合成生物学相关文章
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当前共找到 5089 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-05-31 |
A T7 RNAP regulatory toolbox for cell-free network engineering and biosensing applications
2026-May-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73811-9
PMID:42209525
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研究论文 | 在无细胞系统中工程化T7 RNAP调控工具箱，实现可编程合成抑制子、激活子和生物传感器，用于基因网络构建和生物分子检测 | 首次系统构建T7 RNAP的模块化调控工具箱，结合蛋白质设计流程和全合成结合子开发生物传感器，并实现多种生物分子（小分子药物、抗体、蛋白质）的一管式多重检测 | NA | 开发一种灵活可扩展的无细胞系统，用于构建响应多种生物分子的基因电路并实现即时诊断应用 | T7 RNA聚合酶及其调控元件（合成抑制子、激活子、生物传感器） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、蛋白质设计、酶扩增 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因调控网络（抑制子、激活子、生物传感器） | 医学、诊断 |
| 142 | 2026-05-31 |
Engineering of β-glucosidase for rare ginsenoside biosynthesis via distal conformational fine-tuning and sequential degradation control
2026-May-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134967
PMID:42184941
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研究论文 | 通过计算重设计β-葡萄糖苷酶实现稀有人参皂苷F的高水平生物制造 | 首次整合进化适应度景观与热力学稳定性梯度，识别出协同双突变体Q7D/G189A，并通过远端突变诱导长程变构效应，重塑活性位点，实现底物结合从非特异性疏水相互作用向精确的“分子镊子”模式转变，同时揭示了控制区域选择性的顺序降解机制 | 未提及具体局限性 | 实现稀有人参皂苷F的高效生物合成，并为复杂碳水化合物活性酶提供理性工程框架 | 来自叶居类芽孢杆菌的β-葡萄糖苷酶BglPp及其突变体 | 合成生物学 | NA | 计算重设计、进化适应度景观、热力学稳定性梯度、分子动力学模拟 | NA | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | Paenibacillus phyllosphaerae | 顺序降解途径 | 工业生物技术、医药 |
| 143 | 2026-05-31 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-May-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
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研究论文 | 本研究鉴定了一株耐热菌株Aureobasidium melanogenum DA22，并分析了转录因子Spt23在高温聚苹果酸发酵中的关键调控作用 | 首次发现膜结合转录因子Spt23过表达能协同上调脂质和麦角甾醇合成基因以维持膜完整性，并增强还原性三羧酸循环关键酶活性，实现碳流重定向以提高聚苹果酸产量 | 研究未探索Spt23调控网络中的直接靶基因，也未验证该策略在其他有机酸生产中的普适性 | 工程化耐热微生物细胞工厂，解决工业有机酸生产中的热胁迫限制 | 嗜鞣化黑酵母Aureobasidium melanogenum DA22及转录因子Spt23 | 合成生物学, 工业生物技术 | NA | 过表达, 基因敲除, RT-qPCR, 发酵罐培养 | NA | 基因表达数据, 发酵参数, 生理指标 | 120株野生型分离株 | 基因工程 | Aureobasidium melanogenum | Spt23转录因子过表达回路 | 工业生物技术, 食品 |
| 144 | 2026-05-31 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-May-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 利用正交酶响应DNA阻断剂实现无细胞转录的时间编程 | 设计了正交酶驱动的DNA转录定时器，通过调控酶解阻断链的动力学实现从0.48小时到8.4小时的可调转录时间延迟，并展示了多种酶正交控制多个转录模板以及下游调控Cas12a活性 | 仅描述了体外无细胞系统的验证，未讨论在体内或复杂生物环境中的适用性和稳定性 | 开发一种通用且简便的方法，用于在无细胞合成生物学中编程时间分辨的转录和基因表达 | 无细胞转录系统中的DNA阻断链和酶驱动定时器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 正交酶响应DNA定时器，包含阻断链和三种酶（RNase H、UDG、Fpg）用于降解阻断，实现转录时间延迟和终止控制 | 合成生物学 |
