（具体菌种未指定）和小鼠胃肠道微生物组 | 合成生物学 | NA | 基因组设计, 实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 小鼠, 共生菌 | 遗传防火墙（通过密码子重分配） | 医学, 环境 |
| 148 | 2026-10-03 |
Bioengineering microbial cellulose synthesis pathways as biofactory for industrial-scale cellulose production: a review on current advances
2026-Sep-02, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05233-0
PMID:42684591
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综述 | 本综述批判性地审视了细菌、藻类和卵菌中的微生物纤维素生物合成途径，重点关注细菌作为最先进的生物工厂，并探讨了代谢工程、基因组编辑和合成生物学在提高纤维素产量方面的最新进展 | 系统性地整合了代谢工程、基因组编辑和合成生物学工具包在微生物纤维素生产中的应用，强调了环二鸟苷酸调控网络工程、前体途径优化、副产物抑制和氧气利用效率等创新策略，并提出了整合菌株-工艺工程的概念 | 微生物纤维素从实验室规模向工业制造的过渡仍受限于低生产率、高生产成本、产纤维素菌株的遗传不稳定性、抑制性副产物的积累以及发酵过程中氧气供应不足等问题，此外工程化生物合成途径与纤维素理化性质之间的关系缺乏标准化 | 批判性地审视微生物纤维素生物合成途径，探讨通过代谢工程、基因组编辑和合成生物学手段提高工业规模纤维素生产力的策略，并确定关键研究优先方向 | 细菌、藻类和卵菌中的微生物纤维素生物合成途径，尤其是细菌作为最先进的微生物纤维素生物工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因组编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、藻类、卵菌 | 环二鸟苷酸调控网络、前体途径优化、副产物抑制途径 | 材料、工业生物技术、医学 |
| 149 | 2026-10-03 |
Exploring rare coumarins biosynthesis by Gloeophyllum trabeum: an integrated computational genomics, molecular docking and spectroscopic approach
2026-Aug-14, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05181-9
PMID:42599545
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研究论文 | 该研究通过整合光谱分析、计算基因组学和分子对接，探索了木腐真菌Gloeophyllum trabeum中稀有香豆素类化合物的生物合成 | 首次在Gloeophyllum trabeum中表征了四种稀有香豆素类聚酮化合物，并通过基因组挖掘预测了其生物合成基因簇，为开发新型抗生素提供了新来源 | 研究主要基于计算预测和体外实验，缺乏体内功能验证；化合物产量和纯化成本高，限制了实际应用 | 探索Gloeophyllum trabeum中异香豆素类化合物的生物合成，并评估其抗菌潜力和作用靶点 | Gloeophyllum trabeum真菌及其产生的香豆素类化合物 | 计算基因组学、分子对接、光谱分析、天然产物化学 | 细菌感染 | LCMS, 2-D NMR, 计算基因组学, 分子对接, 平板覆盖生物测定 | NA | 光谱数据、基因组序列、分子对接数据 | 4种化合物（从培养滤液中鉴定） | NA | Gloeophyllum trabeum | NA | 医学、工业生物技术 |
| 150 | 2026-10-03 |
Artificial nondirectional site-specific recombination systems
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103716
PMID:35072008
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研究论文 | 该研究设计并验证了6种新型人工非定向位点特异性重组系统（Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2），它们能够在基因组中随机触发删除、整合、倒位和易位，并与Cre/loxPsym正交 | 设计了6种新型人工非定向位点特异性重组系统，全部与Cre/loxPsym正交，且成对正交的非定向重组系统可同时在基因组两个不同区域独立启动大规模基因重组，这是此前正交系统无法实现的 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 设计并构建新型人工非定向位点特异性重组系统，以实现大规模基因组重组并扩展合成生物学中的位点特异性重组工具箱 | 人工非定向位点特异性重组系统（Vika/voxsym1-4和Dre/roxsym1-2）及其在细胞中的重组功能 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组 | NA | NA | NA | 位点特异性重组系统 | NA | 非定向位点特异性重组系统（可随机触发删除、整合、倒位和易位） | 医学, 工业生物技术 |
| 151 | 2026-10-03 |
Current Advances in the Biodegradation and Bioconversion of Polyethylene Terephthalate
2021-Dec-26, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10010039
PMID:35056486
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综述 | 本文综述了PET生物降解与生物转化领域的最新进展，包括改造PET水解酶、工程化微生物底盘、PET单体生物转化途径及人工微生物群落 | 系统总结了人工微生物群落用于PET生物降解与生物转化的新思路，可实现一步法将PET转化为高价值化学品 | 摘要未提及具体限制 | 总结PET生物降解与生物转化领域的最新进展，为解决环境塑料污染提供思路 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）及其单体对苯二甲酸（TPA）和乙二醇（EG） | 环境生物技术 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 152 | 2026-10-03 |