| 145 | 2026-05-31 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 总结微生物与生物技术策略增强聚乳酸（PLA）生物降解的最新进展 | 该综述系统整合了从自然微生物群落筛选、宏基因组学探索到合成生物学、酶工程与人工智能驱动的酶设计的多学科策略，提出基于AI的结构预测和机器学习平台用于开发高性能PLA降解酶 | 未提及具体实验验证或定量比较不同策略的效率，重点在于概念性综述而非深入技术评估 | 概述加速PLA生物降解的多学科方法，为工业堆肥、废水处理和生物修复提供路线图 | PLA降解微生物群落、酶及降解机制 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 宏基因组数据, 环境DNA数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 代谢途径设计，反馈调节回路 | 工业生物技术, 环境修复 |
| 146 | 2026-05-31 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-04-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 综述了一种通过计算设计代谢网络遗传电路的方法，以优化蛋白质投资下的代谢通量 | 提出了一种基于最大化每单位投资蛋白质通量的方法来推断和设计遗传电路，并用于解释大肠杆菌的天然调控策略 | 仅以大肠杆菌为模型系统进行验证，未涉及真核生物或更复杂的代谢网络 | 理解并计算设计代谢网络的遗传电路，以实现动态条件下的最优代谢适应度 | 大肠杆菌的核糖体表达调控和氨基酸生物合成酶的基因表达控制电路 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 通量优化模型 | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通量调控电路 | 工业生物技术 |
| 147 | 2026-05-31 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-02-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 全面表征了一种快速生长的酵母新菌株XP，并为其遗传操作开发了工具箱 | 发现了一种生长速度快于常用研究和工业菌株的酵母新分离株XP，并在基因组、转录组和代谢组层面解析了其快速生长的机制，开发了包括基因插入、删除和倍性转换在内的遗传操作工具箱 | 未明确提及菌株XP在长期工业应用中的稳定性及潜在风险 | 开发快速生长的酵母底盘以促进合成生物学和生物技术应用 | 酵母新分离株XP及其与常用菌株的比较 | 机器学习 | NA | 基因组测序, 转录组测序, 代谢组分析, 基因编辑 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae） | L-乳酸生产途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 148 | 2026-05-31 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-02, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 比较了快速生长的沙漠微藻Chlorella ohadii与其他绿藻的基因组，揭示其无与伦比生长速率和抗逆性的基因组印记 | 首次对最快生长藻类C. ohadii进行基因组比较分析，发现其核糖体基因数量多、内含子丰富、密码子偏好性强及特有基因与代谢灵活性和抗光损伤相关 | 未明确讨论基因组特征与生长速率的直接因果关系，且研究仅限于两种绿藻比较 | 探究C. ohadii快速生长和抗逆性的基因组基础及其进化意义 | C. ohadii及其近缘种C. sorokiniana UTEX 1663的基因组 | 基因组学 | NA | 基因组比较分析 | NA | 基因组序列数据 | 两种绿藻基因组 | NA | Chlorella ohadii, Chlorella sorokiniana | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 149 | 2026-05-30 |
Current Progress and Future Outlook for Synthetic Gene Circuits in Cardiovascular Therapy
2026-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050754
PMID:42194102
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综述 | 该综述总结了合成基因回路在心血管治疗中的当前进展，并展望了未来发展方向 | 首次系统性地从直接心脏应用、间接靶向心血管疾病和未来潜在应用三个维度梳理合成基因回路，并提出改进的设计-构建-测试-学习框架以促进临床转化 | NA | 探讨合成基因回路在心血管治疗中的现状与未来前景 | 合成基因回路及其在心血管治疗中的应用 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 甲基化测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 诱导开关, 分类器系统, 代谢通路 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 150 | 2026-05-30 |
Bioengineered Silver Nanoparticles: Next-Generation Biogenic Synthesis Strategies for Precision Biomedical Applications
2026-May-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050587
PMID:42194344
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综述 | 本文综述了利用生物工程策略合成银纳米颗粒的新一代方法及其在精准生物医学中的应用 | 不同于传统综述聚焦绿色合成方法，本文重点突出了新兴的生物工程范式，如代谢工程、合成生物学、微流控辅助合成和人工智能引导工艺优化，实现了可编程、可规模化及精密可控的生物源银纳米颗粒制备 | 纳米-生物相互作用、毒理学安全性、监管合规性和转化可扩展性方面仍存在关键挑战，且银纳米颗粒与杂原子掺杂碳纳米点组成的生物源复合材料需要深入研究 | 探讨下一代生物合成银纳米颗粒的范式与策略，阐明其形成的分子机制，突出新兴功能化与生物医学应用范式，并讨论当前转化障碍 | 银纳米颗粒及其生物工程合成策略 | 机器学习 | 癌症 | 生物合成 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | 植物,微生物,真菌,藻类 | NA | 医学 |
| 151 | 2026-05-30 |
Classical Phytohormones and Peptide Plant Hormones in Abiotic Stress Tolerance: Crosstalk, Physiological Integration, and Crop Improvement
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101538
PMID:42197671
|
综述 | 本文综述了经典植物激素与肽类植物激素在非生物胁迫耐受中的相互作用、生理整合及作物改良应用 | 首次综合阐述了植物褪黑素作为整合枢纽在经典激素与肽激素网络中的双重作用（直接抗氧化和双向调控经典激素信号） | 存在网络复杂性、激素响应的上下文依赖性、实验室到田间应用的转化差距，以及多胁迫条件下肽激素作用机制理解不完整等问题 | 探讨植物激素信号网络在非生物胁迫适应中的作用，并提出利用这些网络改良作物的策略 | 植物激素信号通路及其在非生物胁迫响应中的整合网络 | 植物生物学 | NA | 转录组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,代谢组学,系统生物学,CRISPR基因编辑 | NA | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 激素信号调控网络（包括褪黑素抗氧化级联、CEP通路等） | 农业 |
| 152 | 2026-05-30 |
The NRT1.1-NLP7 Nexus: An Integrative Signaling Nexus from Nitrate Sensing to Systemic Adaptation and Structure-Guided Engineering
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101539
PMID:42197673
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综述 | 该文章综述了植物中硝酸盐感知与系统性适应中的NRT1.1-NLP7整合信号中枢，并提出了结构引导的工程改造框架 | 揭示了NRT1.1和NLP7形成整合信号中枢的新机制，并提出了三层次理性设计框架，将作物改良从经验选择转向结构引导设计 | 该研究为综述性质，未提供实验验证数据，缺乏对跨物种保守性差异的定量分析 | 探讨硝酸盐感知与核内转录反应之间的耦合机制，并提出利用结构生物学和合成生物学设计提高氮利用效率的作物工程策略 | 植物中的NRT1.1和NLP7蛋白及其相互作用网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 氮响应回路改造 | 农业 |
| 153 | 2026-05-30 |
Biotic Stress Resistance in Sweet Potato: Mechanisms, Perspectives, and Sustainable Production Strategies
2026-May-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101504
PMID:42197638
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综述 | 本文综述了甘薯生物胁迫抗性的机制、挑战及可持续生产策略，重点分析了真菌、病毒、线虫、害虫和细菌等胁迫的防御机制及分子调控网络 | 首次从多维度系统剖析甘薯防御机制，并提出了结合人工智能、基因编辑、新型组学和合成生物学等新兴技术的十年品种改良路线图 | 未提供具体的实验验证数据，且对多种胁迫交叉作用的分子机制仍缺乏深入解析 | 总结过去两年甘薯生物胁迫抗性研究的最新进展，提出可持续生产策略和品种改良路线 | 甘薯（Ipomoea batatas）及其生物胁迫因子（真菌、病毒、线虫、害虫、细菌） | 数字病理学 | 植物病害 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 甘薯（Ipomoea batatas） | NA | 农业 |
| 154 | 2026-05-30 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品体系中农药降解的工程生物催化策略，从催化性能到实际应用 | 重点介绍了通过工程策略提升酶降解性能和稳定性的进展，包括天然酶、纳米酶及多酶或杂合级联系统，并讨论了基于人工智能辅助设计和合成生物学的新兴方法 | 实验室系统向实际食品基质转化面临关键障碍，包括有限催化效率、稳定性不足、可重复使用性差、规模化限制以及监管不确定性 | 提供关于酶法降解农药的应用导向综述，重点探讨工程策略以提升性能和鲁棒性 | 天然酶、纳米酶、多酶或杂合级联系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工智能辅助设计 | NA | 多酶或杂合级联系统 | 食品, 农业 |
| 155 | 2026-05-30 |
Advances in Functional Genomics and Biotechnology for Enhancing Therapeutic Potential of Medicinal Plants
2026-May-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104245