Modulation of Phototropin Signalosome with Artificial Illumination Holds Great Potential in the Development of Climate-Smart Crops
2021-Oct-18, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了光敏色素信号体与人工光照在气候智能型作物开发中的调控作用 | 系统总结了PHOT信号体与人工光照结合的光生物技术方法在作物改良中的应用潜力 | 作为综述，未提供原始实验数据，且主要基于已有研究归纳，缺乏新实验验证 | 探讨PHOT调控的信号体及人工光照在气候智能型作物开发中的应用 | 农作物及藻类 | 植物生物学、农业生物技术 | NA | 基因靶向、合成生物学、人工光照 | NA | 文本 | NA | NA | 植物、藻类 | NA | 农业 |
| 153 | 2026-10-03 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the molecular characterisation and environmental risk assessment of genetically modified plants obtained through synthetic biology
2021-Feb, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2021.6301
PMID:33598046
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综述 | 本文评估了现有指南对通过合成生物学获得的转基因植物的分子特征描述和环境风险评估的充分性 | 通过地平线扫描演习识别了未来十年最现实和即将出现的合成生物学相关案例，并选取了三个假设性案例研究来支持范围界定工作 | 随着合成生物学的发展，可能需要调整指南以确保其充分性和适用性 | 评估现有指南对通过合成生物学获得的转基因植物的分子特征描述和环境风险评估的充分性，并确定是否需要更新指南 | 通过合成生物学获得的转基因植物 | 合成生物学 | NA | 基因修饰和基因组编辑技术 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 食品 |
| 154 | 2026-10-03 |
Omics-Driven Biotechnology for Industrial Applications
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.613307
PMID:33708762
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综述 | 本文综述了组学技术在工业生物技术中的应用，包括合成生物学和代谢工程驱动的生物制造，并讨论了多组学实验的要求及其对生物燃料、生物产品、农业食品生物技术和COVID-19研究的影响 | 系统总结了不同组学技术的优缺点，并全面探讨了多组学实验的必要条件及其在工业生物技术各领域的应用影响 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且未深入讨论组学技术在实际工业规模应用中的具体技术瓶颈 | 探讨组学技术如何驱动工业生物技术中合成生物学和代谢工程的发展，以建立稳健的工业生物制造平台 | 组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等）及其在生物制造中的应用 | 机器学习 | NA | NGS, RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学, 多组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 155 | 2026-10-03 |
A Generative Neural Network for Maximizing Fitness and Diversity of Synthetic DNA and Protein Sequences
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.05.007
PMID:32711843
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研究论文 | 本文开发了深度探索网络（DENs），一种激活最大化的生成模型，通过梯度下降最小化神经网络适应度预测器的成本，并基于相似性度量惩罚生成模式以最大化序列多样性，同时使用变分自编码器保持生成序列的似然比，应用于合成DNA和蛋白质序列设计 | 提出了深度探索网络（DENs），通过惩罚相似性度量显式最大化序列多样性，并整合变分自编码器避免预测器低置信区域，生成序列的多样性优于传统梯度上升方法 | 未在摘要中明确提及 | 设计具有特定功能特性的合成DNA和蛋白质序列 | 合成DNA序列（多聚腺苷酸化信号、剪接调控序列）和蛋白质序列 | 机器学习 | NA | 深度神经网络、梯度下降优化、变分自编码器 | 深度探索网络（DENs）、变分自编码器（VAE） | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 156 | 2026-10-01 |
Filamentous bacteriophage M13: Structure, biology, and biotechnological applications
2026-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109003
PMID:42567428
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综述 | 该综述系统总结了丝状噬菌体M13的结构生物学、感染动态以及其在纳米技术、合成生物学和临床医学中的工程化应用 | 将基础病毒学与应用材料科学相桥接，整合了M13的物理和遗传结构、生产纯化方法以及化学-遗传工具箱，并指出了临床和工业转化的瓶颈及未来路线图 | 作为综述，未提供原始实验数据，主要基于已有文献的总结和分析 | 全面阐述M13噬菌体平台的结构、生物学特性及其生物技术应用，识别当前转化瓶颈并提供下一代基于M13的生物技术路线图 | 丝状噬菌体M13 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | 噬菌体展示 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 能源, 材料 |
| 157 | 2026-10-01 |
Advances and challenges in building microbial cell factories for phytohormone biomanufacturing toward sustainable agriculture
2026-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109035
PMID:42705366
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综述 | 该综述系统总结了主要植物激素的分类、生物功能和生物合成途径，重点介绍了利用微生物细胞工厂生产植物激素的合成生物学策略，并探讨了自动化、机器学习和人工智能在加速微生物细胞工厂开发中的应用 | 系统整合了植物激素微生物细胞工厂构建的多维度合成生物学策略（包括启动子工程、辅因子工程、转运蛋白工程、动态调控、细胞色素P450工程、亚细胞区室化、蛋白质工程及自动化和人工智能工程），并从高效产物回收、先进合成生物学工具开发和AI赋能生物制造三个视角提出了未来方向 | 异源表达的细胞色素P450活性低，亚细胞区室化复杂，植物激素微生物生产的工业化仍面临挑战 | 探讨利用微生物细胞工厂进行植物激素生物制造的进展与挑战，推动可持续农业发展 | 主要植物激素（脱落酸、赤霉素、茉莉酸、水杨酸、生长素等）及其微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 机器学习, 人工智能 | 文本 | NA | NA | 微生物 | 代谢途径, 启动子工程, 辅因子工程, 转运蛋白工程, 动态调控, 细胞色素P450工程, 亚细胞区室化 | 农业, 工业生物技术 |
| 158 | 2026-10-01 |
"EXPERT" A Practical and Forward-Looking Guide to Capturing Protein Expression and Purification Metadata to develop Machine Learning Models
2026-Sep-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113610
PMID:42810683
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研究论文 | 提出EXPERT框架，用于标准化记录蛋白质表达和纯化数据，以支持机器学习模型开发 | 首次提出一个结构化、标准化的蛋白质表达和纯化实验报告模板，整合了学术界和工业界的专家意见，旨在促进数据收集和模型构建 | 未提及具体实验验证或实际应用案例，可能缺乏对模板有效性的实证评估 | 定义蛋白质表达和纯化数据记录的关键参数，以提高实验可重复性并支持机器学习模型的开发 | 蛋白质表达和纯化实验流程及其相关数据 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 159 | 2026-10-01 |
The miRNA-ROS interactome: Orchestrating plant resilience to environmental fluxes
2026-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2026.111748
PMID:42743829
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综述 | 本文综述了植物中miRNA与活性氧（ROS）之间的双向调控网络，及其在植物抵抗环境胁迫中的作用 | 系统整合了miRNA与ROS在亚细胞区室（质外体、线粒体、叶绿体）中的相互作用，提出了miRNA-ROS互作组作为整合调控框架，并强调了其进化保守性、空间区室化及与激素、营养和钙信号网络的整合 | 在时空动态和细胞器间协调方面存在关键知识空白 | 阐明miRNA-ROS互作网络如何协调植物对环境胁迫的适应性，并提出未来研究方向以指导抗逆作物工程 | 植物 | 植物科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 160 | 2026-10-01 |
Modeling of Conjugative- and Phage-Mediated CRISPR-Based System Against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-Aug, IEEE transactions on bio-medical engineering
DOI:10.1109/TBME.2026.3693402
PMID:42133510
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研究论文 | 本研究采用系统生物学方法建立数学模型，评估工程化接合型益生菌和噬菌体通过CRISPR系统靶向沉默耐药基因或切割基因组来对抗抗菌耐药细菌的策略 | 首次建立综合数学模型同时描述工程化接合型益生菌和工程化噬菌体两种递送系统的动态变化，并纳入突变对执行器功能影响的参数，比较了CRISPR基因组切割、CRISPR干扰基因沉默与传统噬菌体疗法的效果 | 研究仅基于数学建模和模拟，缺乏体内或体外实验验证，模型参数可能无法完全反映真实生物系统的复杂性 | 利用系统生物学方法评估基于合成生物学的策略，通过工程化接合型益生菌和噬菌体对抗抗菌耐药性，探索靶向基因沉默作为替代直接杀菌方案的可行性 | 抗菌耐药细菌、工程化接合型益生菌、工程化噬菌体 | 合成生物学、系统生物学 | 细菌感染、抗菌耐药 | CRISPR、CRISPR干扰、噬菌体疗法、数学建模 | 数学动力学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌、噬菌体 | 基于CRISPR的基因沉默回路和基因组切割系统 | 医学 |