PMID:42196225
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综述 | 综述了功能基因组学和植物生物技术在提升药用植物治疗潜力方面的最新进展 | 提出了一个整合框架，将功能基因组发现与途径工程、合成生物学、人工智能辅助预测及可扩展生产系统相关联 | 对基因组发现如何与途径工程、规模化生产系统和医疗应用相联系的综合理解仍不充分，限制了分子见解向可持续生产转化的有效性 | 提供药用植物研究中前沿方法的全面概述，重点关注通过功能基因组学和生物技术优化关键生物活性化合物的生产 | 药用植物中的关键生物活性化合物，包括青蒿素、大麻素、人参皂苷和紫杉醇 | 机器学习 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 | 植物 | 代谢途径, 合成途径设计 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 156 | 2026-05-30 |
Rethinking Microbial Chemical Ecology: Secondary Metabolites as Concentration-Dependent Signaling Hubs with Implications for Anti-Virulence Intervention
2026-May-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14051074
PMID:42197459
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综述 | 提出将微生物次级代谢产物视为浓度依赖性信号中枢的综合信号网络框架，并探讨其对抗毒力干预的启示 | 突破传统线性信号模型，将次级代谢产物重新定义为连接微生物集体行为与环境适应的关键节点，并引入空间组学和合成生物学工具 | 未给出具体实验验证，主要基于理论框架和已有研究的整合分析 | 重新认识微生物化学生态学，建立动态信号网络视角以指导抗毒力干预和应用 | 微生物次级代谢产物及其在群体感应中的双重功能 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 空间组学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 信号网络解耦 | 工业生物技术, 环境生物修复, 医学 |
| 157 | 2026-05-30 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
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综述 | 综述了微藻CO₂固定的工程与生物机制，涵盖从分子调控到系统优化的多尺度整合 | 全面整合了多尺度视角，从气液传质、CO₂同化途径、关键酶系统到代谢调控和工程策略，并提出了合成生物学、人工智能与系统工程融合的未来路线图 | 未提供定量比较或实验验证，仅基于文献总结，可能缺乏具体数据支持 | 为开发高效、智能和可持续的微藻CO₂固定系统提供理论框架和前瞻视角 | 微藻的CO₂固定机制，包括碳浓缩机制、Rubisco和碳酸酐酶系统等 | 机器学习 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | CO₂固定途径、碳浓缩机制 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 158 | 2026-05-30 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
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研究论文 | 探讨封装生物系统所需克服的一般约束条件，包括现代生化系统及通用自催化系统的分析 | 首次系统性地量化封装生物系统的物理约束，包括核糖体速率与细胞大小阈值，并建立通用自催化系统的生长速率边界模型 | 基于地球现代生化系统作为测试案例，未验证该约束是否适用于所有可能的生物系统 | 研究封装生物系统时面临的一般性限制条件及其对生命起源、天体生物学和合成生物学的启示 | 现代生化系统（核糖体与细胞）及通用自催化系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 天体生物学, 生命起源研究 |
| 159 | 2026-05-30 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 通过从LUCA代谢映射到原始反应规则，探讨生命起源中从地球化学向生物化学转变的关键过程，并建立综合建模框架进行假设验证 | 提出利用生成模型将LUCA代谢反应规则映射到原始生命反应，结合热力学、行星条件等因子构建综合建模框架，并首次探讨酶混杂性和代谢可进化性在生命起源中的驱动作用 | 尚未提供实验验证结果，仅停留在理论框架和假设层面，缺乏具体案例的定量分析 | 阐明从非生物化学到早期生命代谢的进化联系，为合成生物学应用提供理论基础 | LUCA（最后普遍共同祖先）的代谢网络与原始生命反应规则 | 系统化学，计算生物学 | NA | 生成模型，代谢反应规则映射，计算建模 | 生成模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 160 | 2026-05-30 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
|
综述 | 综述虚拟人工生命的起源、定义、检测及工程实现现状 | 从工程视角综合多种生命定义，提出抽象需求、通用设计与具体实现机制的三层框架，并以此审视现有进展 | 尚未有完全满足所有定义要求的虚拟人工生命实例展示 | 探讨虚拟人工生命的定义、检测与起源机制，促进该领域发展 | 虚拟人工生命（计算机内存在） | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |